Caratterizzazione dell'evoluzione del microbioma intestinale dopo donazione o ricezione di trapianto di rene (COMET-DR)
Questo è uno studio pilota che genera ipotesi. L'intento è modellare l'impatto delle pratiche perioperatorie sul microbioma intestinale e possibilmente associare queste condizioni allo stato finale del microbioma (ad esempio, numero di geni di resistenza e diversità associati alle pratiche perioperatorie e allo stato del microbioma preoperatorio). I partecipanti includeranno persone che stanno subendo un intervento chirurgico per ricevere o donare un rene. Per determinare il cambiamento di diversità del microbiota intestinale nel tempo, i tamponi rettali saranno raccolti prima dell'intervento chirurgico e in diversi momenti dopo l'intervento, con l'ultimo tampone raccolto 30 giorni dopo l'intervento.
Questo studio pilota ha lo scopo di ottenere dati preliminari per supportare la logica e la progettazione di una successiva sperimentazione clinica. Questo studio è progettato per comprendere la diversità del microbiota intestinale nel contesto della chirurgia del trapianto renale e il significato clinico dell'uso di antibiotici e del resistoma associato (raccolta di tutti i geni e precursori di resistenza agli antibiotici all'interno di un campione).
Panoramica dello studio
Stato
Condizioni
Descrizione dettagliata
L'emergere di organismi multiresistenti ai farmaci (MDRO) è una minaccia crescente per la salute pubblica globale ed è associata a un'elevata morbilità e mortalità sia nella popolazione generale che trapiantata di organi solidi. La diversità del microbiota intestinale può fornire barriere funzionali e spaziali alla colonizzazione di MDRO batterica e fungina e la perdita di diversità è associata a una maggiore colonizzazione di MDRO. La disbiosi è uno stato di perdita della diversità del microbiota e un singolo ciclo di trattamento antibiotico può causare un'interruzione significativa della diversità del microbiota, anche in individui altrimenti sani. Questa interruzione può favorire la crescita di batteri e funghi patogeni e resistenti a più farmaci. I pazienti trapiantati, in particolare, sono a maggior rischio di colonizzazione e infezione da MDRO a causa delle terapie immunomodulatorie, dell'esposizione sanitaria, dell'aumentata esposizione agli antibiotici e della manipolazione chirurgica della mucosa. Inoltre, è stato dimostrato che la malattia renale cronica e la terapia dialitica che porta al trapianto sono associate ad alterazioni del microbioma intestinale e parodontale. Comprendere l'evoluzione dell'interruzione del microbioma intestinale sia nei riceventi di trapianto di rene che nei donatori sani di trapianto di rene durante il periodo della profilassi chirurgica del trapianto fornirà preziose informazioni su ulteriori strade per la ricerca e possibili interventi che possono mitigare il rischio di colonizzazione di MDRO.
Questo è uno studio pilota prospettico, osservazionale e non interventistico che mira ad arruolare 100 pazienti adulti sottoposti a trapianto renale e 100 donatori adulti di trapianto renale. I partecipanti forniranno campioni di feci e campioni di tampone anale e completeranno questionari dietetici. I partecipanti possono anche scegliere di prendere parte a un sottostudio facoltativo che coinvolge le feci residue bancarie per un futuro utilizzo della ricerca.
Il cambiamento di diversità del microbiota intestinale nel tempo sarà valutato durante la visita di screening, giorno 2 post-operatorio; Giorno 15 post-dimissione e Giorno 30 post-dimissione. I partecipanti saranno seguiti attraverso la revisione della cartella clinica per 24 settimane dopo l'intervento.
Questo studio è progettato per comprendere la diversità del microbiota intestinale nel contesto della chirurgia del trapianto renale e il significato clinico dell'uso di antibiotici e del resistoma associato (raccolta di tutti i geni e precursori di resistenza agli antibiotici all'interno di un campione). Le informazioni apprese da questo studio saranno utilizzate per guidare la progettazione di futuri studi clinici.
Tipo di studio
Iscrizione (Effettivo)
Contatti e Sedi
Luoghi di studio
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Georgia
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Atlanta, Georgia, Stati Uniti, 30322
- The Emory Clinic
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Atlanta, Georgia, Stati Uniti, 30324
- Emory University Hospital
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Criteri di partecipazione
Criteri di ammissibilità
Età idonea allo studio
Accetta volontari sani
Metodo di campionamento
Popolazione di studio
Descrizione
Criterio di inclusione:
- Capacità di comprensione e disponibilità a firmare un documento di consenso informato scritto.
