SNP-baserad Microdeletion and Aneuploidy RegisterTry (SMART) (SMART)
27 januari 2021 uppdaterad av: Natera, Inc.
SNP-baserad Microdeletion och Aneuploidy RegisterTry
Denna multicenter prospektiva observationsstudie är utformad för att spåra födelseresultat och perinatala korrelationer till Panorama prenatal screeningtest i den allmänna befolkningen bland tiotusen kvinnor som presenterar kliniskt och väljer Panorama mikrodeletion och aneuploidiscreening som en del av sin rutinvård.
Det primära målet är att utvärdera prestandan för singelnukleotidpolymorfism (SNP)-baserad icke-invasiv prenatal testning (NIPT) för 22q11.2
mikrodeletion (DiGeorges syndrom) i denna stora kohort av gravida kvinnor.
Detta kommer att göras genom att utföra en granskning av perinatala journaler och ta bioprover efter födseln för att utföra genetiska diagnostiska tester för 22q11.2
radering.
Resultaten från uppföljningsproverna kommer att jämföras med de som erhölls med Panorama-screeningtestet för att bestämma testprestanda.
Specifika testprestandaparametrar inkluderar: PPV, specificitet och sensitivitet.
Studieöversikt
Status
Avslutad
Detaljerad beskrivning
Det primära målet är att i en prospektiv studie bestämma prestandan för SNP-baserad NIPT för 22q11.2 mikrodeletion (DiGeorges syndrom) i en stor kohort av gravida kvinnor som kliniskt väljer denna form av screening. Specifika testprestandaparametrar inkluderar: positivt prediktivt värde (PPV), specificitet och sensitivitet.
Sekundära mål inkluderar:
- Bestäm testprestandan (PPV, specificitet) för SNP-baserad NIPT för att detektera andra mikrodeletionssyndrom som är tillgängliga i Panorama-mikrodeletionspanelen (t.ex. 1p36-deletion, Cri-du-chat, Prader-Willi och Angelman) individuellt och allt kombinerat (inklusive 22q11) .2). Givet incidensen <1:5000 förväntas konfidensintervallen vara stora.
- Bestäm felfrekvensen ('no call') för nästa generations aneuploiditest med SNPs (NATUS)-metoden för 22q11.2 upptäckt, såväl som för aneuploidi.
- Bestäm om en mer exakt risk för aneuploidi kan genereras vid låg fetal fraktion genom att införliva moderns BMI (justerad fetal fraktion percentil).
- Bedöm om låg fetal fraktion är associerad med specifika ultraljudsfynd som kan indikera aneuploidi (t. triploidi, trisomi 13 och 18).
- Undersök sambandet mellan NIPT och sonografiska (nuckal translucens och anatomiundersökning) markörer och serummarkörer från 1:a och 2:a trimesterns aneuploidiscreening.
- Bestäm sensitivitet, specificitet och PPV för kromosomala aneuploidier och könskromosomavvikelser.
- Utför detaljerad bedömning av falskt positiva aneuploidiprover för att bättre förstå felkällor, inklusive placentastudier för att ytterligare förfina frågor kring mosaicism eftersom NIPT representerar cirkulerande placenta-DNA.
- Undersök eventuella samband mellan cirkulerande placenta-DNA (fosterfraktion) eller andra testparametrar, inklusive potentiella genotypmarkörer, och utfall relaterade till onormal placentation (inklusive men inte begränsat till havandeskapsförgiftning, liten för graviditetsåldern och morbida adherent placenta).
- Undersök andra riskfaktorer som kan påverka riskbedömningen för mikrodeletioner inklusive sonografiska fynd som överensstämmer med 22q11.2 (hjärtavvikelser och tymusstorlek).
Studietyp
Observationell
Inskrivning (Faktisk)
20960
Kontakter och platser
Det här avsnittet innehåller kontaktuppgifter för dem som genomför studien och information om var denna studie genomförs.
