Charakterizace vývoje střevního mikrobiomu po darování nebo příjmu transplantace ledvin (COMET-DR)
Toto je pilotní studie generující hypotézy. Záměrem je modelovat dopad perioperačních praktik na střevní mikrobiom a případně spojit tyto stavy s konečným stavem mikrobiomu (např. počet genů rezistence a diverzita spojená s perioperačními praktikami a předoperačním stavem mikrobiomu). Mezi účastníky budou jedinci, kteří podstoupí operaci za účelem získání nebo darování ledviny. K určení změny diverzity střevní mikroflóry v průběhu času se před operací a v několika časových bodech po operaci odeberou rektální výtěry, přičemž poslední výtěr se odebere 30 dní po operaci.
Tato pilotní studie má získat předběžná data na podporu odůvodnění a návrhu následné klinické studie. Tato studie je navržena tak, aby porozuměla diverzitě střevní mikroflóry v prostředí transplantace ledvin a klinickému významu užívání antibiotik a souvisejícího rezistomu (soubor všech genů a prekurzorů antibiotické rezistence ve vzorku).
Přehled studie
Postavení
Podmínky
Detailní popis
Výskyt multirezistentních organismů (MDRO) je rostoucí hrozbou pro globální veřejné zdraví a je spojen s vysokou morbiditou a úmrtností jak u obecné populace, tak u populace po transplantaci solidních orgánů. Diverzita střevní mikroflóry může poskytnout funkční a prostorové bariéry pro bakteriální a houbovou kolonizaci MDRO a ztráta diverzity je spojena se zvýšenou kolonizací MDRO. Dysbióza je stav ztráty diverzity mikroflóry a jediná léčba antibiotiky může způsobit významné narušení diverzity mikrobioty, a to i u jinak zdravých jedinců. Toto narušení může podporovat růst patogenních a multirezistentních bakterií a hub. Zejména pacienti po transplantaci jsou vystaveni zvýšenému riziku kolonizace a infekce MDRO v důsledku imunomodulačních terapií, vystavení zdravotní péči, zvýšené expozici antibiotikům a chirurgické manipulaci se sliznicí. Dále bylo prokázáno, že chronické onemocnění ledvin a dialyzační terapie vedoucí k transplantaci jsou spojeny se změnami střevního i periodontálního mikrobiomu. Pochopení vývoje narušení střevního mikrobiomu jak u příjemců transplantované ledviny, tak u zdravých dárců transplantátu ledviny během transplantační chirurgické profylaxe poskytne cenný pohled na další cesty výzkumu a možných intervencí, které mohou zmírnit riziko kolonizace MDRO.
Toto je prospektivní, observační a neintervenční pilotní studie, jejímž cílem je zapsat 100 dospělých příjemců transplantátu ledviny a 100 dospělých dárců transplantátu ledviny. Účastníci poskytnou vzorky stolice a anální výtěry a vyplní dietní dotazníky. Účastníci se mohou také rozhodnout zúčastnit se volitelné dílčí studie, která zahrnuje uložení zbytkové stolice pro budoucí výzkumné použití.
Změna diverzity střevní mikrobioty v průběhu času bude hodnocena při screeningové návštěvě, pooperační den 2; Den po propuštění 15 a den po propuštění 30. Účastníci budou sledováni formou kontroly lékařské dokumentace po dobu 24 týdnů po operaci.
Tato studie je navržena tak, aby porozuměla diverzitě střevní mikroflóry v prostředí transplantace ledvin a klinickému významu užívání antibiotik a souvisejícího rezistomu (soubor všech genů a prekurzorů antibiotické rezistence ve vzorku). Informace získané z této studie budou použity jako vodítko pro návrh budoucích klinických studií.