- Capacità e disponibilità a rispettare i requisiti del protocollo di studio.
- Modulo di screening verbale completato
- Donazione pianificata di rene o ricezione pianificata di un trapianto di rene da donatore vivente entro 28 giorni dal momento del consenso informato scritto.
Se lo stato delle prestazioni è noto, un punteggio di uno dei seguenti:
- Classificazione dell'American Society of Anesthesia (ASA) di I (paziente sano normale), II (paziente con malattia sistemica lieve) o III (paziente con malattia sistemica grave)
- Grado della scala di stato dell'Eastern Cooperative Oncology Group (ECOG) di 0 (attività normale), 1 (sintomi, ma deambulazione) o 2 (a letto <50% del tempo)
- Karnofsky Performance Scale (KPS) dal 50% (richiede notevole assistenza e cure mediche frequenti) al 100% (normale, nessun disturbo, nessuna evidenza di malattia)
- Parlando inglese.
Criteri di esclusione:
Qualsiasi condizione che, a giudizio dello sperimentatore, possa interferire con gli obiettivi dello studio o limitare la conformità ai requisiti dello studio, inclusi ma non limitati a:
- Noto abuso di droghe o alcol per via endovenosa
- Malattia psichiatrica
- Situazione sociale
- Ricevimento pianificato o effettivo di un trapianto di rene da donatore deceduto.
- Precedente trapianto di rene che richiede ancora un trattamento o un intervento immunosoppressivo attivo.
- Presenza di ileostomia o colostomia deviante.
Piano di studio
Come è strutturato lo studio?
Dettagli di progettazione
- Modelli osservazionali: Altro
- Prospettive temporali: Prospettiva
Coorti e interventi
Gruppo / Coorte |
Intervento / Trattamento |
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Destinatario di trapianto renale
Partecipanti che sono programmati per un trapianto renale pianificato come ricevente del rene. Tutti i partecipanti completeranno i seguenti interventi:
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I partecipanti forniranno un campione di feci al basale (pre-operazione) e 30 giorni dopo l'operazione di trapianto.
I campioni di feci saranno raccolti autonomamente dal partecipante.
I tamponi anali verranno raccolti prima dell'intervento chirurgico (basale) e nei giorni 2, 15 e 30 post-operatori.
I partecipanti la cui durata del ricovero pianificata è estesa dal piano pre-chirurgico riceveranno un tampone anale aggiuntivo, facoltativo, prelevato 2 giorni prima della data di dimissione dall'ospedale prevista.
I tamponi anali saranno raccolti dal team di studio, ad eccezione dell'appuntamento post-operatorio standard di cura (30 giorni dopo l'operazione) per i donatori viventi che raccoglieranno i propri campioni.
Il coordinatore dello studio somministrerà la valutazione della dieta breve (SDA) ai partecipanti prima dell'intervento chirurgico al basale e nei giorni 2, 15 e 30 post-operatori.
I partecipanti la cui durata della degenza ospedaliera pianificata è estesa dal piano pre-chirurgico completeranno il questionario 2 giorni prima della data di dimissione ospedaliera prevista.
Il National Health and Nutrition Examination Survey (NHANES) 2009-2010 Dietary Screener Questionnaire sarà completato il secondo giorno post-operatorio. Il questionario chiede informazioni sugli alimenti consumati negli ultimi 30 giorni.
Ci sono 25 voci nel questionario e possono essere poste ulteriori domande a seconda delle risposte fornite.
Il questionario sarà auto-somministrato o amministrato da un membro del gruppo di studio.
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Donatore di trapianto renale
Partecipanti che sono programmati per un trapianto renale pianificato come donatore del rene. Tutti i partecipanti completeranno i seguenti interventi:
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I partecipanti forniranno un campione di feci al basale (pre-operazione) e 30 giorni dopo l'operazione di trapianto.
I campioni di feci saranno raccolti autonomamente dal partecipante.
I tamponi anali verranno raccolti prima dell'intervento chirurgico (basale) e nei giorni 2, 15 e 30 post-operatori.
I partecipanti la cui durata del ricovero pianificata è estesa dal piano pre-chirurgico riceveranno un tampone anale aggiuntivo, facoltativo, prelevato 2 giorni prima della data di dimissione dall'ospedale prevista.