Studieorter
-
-
New South Wales
-
Camperdown, New South Wales, Australien, 2050
- Royal Prince Alfred
-
-
-
-
California
-
San Francisco, California, Förenta staterna, 94158
- University of California, San Francisco
-
-
New Jersey
-
Camden, New Jersey, Förenta staterna, 08103
- Cooper University Hospital
-
Mount Laurel, New Jersey, Förenta staterna, 08054
- Virtua
-
New Brunswick, New Jersey, Förenta staterna, 08901
- St. Peter's University
-
-
New York
-
Garden City, New York, Förenta staterna, 11530
- Complete Women's Healthcare
-
Manhasset, New York, Förenta staterna, 11030
- North Shore University Hospital
-
Mineola, New York, Förenta staterna, 11501
- Madonna Perinatal
-
New Hyde Park, New York, Förenta staterna, 11040
- Long Island Jewish Medical Center
-
New York, New York, Förenta staterna, 10032
- Columbia University
-
New York, New York, Förenta staterna, 10016
- New York University
-
New York, New York, Förenta staterna, 10461
- Montefiore Medical Center
-
New York, New York, Förenta staterna, 10029
- Icahn School of Medicine Mt Sinai
-
Port Jefferson, New York, Förenta staterna, 11777
- Suffolk OB
-
-
Texas
-
Austin, Texas, Förenta staterna, 78758
- North Austin Maternal Fetal Medicine
-
Longview, Texas, Förenta staterna, 75601
- Zeid Women's Health Center
-
-
Utah
-
Salt Lake City, Utah, Förenta staterna, 84132
- University of Utah
-
-
-
-
-
Dublin, Irland, 1
- Royal College Surgeons in Ireland
-
-
-
-
-
Barcelona, Spanien, 08028
- Dexeus
-
-
-
-
-
London, Storbritannien, SW17 0QT
- St. George University Hospital
-
-
-
-
-
Gothenburg, Sverige, SE-416 85
- Sahlgrenska University Hospital
-
-
Deltagandekriterier
Forskare letar efter personer som passar en viss beskrivning, så kallade behörighetskriterier. Några exempel på dessa kriterier är en persons allmänna hälsotillstånd eller tidigare behandlingar.
Urvalskriterier
Åldrar som är berättigade till studier
16 år till 46 år (Vuxen)
Tar emot friska volontärer
Nej
Kön som är behöriga för studier
Kvinna
Testmetod
Icke-sannolikhetsprov
Studera befolkning
Gravid kvinna
Beskrivning
Inklusionskriterier:
- Singel graviditet
- Får Panorama prenatalt screeningtest för både mikrodeletioner (minst 22q11.2) och aneuploidi
- Planerad sjukhusförlossning
- Graviditetsålder ≥ 9 veckor, 0 dagar baserat på klinisk information och utvärdering.
- Kan ge informerat samtycke
Exklusions kriterier:
- Fick resultat från Panorama-testet före registreringen
- Organtransplanterad mottagare
- Äggdonator används
Studieplan
Det här avsnittet ger detaljer om studieplanen, inklusive hur studien är utformad och vad studien mäter.
Hur är studien utformad?
Designdetaljer
- Observationsmodeller: Kohort
- Tidsperspektiv: Blivande
Kohorter och interventioner
Grupp / Kohort |
|---|
|
Graviditeter som genomgår prenatal mikrodeletionsscreening
Gravida kvinnor som genomgår icke-invasiv prenatal screening för mikrodeletion och aneuploidisyndrom. Inget läkemedel kommer att administreras, denna kohort kommer att genomgå ett icke-invasivt prenatalt blodprov och sedan följa upp data och prover kommer att samlas in för forskningsanalys. |
Vad mäter studien?
Primära resultatmått
Resultatmått |
Åtgärdsbeskrivning |
Tidsram |
|---|---|---|
|
22q11.2 Snp-baserad icke-invasiv prenatal screeningtestprestanda, inklusive positivt prediktivt värde (PPV), specificitet och sensitivitet
Tidsram: 3 år
|
För att i en prospektiv studie bestämma prestandan för SNP-baserad NIPT för 22q11.2
mikrodeletion (DiGeorges syndrom) i en stor kohort av gravida kvinnor som kliniskt väljer denna form av screening.
|
3 år
|
Sekundära resultatmått
Resultatmått |
Åtgärdsbeskrivning |
Tidsram |
|---|---|---|
|
Prestanda för screeningtest för kombinerat mikrodeletionssyndrom
Tidsram: 3 år
|
Bestäm testprestandan (PPV, specificitet) för SNP-baserad NIPT för att detektera andra mikrodeletionssyndrom som är tillgängliga i Panorama-mikrodeletionspanelen (t.ex. 1p36-deletion, Cri-du-chat, Prader-Willi och Angelman) individuellt och allt kombinerat (inklusive 22q11) .2).
