Характеристика эволюции кишечного микробиома после донорства или получения трансплантата почки (COMET-DR)
Это экспериментальное исследование, генерирующее гипотезы. Цель состоит в том, чтобы смоделировать влияние периоперационных практик на кишечный микробиом и, возможно, связать эти условия с окончательным статусом микробиома (например, количество генов резистентности и разнообразие, связанное с периоперационными практиками и предоперационным состоянием микробиома). Среди участников будут люди, которым предстоит операция по пересадке или донорству почки. Чтобы определить изменение разнообразия кишечной микробиоты с течением времени, ректальные мазки будут собираться до операции и в несколько моментов времени после операции, причем последний мазок берется через 30 дней после операции.
Это пилотное исследование предназначено для получения предварительных данных для поддержки обоснования и дизайна последующего клинического испытания. Это исследование предназначено для понимания разнообразия кишечной микробиоты в условиях операции по пересадке почки и клинического значения использования антибиотиков и связанного с ним резистома (сбор всех генов устойчивости к антибиотикам и предшественников в образце).
Обзор исследования
Статус
Условия
Подробное описание
Появление организмов с множественной лекарственной устойчивостью (МЛУ) представляет собой растущую угрозу для глобального общественного здравоохранения и связано с высокой заболеваемостью и смертностью как в общей популяции, так и среди людей, перенесших трансплантацию паренхиматозных органов. Разнообразие кишечной микробиоты может обеспечивать функциональные и пространственные барьеры для бактериальной и грибковой колонизации MDRO, а потеря разнообразия связана с усилением колонизации MDRO. Дисбактериоз — это состояние потери разнообразия микробиоты, и один курс лечения антибиотиками может привести к значительному нарушению разнообразия микробиоты даже у здоровых людей. Это нарушение может способствовать росту патогенных и полирезистентных бактерий и грибков. Пациенты после трансплантации, в частности, подвергаются повышенному риску колонизации и инфицирования MDRO из-за иммуномодулирующей терапии, воздействия медицинских препаратов, повышенного воздействия антибиотиков и хирургических манипуляций на слизистой оболочке. Кроме того, было показано, что хроническое заболевание почек и диализная терапия, предшествующая трансплантации, связаны с изменениями микробиома кишечника и периодонта. Понимание эволюции нарушения кишечного микробиома как у реципиентов почечного трансплантата, так и у здоровых доноров почечного трансплантата во время хирургической профилактики трансплантации даст ценную информацию о дальнейших направлениях исследований и возможных вмешательствах, которые могут снизить риск колонизации MDRO.
Это проспективное, обсервационное и неинтервенционное пилотное исследование, целью которого является зачисление 100 взрослых реципиентов почечного трансплантата и 100 взрослых доноров почечного трансплантата. Участники предоставят образцы стула и образцы анального мазка, а также заполнят анкеты по питанию. Участники также могут принять участие в дополнительном подисследовании, которое включает в себя хранение остатков стула для использования в будущих исследованиях.
Изменение разнообразия кишечной микробиоты с течением времени будет оцениваться во время скринингового визита, послеоперационный день 2; 15-й день после выписки и 30-й день после выписки. В течение 24 недель после операции за участниками будет проводиться проверка медицинской документации.
Это исследование предназначено для понимания разнообразия кишечной микробиоты в условиях операции по пересадке почки и клинического значения использования антибиотиков и связанного с ним резистома (сбор всех генов устойчивости к антибиотикам и предшественников в образце). Информация, полученная в ходе этого исследования, будет использоваться для разработки дизайна будущих клинических испытаний.
Тип исследования
Регистрация (Действительный)
Контакты и местонахождение
Места учебы
-
-
Georgia
-
Atlanta, Georgia, Соединенные Штаты, 30322
- The Emory Clinic
-
Atlanta, Georgia, Соединенные Штаты, 30324
- Emory University Hospital
-
-
Критерии участия
Критерии приемлемости
Возраст, подходящий для обучения
Принимает здоровых добровольцев
Метод выборки
Исследуемая популяция
Описание
Критерии включения:
- Способность понимать и готовность подписать письменный документ информированного согласия.
