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腎移植の寄贈または受領後の腸内微生物叢の進化の特徴付け (COMET-DR)

2024年1月2日 更新者:Colleen S. Kraft、Emory University

これは、仮説を立てるパイロット研究です。 その目的は、腸内マイクロバイオームに対する周術期の実践の影響をモデル化し、おそらくこれらの状態を最終的なマイクロバイオームの状態 (例えば、周術期の実践と術前のマイクロバイオームの状態に関連する耐性遺伝子の数と多様性) に関連付けることです。 参加者には、腎臓を受け取るか提供するために手術を受けている個人が含まれます。 経時的な腸内微生物叢の多様性の変化を判断するために、手術前と手術後のいくつかの時点で直腸スワブが収集され、最後のスワブは手術後 30 日で収集されます。

このパイロット研究は、後続の臨床試験の理論的根拠と設計をサポートする予備データを取得することです。 この研究は、腎移植手術の設定における腸内微生物叢の多様性と、抗生物質の使用と関連するレジストーム (サンプル内のすべての抗生物質耐性遺伝子と前駆体のコレクション) の臨床的意義を理解するために設計されています。

調査の概要

詳細な説明

多剤耐性菌 (MDRO) の出現は、世界の公衆衛生に対する脅威の増大であり、一般臓器移植集団と固形臓器移植集団の両方で高い罹患率と死亡率に関連付けられています。 腸内微生物叢の多様性は、細菌および真菌の MDRO コロニー形成に対する機能的および空間的バリアを提供する可能性があり、多様性の喪失は MDRO コロニー形成の増加に関連しています。 ディスバイオーシスは、微生物叢の多様性が失われた状態であり、1 回の抗生物質治療コースは、そうでなければ健康な個人であっても、微生物叢の多様性に重大な混乱を引き起こす可能性があります。 この混乱は、病原性および多剤耐性の細菌および真菌の増殖を促進する可能性があります。 特に移植患者は、免疫調節療法、ヘルスケアへの曝露、抗生物質への曝露の増加、および粘膜の外科的処置のために、MDROのコロニー形成および感染のリスクが高くなります。 さらに、移植に至るまでの慢性腎臓病と透析療法は、腸と歯周のマイクロバイオームの両方の変化に関連していることが示されています。 腎臓移植レシピエントと健康な腎臓移植ドナーの両方における、移植外科的予防期間中の腸内マイクロバイオームの破壊の進展を理解することは、MDRO定着のリスクを軽減する可能性のある研究と可能な介入のためのさらなる道への貴重な洞察を与える.

これは、100 人の成人腎移植レシピエントと 100 人の成人腎移植ドナーを登録することを目的とした、前向き、観察的、非介入的なパイロット研究です。 参加者は、便のサンプルと肛門スワブのサンプルを提供し、食事に関するアンケートに記入します。 参加者は、将来の研究使用のために残りの便を銀行に保管することを含む、オプションのサブスタディに参加することも選択できます。

経時的な腸内微生物叢の多様性の変化は、スクリーニング訪問、術後2日目に評価されます。退院後 15 日目と退院後 30 日目。 参加者は、手術後24週間の医療記録レビューの方法で追跡されます。

この研究は、腎移植手術の設定における腸内微生物叢の多様性と、抗生物質の使用と関連するレジストーム (サンプル内のすべての抗生物質耐性遺伝子と前駆体のコレクション) の臨床的意義を理解するために設計されています。 この研究から得られた情報は、将来の臨床試験の設計を導くために使用されます。

研究の種類

観察的

入学 (推定)

200

連絡先と場所

このセクションには、調査を実施する担当者の連絡先の詳細と、この調査が実施されている場所に関する情報が記載されています。

研究連絡先

研究場所

    • Georgia
      • Atlanta、Georgia、アメリカ、30322
        • The Emory Clinic
      • Atlanta、Georgia、アメリカ、30324
        • Emory University Hospital