Typ studie
Zápis (Odhadovaný)
Kontakty a umístění
Studijní místa
-
-
Georgia
-
Atlanta, Georgia, Spojené státy, 30322
- The Emory Clinic
-
Atlanta, Georgia, Spojené státy, 30324
- Emory University Hospital
-
-
Kritéria účasti
Kritéria způsobilosti
Věk způsobilý ke studiu
Přijímá zdravé dobrovolníky
Metoda odběru vzorků
Studijní populace
Popis
Kritéria pro zařazení:
- Schopnost porozumět a ochota podepsat písemný informovaný souhlas.
- Schopnost a ochota splnit požadavky protokolu studie.
- Vyplněný ústní screeningový formulář
- Plánované dárcovství ledviny nebo plánovaný příjem transplantace ledviny od žijícího dárce do 28 dnů od písemného informovaného souhlasu.
Pokud je znám stav výkonu, skóre kteréhokoli z následujících:
- American Society of Anesthesia (ASA) klasifikace I (normální zdravý pacient), II (pacient s mírným systémovým onemocněním) nebo III (pacient se závažným systémovým onemocněním)
- Stupeň škály stavu Eastern Cooperative Oncology Group (ECOG) 0 (normální aktivita), 1 (symptomy, ale ambulantně) nebo 2 (v lůžku <50 % času)
- Karnofsky Performance Scale (KPS) od 50 % (vyžaduje značnou asistenci a častou lékařskou péči) až 100 % (normální, žádné stížnosti, žádné známky onemocnění)
- Anglicky mluvící.
Kritéria vyloučení:
Jakýkoli stav, který by podle názoru zkoušejícího mohl narušovat cíle studie nebo omezovat soulad s požadavky studie, mimo jiné včetně:
- Známé aktivní nitrožilní zneužívání drog nebo alkoholu
- Psychiatrické onemocnění
- Sociální situace
- Plánovaný nebo skutečný příjem transplantace ledviny od zemřelého dárce.
- Předchozí transplantace ledviny, která stále vyžaduje aktivní imunosupresivní léčbu nebo intervenci.
- Přítomnost odkláněcí ileostomie nebo kolostomie.
Studijní plán
Jak je studie koncipována?
Detaily designu
- Observační modely: Jiný
- Časové perspektivy: Budoucí
Kohorty a intervence
Skupina / kohorta |
Intervence / Léčba |
|---|---|
|
Příjemce transplantátu ledviny
Účastníci, kteří jsou naplánováni na plánovanou transplantaci ledviny jako příjemce ledviny. Všichni účastníci provedou následující zásahy:
|
Účastníci poskytnou vzorek stolice na začátku (před operací) a 30 dní po transplantaci.
Vzorky stolice si účastník sám odebere.
Anální výtěry budou odebrány před operací (základní stav) a ve dnech 2, 15 a 30 po operaci.
Účastníkům, jejichž plánovaná doba hospitalizace je prodloužena oproti předoperačnímu plánu, bude odebrán další volitelný anální výtěr 2 dny před předpokládaným datem propuštění z nemocnice.
Anální výtěry budou odebírány studijním týmem, s výjimkou standardní péče pooperační schůzky (30 dní po operaci) pro žijící dárce, kteří si odeberou své vlastní vzorky.
Koordinátor studie provede účastníkům hodnocení krátké diety (SDA) před operací ve dnech 2, 15 a 30 po operaci.
Účastníci, jejichž plánovaná délka hospitalizace je prodloužena oproti předoperačnímu plánu, vyplní dotazník 2 dny před předpokládaným datem propuštění z nemocnice.
Dotazník National Health and Nutrition Examination Survey (NHANES) 2009-2010 bude vyplněn 2. pooperační den. Dotazník se ptá na potraviny zkonzumované během posledních 30 dnů.
Dotazník obsahuje 25 položek a v závislosti na poskytnutých odpovědích mohou být položeny další otázky.
Dotazník bude administrován samostatně nebo bude administrován členem studijního týmu.
|
|
Dárce transplantace ledvin
Účastníci, kteří jsou naplánováni na plánovanou transplantaci ledviny jako dárce ledviny. Všichni účastníci provedou následující zásahy:
|
Účastníci poskytnou vzorek stolice na začátku (před operací) a 30 dní po transplantaci.
