Genomin ilmentyminen lymfoomassa, leukemiassa ja multippeli myeloomassa

Tässä tutkimuksessa käytetään genomiikkaan perustuvaa teknologiaa, kuten DNA-mikrosiruja, diagnosoimaan tarkemmin lymfooma-, leukemia- ja multippeli myeloomapotilaiden alaryhmät. Useita yrityksiä on yritetty luokitella lymfoidisia syöpiä tavoilla, jotka ovat hyödyllisiä kliinisessä diagnoosissa ja hoidossa. Vaikka laajat diagnostiset kategoriat on määritelty luotettavasti, kussakin kategoriassa olevilla potilailla on erilainen kliininen kulku, mikä viittaa siihen, että nämä luokitukset voitaisiin jakaa edelleen molekulaarisiin (geneettisiin) alatyyppeihin. Esimerkiksi 40 prosenttia potilaista, joilla on diffuusi suuri B-solulymfooma, saavuttaa pitkäaikaisen taudin remission yhdistelmäkemoterapian jälkeen ja on ilmeisesti parantunut, kun taas loput 60 prosenttia kuolee sairauteen. Samoin joillekin follikulaarista lymfoomaa sairastaville potilaille kehittyy aggressiivinen sairaus muutaman vuoden kuluessa diagnoosista, kun taas toisilla tauti on vakaa 10–20 vuoden aikana. Vaikka näiden sairauksien kliinisen kulun erot tunnustetaan, ei ole olemassa tutkimuksia tämän vaihtelun molekyylisen (geneettisen) perustan määrittämiseksi. Tässä tutkimuksessa pyritään määrittelemään uusia molekyylidiagnostisia luokkia näille sairauksille ja korreloimaan niitä kliinisten ominaisuuksien kanssa, mukaan lukien hoitovaste, taudin remissio ja yleinen eloonjääminen kemoterapian jälkeen.

Tämä retrospektiivinen tutkimus käyttää kliinisiä tietoja ja kudosnäytteitä osallistuvista keskuksista Lymfooma/Leukemia Molecular Profiling Project LLMPP). Uusia potilaita ei oteta mukaan tähän tutkimukseen.

Biopsiamateriaalit, mukaan lukien tuore pakastettu tai OTC-sulautettu lymfoomabiopsiamateriaali, elinkykyisesti pakastetut näytteet leukemiapotilaiden perifeerisistä verisoluista ja elinvoimaisesti pakastetut näytteet multippeli myeloomapotilaiden luuytimen aspiraateista, kerätään LLMPP:hen osallistuvilta patologiilta. Kasvainnäytteistä uutetaan RNA ja genominen DNA. Erilaisia ​​tekniikoita käytetään syöpäsolujen genomin karakterisoimiseen, mukaan lukien lymfosiru-mikrosirut array-pohjaista vertailevaa genomista hybridisaatiota varten; Southern blot -analyysi ja PCR näihin pahanlaatuisiin kasvaimiin aiemmin liittyvien geenien translokoimiseksi; ja PCR- ja DNA-sekvensointimenetelmät syöpäsolujen genomin emäsmuutosten analysoimiseksi. Kliiniset tiedot alkuperäisestä diagnoosista taudin uusiutumiseen otetaan olemassa olevista tietokannoista ja/tai potilaskartoista. Geeniekspressio korreloidaan kliinisten tietojen kanssa. Jos havaitaan, että pieni määrä geenejä ennustaa vahvasti kliinisen lopputuloksen, kvantitatiivisia RT-PCR-määrityksiä, joissa käytetään Taqman-tekniikkaa, voidaan kehittää vaihtoehtona DNA-mikrosiruanalyysille.

...