参加基準

研究者は、適格基準と呼ばれる特定の説明に適合する人を探します。これらの基準のいくつかの例は、人の一般的な健康状態または以前の治療です。

適格基準

就学可能な年齢

18年歳以上 (大人、高齢者)

健康ボランティアの受け入れ

いいえ

サンプリング方法

非確率サンプル

調査対象母集団

腎移植レシピエントおよび生体ドナー

説明

包含基準:

  • -書面によるインフォームドコンセント文書を理解する能力と署名する意欲。
  • -研究プロトコルの要件を順守する能力と意欲。
  • 記入済み口頭審査フォーム
  • -書面によるインフォームドコンセントの時点から28日以内に計画された腎臓提供または生体腎移植の計画された受領。
  • パフォーマンスステータスがわかっている場合は、次のいずれかのスコア:

    • 米国麻酔学会 (ASA) 分類 I (正常な健康な患者)、II (軽度の全身性疾患の患者)、または III (重度の全身性疾患の患者)
    • -Eastern Cooperative Oncology Group(ECOG)ステータス スケール グレード 0(通常の活動)、1(症状はあるが歩行可能)または 2(就寝時間の 50% 未満)
    • Karnofsky Performance Scale (KPS) が 50% (かなりの支援と頻繁な医療が必要) から 100% (正常、苦情なし、病気の証拠なし)
  • 英語を話す。

除外基準:

  • 治験責任医師の意見では、治験の目的を妨げたり、治験要件の順守を制限したりする可能性のある状態には、以下が含まれますがこれらに限定されません:

    • -既知のアクティブな静脈内薬物またはアルコール乱用
    • 精神疾患
    • 社会的状況
  • 死亡したドナーの腎臓移植の計画的または実際の受領。
  • -まだ積極的な免疫抑制治療または介入が必要な以前の腎移植。
  • 回腸造瘻術または人工肛門造設術の存在。

研究計画

このセクションでは、研究がどのように設計され、研究が何を測定しているかなど、研究計画の詳細を提供します。

研究はどのように設計されていますか?

デザインの詳細

  • 観測モデル:他の
  • 時間の展望:見込みのある

コホートと介入

グループ/コホート
介入・治療
腎移植レシピエント

-腎臓のレシピエントとして計画された腎移植が予定されている参加者。

すべての参加者は、次の介入を完了します。

  • 便検体採取
  • 肛門スワブサンプリング
  • ショート・ダイエット・アセスメント (SDA)
  • NHANES ダイエット スクリーナー アンケート (DSQ)
参加者は、ベースライン時 (手術前) および移植手術の 30 日後に便サンプルを提供します。 糞便標本は、参加者によって自己収集されます。
肛門スワブは、手術前 (ベースライン) と手術後 2、15、および 30 日目に収集されます。 計画された入院期間が手術前の計画から延長された参加者は、退院予定日の2日前に追加のオプションの肛門スワブを採取します。 肛門スワブは研究チームによって収集されますが、独自のサンプルを収集する生体ドナーの標準的な手術後の予約(手術後30日)を除きます。
研究コーディネーターは、ベースラインでの手術前および手術後の2、15、および30日目に、参加者に短時間の食事評価(SDA)を実施します。 計画された入院期間が手術前計画から延長された参加者は、予想される退院日の2日前にアンケートに回答します。
国民健康栄養調査 (NHANES) 2009-2010 食事スクリーナー アンケートは、手術後 2 日目に完了します。アンケートでは、過去 30 日間に消費された食品について質問します。 アンケートは 25 項目あり、回答内容によっては追加の質問をする場合があります。 アンケートは自己管理または研究チームのメンバーによって管理されます。
腎移植ドナー

