Karakterisering af tarmmikrobiomets udvikling efter nyretransplantation donation eller modtagelse (COMET-DR)
Dette er et hypotese-genererende pilotstudie. Hensigten er at modellere virkningen af perioperativ praksis på tarmmikrobiomet og muligvis forbinde disse tilstande med den endelige mikrobiomstatus (f.eks. antal resistensgener og diversitet forbundet med perioperativ praksis og præoperativ mikrobiomstatus). Deltagerne vil omfatte personer, der skal opereres for enten at modtage eller donere en nyre. For at bestemme diversitetsændringen af tarmmikrobiotaen over tid, vil rektale podninger blive indsamlet før operationen og på flere tidspunkter efter operationen, med den sidste podning indsamlet 30 dage efter operationen.
Denne pilotundersøgelse skal indhente foreløbige data til støtte for begrundelsen og designet til et efterfølgende klinisk forsøg. Denne undersøgelse er designet til at forstå den intestinale mikrobiota-diversitet i forbindelse med nyretransplantationskirurgi og den kliniske betydning af antibiotikabrug og det tilhørende resistom (indsamling af alle antibiotikaresistensgener og -prækursorer i en prøve).
Studieoversigt
Status
Betingelser
Detaljeret beskrivelse
Fremkomsten af multidrug-resistente organismer (MDRO'er) er en voksende trussel mod den globale folkesundhed og er forbundet med høj morbiditet og dødelighed i både den generelle og solide organtransplantationspopulation. Intestinal mikrobiota-diversitet kan give funktionelle og rumlige barrierer for bakteriel og svampe-MDRO-kolonisering, og tab af diversitet er forbundet med øget MDRO-kolonisering. Dysbiose er en tilstand af tab af mikrobiotadiversitet, og et enkelt antibiotikabehandlingsforløb kan forårsage betydelige forstyrrelser i mikrobiotadiversiteten, selv hos ellers raske individer. Denne forstyrrelse kan fremme væksten af patogene og multiresistente bakterier og svampe. Især transplantationspatienter har øget risiko for kolonisering og infektion med MDRO på grund af immunmodulerende terapier, sundhedseksponering, øget antibiotikaeksponering og kirurgisk manipulation af slimhinden. Desuden har kronisk nyresygdom og dialysebehandling, der fører op til transplantation, vist sig at være forbundet med ændringer i både det intestinale og parodontale mikrobiom. Forståelse af udviklingen af forstyrrelsen i tarmmikrobiomet hos både nyretransplanterede og raske nyretransplantationsdonorer i løbet af transplantationskirurgisk profylakse vil give værdifuld indsigt i yderligere muligheder for forskning og mulige indgreb, der kan mindske risikoen for MDRO-kolonisering.
Dette er en prospektiv, observationel og ikke-interventionel pilotundersøgelse, som sigter mod at indskrive 100 voksne nyretransplanterede modtagere og 100 voksne nyretransplantationsdonorer. Deltagerne vil give afføringsprøver og analpodningsprøver og udfylde kostspørgeskemaer. Deltagerne kan også vælge at deltage i et valgfrit delstudie, som involverer bankrester til fremtidig forskningsbrug.
Diversitetsændringen af tarmmikrobiotaen over tid vil blive vurderet ved screeningsbesøget, postoperativ dag 2; Dag 15 efter udskrivelsen og dag 30 efter udskrivelsen. Deltagerne vil blive fulgt ved journalgennemgang i 24 uger efter operationen.
Denne undersøgelse er designet til at forstå den intestinale mikrobiota-diversitet i forbindelse med nyretransplantationskirurgi og den kliniske betydning af antibiotikabrug og det tilhørende resistom (indsamling af alle antibiotikaresistensgener og -prækursorer i en prøve). Information lært fra denne undersøgelse vil blive brugt til at vejlede udformningen af fremtidige kliniske forsøg.
Undersøgelsestype
Tilmelding (Faktiske)
Kontakter og lokationer
Studiesteder
-
-
Georgia
-
Atlanta, Georgia, Forenede Stater, 30322
- The Emory Clinic
-
Atlanta, Georgia, Forenede Stater, 30324
- Emory University Hospital
-
-
Deltagelseskriterier
Berettigelseskriterier
Aldre berettiget til at studere
Tager imod sunde frivillige
Prøveudtagningsmetode
Studiebefolkning
Beskrivelse
Inklusionskriterier:
- Evne til at forstå og villighed til at underskrive et skriftligt informeret samtykkedokument.
- Evne og vilje til at overholde studieprotokolkrav.