Vzorky stolice si účastník sám odebere.
Anální výtěry budou odebrány před operací (základní stav) a ve dnech 2, 15 a 30 po operaci.
Účastníkům, jejichž plánovaná doba hospitalizace je prodloužena oproti předoperačnímu plánu, bude odebrán další volitelný anální výtěr 2 dny před předpokládaným datem propuštění z nemocnice.
Anální výtěry budou odebírány studijním týmem, s výjimkou standardní péče pooperační schůzky (30 dní po operaci) pro žijící dárce, kteří si odeberou své vlastní vzorky.
Koordinátor studie provede účastníkům hodnocení krátké diety (SDA) před operací ve dnech 2, 15 a 30 po operaci.
Účastníci, jejichž plánovaná délka hospitalizace je prodloužena oproti předoperačnímu plánu, vyplní dotazník 2 dny před předpokládaným datem propuštění z nemocnice.
Dotazník National Health and Nutrition Examination Survey (NHANES) 2009-2010 bude vyplněn 2. pooperační den. Dotazník se ptá na potraviny zkonzumované během posledních 30 dnů.
Dotazník obsahuje 25 položek a v závislosti na poskytnutých odpovědích mohou být položeny další otázky.
Dotazník bude administrován samostatně nebo bude administrován členem studijního týmu.
|
Co je měření studie?
Primární výstupní opatření
Měření výsledku |
Popis opatření |
Časové okno |
|---|---|---|
|
Změna složení mikrobioty
Časové okno: Výchozí stav do pooperačního dne 30
|
Abychom porozuměli celkovému dopadu chirurgické profylaxe na složení střevní mikroflóry při transplantaci ledviny, bude popsána distribuce a relativní četnost bakteriálních a plísňových taxonů pro každý odebraný vzorek.
Rod kmene bude považován za převládající, pokud představuje alespoň 30 % všech rodů nebo kmenů mikrobioty ve vzorku stolice.
|
Výchozí stav do pooperačního dne 30
|
|
Změna diverzity mikrobioty
Časové okno: Výchozí stav do pooperačního dne 30
|
Pro pochopení celkového dopadu chirurgické profylaxe na diverzitu střevní mikroflóry v podmínkách transplantace ledviny budou využita měření α- a β-diverzity střevní mikrobioty.
Maximální procento všech genů identifikovaných ve stejném taxonu bude určeno z každého vzorku stolice.
|
Výchozí stav do pooperačního dne 30
|
|
Změna taxonomie mikroflóry
Časové okno: Výchozí stav do pooperačního dne 30
|
Abychom porozuměli celkovému dopadu chirurgické profylaxe na taxonomii střevní mikroflóry, v prostředí transplantační chirurgie ledviny budou odebrané vzorky použity pro stanovení taxonomického složení bakterií a hub.
Metagenomické sekvenování celého genomu brokovnicí bude provedeno na Illumina Miseq (nebo HiSeq).
K screeningu a vyřazení lidských sekvencí z každého vzorku stolice se použije mapovač pro krátké čtení a následně se pro stanovení taxonomického složení použijí Metaphlan a KRAKEN.
|
Výchozí stav do pooperačního dne 30
|
|
Změna odporu mikrobioty
Časové okno: Výchozí stav do pooperačního dne 30
|
Abychom porozuměli celkovému dopadu chirurgické profylaxe na rezistenci střevní mikroflóry, v prostředí transplantace ledviny budou shromážděné studijní vzorky použity k poskytnutí souhrnu celkového počtu a diverzity genů rezistence bakterií a plísní, včetně jakýchkoli nových akvizic.
|
Výchozí stav do pooperačního dne 30
|
Sekundární výstupní opatření
Měření výsledku |
Popis opatření |
Časové okno |
|---|---|---|
|
Složení mikrobioty u pacientů na renální dialýze
Časové okno: Základní linie
|
Abychom porozuměli složení střevní mikroflóry u pacientů podstupujících renální dialýzu, bude popsána distribuce a relativní množství taxonů bakterií a hub pro každý odebraný vzorek.
