Charakterisierung der Entwicklung des Darmmikrobioms nach Spende oder Erhalt einer Nierentransplantation (COMET-DR)
Dies ist eine hypothesengenerierende Pilotstudie. Die Absicht besteht darin, die Auswirkungen perioperativer Praktiken auf das Darmmikrobiom zu modellieren und diese Bedingungen möglicherweise mit dem endgültigen Mikrobiomstatus in Verbindung zu bringen (z. B. Anzahl der Resistenzgene und Diversität im Zusammenhang mit perioperativen Praktiken und präoperativem Mikrobiomstatus). Zu den Teilnehmern gehören Personen, die sich einer Operation unterziehen, um entweder eine Niere zu erhalten oder zu spenden. Um die Veränderung der Diversität der Darmmikrobiota im Laufe der Zeit zu bestimmen, werden Rektalabstriche vor der Operation und zu mehreren Zeitpunkten nach der Operation entnommen, wobei der letzte Abstrich 30 Tage nach der Operation entnommen wird.
Diese Pilotstudie soll vorläufige Daten sammeln, um die Begründung und das Design für eine nachfolgende klinische Studie zu unterstützen. Diese Studie soll die Diversität der Darmmikrobiota im Rahmen einer Nierentransplantation und die klinische Bedeutung des Antibiotikaeinsatzes und des damit verbundenen Resistoms (Sammlung aller Antibiotikaresistenzgene und -vorläufer in einer Probe) verstehen.
Studienübersicht
Status
Bedingungen
Detaillierte Beschreibung
Das Auftreten von multiresistenten Organismen (MDROs) ist eine wachsende Bedrohung für die globale öffentliche Gesundheit und ist mit einer hohen Morbidität und Mortalität sowohl in der allgemeinen als auch in der soliden Organtransplantationspopulation verbunden. Die Diversität der Darmmikrobiota kann funktionelle und räumliche Barrieren für die bakterielle und pilzliche MDRO-Kolonisierung darstellen, und der Verlust der Diversität ist mit einer erhöhten MDRO-Kolonisierung verbunden. Dysbiose ist ein Zustand des Verlusts der Mikrobiota-Diversität, und eine einzige antibiotische Behandlung kann zu einer erheblichen Störung der Mikrobiota-Diversität führen, selbst bei ansonsten gesunden Personen. Diese Störung kann das Wachstum von pathogenen und multiresistenten Bakterien und Pilzen fördern. Insbesondere Transplantationspatienten sind aufgrund von immunmodulatorischen Therapien, medizinischer Behandlung, erhöhter Antibiotikabelastung und chirurgischer Manipulation der Schleimhaut einem erhöhten Risiko einer Kolonisierung und Infektion mit MRE ausgesetzt. Darüber hinaus wurde gezeigt, dass chronische Nierenerkrankungen und Dialysetherapien im Vorfeld einer Transplantation mit Veränderungen sowohl des intestinalen als auch des parodontalen Mikrobioms verbunden sind. Das Verständnis der Entwicklung der Störung des Darmmikrobioms sowohl bei Empfängern von Nierentransplantaten als auch bei gesunden Spendern von Nierentransplantaten während der Zeit der chirurgischen Transplantationsprophylaxe wird wertvolle Einblicke in weitere Forschungswege und mögliche Interventionen geben, die das Risiko einer MRE-Kolonisierung mindern können.
Dies ist eine prospektive, beobachtende und nicht-interventionelle Pilotstudie, die darauf abzielt, 100 erwachsene Nierentransplantatempfänger und 100 erwachsene Nierentransplantatspender aufzunehmen. Die Teilnehmer stellen Stuhlproben und Analabstrichproben zur Verfügung und füllen Ernährungsfragebögen aus. Die Teilnehmer können sich auch für die Teilnahme an einer optionalen Teilstudie entscheiden, bei der Stuhlreste für zukünftige Forschungszwecke gesammelt werden.
Die Diversitätsveränderung der Darmmikrobiota im Laufe der Zeit wird beim Screening-Besuch am 2. postoperativen Tag bewertet; Tag 15 nach der Entlassung und Tag 30 nach der Entlassung. Die Teilnehmer werden über einen Zeitraum von 24 Wochen nach der Operation durch Überprüfung der Krankenakte nachbeobachtet.