- Способность и готовность соблюдать требования протокола исследования.
- Заполненная форма устной проверки
- Планируемое донорство почки или планируемое получение трансплантата почки от живого донора в течение 28 дней с момента получения письменного информированного согласия.
Если статус производительности известен, оценка любого из следующего:
- Классификация Американского общества анестезиологов (ASA) I (нормальный здоровый пациент), II (пациент с легким системным заболеванием) или III (пациент с тяжелым системным заболеванием)
- Восточная кооперативная онкологическая группа (ECOG) Оценка по шкале состояния 0 (нормальная активность), 1 (симптомы, но амбулаторные) или 2 (в постели <50% времени)
- Шкала производительности Карновского (KPS) от 50% (требуется значительная помощь и частая медицинская помощь) до 100% (норма, жалоб нет, признаков заболевания нет)
- говорящий по-английски.
Критерий исключения:
Любое состояние, которое, по мнению исследователя, может помешать достижению целей исследования или ограничить соблюдение требований исследования, включая, помимо прочего:
- Известное активное внутривенное злоупотребление наркотиками или алкоголем
- Психическое заболевание
- Общественная ситуация
- Запланированное или фактическое получение трансплантата почки умершего донора.
- Предыдущая трансплантация почки, которая все еще требует активного иммуносупрессивного лечения или вмешательства.
- Наличие отводящей илеостомы или колостомы.
Учебный план
Как устроено исследование?
Детали дизайна
- Наблюдательные модели: Другой
- Временные перспективы: Перспективный
Когорты и вмешательства
Группа / когорта |
Вмешательство/лечение |
|---|---|
|
Реципиент почечного трансплантата
Участники, которым запланирована плановая трансплантация почки в качестве реципиента почки. Все участники выполнят следующие действия:
|
Участники предоставят образец стула на исходном уровне (до операции) и через 30 дней после операции по пересадке.
Образцы стула будут собраны участником самостоятельно.
Анальные мазки будут собираться до операции (базовый уровень) и на 2-й, 15-й и 30-й дни после операции.
Участникам, чья запланированная продолжительность госпитализации продлена по сравнению с предоперационным планом, будет взят дополнительный необязательный анальный мазок за 2 дня до предполагаемой даты выписки из больницы.
Анальные мазки будут собираться исследовательской группой, за исключением стандартного послеоперационного приема (30 дней после операции) для живых доноров, которые будут собирать свои собственные образцы.
Координатор исследования проведет краткую оценку диеты (SDA) для участников перед операцией на исходном уровне и на 2-й, 15-й и 30-й дни после операции.
Участники, чей запланированный срок пребывания в больнице продлен по сравнению с предоперационным планом, заполнят анкету за 2 дня до предполагаемой даты выписки из больницы.
Анкета Национального обследования состояния здоровья и питания (NHANES) за 2009-2010 гг. будет заполнена на 2-й послеоперационный день. В анкете задаются вопросы о продуктах, потребляемых в течение последних 30 дней.
В анкете 25 пунктов, и в зависимости от полученных ответов могут быть заданы дополнительные вопросы.
Анкета будет заполняться самостоятельно или проводиться членом исследовательской группы.
|
|
Донор почечного трансплантата
Участники, которым запланирована плановая трансплантация почки в качестве донора почки. Все участники выполнят следующие действия:
|
Участники предоставят образец стула на исходном уровне (до операции) и через 30 дней после операции по пересадке.
Образцы стула будут собраны участником самостоятельно.
Анальные мазки будут собираться до операции (базовый уровень) и на 2-й, 15-й и 30-й дни после операции.
Участникам, чья запланированная продолжительность госпитализации продлена по сравнению с предоперационным планом, будет взят дополнительный необязательный анальный мазок за 2 дня до предполагаемой даты выписки из больницы.
Анальные мазки будут собираться исследовательской группой, за исключением стандартного послеоперационного приема (30 дней после операции) для живых доноров, которые будут собирать свои собственные образцы.
Координатор исследования проведет краткую оценку диеты (SDA) для участников перед операцией на исходном уровне и на 2-й, 15-й и 30-й дни после операции.
