Genomová exprese u lymfomu, leukémie a mnohočetného myelomu

Tato studie bude využívat technologii založenou na genomice, jako jsou DNA mikročipy, k přesnější diagnostice podskupin pacientů s lymfomem, leukémií a mnohočetným myelomem. Bylo provedeno mnoho pokusů klasifikovat lymfoidní rakoviny způsoby, které budou užitečné pro klinickou diagnostiku a léčbu. Přestože byly spolehlivě definovány široké diagnostické kategorie, pacienti v každé kategorii mají odlišné klinické průběhy, což naznačuje, že tyto klasifikace by mohly být dále rozděleny na molekulární (genetické) podtypy. Například 40 procent pacientů s difuzním velkobuněčným B-lymfomem dosáhne po kombinované chemoterapii dlouhodobé remise onemocnění a je zjevně vyléčeno, zatímco zbývajících 60 procent na toto onemocnění zemře. Podobně se u některých pacientů s folikulárním lymfomem rozvine agresivní onemocnění během několika let od diagnózy, zatímco u jiných je onemocnění stabilní po 10 až 20 letech. Ačkoli jsou uznávány rozdíly v klinickém průběhu těchto onemocnění, neexistují žádné studie, které by určily molekulární (genetický) základ této variability. Tato studie se pokusí definovat nové molekulárně diagnostické kategorie u těchto onemocnění a korelovat je s klinickými rysy, včetně odpovědi na léčbu, remise onemocnění a celkového přežití po chemoterapii.

Tato retrospektivní studie bude využívat klinická data a vzorky tkání ze zúčastněných center projektu molekulárního profilování lymfomů/leukémie LLMPP). Do této studie nebudou přijímáni noví pacienti.

Od patologů účastnících se LLMPP budou odebrány bioptické materiály, včetně čerstvě zmrazeného nebo OTC začleněného lymfomového bioptického materiálu, životaschopně zmrazených vzorků buněk periferní krve od pacientů s leukémií a životaschopně zmrazených vzorků aspirátů kostní dřeně od pacientů s mnohočetným myelomem. Ze vzorků nádoru bude extrahována RNA a genomová DNA. K charakterizaci genomu rakovinných buněk bude použita řada technologií, včetně lymfochipových mikročipů pro komparativní genomovou hybridizaci založenou na poli; Southern blotting a PCR pro translokaci genů, které se dříve podílely na těchto malignitách; a metody PCR a DNA sekvenování pro analýzu změn bází v genomu rakovinných buněk. Klinické informace od počáteční diagnózy až po relaps onemocnění budou převzaty z existujících databází a/nebo tabulek pacientů. Genová exprese bude korelována s klinickými údaji. Pokud se zjistí, že malý počet genů silně předpovídá klinický výsledek, mohou být jako alternativa k analýze DNA microarray vyvinuty kvantitativní testy RT-PCR využívající technologii Taqman.

...