- Udfyldt Verbal Screening Form
- Planlagt nyredonation eller planlagt modtagelse af en levende donor nyretransplantation inden for 28 dage fra tidspunktet for skriftligt informeret samtykke.
Hvis præstationsstatus er kendt, en score på et af følgende:
- American Society of Anesthesia (ASA) klassificering af I (en normal sund patient), II (en patient med mild systemisk sygdom) eller III (en patient med alvorlig systemisk sygdom)
- Eastern Cooperative Oncology Group (ECOG) Status Skalagrad på 0 (normal aktivitet), 1 (symptomer, men ambulerende) eller 2 (i seng <50 % af tiden)
- Karnofsky Performance Scale (KPS) på 50 % (kræver betydelig assistance og hyppig lægebehandling) til 100 % (normalt, ingen klager, ingen tegn på sygdom)
- Engelsktalende.
Ekskluderingskriterier:
Enhver tilstand, der efter investigatorens mening kan forstyrre undersøgelsens mål eller begrænse overholdelse af undersøgelseskravene, herunder men ikke begrænset til:
- Kendt aktivt intravenøst stof- eller alkoholmisbrug
- Psykiatrisk sygdom
- Social situation
- Planlagt eller faktisk modtagelse af en afdød donor nyretransplantation.
- Tidligere nyretransplantation, der stadig kræver aktiv immunsuppressiv behandling eller intervention.
- Tilstedeværelse af omdirigerende ileostomi eller kolostomi.
Studieplan
Hvordan er undersøgelsen tilrettelagt?
Design detaljer
- Observationsmodeller: Andet
- Tidsperspektiver: Fremadrettet
Kohorter og interventioner
Gruppe / kohorte |
Intervention / Behandling |
|---|---|
|
Nyretransplanteret modtager
Deltagere, der er planlagt til en planlagt nyretransplantation som modtager af nyren. Alle deltagere vil gennemføre følgende interventioner:
|
Deltagerne vil give en afføringsprøve ved baseline (før operation) og 30 dage efter transplantationsoperationen.
Afføringsprøver afhentes selv af deltageren.
Anale podninger vil blive indsamlet før operationen (baseline) og på dag 2, 15 og 30 efter operationen.
Deltagere, hvis planlagte indlæggelsesvarighed er forlænget fra den prækirurgiske plan, vil få en ekstra, valgfri, anal podning indsamlet 2 dage før deres forventede udskrivelsesdato.
Anale podninger vil blive indsamlet af undersøgelsesholdet, bortset fra standardbehandlingen efter operationen (30 dage efter operationen) for de levende donorer, som vil indsamle deres egne prøver.
Studiekoordinatoren vil administrere Short Diet Assessment (SDA) til deltagerne før operationen ved baseline og post-operation dag 2, 15 og 30.
Deltagere, hvis planlagte hospitalsophold forlænges fra den prækirurgiske plan, vil udfylde spørgeskemaet 2 dage før deres forventede hospitalsudskrivningsdato.
National Health and Nutrition Examination Survey (NHANES) 2009-2010 Dietary Screener Spørgeskema vil blive udfyldt på post-operativ dag 2. Spørgeskemaet spørger om fødevarer indtaget i løbet af de sidste 30 dage.
Der er 25 punkter på spørgeskemaet, og yderligere spørgsmål kan blive stillet afhængigt af svarene.
Spørgeskemaet bliver selvadministreret eller administreret af et studieteammedlem.
|
|
Nyretransplantationsdonor
Deltagere, der er planlagt til en planlagt nyretransplantation som donor af nyren. Alle deltagere vil gennemføre følgende interventioner:
|
Deltagerne vil give en afføringsprøve ved baseline (før operation) og 30 dage efter transplantationsoperationen.
Afføringsprøver afhentes selv af deltageren.
Anale podninger vil blive indsamlet før operationen (baseline) og på dag 2, 15 og 30 efter operationen.
Deltagere, hvis planlagte indlæggelsesvarighed er forlænget fra den prækirurgiske plan, vil få en ekstra, valgfri, anal podning indsamlet 2 dage før deres forventede udskrivelsesdato.
Anale podninger vil blive indsamlet af undersøgelsesholdet, bortset fra standardbehandlingen efter operationen (30 dage efter operationen) for de levende donorer, som vil indsamle deres egne prøver.
Studiekoordinatoren vil administrere Short Diet Assessment (SDA) til deltagerne før operationen ved baseline og post-operation dag 2, 15 og 30.
