Genomuttrykk i lymfom, leukemi og multippelt myelom

Denne studien vil bruke genomikkbasert teknologi, som DNA-mikroarrayer, for mer presist å diagnostisere undergrupper av lymfom-, leukemi- og myelomatosepasienter. Det har vært mange forsøk på å klassifisere lymfoide kreftformer på måter som vil være nyttige for klinisk diagnose og behandling. Selv om brede diagnostiske kategorier er pålitelig definert, har pasienter innenfor hver kategori distinkte kliniske forløp, noe som tyder på at disse klassifikasjonene kan deles videre inn i molekylære (genetiske) subtyper. For eksempel oppnår 40 prosent av pasientene med diffust stort B-celle lymfom langvarige sykdomsremisjoner etter kombinasjonskjemoterapi og blir tilsynelatende helbredet, mens de resterende 60 prosent dør av sykdommen. Tilsvarende utvikler noen pasienter med follikulært lymfom aggressiv sykdom innen få år etter diagnosen, mens andre har stabil sykdom over 10 til 20 år. Selv om forskjellene i klinisk forløp av disse sykdommene er anerkjent, er det ingen studier for å bestemme det molekylære (genetiske) grunnlaget for denne variasjonen. Denne studien vil prøve å definere nye molekylære diagnostiske kategorier i disse sykdommene og korrelere dem med kliniske trekk, inkludert behandlingsrespons, sykdomsremisjon og total overlevelse etter kjemoterapi.

Denne retrospektive studien vil bruke kliniske data og vevsprøver fra deltakende sentre i Lymphoma/Leukemia Molecular Profiling Project LLMPP). Nye pasienter vil ikke bli rekruttert til denne studien.

Biopsimateriale, inkludert ferskt frosset eller OTC-innebygd lymfombiopsimateriale, levedyktig frosne prøver av perifere blodceller fra leukemipasienter og levedyktig frosne prøver av benmargsaspirater fra multippelt myelompasienter vil bli samlet inn fra patologer som deltar i LLMPP. RNA og genomisk DNA vil bli ekstrahert fra tumorprøvene. En rekke teknologier vil bli brukt for å karakterisere genomet til kreftcellene, inkludert lymfochip-mikroarrayer for array-basert komparativ genomisk hybridisering; Southern blotting og PCR for translokasjon av gener som tidligere var implisert i disse malignitetene; og PCR- og DNA-sekvenseringsmetoder for å analysere baseendringer i kreftcellenes genom. Klinisk informasjon fra den første diagnosen til sykdomsresidiv vil bli hentet fra eksisterende databaser og/eller pasientskjemaer. Genekspresjon vil være korrelert med de kliniske dataene. Hvis et lite antall gener viser seg å sterkt forutsi klinisk utfall, kan kvantitative RT-PCR-analyser ved bruk av Taqman-teknologien utvikles som et alternativ til DNA-mikroarray-analyse.

...