Genoomexpressie bij lymfoom, leukemie en multipel myeloom

Deze studie zal op genomica gebaseerde technologie gebruiken, zoals DNA-microarrays, om subgroepen van lymfoom-, leukemie- en multipel myeloompatiënten nauwkeuriger te diagnosticeren. Er zijn veel pogingen gedaan om lymfoïde kankers te classificeren op manieren die bruikbaar zijn voor klinische diagnose en behandeling. Hoewel brede diagnostische categorieën op betrouwbare wijze zijn gedefinieerd, hebben patiënten binnen elke categorie een verschillend klinisch verloop, wat suggereert dat deze classificaties verder kunnen worden onderverdeeld in moleculaire (genetische) subtypen. Zo bereikt 40 procent van de patiënten met diffuus grootcellig B-cellymfoom een ​​langdurige remissie van de ziekte na combinatiechemotherapie en lijkt te genezen, terwijl de overige 60 procent aan de ziekte overlijdt. Evenzo ontwikkelen sommige patiënten met folliculair lymfoom een ​​agressieve ziekte binnen een paar jaar na de diagnose, terwijl anderen een stabiele ziekte hebben gedurende 10 tot 20 jaar. Hoewel de verschillen in klinisch beloop van deze ziekten worden erkend, zijn er geen studies om de moleculaire (genetische) basis voor deze variabiliteit te bepalen. Deze studie zal proberen nieuwe moleculaire diagnostische categorieën bij deze ziekten te definiëren en deze te correleren met klinische kenmerken, waaronder behandelingsrespons, ziekteremissie en algehele overleving na chemotherapie.

Deze retrospectieve studie zal gebruik maken van klinische gegevens en weefselmonsters van deelnemende centra in het Lymphoma/Leukemia Molecular Profiling Project (LLMPP). Er worden geen nieuwe patiënten geworven voor deze studie.

Biopsiematerialen, waaronder vers ingevroren of OTC-ingebed lymfoombiopsiemateriaal, levensvatbaar ingevroren monsters van perifere bloedcellen van leukemiepatiënten en levensvatbaar ingevroren monsters van beenmergaspiraten van multipel myeloompatiënten zullen worden verzameld van pathologen die deelnemen aan de LLMPP. Uit de tumormonsters zal RNA en genomisch DNA worden geëxtraheerd. Een verscheidenheid aan technologieën zal worden gebruikt om het genoom van de kankercellen te karakteriseren, waaronder lymphochip microarrays voor array-gebaseerde vergelijkende genomische hybridisatie; Southern-blotting en PCR voor translocatie van genen die eerder betrokken waren bij deze maligniteiten; en PCR- en DNA-sequencingmethoden voor het analyseren van baseveranderingen in het genoom van de kankercellen. Klinische informatie vanaf de initiële diagnose tot terugval van de ziekte zal worden ontleend aan bestaande databases en/of patiëntendossiers. Genexpressie zal worden gecorreleerd met de klinische gegevens. Als blijkt dat een klein aantal genen de klinische uitkomst sterk voorspelt, kunnen kwantitatieve RT-PCR-assays met behulp van de Taqman-technologie worden ontwikkeld als alternatief voor DNA-microarray-analyse.

...