Deltagere, hvis planlagte hospitalsophold forlænges fra den prækirurgiske plan, vil udfylde spørgeskemaet 2 dage før deres forventede hospitalsudskrivningsdato.
National Health and Nutrition Examination Survey (NHANES) 2009-2010 Dietary Screener Spørgeskema vil blive udfyldt på post-operativ dag 2. Spørgeskemaet spørger om fødevarer indtaget i løbet af de sidste 30 dage.
Der er 25 punkter på spørgeskemaet, og yderligere spørgsmål kan blive stillet afhængigt af svarene.
Spørgeskemaet bliver selvadministreret eller administreret af et studieteammedlem.
|
Hvad måler undersøgelsen?
Primære resultatmål
Resultatmål |
Foranstaltningsbeskrivelse |
Tidsramme |
|---|---|---|
|
Ændring i mikrobiotasammensætning
Tidsramme: Baseline til postoperativ dag 30
|
For at forstå den overordnede indvirkning af kirurgisk profylakse på intestinal mikrobiotasammensætning i forbindelse med nyretransplantationskirurgi, vil fordelingen og den relative mængde af bakterie- og svampetaxa for hver indsamlet prøve blive beskrevet.
En slægt af stamme vil blive betragtet som dominerende, hvis den repræsenterer mindst 30 % af alle slægter eller stammer af mikrobiota i afføringsprøven.
|
Baseline til postoperativ dag 30
|
|
Ændring i mikrobiota diversitet
Tidsramme: Baseline til postoperativ dag 30
|
For at forstå den overordnede indvirkning af kirurgisk profylakse på intestinal mikrobiota-diversitet i forbindelse med nyretransplantationskirurgi, vil mål for α- og β-diversitet af tarmmikrobiotaen blive brugt.
Den maksimale procentdel af alle identificerede gener inkluderet i samme taxon vil blive bestemt fra hver afføringsprøve.
|
Baseline til postoperativ dag 30
|
|
Ændring i mikrobiota taksonomi
Tidsramme: Baseline til postoperativ dag 30
|
For at forstå den overordnede indvirkning af kirurgisk profylakse på tarmmikrobiota-taksonomi, i forbindelse med nyretransplantationskirurgi, vil de indsamlede prøver blive brugt til taksonomisk sammensætningsbestemmelse af bakterier og svampe.
Metagenomisk sekventering af hele genomet af haglgevær vil blive udført på en Illumina Miseq (eller HiSeq).
En kort læsemapper vil blive brugt til at screene ud og kassere humane sekvenser fra hver afføringsprøve, og efterfølgende bruges Metaphlan og KRAKEN til bestemmelse af taksonomisk sammensætning.
|
Baseline til postoperativ dag 30
|
|
Ændring i mikrobiota-resistom
Tidsramme: Baseline til postoperativ dag 30
|
For at forstå den overordnede indvirkning af kirurgisk profylakse på tarmmikrobiota-resistens, i forbindelse med nyretransplantationskirurgi, vil de indsamlede undersøgelsesprøver blive brugt til at give en oversigt over det samlede antal og mangfoldighed af bakterie- og svamperesistensgener, inklusive enhver nyerhvervelse.
|
Baseline til postoperativ dag 30
|
Sekundære resultatmål
Resultatmål |
Foranstaltningsbeskrivelse |
Tidsramme |
|---|---|---|
|
Mikrobiotasammensætning hos nyredialysepatienter
Tidsramme: Baseline
|
For at forstå den intestinale mikrobiotasammensætning hos patienter, der modtager nyredialyse, vil fordelingen og den relative mængde af bakterie- og svampetaxa for hver indsamlet prøve blive beskrevet.
En stammeslægt vil blive betragtet som dominerende, hvis den repræsenterer mindst 30 % af alle slægter eller stammer af mikrobiota i afføringsprøven indsamlet ved baseline (før nyretransplantation).
|
Baseline
|
|
Mikrobiotadiversitet hos nyredialysepatienter
Tidsramme: Baseline
|
For at forstå tarmmikrobiotaens alfa- og beta-diversitet hos patienter, der modtager nyredialyse, vil den maksimale procentdel af alle identificerede gener, der er inkluderet i samme taxon, blive bestemt ud fra undersøgelsesprøverne indsamlet ved baseline (før nyretransplantation).
|
Baseline
|
|
Mikrobiota-resistom hos nyredialysepatienter
Tidsramme: Baseline
|
For at forstå den intestinale mikrobiota-resistens hos patienter, der modtager nyredialyse, vil undersøgelsesprøverne indsamlet ved baseline (før nyretransplantation) blive brugt til at give en oversigt over det samlede antal og mangfoldighed af bakterielle resistensgener.
|
Baseline
|
Andre resultatmål
Resultatmål |
Foranstaltningsbeskrivelse |
Tidsramme |
|---|---|---|
|
Sammenlign mikrobiotasammensætning af donorer og modtagere
Tidsramme: Baseline
|
Det eksplorative formål med denne undersøgelse er at karakterisere lighederne og forskellene i tarmmikrobiota mellem levende donor og modtagere på baselinetidspunktet.