Givet incidensen <1:5000 förväntas konfidensintervallen vara stora.
|
3 år
|
|
Ingen samtalstaxa
Tidsram: 3 år
|
Bestäm felfrekvensen ('no call') för NATUS-metoden för 22q11.2
upptäckt, såväl som för aneuploidi.
|
3 år
|
|
Låg fetal fraktion aneuploidi risk förfining
Tidsram: 3 år
|
Bestäm om en mer exakt risk för aneuploidi kan genereras vid låg fetal fraktion genom att införliva moderns BMI (justerad fetal fraktion percentil), eller om låg fetal fraktion är associerad med specifika ultraljudsfynd som kan indikera aneuploidi (t.
triploidi, trisomi 13 och 18).
|
3 år
|
|
Utforskning av placentamosaicism
Tidsram: 3 år
|
Utför detaljerad bedömning av falskt positiva aneuploidiprover för att bättre förstå felkällor, inklusive placentastudier för att ytterligare förfina frågor kring mosaicism eftersom NIPT representerar cirkulerande placenta-DNA.
|
3 år
|
|
Utforskning av placentakomplikationer
Tidsram: 3 år
|
Undersök eventuella samband mellan cirkulerande placenta-DNA (fosterfraktion) eller andra testparametrar, inklusive potentiella genotypmarkörer, och utfall relaterade till onormal placentation (inklusive men inte begränsat till havandeskapsförgiftning, liten för graviditetsåldern och morbida adherent placenta).
|
3 år
|
Samarbetspartners och utredare
Det är här du hittar personer och organisationer som är involverade i denna studie.
Sponsor
Samarbetspartners
Utredare
- Huvudutredare: Mary Norton, MD, University of California, San Francisco
- Huvudutredare: Peer Dar, MD, Montefiore Medical Center
Publikationer och användbara länkar
Den som ansvarar för att lägga in information om studien tillhandahåller frivilligt dessa publikationer. Dessa kan handla om allt som har med studien att göra.
Allmänna publikationer
- Palomaki GE, Deciu C, Kloza EM, Lambert-Messerlian GM, Haddow JE, Neveux LM, Ehrich M, van den Boom D, Bombard AT, Grody WW, Nelson SF, Canick JA. DNA sequencing of maternal plasma reliably identifies trisomy 18 and trisomy 13 as well as Down syndrome: an international collaborative study. Genet Med. 2012 Mar;14(3):296-305. doi: 10.1038/gim.2011.73. Epub 2012 Feb 2.
- Palomaki GE, Kloza EM, Lambert-Messerlian GM, Haddow JE, Neveux LM, Ehrich M, van den Boom D, Bombard AT, Deciu C, Grody WW, Nelson SF, Canick JA. DNA sequencing of maternal plasma to detect Down syndrome: an international clinical validation study. Genet Med. 2011 Nov;13(11):913-20. doi: 10.1097/GIM.0b013e3182368a0e.
- American College of Obstetricians and Gynecologists Committee on Genetics. Committee Opinion No. 581: the use of chromosomal microarray analysis in prenatal diagnosis. Obstet Gynecol. 2013 Dec;122(6):1374-7. doi: 10.1097/01.AOG.0000438962.16108.d1.
- Pergament E, Cuckle H, Zimmermann B, Banjevic M, Sigurjonsson S, Ryan A, Hall MP, Dodd M, Lacroute P, Stosic M, Chopra N, Hunkapiller N, Prosen DE, McAdoo S, Demko Z, Siddiqui A, Hill M, Rabinowitz M. Single-nucleotide polymorphism-based noninvasive prenatal screening in a high-risk and low-risk cohort. Obstet Gynecol. 2014 Aug;124(2 Pt 1):210-218. doi: 10.1097/AOG.0000000000000363.
