SNP-baseret Microdeletion and Aneuploidy RegistrTry (SMART) (SMART)
27. januar 2021 opdateret af: Natera, Inc.
SNP-baseret Microdeletion og Aneuploidy RegistrTry
Dette multicenter prospektive observationsstudie er designet til at spore fødselsresultater og perinatale korrelationer til Panorama prænatal screeningtest i den generelle befolkning blandt ti tusinde kvinder, der præsenterer klinisk og vælger Panorama mikrodeletion og aneuploidiscreening som en del af deres rutinepleje.
Det primære mål er at evaluere ydeevnen af Single Nucleotide Polymorphism (SNP)-baseret Non Invasive Prenatal Testing (NIPT) for 22q11.2
mikrodeletion (DiGeorge syndrom) i denne store kohorte af gravide kvinder.
Dette vil blive gjort ved at udføre en gennemgang af perinatale journaler og indhente bioprøver efter fødslen for at udføre genetisk diagnostisk test for 22q11.2
sletning.
Resultaterne fra opfølgningsprøverne vil blive sammenlignet med dem opnået ved Panorama-screeningstesten for at bestemme testydeevnen.
Specifikke testpræstationsparametre vil omfatte: PPV, specificitet og sensitivitet.
Studieoversigt
Status
Afsluttet
Detaljeret beskrivelse
Det primære mål er i en prospektiv undersøgelse at bestemme ydeevnen af SNP-baseret NIPT for 22q11.2 mikrodeletion (DiGeorge syndrom) i en stor kohorte af gravide kvinder, der klinisk vælger denne form for screening. Specifikke testpræstationsparametre vil omfatte: positiv prædiktiv værdi (PPV), specificitet og sensitivitet.
Sekundære mål omfatter:
- Bestem testydelsen (PPV, specificitet) af SNP-baseret NIPT til påvisning af andre mikrodeletionssyndromer, der er tilgængelige i Panorama mikrodeletionspanelet (f.eks. 1p36-sletning, Cri-du-chat, Prader-Willi og Angelman) individuelt og alt sammen (inklusive 22q11 .2). Givet forekomsterne på <1:5000, forventes konfidensintervallerne at være store.
- Bestem fejlprocenten ('no call') for næste generations aneuploiditest ved hjælp af SNP'er (NATUS)-metoden for 22q11.2 påvisning, samt for aneuploidi.
- Bestem, om der kan genereres en mere præcis risiko for aneuploidi i forbindelse med lav føtal fraktion ved at inkorporere maternal BMI (justeret føtal fraktion percentil).
- Vurder, om lav føtal fraktion er forbundet med specifikke ultralydsfund, der kan indikere aneuploidi (f. triploidy, trisomi 13 og 18).
- Undersøg forholdet mellem NIPT og sonografiske (nukal translucens og anatomiundersøgelse) markører og serummarkører fra 1. og 2. trimester aneuploidiscreening.
- Bestem sensitivitet, specificitet og PPV for kromosomale aneuploidier og kønskromosomabnormaliteter.
- Udfør detaljeret vurdering af falsk positive aneuploidiprøver for bedre at forstå fejlkilder, herunder placentaundersøgelser for yderligere at forfine problemer omkring mosaicisme, da NIPT repræsenterer cirkulerende placenta-DNA.
- Undersøg ethvert forhold mellem cirkulerende placenta-DNA (føtal fraktion) eller andre testparametre, herunder potentielle genotypiske markører, og resultater relateret til unormal placentation (inklusive men ikke begrænset til præeklampsi, lille for svangerskabsalderen og sygeligt adhærent placenta).
- Undersøg andre risikofaktorer, der kan påvirke risikovurderingen for mikrodeletioner, herunder sonografiske fund i overensstemmelse med 22q11.2 (hjerteanomalier og thymusstørrelse).
Undersøgelsestype
Observationel
Tilmelding (Faktiske)
20960
Kontakter og lokationer
Dette afsnit indeholder kontaktoplysninger for dem, der udfører undersøgelsen, og oplysninger om, hvor denne undersøgelse udføres.