-腎臓のドナーとして計画された腎移植が予定されている参加者。

すべての参加者は、次の介入を完了します。

  • 便検体採取
  • 肛門スワブサンプリング
  • ショート・ダイエット・アセスメント (SDA)
  • NHANES ダイエット スクリーナー アンケート (DSQ)
参加者は、ベースライン時 (手術前) および移植手術の 30 日後に便サンプルを提供します。 糞便標本は、参加者によって自己収集されます。
肛門スワブは、手術前 (ベースライン) と手術後 2、15、および 30 日目に収集されます。 計画された入院期間が手術前の計画から延長された参加者は、退院予定日の2日前に追加のオプションの肛門スワブを採取します。 肛門スワブは研究チームによって収集されますが、独自のサンプルを収集する生体ドナーの標準的な手術後の予約(手術後30日)を除きます。
研究コーディネーターは、ベースラインでの手術前および手術後の2、15、および30日目に、参加者に短時間の食事評価(SDA)を実施します。 計画された入院期間が手術前計画から延長された参加者は、予想される退院日の2日前にアンケートに回答します。
国民健康栄養調査 (NHANES) 2009-2010 食事スクリーナー アンケートは、手術後 2 日目に完了します。アンケートでは、過去 30 日間に消費された食品について質問します。 アンケートは 25 項目あり、回答内容によっては追加の質問をする場合があります。 アンケートは自己管理または研究チームのメンバーによって管理されます。

この研究は何を測定していますか?

主要な結果の測定

結果測定
メジャーの説明
時間枠
微生物叢組成の変化
時間枠:ベースラインから術後 30 日目まで
腎移植手術の設定における腸内微生物叢組成に対する外科的予防の全体的な影響を理解するために、収集された各サンプルの細菌および真菌分類群の分布と相対存在量が説明されます。 株の属は、糞便サンプル内の微生物叢のすべての属または株の少なくとも 30% を表す場合、優勢であると見なされます。
ベースラインから術後 30 日目まで
微生物叢の多様性の変化
時間枠:ベースラインから術後 30 日目まで
腎移植手術の設定における腸内微生物叢の多様性に対する外科的予防の全体的な影響を理解するために、腸内微生物叢のα-およびβ-多様性の測定が利用されます。 同じ分類群内に含まれる識別されたすべての遺伝子の最大パーセンテージは、各糞便サンプルから決定されます。
ベースラインから術後 30 日目まで
微生物叢の分類の変化
時間枠:ベースラインから術後 30 日目まで
腸内微生物叢の分類に対する外科的予防の全体的な影響を理解するために、腎移植手術の設定において、収集された標本は細菌および真菌の分類学的組成決定に使用されます。 全ゲノム ショットガン メタゲノム シーケンスは、Illumina Miseq (または HiSeq) で実行されます。 ショートリードマッパーを使用して、各糞便サンプルからヒト配列をスクリーニングして破棄し、その後、分類学的組成の決定に Metaphlan と KRAKEN を使用します。
ベースラインから術後 30 日目まで
微生物叢のレジスタンスの変化
時間枠:ベースラインから術後 30 日目まで
腸内細菌叢耐性に対する外科的予防の全体的な影響を理解するために、腎移植手術の設定において、収集された研究サンプルを使用して、細菌および真菌耐性遺伝子の総数と多様性の概要を提供します。これには、新たな獲得が含まれます。
ベースラインから術後 30 日目まで

二次結果の測定

結果測定
メジャーの説明
時間枠
腎透析患者の微生物叢組成
時間枠:ベースライン
腎透析を受けている患者の腸内微生物叢の組成を理解するために、収集された各サンプルの細菌および真菌分類群の分布と相対存在量について説明します。 ベースライン(腎移植前)に収集された糞便サンプル内の微生物叢のすべての属または株の少なくとも 30% を表す場合、株の属は優勢であると見なされます。
ベースライン
腎透析患者における微生物叢の多様性
時間枠:ベースライン
腎透析を受けている患者の腸内微生物叢のアルファおよびベータの多様性を理解するために、同じ分類群に含まれる特定されたすべての遺伝子の最大パーセンテージが、ベースラインで収集された研究サンプルから決定されます (腎移植前)。
ベースライン
腎透析患者における微生物叢の抵抗性
時間枠:ベースライン
腎透析を受けている患者の腸内微生物叢の耐性を理解するために、ベースライン(腎移植前)に収集された研究サンプルを使用して、細菌耐性遺伝子の総数と多様性の要約を提供します。
ベースライン