- Ehrich M, Deciu C, Zwiefelhofer T, Tynan JA, Cagasan L, Tim R, Lu V, McCullough R, McCarthy E, Nygren AO, Dean J, Tang L, Hutchison D, Lu T, Wang H, Angkachatchai V, Oeth P, Cantor CR, Bombard A, van den Boom D. Noninvasive detection of fetal trisomy 21 by sequencing of DNA in maternal blood: a study in a clinical setting. Am J Obstet Gynecol. 2011 Mar;204(3):205.e1-11. doi: 10.1016/j.ajog.2010.12.060. Epub 2011 Feb 18.
- Sehnert AJ, Rhees B, Comstock D, de Feo E, Heilek G, Burke J, Rava RP. Optimal detection of fetal chromosomal abnormalities by massively parallel DNA sequencing of cell-free fetal DNA from maternal blood. Clin Chem. 2011 Jul;57(7):1042-9. doi: 10.1373/clinchem.2011.165910. Epub 2011 Apr 25.
- Benn P, Cuckle H, Pergament E. Genome-wide fetal aneuploidy detection by maternal plasma DNA sequencing. Obstet Gynecol. 2012 Jun;119(6):1270; author reply 1270-1. doi: 10.1097/AOG.0b013e318258c401. No abstract available.
- Sparks AB, Struble CA, Wang ET, Song K, Oliphant A. Noninvasive prenatal detection and selective analysis of cell-free DNA obtained from maternal blood: evaluation for trisomy 21 and trisomy 18. Am J Obstet Gynecol. 2012 Apr;206(4):319.e1-9. doi: 10.1016/j.ajog.2012.01.030. Epub 2012 Jan 26.
- Norton ME, Brar H, Weiss J, Karimi A, Laurent LC, Caughey AB, Rodriguez MH, Williams J 3rd, Mitchell ME, Adair CD, Lee H, Jacobsson B, Tomlinson MW, Oepkes D, Hollemon D, Sparks AB, Oliphant A, Song K. Non-Invasive Chromosomal Evaluation (NICE) Study: results of a multicenter prospective cohort study for detection of fetal trisomy 21 and trisomy 18. Am J Obstet Gynecol. 2012 Aug;207(2):137.e1-8. doi: 10.1016/j.ajog.2012.05.021. Epub 2012 Jun 1.
- Nicolaides KH, Syngelaki A, Gil M, Atanasova V, Markova D. Validation of targeted sequencing of single-nucleotide polymorphisms for non-invasive prenatal detection of aneuploidy of chromosomes 13, 18, 21, X, and Y. Prenat Diagn. 2013 Jun;33(6):575-9. doi: 10.1002/pd.4103. Epub 2013 Apr 24.
- Nicolaides KH, Syngelaki A, del Mar Gil M, Quezada MS, Zinevich Y. Prenatal detection of fetal triploidy from cell-free DNA testing in maternal blood. Fetal Diagn Ther. 2014;35(3):212-7. doi: 10.1159/000355655. Epub 2013 Oct 10.
- Samango-Sprouse C, Banjevic M, Ryan A, Sigurjonsson S, Zimmermann B, Hill M, Hall MP, Westemeyer M, Saucier J, Demko Z, Rabinowitz M. SNP-based non-invasive prenatal testing detects sex chromosome aneuploidies with high accuracy. Prenat Diagn. 2013 Jul;33(7):643-9. doi: 10.1002/pd.4159. Epub 2013 Jun 20.
- Wapner RJ, Martin CL, Levy B, Ballif BC, Eng CM, Zachary JM, Savage M, Platt LD, Saltzman D, Grobman WA, Klugman S, Scholl T, Simpson JL, McCall K, Aggarwal VS, Bunke B, Nahum O, Patel A, Lamb AN, Thom EA, Beaudet AL, Ledbetter DH, Shaffer LG, Jackson L. Chromosomal microarray versus karyotyping for prenatal diagnosis. N Engl J Med. 2012 Dec 6;367(23):2175-84. doi: 10.1056/NEJMoa1203382.
- Wapner RJ, Babiarz JE, Levy B, Stosic M, Zimmermann B, Sigurjonsson S, Wayham N, Ryan A, Banjevic M, Lacroute P, Hu J, Hall MP, Demko Z, Siddiqui A, Rabinowitz M, Gross SJ, Hill M, Benn P. Expanding the scope of noninvasive prenatal testing: detection of fetal microdeletion syndromes. Am J Obstet Gynecol. 2015 Mar;212(3):332.e1-9. doi: 10.1016/j.ajog.2014.11.041. Epub 2014 Dec 2.