Studiesteder
-
-
New South Wales
-
Camperdown, New South Wales, Australien, 2050
- Royal Prince Alfred
-
-
-
-
-
London, Det Forenede Kongerige, SW17 0QT
- St. George University Hospital
-
-
-
-
California
-
San Francisco, California, Forenede Stater, 94158
- University of California, San Francisco
-
-
New Jersey
-
Camden, New Jersey, Forenede Stater, 08103
- Cooper University Hospital
-
Mount Laurel, New Jersey, Forenede Stater, 08054
- Virtua
-
New Brunswick, New Jersey, Forenede Stater, 08901
- St. Peter's University
-
-
New York
-
Garden City, New York, Forenede Stater, 11530
- Complete Women's Healthcare
-
Manhasset, New York, Forenede Stater, 11030
- North Shore University Hospital
-
Mineola, New York, Forenede Stater, 11501
- Madonna Perinatal
-
New Hyde Park, New York, Forenede Stater, 11040
- Long Island Jewish Medical Center
-
New York, New York, Forenede Stater, 10032
- Columbia University
-
New York, New York, Forenede Stater, 10016
- New York University
-
New York, New York, Forenede Stater, 10461
- Montefiore Medical Center
-
New York, New York, Forenede Stater, 10029
- Icahn School of Medicine Mt Sinai
-
Port Jefferson, New York, Forenede Stater, 11777
- Suffolk OB
-
-
Texas
-
Austin, Texas, Forenede Stater, 78758
- North Austin Maternal Fetal Medicine
-
Longview, Texas, Forenede Stater, 75601
- Zeid Women's Health Center
-
-
Utah
-
Salt Lake City, Utah, Forenede Stater, 84132
- University of Utah
-
-
-
-
-
Dublin, Irland, 1
- Royal College Surgeons in Ireland
-
-
-
-
-
Barcelona, Spanien, 08028
- Dexeus
-
-
-
-
-
Gothenburg, Sverige, SE-416 85
- Sahlgrenska University Hospital
-
-
Deltagelseskriterier
Forskere leder efter personer, der passer til en bestemt beskrivelse, kaldet berettigelseskriterier. Nogle eksempler på disse kriterier er en persons generelle helbredstilstand eller tidligere behandlinger.
Berettigelseskriterier
Aldre berettiget til at studere
14 år til 44 år (Voksen)
Tager imod sunde frivillige
Ingen
Køn, der er berettiget til at studere
Kvinde
Prøveudtagningsmetode
Ikke-sandsynlighedsprøve
Studiebefolkning
Gravid kvinde
Beskrivelse
Inklusionskriterier:
- Singleton graviditet
- Modtager Panorama prænatal screeningstest for både mikrodeletioner (mindst 22q11.2) og aneuploidi
- Planlagt hospitalslevering
- Svangerskabsalder på ≥ 9 uger, 0 dage baseret på klinisk information og evaluering.
- Kan give informeret samtykke
Ekskluderingskriterier:
- Modtaget resultater af Panorama-testen før tilmelding
- Organtransplanteret modtager
- Ægdonor brugt
Studieplan
Dette afsnit indeholder detaljer om studieplanen, herunder hvordan undersøgelsen er designet, og hvad undersøgelsen måler.
Hvordan er undersøgelsen tilrettelagt?
Design detaljer
- Observationsmodeller: Kohorte
- Tidsperspektiver: Fremadrettet
Kohorter og interventioner
Gruppe / kohorte |
|---|
|
Graviditeter, der gennemgår prænatal mikrodeletionsscreening
Gravide kvinder, der gennemgår ikke-invasiv prænatal screening for mikrodeletions- og aneuploidisyndromer. Intet lægemiddel vil blive administreret, denne kohorte vil gennemgå en ikke-invasiv prænatal blodprøve og derefter opfølgende data og prøver vil blive indsamlet til forskningsanalyse. |
Hvad måler undersøgelsen?