Diese Studie soll die Diversität der Darmmikrobiota im Rahmen einer Nierentransplantation und die klinische Bedeutung des Antibiotikaeinsatzes und des damit verbundenen Resistoms (Sammlung aller Antibiotikaresistenzgene und -vorläufer in einer Probe) verstehen. Die aus dieser Studie gewonnenen Informationen werden verwendet, um das Design zukünftiger klinischer Studien zu leiten.
Studientyp
Einschreibung (Tatsächlich)
Kontakte und Standorte
Studienorte
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Georgia
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Atlanta, Georgia, Vereinigte Staaten, 30322
- The Emory Clinic
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Atlanta, Georgia, Vereinigte Staaten, 30324
- Emory University Hospital
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Teilnahmekriterien
Zulassungskriterien
Studienberechtigtes Alter
Akzeptiert gesunde Freiwillige
Probenahmeverfahren
Studienpopulation
Beschreibung
Einschlusskriterien:
- Fähigkeit zu verstehen und die Bereitschaft, eine schriftliche Einverständniserklärung zu unterzeichnen.
- Fähigkeit und Bereitschaft, die Anforderungen des Studienprotokolls einzuhalten.
- Ausgefülltes mündliches Screening-Formular
- Geplante Nierenspende oder geplanter Erhalt einer Lebendspende-Nierentransplantation innerhalb von 28 Tagen ab dem Zeitpunkt der schriftlichen Einverständniserklärung.
Wenn der Leistungsstatus bekannt ist, eine der folgenden Punktzahlen:
- Klassifikation der American Society of AnAesthetic (ASA) I (ein normaler gesunder Patient), II (ein Patient mit leichter systemischer Erkrankung) oder III (ein Patient mit schwerer systemischer Erkrankung)
- Statusskala der Eastern Cooperative Oncology Group (ECOG) mit 0 (normale Aktivität), 1 (Symptome, aber gehfähig) oder 2 (weniger als 50 % der Zeit im Bett)
- Karnofsky Performance Scale (KPS) von 50 % (erfordert erhebliche Unterstützung und häufige medizinische Versorgung) bis 100 % (normal, keine Beschwerden, keine Anzeichen einer Krankheit)
- Englisch sprechend.
Ausschlusskriterien:
Jede Bedingung, die nach Ansicht des Prüfarztes die Studienziele beeinträchtigen oder die Einhaltung der Studienanforderungen einschränken könnte, einschließlich, aber nicht beschränkt auf:
- Bekannter aktiver intravenöser Drogen- oder Alkoholmissbrauch
- Psychiatrische Krankheit
- Soziale Lage
- Geplanter oder tatsächlicher Erhalt einer Nierentransplantation eines verstorbenen Spenders.
- Vorherige Nierentransplantation, die noch eine aktive immunsuppressive Behandlung oder Intervention erfordert.
- Vorhandensein einer umleitenden Ileostomie oder Kolostomie.
Studienplan
Wie ist die Studie aufgebaut?
Designdetails
- Beobachtungsmodelle: Sonstiges
- Zeitperspektiven: Interessent
Kohorten und Interventionen
Gruppe / Kohorte |
Intervention / Behandlung |
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Empfänger einer Nierentransplantation
Teilnehmer, die als Empfänger der Niere für eine geplante Nierentransplantation vorgesehen sind. Alle Teilnehmer werden die folgenden Interventionen durchführen:
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Die Teilnehmer stellen zu Studienbeginn (vor der Operation) und 30 Tage nach der Transplantationsoperation eine Stuhlprobe zur Verfügung.
Stuhlproben werden vom Teilnehmer selbst gesammelt.
Analabstriche werden vor der Operation (Baseline) und an den Tagen 2, 15 und 30 nach der Operation entnommen.
Bei Teilnehmern, deren geplante Krankenhausaufenthaltsdauer gegenüber dem präoperativen Plan verlängert wird, wird 2 Tage vor dem voraussichtlichen Entlassungsdatum aus dem Krankenhaus ein zusätzlicher, optionaler Analabstrich entnommen.