I tamponi anali saranno raccolti dal team di studio, ad eccezione dell'appuntamento post-operatorio standard di cura (30 giorni dopo l'operazione) per i donatori viventi che raccoglieranno i propri campioni.
Il coordinatore dello studio somministrerà la valutazione della dieta breve (SDA) ai partecipanti prima dell'intervento chirurgico al basale e nei giorni 2, 15 e 30 post-operatori.
I partecipanti la cui durata della degenza ospedaliera pianificata è estesa dal piano pre-chirurgico completeranno il questionario 2 giorni prima della data di dimissione ospedaliera prevista.
Il National Health and Nutrition Examination Survey (NHANES) 2009-2010 Dietary Screener Questionnaire sarà completato il secondo giorno post-operatorio. Il questionario chiede informazioni sugli alimenti consumati negli ultimi 30 giorni.
Ci sono 25 voci nel questionario e possono essere poste ulteriori domande a seconda delle risposte fornite.
Il questionario sarà auto-somministrato o amministrato da un membro del gruppo di studio.
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Cosa sta misurando lo studio?
Misure di risultato primarie
Misura del risultato |
Misura Descrizione |
Lasso di tempo |
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Cambiamento nella composizione del microbiota
Lasso di tempo: Dal basale al giorno 30 postoperatorio
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Per comprendere l'impatto complessivo della profilassi chirurgica sulla composizione del microbiota intestinale nel contesto della chirurgia del trapianto renale, verranno descritte la distribuzione e l'abbondanza relativa di taxa batterici e fungini per ciascun campione raccolto.
Un genere di ceppo sarà considerato predominante se rappresenta almeno il 30% di tutti i generi o ceppi di microbiota all'interno del campione di feci.
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Dal basale al giorno 30 postoperatorio
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Cambiamento nella diversità del microbiota
Lasso di tempo: Dal basale al giorno 30 postoperatorio
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Per comprendere l'impatto complessivo della profilassi chirurgica sulla diversità del microbiota intestinale nel contesto della chirurgia del trapianto renale, saranno utilizzate misure di α- e β-diversità del microbiota intestinale.
La percentuale massima di tutti i geni identificati inclusi all'interno dello stesso taxon sarà determinata da ciascun campione di feci.
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Dal basale al giorno 30 postoperatorio
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Cambiamento nella tassonomia del microbiota
Lasso di tempo: Dal basale al giorno 30 postoperatorio
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Per comprendere l'impatto complessivo della profilassi chirurgica sulla tassonomia del microbiota intestinale, nell'ambito della chirurgia del trapianto renale, i campioni raccolti saranno utilizzati per la determinazione della composizione tassonomica di batteri e funghi.
Il sequenziamento metagenomico shotgun dell'intero genoma sarà eseguito su un Illumina Miseq (o HiSeq).
Un mappatore di lettura breve verrà utilizzato per escludere e scartare le sequenze umane da ciascun campione di feci e successivamente Metaphlan e KRAKEN verranno utilizzati per la determinazione della composizione tassonomica.
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Dal basale al giorno 30 postoperatorio
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Cambiamento nel microbiota resistoma
Lasso di tempo: Dal basale al giorno 30 postoperatorio
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Per comprendere l'impatto complessivo della profilassi chirurgica sulla resistenza del microbiota intestinale, nell'ambito della chirurgia del trapianto renale, i campioni di studio raccolti verranno utilizzati per fornire un riepilogo del numero complessivo e della diversità dei geni di resistenza batterica e fungina, inclusa qualsiasi nuova acquisizione.
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Dal basale al giorno 30 postoperatorio
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Misure di risultato secondarie
Misura del risultato |
Misura Descrizione |
Lasso di tempo |
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Composizione del microbiota nei pazienti in dialisi renale
Lasso di tempo: Linea di base
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Per comprendere la composizione del microbiota intestinale nei pazienti sottoposti a dialisi renale, verrà descritta la distribuzione e l'abbondanza relativa di taxa batterici e fungini per ciascun campione raccolto.
Un genere di ceppo sarà considerato predominante se rappresenta almeno il 30% di tutti i generi o ceppi di microbiota all'interno del campione di feci raccolto al basale (prima del trapianto renale).