- Vora NL, O'Brien BM. Noninvasive prenatal testing for microdeletion syndromes and expanded trisomies: proceed with caution. Obstet Gynecol. 2014 May;123(5):1097-1099. doi: 10.1097/AOG.0000000000000237.
- Taglauer ES, Wilkins-Haug L, Bianchi DW. Review: cell-free fetal DNA in the maternal circulation as an indication of placental health and disease. Placenta. 2014 Feb;35 Suppl(Suppl):S64-8. doi: 10.1016/j.placenta.2013.11.014. Epub 2013 Dec 1.
- Knight M, Redman CW, Linton EA, Sargent IL. Shedding of syncytiotrophoblast microvilli into the maternal circulation in pre-eclamptic pregnancies. Br J Obstet Gynaecol. 1998 Jun;105(6):632-40. doi: 10.1111/j.1471-0528.1998.tb10178.x.
- Dar P, Curnow KJ, Gross SJ, Hall MP, Stosic M, Demko Z, Zimmermann B, Hill M, Sigurjonsson S, Ryan A, Banjevic M, Kolacki PL, Koch SW, Strom CM, Rabinowitz M, Benn P. Clinical experience and follow-up with large scale single-nucleotide polymorphism-based noninvasive prenatal aneuploidy testing. Am J Obstet Gynecol. 2014 Nov;211(5):527.e1-527.e17. doi: 10.1016/j.ajog.2014.08.006. Epub 2014 Aug 8.
- Amos-Landgraf JM, Ji Y, Gottlieb W, Depinet T, Wandstrat AE, Cassidy SB, Driscoll DJ, Rogan PK, Schwartz S, Nicholls RD. Chromosome breakage in the Prader-Willi and Angelman syndromes involves recombination between large, transcribed repeats at proximal and distal breakpoints. Am J Hum Genet. 1999 Aug;65(2):370-86. doi: 10.1086/302510.
- Roberts JM, Myatt L, Spong CY, Thom EA, Hauth JC, Leveno KJ, Pearson GD, Wapner RJ, Varner MW, Thorp JM Jr, Mercer BM, Peaceman AM, Ramin SM, Carpenter MW, Samuels P, Sciscione A, Harper M, Smith WJ, Saade G, Sorokin Y, Anderson GB; Eunice Kennedy Shriver National Institute of Child Health and Human Development Maternal-Fetal Medicine Units Network. Vitamins C and E to prevent complications of pregnancy-associated hypertension. N Engl J Med. 2010 Apr 8;362(14):1282-91. doi: 10.1056/NEJMoa0908056.
- Tranquilli AL, Emanuelli M. The thrombophilic fetus. Med Hypotheses. 2006;67(5):1226-9. doi: 10.1016/j.mehy.2006.04.046. Epub 2006 Jul 11.
- Faiz AS, Ananth CV. Etiology and risk factors for placenta previa: an overview and meta-analysis of observational studies. J Matern Fetal Neonatal Med. 2003 Mar;13(3):175-90. doi: 10.1080/jmf.13.3.175.190.
- Dar P, Jacobsson B, MacPherson C, Egbert M, Malone F, Wapner RJ, Roman AS, Khalil A, Faro R, Madankumar R, Edwards L, Haeri S, Silver R, Vohra N, Hyett J, Clunie G, Demko Z, Martin K, Rabinowitz M, Flood K, Carlsson Y, Doulaveris G, Malone C, Hallingstrom M, Klugman S, Clifton R, Kao C, Hakonarson H, Norton ME. Cell-free DNA screening for trisomies 21, 18, and 13 in pregnancies at low and high risk for aneuploidy with genetic confirmation. Am J Obstet Gynecol. 2022 Aug;227(2):259.e1-259.e14. doi: 10.1016/j.ajog.2022.01.019. Epub 2022 Jan 25.