Analabstriche werden vom Studienteam entnommen, mit Ausnahme des postoperativen Standardbehandlungstermins (30 Tage nach der Operation) für Lebendspender, die ihre eigenen Proben entnehmen.
Der Studienkoordinator wird den Teilnehmern vor der Operation zu Studienbeginn und an den Tagen 2, 15 und 30 nach der Operation die Short Diet Assessment (SDA) durchführen.
Teilnehmer, deren geplante Krankenhausaufenthaltsdauer gegenüber dem präoperativen Plan verlängert ist, füllen den Fragebogen 2 Tage vor ihrem voraussichtlichen Entlassungsdatum aus dem Krankenhaus aus.
Der Ernährungs-Screener-Fragebogen der National Health and Nutrition Examination Survey (NHANES) 2009-2010 wird am 2. postoperativen Tag ausgefüllt. Der Fragebogen fragt nach Nahrungsmitteln, die in den letzten 30 Tagen konsumiert wurden.
Der Fragebogen umfasst 25 Punkte, und abhängig von den Antworten können zusätzliche Fragen gestellt werden.
Der Fragebogen wird selbst verwaltet oder von einem Mitglied des Studienteams verwaltet.
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Spender einer Nierentransplantation
Teilnehmer, die als Spender der Niere für eine geplante Nierentransplantation vorgesehen sind. Alle Teilnehmer werden die folgenden Interventionen durchführen:
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Die Teilnehmer stellen zu Studienbeginn (vor der Operation) und 30 Tage nach der Transplantationsoperation eine Stuhlprobe zur Verfügung.
Stuhlproben werden vom Teilnehmer selbst gesammelt.
Analabstriche werden vor der Operation (Baseline) und an den Tagen 2, 15 und 30 nach der Operation entnommen.
Bei Teilnehmern, deren geplante Krankenhausaufenthaltsdauer gegenüber dem präoperativen Plan verlängert wird, wird 2 Tage vor dem voraussichtlichen Entlassungsdatum aus dem Krankenhaus ein zusätzlicher, optionaler Analabstrich entnommen.
Analabstriche werden vom Studienteam entnommen, mit Ausnahme des postoperativen Standardbehandlungstermins (30 Tage nach der Operation) für Lebendspender, die ihre eigenen Proben entnehmen.
Der Studienkoordinator wird den Teilnehmern vor der Operation zu Studienbeginn und an den Tagen 2, 15 und 30 nach der Operation die Short Diet Assessment (SDA) durchführen.
Teilnehmer, deren geplante Krankenhausaufenthaltsdauer gegenüber dem präoperativen Plan verlängert ist, füllen den Fragebogen 2 Tage vor ihrem voraussichtlichen Entlassungsdatum aus dem Krankenhaus aus.
Der Ernährungs-Screener-Fragebogen der National Health and Nutrition Examination Survey (NHANES) 2009-2010 wird am 2. postoperativen Tag ausgefüllt. Der Fragebogen fragt nach Nahrungsmitteln, die in den letzten 30 Tagen konsumiert wurden.
Der Fragebogen umfasst 25 Punkte, und abhängig von den Antworten können zusätzliche Fragen gestellt werden.
Der Fragebogen wird selbst verwaltet oder von einem Mitglied des Studienteams verwaltet.
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Was misst die Studie?
Primäre Ergebnismessungen
Ergebnis Maßnahme |
Maßnahmenbeschreibung |
Zeitfenster |
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Veränderung der Zusammensetzung der Mikrobiota
Zeitfenster: Baseline bis zum postoperativen Tag 30
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Um den Gesamteinfluss der chirurgischen Prophylaxe auf die Zusammensetzung der Darmmikrobiota im Rahmen einer Nierentransplantation zu verstehen, werden die Verteilung und relative Häufigkeit von Bakterien- und Pilztaxa für jede gesammelte Probe beschrieben.
Eine Stammgattung gilt als vorherrschend, wenn sie mindestens 30 % aller Gattungen oder Stämme der Mikrobiota in der Stuhlprobe ausmacht.
