Ekspresja genomu w chłoniaku, białaczce i szpiczaku mnogim

W badaniu tym wykorzystana zostanie technologia oparta na genomice, taka jak mikromacierze DNA, do dokładniejszego diagnozowania podgrup pacjentów z chłoniakiem, białaczką i szpiczakiem mnogim. Podjęto wiele prób sklasyfikowania raków układu limfatycznego w sposób, który będzie przydatny w diagnostyce klinicznej i leczeniu. Chociaż szerokie kategorie diagnostyczne zostały wiarygodnie zdefiniowane, pacjenci w każdej kategorii mają różne przebiegi kliniczne, co sugeruje, że te klasyfikacje można dalej podzielić na podtypy molekularne (genetyczne). Na przykład 40 procent pacjentów z rozlanym chłoniakiem z dużych komórek B osiąga długoterminową remisję choroby po chemioterapii skojarzonej i jest najwyraźniej wyleczonych, podczas gdy pozostałe 60 procent umiera z powodu choroby. Podobnie, u niektórych pacjentów z chłoniakiem grudkowym rozwija się agresywna choroba w ciągu kilku lat od rozpoznania, podczas gdy u innych choroba jest stabilna przez 10 do 20 lat. Chociaż rozpoznaje się różnice w przebiegu klinicznym tych chorób, nie ma badań, które określałyby molekularne (genetyczne) podłoże tej zmienności. W tym badaniu podjęta zostanie próba zdefiniowania nowych molekularnych kategorii diagnostycznych w tych chorobach i skorelowania ich z cechami klinicznymi, w tym odpowiedzią na leczenie, remisją choroby i całkowitym przeżyciem po chemioterapii.

W tym badaniu retrospektywnym zostaną wykorzystane dane kliniczne i próbki tkanek z ośrodków uczestniczących w projekcie profilowania molekularnego chłoniaka/białaczki (LLMPP). Nowi pacjenci nie będą rekrutowani do tego badania.

Materiały biopsyjne, w tym świeżo zamrożony lub zatopiony w OTC materiał biopsyjny chłoniaka, żywo zamrożone próbki komórek krwi obwodowej od pacjentów z białaczką oraz żywotnie zamrożone próbki aspiratów szpiku kostnego od pacjentów ze szpiczakiem mnogim zostaną zebrane od patologów uczestniczących w LLMPP. Z próbek guza zostanie wyekstrahowany RNA i genomowy DNA. Do scharakteryzowania genomu komórek nowotworowych zostaną wykorzystane różnorodne technologie, w tym mikromacierze lymphochip do porównawczej hybrydyzacji genomowej opartej na macierzach; Southern blotting i PCR w celu translokacji genów wcześniej zaangażowanych w te nowotwory złośliwe; oraz metody PCR i sekwencjonowania DNA do analizy zmian zasad w genomie komórek nowotworowych. Informacje kliniczne od wstępnej diagnozy do nawrotu choroby będą pobierane z istniejących baz danych i/lub kart pacjentów. Ekspresja genów zostanie skorelowana z danymi klinicznymi. Jeśli okaże się, że niewielka liczba genów silnie prognozuje wynik kliniczny, można opracować ilościowe testy RT-PCR z wykorzystaniem technologii Taqman jako alternatywę dla analizy mikromacierzy DNA.

...