Участники, чей запланированный срок пребывания в больнице продлен по сравнению с предоперационным планом, заполнят анкету за 2 дня до предполагаемой даты выписки из больницы.
Анкета Национального обследования состояния здоровья и питания (NHANES) за 2009-2010 гг. будет заполнена на 2-й послеоперационный день. В анкете задаются вопросы о продуктах, потребляемых в течение последних 30 дней.
В анкете 25 пунктов, и в зависимости от полученных ответов могут быть заданы дополнительные вопросы.
Анкета будет заполняться самостоятельно или проводиться членом исследовательской группы.
|
Что измеряет исследование?
Первичные показатели результатов
Мера результата |
Мера Описание |
Временное ограничение |
|---|---|---|
|
Изменение состава микробиоты
Временное ограничение: От исходного уровня до 30-го дня после операции
|
Чтобы понять общее влияние хирургической профилактики на состав кишечной микробиоты в условиях операции по пересадке почки, будет описано распределение и относительная численность таксонов бактерий и грибков для каждого собранного образца.
Род штамма будет считаться преобладающим, если он представляет не менее 30% всех родов или штаммов микробиоты в образце стула.
|
От исходного уровня до 30-го дня после операции
|
|
Изменение разнообразия микробиоты
Временное ограничение: От исходного уровня до 30-го дня после операции
|
Чтобы понять общее влияние хирургической профилактики на разнообразие кишечной микробиоты в условиях операции по пересадке почки, будут использоваться показатели α- и β-разнообразия кишечной микробиоты.
Максимальный процент всех идентифицированных генов, включенных в один и тот же таксон, будет определяться из каждого образца стула.
|
От исходного уровня до 30-го дня после операции
|
|
Изменение таксономии микробиоты
Временное ограничение: От исходного уровня до 30-го дня после операции
|
Чтобы понять общее влияние хирургической профилактики на таксономию кишечной микробиоты в условиях операции по пересадке почки, собранные образцы будут использоваться для определения таксономического состава бактерий и грибов.
Полногеномное метагеномное секвенирование будет проводиться на Illumina Miseq (или HiSeq).
Картограф с коротким считыванием будет использоваться для отбора и исключения последовательностей человека из каждого образца стула, а затем для определения таксономического состава будут использоваться Metaphlan и KRAKEN.
|
От исходного уровня до 30-го дня после операции
|
|
Изменение резистома микробиоты
Временное ограничение: От исходного уровня до 30-го дня после операции
|
Чтобы понять общее влияние хирургической профилактики на резистентность кишечной микробиоты в условиях операции по пересадке почки, собранные образцы исследования будут использоваться для предоставления сводки об общем количестве и разнообразии генов резистентности к бактериям и грибкам, включая любое новое приобретение.
|
От исходного уровня до 30-го дня после операции
|
Вторичные показатели результатов
Мера результата |
Мера Описание |
Временное ограничение |
|---|---|---|
|
Состав микробиоты у больных на почечном диализе
Временное ограничение: Базовый уровень
|
Чтобы понять состав кишечной микробиоты у пациентов, получающих почечный диализ, будет описано распределение и относительная численность бактериальных и грибковых таксонов для каждого собранного образца.
Род штамма будет считаться преобладающим, если он представляет не менее 30% всех родов или штаммов микробиоты в образце стула, собранном на исходном уровне (до трансплантации почки).
|
Базовый уровень
|
|
Разнообразие микробиоты у пациентов с почечным диализом
Временное ограничение: Базовый уровень
|
Чтобы понять альфа- и бета-разнообразие кишечной микробиоты у пациентов, получающих почечный диализ, максимальный процент всех идентифицированных генов, включенных в один и тот же таксон, будет определен из образцов исследования, собранных на исходном уровне (до трансплантации почки).
|
Базовый уровень
|
|
Резистомная микробиота у больных на почечном диализе
Временное ограничение: Базовый уровень
|
Чтобы понять устойчивость кишечной микробиоты у пациентов, получающих почечный диализ, образцы исследования, собранные на исходном уровне (до трансплантации почки), будут использоваться для получения сводки об общем количестве и разнообразии генов устойчивости бактерий.
|
Базовый уровень
|
Другие показатели результатов
Мера результата |
Мера Описание |
Временное ограничение |
|---|---|---|
|
Сравните состав микробиоты доноров и реципиентов
Временное ограничение: Базовый уровень
|
Исследовательская цель этого исследования состоит в том, чтобы охарактеризовать сходства и различия в кишечной микробиоте между живыми донорами и реципиентами в исходный момент времени.