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Baseline bis zum postoperativen Tag 30
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Veränderung der Mikrobiota-Diversität
Zeitfenster: Baseline bis zum postoperativen Tag 30
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Um den Gesamteinfluss der chirurgischen Prophylaxe auf die Diversität der Darmmikrobiota im Rahmen einer Nierentransplantation zu verstehen, werden Messungen der α- und β-Diversität der Darmmikrobiota verwendet.
Der maximale Prozentsatz aller identifizierten Gene, die in demselben Taxon enthalten sind, wird aus jeder Stuhlprobe bestimmt.
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Baseline bis zum postoperativen Tag 30
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Änderung der Mikrobiota-Taxonomie
Zeitfenster: Baseline bis zum postoperativen Tag 30
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Um den Gesamteinfluss der chirurgischen Prophylaxe auf die Taxonomie der Darmmikrobiota im Rahmen der Nierentransplantation zu verstehen, werden die gesammelten Proben zur Bestimmung der taxonomischen Zusammensetzung von Bakterien und Pilzen verwendet.
Die metagenomische Shotgun-Sequenzierung des gesamten Genoms wird auf einem Illumina Miseq (oder HiSeq) durchgeführt.
Ein Short-Read-Mapper wird verwendet, um menschliche Sequenzen aus jeder Stuhlprobe herauszufiltern und zu verwerfen, und anschließend werden Metaphlan und KRAKEN zur Bestimmung der taxonomischen Zusammensetzung verwendet.
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Baseline bis zum postoperativen Tag 30
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Veränderung des Resistoms der Mikrobiota
Zeitfenster: Baseline bis zum postoperativen Tag 30
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Um die Gesamtauswirkung der chirurgischen Prophylaxe auf die Resistenz der Darmmikrobiota im Rahmen einer Nierentransplantation zu verstehen, werden die gesammelten Studienproben verwendet, um eine Zusammenfassung der Gesamtzahl und Vielfalt der Bakterien- und Pilzresistenzgene, einschließlich aller Neuanschaffungen, bereitzustellen.
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Baseline bis zum postoperativen Tag 30
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Sekundäre Ergebnismessungen
Ergebnis Maßnahme |
Maßnahmenbeschreibung |
Zeitfenster |
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Zusammensetzung der Mikrobiota bei Nierendialysepatienten
Zeitfenster: Grundlinie
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Um die Zusammensetzung der Darmmikrobiota bei Nierendialysepatienten zu verstehen, wird die Verteilung und relative Häufigkeit von Bakterien- und Pilztaxa für jede gesammelte Probe beschrieben.
Eine Stammgattung wird als vorherrschend angesehen, wenn sie mindestens 30 % aller Gattungen oder Stämme von Mikrobiota in der zu Studienbeginn (vor der Nierentransplantation) entnommenen Stuhlprobe ausmacht.
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Grundlinie
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Diversität der Mikrobiota bei Nierendialysepatienten
Zeitfenster: Grundlinie
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Um die Alpha- und Beta-Diversität der Darmmikrobiota bei Patienten, die eine Nierendialyse erhalten, zu verstehen, wird der maximale Prozentsatz aller identifizierten Gene, die innerhalb desselben Taxons enthalten sind, anhand der Studienproben bestimmt, die zu Studienbeginn (vor der Nierentransplantation) entnommen wurden.
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Grundlinie
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Mikrobiota-Resistom bei Nierendialysepatienten
Zeitfenster: Grundlinie
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Um die Darmmikrobiota-Resistenz bei Nierendialysepatienten zu verstehen, werden die zu Studienbeginn (vor der Nierentransplantation) gesammelten Studienproben verwendet, um eine Zusammenfassung der Gesamtzahl und Vielfalt der bakteriellen Resistenzgene bereitzustellen.
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Grundlinie
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Andere Ergebnismessungen
Ergebnis Maßnahme |
Maßnahmenbeschreibung |
Zeitfenster |
|---|---|---|
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Vergleichen Sie die Zusammensetzung der Mikrobiota von Spendern und Empfängern
Zeitfenster: Grundlinie
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Das explorative Ziel dieser Studie ist es, die Ähnlichkeiten und Unterschiede in der Darmmikrobiota zwischen lebenden Spendern und Empfängern zum Ausgangszeitpunkt zu charakterisieren.
