Экспрессия генома при лимфоме, лейкемии и множественной миеломе

В этом исследовании будут использоваться технологии на основе геномики, такие как ДНК-микрочипы, для более точной диагностики пациентов с лимфомой, лейкемией и множественной миеломой. Было предпринято много попыток классифицировать лимфоидный рак способами, которые будут полезны для клинической диагностики и лечения. Хотя широкие диагностические категории были надежно определены, пациенты в каждой категории имеют различные клинические течения, что позволяет предположить, что эти классификации могут быть далее разделены на молекулярные (генетические) подтипы. Например, 40 процентов пациентов с диффузной крупноклеточной В-клеточной лимфомой достигают длительной ремиссии заболевания после комбинированной химиотерапии и, по-видимому, излечиваются, тогда как остальные 60 процентов умирают от болезни. Точно так же у некоторых пациентов с фолликулярной лимфомой заболевание развивается агрессивно в течение нескольких лет после постановки диагноза, в то время как у других заболевание стабильно в течение 10–20 лет. Несмотря на то, что различия в клиническом течении этих заболеваний признаны, исследований, определяющих молекулярную (генетическую) основу этой изменчивости, не проводилось. В этом исследовании будет предпринята попытка определить новые категории молекулярной диагностики этих заболеваний и сопоставить их с клиническими особенностями, включая ответ на лечение, ремиссию заболевания и общую выживаемость после химиотерапии.

В этом ретроспективном исследовании будут использованы клинические данные и образцы тканей из центров, участвующих в Проекте молекулярного профилирования лимфомы/лейкемии (LLMPP). Новые пациенты не будут набираться для этого исследования.

Материалы для биопсии, в том числе свежезамороженные или содержащие безрецептурные биоптаты лимфомы, жизнеспособно замороженные образцы клеток периферической крови от пациентов с лейкемией и жизнеспособно замороженные образцы аспиратов костного мозга от пациентов с множественной миеломой, будут собираться у патологоанатомов, участвующих в LLMPP. РНК и геномная ДНК будут извлечены из образцов опухоли. Для характеристики генома раковых клеток будут использоваться различные технологии, в том числе микрочипы лимфочипов для сравнительной геномной гибридизации на основе массивов; Саузерн-блоттинг и ПЦР для транслокации генов, ранее причастных к этим злокачественным новообразованиям; и методы ПЦР и секвенирования ДНК для анализа изменений оснований в геноме раковых клеток. Клиническая информация от первоначального диагноза до рецидива заболевания будет браться из существующих баз данных и/или карт пациентов. Экспрессия генов будет коррелировать с клиническими данными. Если будет обнаружено, что небольшое количество генов сильно предсказывает клинический исход, количественные анализы RT-PCR с использованием технологии Taqman могут быть разработаны в качестве альтернативы анализу ДНК на микрочипах.

...