- Dar P, Jacobsson B, Clifton R, Egbert M, Malone F, Wapner RJ, Roman AS, Khalil A, Faro R, Madankumar R, Edwards L, Strong N, Haeri S, Silver R, Vohra N, Hyett J, Demko Z, Martin K, Rabinowitz M, Flood K, Carlsson Y, Doulaveris G, Daly S, Hallingstrom M, MacPherson C, Kao C, Hakonarson H, Norton ME. Cell-free DNA screening for prenatal detection of 22q11.2 deletion syndrome. Am J Obstet Gynecol. 2022 Jul;227(1):79.e1-79.e11. doi: 10.1016/j.ajog.2022.01.002. Epub 2022 Jan 13.
Användbara länkar
Studieavstämningsdatum
Dessa datum spårar framstegen för inlämningar av studieposter och sammanfattande resultat till ClinicalTrials.gov. Studieposter och rapporterade resultat granskas av National Library of Medicine (NLM) för att säkerställa att de uppfyller specifika kvalitetskontrollstandarder innan de publiceras på den offentliga webbplatsen.
Studera stora datum
Studiestart (Faktisk)
1 april 2015
Primärt slutförande (Faktisk)
1 juni 2020
Avslutad studie (Faktisk)
1 juni 2020
Studieregistreringsdatum
Först inskickad
2 mars 2015
Först inskickad som uppfyllde QC-kriterierna
2 mars 2015
Första postat (Uppskatta)
6 mars 2015
Uppdateringar av studier
Senaste uppdatering publicerad (Faktisk)
29 januari 2021
Senaste inskickade uppdateringen som uppfyllde QC-kriterierna
27 januari 2021
Senast verifierad
1 januari 2021
Mer information
Termer relaterade till denna studie
Ytterligare relevanta MeSH-villkor
- Patologiska processer
- Hjärtsjukdom
- Hjärt-kärlsjukdomar
- Sjukdomar i centrala nervsystemet
- Sjukdomar i nervsystemet
- Lymfatiska sjukdomar
- Neurologiska manifestationer
- Neurobehavioral manifestationer
- Sjukdomar i det endokrina systemet
- Sjukdom
- Medfödda abnormiteter
- Övernäring
- Näringsstörningar
- Genetiska sjukdomar, medfödda
- Muskuloskeletala sjukdomar
- Paratyreoidea sjukdomar
- Rörelsestörningar
- Intellektuell funktionsnedsättning
- Hjärtfel, medfödda
- Kardiovaskulära avvikelser
- Kraniofaciala abnormiteter
- Muskuloskeletala abnormiteter
- Avvikelser, flera
- Fetma
- Kromosomduplicering
- Lymfatiska abnormiteter
- Hypoparatyreos
- Syndrom
- Downs syndrom
- Prader-Willis syndrom
- Aneuploidi
- Kromosomstörningar
- Kromosomavvikelser
- Angelmans syndrom
- Trisomi
- Trisomi 13 syndrom
- Trisomi 18 syndrom
- Monosomi
- Sexkromosomavvikelser
- DiGeorges syndrom
- 22q11 deletionssyndrom
- Cri-du-Chat syndrom
Andra studie-ID-nummer
- 14-024-NPT
Denna information hämtades direkt från webbplatsen clinicaltrials.gov utan några ändringar. Om du har några önskemål om att ändra, ta bort eller uppdatera dina studieuppgifter, vänligen kontakta register@clinicaltrials.gov. Så snart en ändring har implementerats på clinicaltrials.gov, kommer denna att uppdateras automatiskt även på vår webbplats .
Kliniska prövningar på Prader-Willis syndrom
-
University of FloridaNational Institutes of Health (NIH)Avslutad
-
Samsung Medical CenterAvslutadFetma | Prader Willi syndrom
-
Duke UniversityCanadian Institutes of Health Research (CIHR); National Institutes of Health... och andra samarbetspartnersAvslutad
-
Samsung Medical CenterAvslutadFetma | Prader Willi syndrom
-
University Hospital, ToulouseAvslutadPrader Willi syndromFrankrike
-
University of FloridaFoundation for Prader-Willi ResearchAvslutad
-
University Hospital, ToulouseAvslutadPrader Willi syndromFrankrike
-
California State University, FullertonUniversity of FloridaOkändBarnfetma | Prader Willi syndromFörenta staterna
-
Duke UniversityFoundation for Prader-Willi ResearchAvslutadBarnfetma | Prader Willi syndrom | Syndromisk fetmaFörenta staterna, Kanada