Fordelingen og den relative mængde af bakterie- og svampetaxa for hver basislinjeprøve (før nyretransplantation) vil blive beskrevet.
En slægt af stamme vil blive betragtet som dominerende, hvis den repræsenterer mindst 30 % af alle slægter eller stammer af mikrobiota i afføringsprøven.
|
Baseline
|
|
Sammenlign mikrobiota-diversiteten af donorer og modtagere
Tidsramme: Baseline
|
Det eksplorative formål med denne undersøgelse er at karakterisere lighederne og forskellene i tarmmikrobiota mellem levende donor og modtagere på baselinetidspunktet.
Den maksimale procentdel af alle identificerede gener, der er inkluderet i samme taxon, vil blive bestemt ud fra hver afføringsprøve indsamlet før nyretransplantation.
|
Baseline
|
|
Sammenlign mikrobiotataksonomi for donorer og modtagere
Tidsramme: Baseline
|
Det eksplorative formål med denne undersøgelse er at karakterisere lighederne og forskellene i tarmmikrobiota mellem levende donor og modtagere på baselinetidspunktet.
De indsamlede undersøgelsesprøver vil blive brugt til taksonomisk sammensætningsbestemmelse af bakterier og svampe.
Metagenomisk sekventering af hele genomet af haglgevær vil blive udført på en Illumina Miseq (eller HiSeq).
En kort læsemapper vil blive brugt til at screene ud og kassere humane sekvenser fra hver afføringsprøve, og efterfølgende bruges Metaphlan og KRAKEN til bestemmelse af taksonomisk sammensætning.
|
Baseline
|
|
Sammenlign mikrobiota-resistom hos donorer og modtagere
Tidsramme: Baseline
|
Det eksplorative formål med denne undersøgelse er at karakterisere lighederne og forskellene i tarmmikrobiota mellem levende donor og modtagere på baselinetidspunktet.
De indsamlede undersøgelsesprøver vil blive brugt til at give et resumé af det samlede antal og mangfoldighed af bakterie- og svamperesistensgener, inklusive enhver nyerhvervelse.
|
Baseline
|
Samarbejdspartnere og efterforskere
Sponsor
Samarbejdspartnere
Efterforskere
- Ledende efterforsker: Colleen S Kraft, MD, MSc, Emory University
Datoer for undersøgelser
Studer store datoer
Studiestart (Faktiske)
Primær færdiggørelse (Faktiske)
Studieafslutning (Faktiske)
Datoer for studieregistrering
Først indsendt
Først indsendt, der opfyldte QC-kriterier
Først opslået (Anslået)
Opdateringer af undersøgelsesjournaler
Sidste opdatering sendt (Faktiske)
Sidste opdatering indsendt, der opfyldte kvalitetskontrolkriterier
Sidst verificeret
Mere information
Begreber relateret til denne undersøgelse
Nøgleord
Andre undersøgelses-id-numre
- IRB00092450
- 16IPA1609418 (Andet bevillings-/finansieringsnummer: Centers for Disease Control and Prevention (CDC))
- 16IPA1609428 (Andet bevillings-/finansieringsnummer: Centers for Disease Control and Prevention (CDC))
- CDC-IRB00092450 (Anden identifikator: Centers for Disease Control and Prevention (CDC))
Plan for individuelle deltagerdata (IPD)
Planlægger du at dele individuelle deltagerdata (IPD)?
Lægemiddel- og udstyrsoplysninger, undersøgelsesdokumenter
Studerer et amerikansk FDA-reguleret lægemiddelprodukt
Studerer et amerikansk FDA-reguleret enhedsprodukt
produkt fremstillet i og eksporteret fra U.S.A.
Disse oplysninger blev hentet direkte fra webstedet clinicaltrials.gov uden ændringer. Hvis du har nogen anmodninger om at ændre, fjerne eller opdatere dine undersøgelsesoplysninger, bedes du kontakte register@clinicaltrials.gov. Så snart en ændring er implementeret på clinicaltrials.gov, vil denne også blive opdateret automatisk på vores hjemmeside .