Die Verteilung und relative Häufigkeit von Bakterien- und Pilztaxa für jede Grundlinienprobe (vor der Nierentransplantation) wird beschrieben.
Eine Stammgattung gilt als vorherrschend, wenn sie mindestens 30 % aller Gattungen oder Stämme der Mikrobiota in der Stuhlprobe ausmacht.
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Grundlinie
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Vergleichen Sie die Mikrobiota-Diversität von Spendern und Empfängern
Zeitfenster: Grundlinie
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Das explorative Ziel dieser Studie ist es, die Ähnlichkeiten und Unterschiede in der Darmmikrobiota zwischen lebenden Spendern und Empfängern zum Ausgangszeitpunkt zu charakterisieren.
Der maximale Prozentsatz aller identifizierten Gene, die in demselben Taxon enthalten sind, wird aus jeder vor der Nierentransplantation entnommenen Stuhlprobe bestimmt.
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Grundlinie
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Vergleichen Sie die Mikrobiota-Taxonomie von Spendern und Empfängern
Zeitfenster: Grundlinie
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Das explorative Ziel dieser Studie ist es, die Ähnlichkeiten und Unterschiede in der Darmmikrobiota zwischen lebenden Spendern und Empfängern zum Ausgangszeitpunkt zu charakterisieren.
Die gesammelten Studienproben werden zur Bestimmung der taxonomischen Zusammensetzung von Bakterien und Pilzen verwendet.
Die metagenomische Shotgun-Sequenzierung des gesamten Genoms wird auf einem Illumina Miseq (oder HiSeq) durchgeführt.
Ein Short-Read-Mapper wird verwendet, um menschliche Sequenzen aus jeder Stuhlprobe herauszufiltern und zu verwerfen, und anschließend werden Metaphlan und KRAKEN zur Bestimmung der taxonomischen Zusammensetzung verwendet.
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Grundlinie
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Vergleichen Sie das Mikrobiota-Resistom von Spendern und Empfängern
Zeitfenster: Grundlinie
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Das explorative Ziel dieser Studie ist es, die Ähnlichkeiten und Unterschiede in der Darmmikrobiota zwischen lebenden Spendern und Empfängern zum Ausgangszeitpunkt zu charakterisieren.
Die gesammelten Studienproben werden verwendet, um eine Zusammenfassung der Gesamtzahl und Vielfalt der Bakterien- und Pilzresistenzgene zu erstellen, einschließlich aller Neuanschaffungen.
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Grundlinie
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Mitarbeiter und Ermittler
Sponsor
Mitarbeiter
Ermittler
- Hauptermittler: Colleen S Kraft, MD, MSc, Emory University
Studienaufzeichnungsdaten
Haupttermine studieren
Studienbeginn (Tatsächlich)
Primärer Abschluss (Tatsächlich)
Studienabschluss (Tatsächlich)
Studienanmeldedaten
Zuerst eingereicht
Zuerst eingereicht, das die QC-Kriterien erfüllt hat
Zuerst gepostet (Geschätzt)
Studienaufzeichnungsaktualisierungen
Letztes Update gepostet (Tatsächlich)
Letztes eingereichtes Update, das die QC-Kriterien erfüllt
Zuletzt verifiziert
Mehr Informationen
Begriffe im Zusammenhang mit dieser Studie
Schlüsselwörter
Andere Studien-ID-Nummern
- IRB00092450
- 16IPA1609418 (Andere Zuschuss-/Finanzierungsnummer: Centers for Disease Control and Prevention (CDC))
- 16IPA1609428 (Andere Zuschuss-/Finanzierungsnummer: Centers for Disease Control and Prevention (CDC))
- CDC-IRB00092450 (Andere Kennung: Centers for Disease Control and Prevention (CDC))
Plan für individuelle Teilnehmerdaten (IPD)
Planen Sie, individuelle Teilnehmerdaten (IPD) zu teilen?
Arzneimittel- und Geräteinformationen, Studienunterlagen
Studiert ein von der US-amerikanischen FDA reguliertes Arzneimittelprodukt
Studiert ein von der US-amerikanischen FDA reguliertes Geräteprodukt
Produkt, das in den USA hergestellt und aus den USA exportiert wird
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