Genomuttryck i lymfom, leukemi och multipelt myelom

Denna studie kommer att använda genomikbaserad teknologi, såsom DNA-mikroarrayer, för att mer exakt diagnostisera undergrupper av patienter med lymfom, leukemi och multipelt myelom. Det har gjorts många försök att klassificera lymfoida cancerformer på sätt som kommer att vara användbara för klinisk diagnos och behandling. Även om breda diagnostiska kategorier har definierats tillförlitligt, har patienter inom varje kategori distinkta kliniska förlopp, vilket tyder på att dessa klassificeringar skulle kunna delas in ytterligare i molekylära (genetiska) subtyper. Till exempel uppnår 40 procent av patienterna med diffust stort B-cellslymfom långvariga sjukdomsremissioner efter kombinationskemoterapi och blir uppenbarligen botade, medan de återstående 60 procenten dör av sjukdomen. På liknande sätt utvecklar vissa patienter med follikulärt lymfom aggressiv sjukdom inom några år efter diagnos, medan andra har stabil sjukdom under 10 till 20 år. Även om skillnaderna i kliniskt förlopp för dessa sjukdomar är erkända, finns det inga studier för att fastställa den molekylära (genetiska) grunden för denna variation. Denna studie kommer att försöka definiera nya molekylära diagnostiska kategorier i dessa sjukdomar och korrelera dem med kliniska egenskaper, inklusive behandlingssvar, sjukdomsremission och total överlevnad efter kemoterapi.

Denna retrospektiva studie kommer att använda kliniska data och vävnadsprover från deltagande centra i Lymphoma/Leukemia Molecular Profiling Project LLMPP). Nya patienter kommer inte att rekryteras till denna studie.

Biopsimaterial, inklusive färskfryst eller OTC-inbäddat lymfombiopsimaterial, livskraftigt frysta prov av perifera blodkroppar från leukemipatienter och livskraftigt frysta prover av benmärgsaspirat från patienter med multipelt myelom kommer att samlas in från patologer som deltar i LLMPP. RNA och genomiskt DNA kommer att extraheras från tumörproverna. En mängd olika teknologier kommer att användas för att karakterisera genomet av cancercellerna, inklusive lymfochip-mikroarrayer för array-baserad jämförande genomisk hybridisering; Southern blotting och PCR för translokation av gener som tidigare var inblandade i dessa maligniteter; och PCR- och DNA-sekvenseringsmetoder för att analysera basförändringar i cancercellernas genom. Klinisk information från den initiala diagnosen till sjukdomsåterfall kommer att tas från befintliga databaser och/eller patientdiagram. Genuttryck kommer att korreleras med kliniska data. Om ett litet antal gener visar sig starkt förutsäga kliniska utfall, kan kvantitativa RT-PCR-analyser med Taqman-teknologin utvecklas som ett alternativ till DNA-mikroarrayanalys.

...