Primære resultatmål
Resultatmål |
Foranstaltningsbeskrivelse |
Tidsramme |
|---|---|---|
|
22q11.2 Snp-baseret non-invasiv prænatal screeningstestydelse, herunder positiv prædiktiv værdi (PPV), specificitet og sensitivitet
Tidsramme: 3 år
|
For at bestemme i en prospektiv undersøgelse ydeevnen af SNP-baseret NIPT for 22q11.2
mikrodeletion (DiGeorge syndrom) i en stor kohorte af gravide kvinder, der klinisk vælger denne form for screening.
|
3 år
|
Sekundære resultatmål
Resultatmål |
Foranstaltningsbeskrivelse |
Tidsramme |
|---|---|---|
|
Kombineret mikrodeletionssyndrom screeningstest ydeevne
Tidsramme: 3 år
|
Bestem testydelsen (PPV, specificitet) af SNP-baseret NIPT til påvisning af andre mikrodeletionssyndromer, der er tilgængelige i Panorama mikrodeletionspanelet (f.eks. 1p36-sletning, Cri-du-chat, Prader-Willi og Angelman) individuelt og alt sammen (inklusive 22q11 .2).
Givet forekomsterne på <1:5000, forventes konfidensintervallerne at være store.
|
3 år
|
|
Ingen opkaldstakst
Tidsramme: 3 år
|
Bestem fejlprocenten ('no call') for NATUS-metoden for 22q11.2
påvisning, samt for aneuploidi.
|
3 år
|
|
Lav føtal fraktion aneuploidirisiko forfining
Tidsramme: 3 år
|
Bestem, om en mere præcis risiko for aneuploidi kan genereres ved lav føtal fraktion ved at inkorporere maternal BMI (justeret føtal fraktion percentil), eller om lav føtal fraktion er forbundet med specifikke ultralydsfund, der kan indikere aneuploidi (f.eks.
triploidy, trisomi 13 og 18).
|
3 år
|
|
Udforskning af placenta mosaicisme
Tidsramme: 3 år
|
Udfør detaljeret vurdering af falsk positive aneuploidiprøver for bedre at forstå fejlkilder, herunder placentaundersøgelser for yderligere at forfine problemer omkring mosaicisme, da NIPT repræsenterer cirkulerende placenta-DNA.
|
3 år
|
|
Udforskning af placenta komplikationer
Tidsramme: 3 år
|
Undersøg ethvert forhold mellem cirkulerende placenta-DNA (føtal fraktion) eller andre testparametre, herunder potentielle genotypiske markører, og resultater relateret til unormal placentation (inklusive men ikke begrænset til præeklampsi, lille for svangerskabsalderen og sygeligt adhærent placenta).
|
3 år
|
Samarbejdspartnere og efterforskere
Det er her, du vil finde personer og organisationer, der er involveret i denne undersøgelse.
Sponsor
Samarbejdspartnere
Efterforskere
- Ledende efterforsker: Mary Norton, MD, University of California, San Francisco
- Ledende efterforsker: Peer Dar, MD, Montefiore Medical Center
Publikationer og nyttige links
Den person, der er ansvarlig for at indtaste oplysninger om undersøgelsen, leverer frivilligt disse publikationer. Disse kan handle om alt relateret til undersøgelsen.
Generelle publikationer
- Palomaki GE, Deciu C, Kloza EM, Lambert-Messerlian GM, Haddow JE, Neveux LM, Ehrich M, van den Boom D, Bombard AT, Grody WW, Nelson SF, Canick JA. DNA sequencing of maternal plasma reliably identifies trisomy 18 and trisomy 13 as well as Down syndrome: an international collaborative study. Genet Med. 2012 Mar;14(3):296-305. doi: 10.1038/gim.2011.73. Epub 2012 Feb 2.
- Palomaki GE, Kloza EM, Lambert-Messerlian GM, Haddow JE, Neveux LM, Ehrich M, van den Boom D, Bombard AT, Deciu C, Grody WW, Nelson SF, Canick JA. DNA sequencing of maternal plasma to detect Down syndrome: an international clinical validation study. Genet Med. 2011 Nov;13(11):913-20. doi: 10.1097/GIM.0b013e3182368a0e.
- American College of Obstetricians and Gynecologists Committee on Genetics. Committee Opinion No. 581: the use of chromosomal microarray analysis in prenatal diagnosis. Obstet Gynecol. 2013 Dec;122(6):1374-7. doi: 10.1097/01.AOG.0000438962.16108.d1.