その他の成果指標

結果測定
メジャーの説明
時間枠
ドナーとレシピエントの微生物叢の組成を比較する
時間枠:ベースライン
この研究の探索的目的は、ベースライン時点での生きているドナーとレシピエントの間の腸内微生物叢の類似点と相違点を特徴付けることです。 各ベースライン サンプル (腎移植前) の細菌および真菌分類群の分布と相対存在量について説明します。 株の属は、糞便サンプル内の微生物叢のすべての属または株の少なくとも 30% を表す場合、優勢であると見なされます。
ベースライン
ドナーとレシピエントの微生物叢の多様性を比較する
時間枠:ベースライン
この研究の探索的目的は、ベースライン時点での生きているドナーとレシピエントの間の腸内微生物叢の類似点と相違点を特徴付けることです。 同じ分類群内に含まれる同定されたすべての遺伝子の最大パーセンテージは、腎移植前に収集された各糞便サンプルから決定されます。
ベースライン
ドナーとレシピエントの微生物叢の分類を比較する
時間枠:ベースライン
この研究の探索的目的は、ベースライン時点での生きているドナーとレシピエントの間の腸内微生物叢の類似点と相違点を特徴付けることです。 収集された研究サンプルは、細菌および真菌の分類学的構成決定に使用されます。 全ゲノム ショットガン メタゲノム シーケンスは、Illumina Miseq (または HiSeq) で実行されます。 ショートリードマッパーを使用して、各糞便サンプルからヒト配列をスクリーニングして破棄し、その後、分類学的組成の決定に Metaphlan と KRAKEN を使用します。
ベースライン
ドナーとレシピエントの微生物叢の抵抗性を比較する
時間枠:ベースライン
この研究の探索的目的は、ベースライン時点での生きているドナーとレシピエントの間の腸内微生物叢の類似点と相違点を特徴付けることです。 収集された研究サンプルは、新しい取得を含む細菌および真菌耐性遺伝子の総数と多様性の概要を提供するために使用されます。
ベースライン

協力者と研究者

ここでは、この調査に関係する人々や組織を見つけることができます。

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捜査官

  • 主任研究者:Colleen S Kraft, MD, MSc、Emory University

研究記録日

これらの日付は、ClinicalTrials.gov への研究記録と要約結果の提出の進捗状況を追跡します。研究記録と報告された結果は、国立医学図書館 (NLM) によって審査され、公開 Web サイトに掲載される前に、特定の品質管理基準を満たしていることが確認されます。

主要日程の研究

研究開始 (実際)

2017年10月2日

一次修了 (推定)

2025年12月1日

研究の完了 (推定)

2025年12月1日

試験登録日

最初に提出

2017年2月2日

QC基準を満たした最初の提出物

2017年2月2日

最初の投稿 (推定)

2017年2月6日

学習記録の更新

投稿された最後の更新 (実際)

2024年1月5日

QC基準を満たした最後の更新が送信されました

2024年1月2日

最終確認日

2024年1月1日

詳しくは

本研究に関する用語

その他の研究ID番号

  • IRB00092450
  • 16IPA1609418 (その他の助成金/資金番号:Centers for Disease Control and Prevention (CDC))
  • 16IPA1609428 (その他の助成金/資金番号:Centers for Disease Control and Prevention (CDC))

個々の参加者データ (IPD) の計画

個々の参加者データ (IPD) を共有する予定はありますか?

いいえ

医薬品およびデバイス情報、研究文書

米国FDA規制医薬品の研究

いいえ

米国FDA規制機器製品の研究

いいえ

米国で製造され、米国から輸出された製品。

いいえ

この情報は、Web サイト clinicaltrials.gov から変更なしで直接取得したものです。研究の詳細を変更、削除、または更新するリクエストがある場合は、register@clinicaltrials.gov。 までご連絡ください。 clinicaltrials.gov に変更が加えられるとすぐに、ウェブサイトでも自動的に更新されます。

便検体採取の臨床試験

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