Kutan mastocytose hos børn: Analyse af somatiske og kimlinjemutationer

Urticaria pigmentosa (UP) er en relativt almindelig lidelse hos pædiatriske patienter, og man ved kun lidt om de somatiske og kimlinie-genetiske varianter forbundet med sygdommen. University of Minnesota Masonic Children's Hospital er et regionalt henvisningscenter for pædiatriske patienter med mastcellelidelser. Samarbejdspartnere på denne undersøgelse omfatter flere universitetsafdelinger, herunder: Pædiatrisk Dermatologi, Pædiatrisk Onkologi, Biomedicinsk Genomics-program, Lab Medicin og Patologiafdeling. Vi antager, at på grund af forskelle observeret i den kliniske adfærd af pædiatrisk og voksendebut mastcellesygdom, specifikt UP, vil vi identificere nye somatiske genvarianter ud over c-KIT. Vi antager yderligere, at vi vil observere nye genetiske kimlinievarianter i pædiatrisk UP adskilt fra det, der tidligere er blevet beskrevet hos voksne.

Specifikke mål inkluderer følgende:

Specifikt mål 1: RNA-sekventering til genekspression og mutationsanalyse. Ved at bruge RNA-sekventering (RNA-Seq) vil vi udføre parret læsionel og perifer blodsekventering i UP-tilfælde for at identificere variation i genekspression og definere nye somatiske mutationer forbundet med pædiatrisk UP.

Specifikt mål 2: Udforskning af kimlinjerisiko. Ved at bruge single nucleotide polymorphism (SNP) array vil vi udføre koblingsanalyse i UP-tilfælde og deres upåvirkede familiemedlemmer for at identificere genetiske varianter af kimlinie forbundet med UP.

1. Uoverensstemmende søskendeanalyse: Børn med UP og deres upåvirkede søskende vil blive sammenlignet for at identificere kimlinievarianter.
2. Identiske tvillinger og forældreanalyse: Enæggede tvillinger med en alvorlig UP-fænotype vil blive sammenlignet med deres upåvirkede forældre.