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Linea di base
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Diversità del microbiota nei pazienti in dialisi renale
Lasso di tempo: Linea di base
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Per comprendere la diversità del microbiota intestinale Alpha e Beta nei pazienti sottoposti a dialisi renale, la percentuale massima di tutti i geni identificati inclusi nello stesso taxon sarà determinata dai campioni di studio raccolti al basale (prima del trapianto renale).
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Linea di base
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Il microbiota resistoma nei pazienti in dialisi renale
Lasso di tempo: Linea di base
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Per comprendere la resistenza del microbiota intestinale nei pazienti sottoposti a dialisi renale, i campioni di studio raccolti al basale (prima del trapianto renale) verranno utilizzati per fornire un riepilogo del numero complessivo e della diversità dei geni di resistenza batterica.
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Linea di base
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Altre misure di risultato
Misura del risultato |
Misura Descrizione |
Lasso di tempo |
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Confronta la composizione del microbiota di donatori e riceventi
Lasso di tempo: Linea di base
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L'obiettivo esplorativo di questo studio è quello di caratterizzare le somiglianze e le differenze nel microbiota intestinale tra donatore vivente e ricevente al punto temporale di riferimento.
Verranno descritte la distribuzione e l'abbondanza relativa di taxa batterici e fungini per ciascun campione di riferimento (prima del trapianto renale).
Un genere di ceppo sarà considerato predominante se rappresenta almeno il 30% di tutti i generi o ceppi di microbiota all'interno del campione di feci.
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Linea di base
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Confronta la diversità del microbiota di donatori e riceventi
Lasso di tempo: Linea di base
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L'obiettivo esplorativo di questo studio è quello di caratterizzare le somiglianze e le differenze nel microbiota intestinale tra donatore vivente e ricevente al punto temporale di riferimento.
La percentuale massima di tutti i geni identificati inclusi all'interno dello stesso taxon sarà determinata da ciascun campione di feci raccolto prima del trapianto renale.
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Linea di base
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Confronta la tassonomia del microbiota di donatori e riceventi
Lasso di tempo: Linea di base
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L'obiettivo esplorativo di questo studio è quello di caratterizzare le somiglianze e le differenze nel microbiota intestinale tra donatore vivente e ricevente al punto temporale di riferimento.
I campioni di studio raccolti saranno utilizzati per la determinazione della composizione tassonomica di batteri e funghi.
Il sequenziamento metagenomico shotgun dell'intero genoma sarà eseguito su un Illumina Miseq (o HiSeq).
Un mappatore di lettura breve verrà utilizzato per escludere e scartare le sequenze umane da ciascun campione di feci e successivamente Metaphlan e KRAKEN verranno utilizzati per la determinazione della composizione tassonomica.
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Linea di base
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Confronta il microbiota resistoma di donatori e riceventi
Lasso di tempo: Linea di base
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L'obiettivo esplorativo di questo studio è quello di caratterizzare le somiglianze e le differenze nel microbiota intestinale tra donatore vivente e ricevente al punto temporale di riferimento.
I campioni di studio raccolti verranno utilizzati per fornire un riepilogo del numero complessivo e della diversità dei geni di resistenza batterica e fungina, inclusa qualsiasi nuova acquisizione.
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Linea di base
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Collaboratori e investigatori
Sponsor
Collaboratori
Investigatori
- Investigatore principale: Colleen S Kraft, MD, MSc, Emory University
Studiare le date dei record
Studia le date principali
Inizio studio (Effettivo)
Completamento primario (Effettivo)
Completamento dello studio (Effettivo)
Date di iscrizione allo studio
Primo inviato
Primo inviato che soddisfa i criteri di controllo qualità
Primo Inserito (Stimato)
Aggiornamenti dei record di studio
Ultimo aggiornamento pubblicato (Effettivo)
Ultimo aggiornamento inviato che soddisfa i criteri QC
Ultimo verificato
Maggiori informazioni
Termini relativi a questo studio
Parole chiave
Altri numeri di identificazione dello studio
- IRB00092450
- 16IPA1609418 (Altro numero di sovvenzione/finanziamento: Centers for Disease Control and Prevention (CDC))
- 16IPA1609428 (Altro numero di sovvenzione/finanziamento: Centers for Disease Control and Prevention (CDC))
- CDC-IRB00092450 (Altro identificatore: Centers for Disease Control and Prevention (CDC))
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