- Pergament E, Cuckle H, Zimmermann B, Banjevic M, Sigurjonsson S, Ryan A, Hall MP, Dodd M, Lacroute P, Stosic M, Chopra N, Hunkapiller N, Prosen DE, McAdoo S, Demko Z, Siddiqui A, Hill M, Rabinowitz M. Single-nucleotide polymorphism-based noninvasive prenatal screening in a high-risk and low-risk cohort. Obstet Gynecol. 2014 Aug;124(2 Pt 1):210-218. doi: 10.1097/AOG.0000000000000363.
- Ehrich M, Deciu C, Zwiefelhofer T, Tynan JA, Cagasan L, Tim R, Lu V, McCullough R, McCarthy E, Nygren AO, Dean J, Tang L, Hutchison D, Lu T, Wang H, Angkachatchai V, Oeth P, Cantor CR, Bombard A, van den Boom D. Noninvasive detection of fetal trisomy 21 by sequencing of DNA in maternal blood: a study in a clinical setting. Am J Obstet Gynecol. 2011 Mar;204(3):205.e1-11. doi: 10.1016/j.ajog.2010.12.060. Epub 2011 Feb 18.
- Sehnert AJ, Rhees B, Comstock D, de Feo E, Heilek G, Burke J, Rava RP. Optimal detection of fetal chromosomal abnormalities by massively parallel DNA sequencing of cell-free fetal DNA from maternal blood. Clin Chem. 2011 Jul;57(7):1042-9. doi: 10.1373/clinchem.2011.165910. Epub 2011 Apr 25.
- Benn P, Cuckle H, Pergament E. Genome-wide fetal aneuploidy detection by maternal plasma DNA sequencing. Obstet Gynecol. 2012 Jun;119(6):1270; author reply 1270-1. doi: 10.1097/AOG.0b013e318258c401. No abstract available.
- Sparks AB, Struble CA, Wang ET, Song K, Oliphant A. Noninvasive prenatal detection and selective analysis of cell-free DNA obtained from maternal blood: evaluation for trisomy 21 and trisomy 18. Am J Obstet Gynecol. 2012 Apr;206(4):319.e1-9. doi: 10.1016/j.ajog.2012.01.030. Epub 2012 Jan 26.
- Norton ME, Brar H, Weiss J, Karimi A, Laurent LC, Caughey AB, Rodriguez MH, Williams J 3rd, Mitchell ME, Adair CD, Lee H, Jacobsson B, Tomlinson MW, Oepkes D, Hollemon D, Sparks AB, Oliphant A, Song K. Non-Invasive Chromosomal Evaluation (NICE) Study: results of a multicenter prospective cohort study for detection of fetal trisomy 21 and trisomy 18. Am J Obstet Gynecol. 2012 Aug;207(2):137.e1-8. doi: 10.1016/j.ajog.2012.05.021. Epub 2012 Jun 1.
- Nicolaides KH, Syngelaki A, Gil M, Atanasova V, Markova D. Validation of targeted sequencing of single-nucleotide polymorphisms for non-invasive prenatal detection of aneuploidy of chromosomes 13, 18, 21, X, and Y. Prenat Diagn. 2013 Jun;33(6):575-9. doi: 10.1002/pd.4103. Epub 2013 Apr 24.
- Nicolaides KH, Syngelaki A, del Mar Gil M, Quezada MS, Zinevich Y. Prenatal detection of fetal triploidy from cell-free DNA testing in maternal blood. Fetal Diagn Ther. 2014;35(3):212-7. doi: 10.1159/000355655. Epub 2013 Oct 10.
- Samango-Sprouse C, Banjevic M, Ryan A, Sigurjonsson S, Zimmermann B, Hill M, Hall MP, Westemeyer M, Saucier J, Demko Z, Rabinowitz M. SNP-based non-invasive prenatal testing detects sex chromosome aneuploidies with high accuracy. Prenat Diagn. 2013 Jul;33(7):643-9. doi: 10.1002/pd.4159. Epub 2013 Jun 20.
