Kutan mastocytose hos barn: Analyse av somatiske og kimlinjemutasjoner

Urticaria pigmentosa (UP) er en relativt vanlig lidelse hos pediatriske pasienter, og lite er kjent om de somatiske og kimlinjegenetiske variantene forbundet med sykdommen. University of Minnesota Masonic Children's Hospital er et regionalt henvisningssenter for pediatriske pasienter med mastcelleforstyrrelser. Samarbeidspartnere på denne studien inkluderer flere universitetsavdelinger, inkludert: Pediatrisk dermatologi, Pediatrisk onkologi, Biomedical Genomics-programmet, laboratoriemedisin og patologiavdeling. Vi antar at på grunn av forskjeller observert i den kliniske oppførselen til pediatrisk og voksendebut av mastcellesykdom, spesielt UP, vil vi identifisere nye somatiske genvarianter i tillegg til c-KIT. Vi antar videre at vi vil observere nye kimlinjegenetiske varianter i pediatrisk UP som er forskjellige fra det som tidligere er beskrevet hos voksne.

Spesifikke mål inkluderer følgende:

Spesifikt mål 1: RNA-sekvensering for genekspresjon og mutasjonsanalyse. Ved å bruke RNA-sekvensering (RNA-Seq), vil vi utføre paret lesjons- og perifer blodsekvensering i UP-tilfeller for å identifisere variasjon i genuttrykk og definere nye somatiske mutasjoner assosiert med pediatrisk UP.

Spesifikt mål 2: Utforskning av kimlinjerisiko. Ved å bruke single nucleotide polymorphism (SNP) array, vil vi utføre koblingsanalyse i UP-tilfeller og deres upåvirkede familiemedlemmer for å identifisere genetiske varianter knyttet til UP.

1. Uoverensstemmende søskenanalyse: Barn med UP og deres upåvirkede søsken vil bli sammenlignet for å identifisere kimlinjevarianter.
2. Identisk tvilling- og foreldreanalyse: Identiske tvillinger med en alvorlig UP-fenotype vil bli sammenlignet med deres upåvirkede foreldre.