Будут описаны распределение и относительная численность бактериальных и грибковых таксонов для каждого исходного образца (до трансплантации почки).
Род штамма будет считаться преобладающим, если он представляет не менее 30% всех родов или штаммов микробиоты в образце стула.
|
Базовый уровень
|
|
Сравните разнообразие микробиоты доноров и реципиентов
Временное ограничение: Базовый уровень
|
Исследовательская цель этого исследования состоит в том, чтобы охарактеризовать сходства и различия в кишечной микробиоте между живыми донорами и реципиентами в исходный момент времени.
Максимальный процент всех идентифицированных генов, включенных в один и тот же таксон, будет определяться из каждого образца стула, собранного до трансплантации почки.
|
Базовый уровень
|
|
Сравните таксономию микробиоты доноров и реципиентов
Временное ограничение: Базовый уровень
|
Исследовательская цель этого исследования состоит в том, чтобы охарактеризовать сходства и различия в кишечной микробиоте между живыми донорами и реципиентами в исходный момент времени.
Собранные для исследования образцы будут использованы для определения таксономического состава бактерий и грибов.
Полногеномное метагеномное секвенирование будет проводиться на Illumina Miseq (или HiSeq).
Картограф с коротким считыванием будет использоваться для отбора и исключения последовательностей человека из каждого образца стула, а затем для определения таксономического состава будут использоваться Metaphlan и KRAKEN.
|
Базовый уровень
|
|
Сравните резистом микробиоты доноров и реципиентов.
Временное ограничение: Базовый уровень
|
Исследовательская цель этого исследования состоит в том, чтобы охарактеризовать сходства и различия в кишечной микробиоте между живыми донорами и реципиентами в исходный момент времени.
Собранные образцы для исследования будут использованы для предоставления сводки об общем количестве и разнообразии генов устойчивости к бактериям и грибкам, включая любые новые приобретения.
|
Базовый уровень
|
Соавторы и исследователи
Спонсор
Следователи
- Главный следователь: Colleen S Kraft, MD, MSc, Emory University
Даты записи исследования
Изучение основных дат
Начало исследования (Действительный)
Первичное завершение (Действительный)
Завершение исследования (Действительный)
Даты регистрации исследования
Первый отправленный
Впервые представлено, что соответствует критериям контроля качества
Первый опубликованный (Оцененный)
Обновления учебных записей
Последнее опубликованное обновление (Действительный)
Последнее отправленное обновление, отвечающее критериям контроля качества
Последняя проверка
Дополнительная информация
Термины, связанные с этим исследованием
Ключевые слова
Другие идентификационные номера исследования
- IRB00092450
- 16IPA1609418 (Другой номер гранта/финансирования: Centers for Disease Control and Prevention (CDC))
- 16IPA1609428 (Другой номер гранта/финансирования: Centers for Disease Control and Prevention (CDC))
- CDC-IRB00092450 (Другой идентификатор: Centers for Disease Control and Prevention (CDC))
Планирование данных отдельных участников (IPD)
Планируете делиться данными об отдельных участниках (IPD)?
Информация о лекарствах и устройствах, исследовательские документы
Изучает лекарственный продукт, регулируемый FDA США.
Изучает продукт устройства, регулируемый Управлением по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов США.
продукт, произведенный в США и экспортированный из США.
Эта информация была получена непосредственно с веб-сайта clinicaltrials.gov без каких-либо изменений. Если у вас есть запросы на изменение, удаление или обновление сведений об исследовании, обращайтесь по адресу register@clinicaltrials.gov. Как только изменение будет реализовано на clinicaltrials.gov, оно будет автоматически обновлено и на нашем веб-сайте. .