Kutan mastocytos hos barn: analys av somatiska mutationer och könslinjemutationer

Urticaria pigmentosa (UP) är en relativt vanlig sjukdom hos pediatriska patienter, och lite är känt om de somatiska och könscellsgenetiska varianterna som är förknippade med sjukdomen. University of Minnesota Masonic Children's Hospital är ett regionalt remisscenter för pediatriska patienter med mastcellstörningar. Samarbetspartners i denna studie inkluderar flera universitetsavdelningar inklusive: Pediatric Dermatology, Pediatric Oncology, Biomedical Genomics-programmet, Lab Medicine and Pathology Department. Vi antar att på grund av skillnader som observerats i det kliniska beteendet hos pediatrisk och vuxen-debut mastcellsjukdom, specifikt UP, kommer vi att identifiera nya somatiska genvarianter utöver c-KIT. Vi antar vidare att vi kommer att observera nya genetiska varianter av könsceller i pediatrisk UP som skiljer sig från vad som tidigare har beskrivits hos vuxna.

Specifika mål inkluderar följande:

Specifikt mål 1: RNA-sekvensering för genuttryck och mutationsanalys. Genom att använda RNA-sekvensering (RNA-Seq), kommer vi att utföra parad lesional och perifer blodsekvensering i UP-fall för att identifiera variation i genuttryck och definiera nya somatiska mutationer associerade med pediatrisk UP.

Specifikt mål 2: Utforskning av könslinjerisk. Genom att använda singelnukleotidpolymorfism (SNP) array kommer vi att utföra länkanalys i UP-fall och deras opåverkade familjemedlemmar för att identifiera genetiska varianter av könsceller associerade med UP.

1. Diskordant syskonanalys: Barn med UP och deras opåverkade syskon kommer att jämföras för att identifiera könslinjevarianter.
2. Analys av enäggstvillingar och förälder: Enäggstvillingar med en allvarlig UP-fenotyp kommer att jämföras med sina opåverkade föräldrar.