- Wapner RJ, Martin CL, Levy B, Ballif BC, Eng CM, Zachary JM, Savage M, Platt LD, Saltzman D, Grobman WA, Klugman S, Scholl T, Simpson JL, McCall K, Aggarwal VS, Bunke B, Nahum O, Patel A, Lamb AN, Thom EA, Beaudet AL, Ledbetter DH, Shaffer LG, Jackson L. Chromosomal microarray versus karyotyping for prenatal diagnosis. N Engl J Med. 2012 Dec 6;367(23):2175-84. doi: 10.1056/NEJMoa1203382.
- Wapner RJ, Babiarz JE, Levy B, Stosic M, Zimmermann B, Sigurjonsson S, Wayham N, Ryan A, Banjevic M, Lacroute P, Hu J, Hall MP, Demko Z, Siddiqui A, Rabinowitz M, Gross SJ, Hill M, Benn P. Expanding the scope of noninvasive prenatal testing: detection of fetal microdeletion syndromes. Am J Obstet Gynecol. 2015 Mar;212(3):332.e1-9. doi: 10.1016/j.ajog.2014.11.041. Epub 2014 Dec 2.
- Vora NL, O'Brien BM. Noninvasive prenatal testing for microdeletion syndromes and expanded trisomies: proceed with caution. Obstet Gynecol. 2014 May;123(5):1097-1099. doi: 10.1097/AOG.0000000000000237.
- Taglauer ES, Wilkins-Haug L, Bianchi DW. Review: cell-free fetal DNA in the maternal circulation as an indication of placental health and disease. Placenta. 2014 Feb;35 Suppl(Suppl):S64-8. doi: 10.1016/j.placenta.2013.11.014. Epub 2013 Dec 1.
- Knight M, Redman CW, Linton EA, Sargent IL. Shedding of syncytiotrophoblast microvilli into the maternal circulation in pre-eclamptic pregnancies. Br J Obstet Gynaecol. 1998 Jun;105(6):632-40. doi: 10.1111/j.1471-0528.1998.tb10178.x.
- Dar P, Curnow KJ, Gross SJ, Hall MP, Stosic M, Demko Z, Zimmermann B, Hill M, Sigurjonsson S, Ryan A, Banjevic M, Kolacki PL, Koch SW, Strom CM, Rabinowitz M, Benn P. Clinical experience and follow-up with large scale single-nucleotide polymorphism-based noninvasive prenatal aneuploidy testing. Am J Obstet Gynecol. 2014 Nov;211(5):527.e1-527.e17. doi: 10.1016/j.ajog.2014.08.006. Epub 2014 Aug 8.
- Amos-Landgraf JM, Ji Y, Gottlieb W, Depinet T, Wandstrat AE, Cassidy SB, Driscoll DJ, Rogan PK, Schwartz S, Nicholls RD. Chromosome breakage in the Prader-Willi and Angelman syndromes involves recombination between large, transcribed repeats at proximal and distal breakpoints. Am J Hum Genet. 1999 Aug;65(2):370-86. doi: 10.1086/302510.
- Roberts JM, Myatt L, Spong CY, Thom EA, Hauth JC, Leveno KJ, Pearson GD, Wapner RJ, Varner MW, Thorp JM Jr, Mercer BM, Peaceman AM, Ramin SM, Carpenter MW, Samuels P, Sciscione A, Harper M, Smith WJ, Saade G, Sorokin Y, Anderson GB; Eunice Kennedy Shriver National Institute of Child Health and Human Development Maternal-Fetal Medicine Units Network. Vitamins C and E to prevent complications of pregnancy-associated hypertension. N Engl J Med. 2010 Apr 8;362(14):1282-91. doi: 10.1056/NEJMoa0908056.
- Tranquilli AL, Emanuelli M. The thrombophilic fetus. Med Hypotheses. 2006;67(5):1226-9. doi: 10.1016/j.mehy.2006.04.046. Epub 2006 Jul 11.
- Faiz AS, Ananth CV. Etiology and risk factors for placenta previa: an overview and meta-analysis of observational studies. J Matern Fetal Neonatal Med. 2003 Mar;13(3):175-90. doi: 10.1080/jmf.13.3.175.190.
- Dar P, Jacobsson B, MacPherson C, Egbert M, Malone F, Wapner RJ, Roman AS, Khalil A, Faro R, Madankumar R, Edwards L, Haeri S, Silver R, Vohra N, Hyett J, Clunie G, Demko Z, Martin K, Rabinowitz M, Flood K, Carlsson Y, Doulaveris G, Malone C, Hallingstrom M, Klugman S, Clifton R, Kao C, Hakonarson H, Norton ME. Cell-free DNA screening for trisomies 21, 18, and 13 in pregnancies at low and high risk for aneuploidy with genetic confirmation. Am J Obstet Gynecol. 2022 Aug;227(2):259.e1-259.e14. doi: 10.1016/j.ajog.2022.01.019. Epub 2022 Jan 25.
- Dar P, Jacobsson B, Clifton R, Egbert M, Malone F, Wapner RJ, Roman AS, Khalil A, Faro R, Madankumar R, Edwards L, Strong N, Haeri S, Silver R, Vohra N, Hyett J, Demko Z, Martin K, Rabinowitz M, Flood K, Carlsson Y, Doulaveris G, Daly S, Hallingstrom M, MacPherson C, Kao C, Hakonarson H, Norton ME. Cell-free DNA screening for prenatal detection of 22q11.2 deletion syndrome. Am J Obstet Gynecol. 2022 Jul;227(1):79.e1-79.e11. doi: 10.1016/j.ajog.2022.01.002. Epub 2022 Jan 13.
Hjælpsomme links
Datoer for undersøgelser
Disse datoer sporer fremskridtene for indsendelser af undersøgelsesrekord og resumeresultater til ClinicalTrials.gov. Studieregistreringer og rapporterede resultater gennemgås af National Library of Medicine (NLM) for at sikre, at de opfylder specifikke kvalitetskontrolstandarder, før de offentliggøres på den offentlige hjemmeside.
Studer store datoer
Studiestart (Faktiske)
1. april 2015
Primær færdiggørelse (Faktiske)
1. juni 2020
Studieafslutning (Faktiske)
1. juni 2020
Datoer for studieregistrering
Først indsendt
2. marts 2015
Først indsendt, der opfyldte QC-kriterier
2. marts 2015
Først opslået (Skøn)
6. marts 2015
Opdateringer af undersøgelsesjournaler
Sidste opdatering sendt (Faktiske)
29. januar 2021
Sidste opdatering indsendt, der opfyldte kvalitetskontrolkriterier
27. januar 2021
Sidst verificeret
1. januar 2021
Mere information
Begreber relateret til denne undersøgelse
Yderligere relevante MeSH-vilkår
- Patologiske processer
- Hjertesygdomme
- Hjerte-kar-sygdomme
- Sygdomme i centralnervesystemet
- Sygdomme i nervesystemet
- Lymfesygdomme
- Neurologiske manifestationer
- Neuroadfærdsmæssige manifestationer
- Sygdomme i det endokrine system
- Sygdom
- Medfødte abnormiteter
- Overernæring
- Ernæringsforstyrrelser
- Genetiske sygdomme, medfødte
- Muskuloskeletale sygdomme
- Parathyreoidea sygdomme
- Bevægelsesforstyrrelser
- Intellektuel handicap
- Hjertefejl, medfødt
- Kardiovaskulære abnormiteter
- Kraniofaciale abnormiteter
- Muskuloskeletale abnormiteter
- Abnormiteter, multiple
- Fedme
- Kromosomduplikation
- Lymfatiske abnormiteter
- Hypoparathyroidisme
- Syndrom
- Downs syndrom
- Prader-Willi syndrom
- Aneuploidi
- Kromosomlidelser
- Kromosomafvigelser
- Angelman syndrom
- Trisomi
- Trisomi 13 syndrom
- Trisomi 18 syndrom
- Monosomi
- Kønskromosomafvigelser
- DiGeorges syndrom
- 22q11 deletionssyndrom
- Cri-du-Chat syndrom
Andre undersøgelses-id-numre
- 14-024-NPT
Disse oplysninger blev hentet direkte fra webstedet clinicaltrials.gov uden ændringer. Hvis du har nogen anmodninger om at ændre, fjerne eller opdatere dine undersøgelsesoplysninger, bedes du kontakte register@clinicaltrials.gov. Så snart en ændring er implementeret på clinicaltrials.gov, vil denne også blive opdateret automatisk på vores hjemmeside .