Rod kmene bude považován za převládající, pokud představuje alespoň 30 % všech rodů nebo kmenů mikroflóry ve vzorku stolice odebraném na začátku (před transplantací ledvin).
|
Základní linie
|
|
Diverzita mikroflóry u pacientů na renální dialýze
Časové okno: Základní linie
|
Abychom porozuměli diverzitě Alfa a Beta střevní mikroflóry u pacientů podstupujících renální dialýzu, maximální procento všech genů identifikovaných ve stejném taxonu bude určeno ze vzorků studie odebraných na začátku (před transplantací ledvin).
|
Základní linie
|
|
Rezistence mikrobioty u pacientů na renální dialýze
Časové okno: Základní linie
|
Abychom porozuměli rezistenci střevní mikroflóry u pacientů podstupujících renální dialýzu, vzorky ze studie odebrané na začátku (před transplantací ledviny) budou použity k poskytnutí souhrnu celkového počtu a diverzity genů bakteriální rezistence.
|
Základní linie
|
Další výstupní opatření
Měření výsledku |
Popis opatření |
Časové okno |
|---|---|---|
|
Porovnejte složení mikroflóry dárců a příjemců
Časové okno: Základní linie
|
Průzkumným cílem této studie je charakterizovat podobnosti a rozdíly ve střevní mikrobiotě mezi žijícími dárci a příjemci ve výchozím časovém bodě.
Bude popsána distribuce a relativní četnost bakteriálních a houbových taxonů pro každý základní vzorek (před transplantací ledviny).
Rod kmene bude považován za převládající, pokud představuje alespoň 30 % všech rodů nebo kmenů mikrobioty ve vzorku stolice.
|
Základní linie
|
|
Porovnejte diverzitu mikroflóry dárců a příjemců
Časové okno: Základní linie
|
Průzkumným cílem této studie je charakterizovat podobnosti a rozdíly ve střevní mikrobiotě mezi žijícími dárci a příjemci ve výchozím časovém bodě.
Maximální procento všech genů identifikovaných ve stejném taxonu bude určeno z každého vzorku stolice odebraného před transplantací ledviny.
|
Základní linie
|
|
Porovnejte taxonomii mikroflóry dárců a příjemců
Časové okno: Základní linie
|
Průzkumným cílem této studie je charakterizovat podobnosti a rozdíly ve střevní mikrobiotě mezi žijícími dárci a příjemci ve výchozím časovém bodě.
Odebrané studijní vzorky budou použity pro stanovení taxonomického složení bakterií a hub.
Metagenomické sekvenování celého genomu brokovnicí bude provedeno na Illumina Miseq (nebo HiSeq).
K screeningu a vyřazení lidských sekvencí z každého vzorku stolice se použije mapovač pro krátké čtení a následně se pro stanovení taxonomického složení použijí Metaphlan a KRAKEN.
|
Základní linie
|
|
Porovnejte odpor mikrobioty dárců a příjemců
Časové okno: Základní linie
|
Průzkumným cílem této studie je charakterizovat podobnosti a rozdíly ve střevní mikrobiotě mezi žijícími dárci a příjemci ve výchozím časovém bodě.
Shromážděné studijní vzorky budou použity k poskytnutí souhrnu celkového počtu a diverzity genů rezistence bakterií a hub, včetně jakýchkoli nových akvizic.
|
Základní linie
|
Spolupracovníci a vyšetřovatelé
Sponzor
Spolupracovníci
Vyšetřovatelé
- Vrchní vyšetřovatel: Colleen S Kraft, MD, MSc, Emory University
Termíny studijních záznamů
Hlavní termíny studia
Začátek studia (Aktuální)
Primární dokončení (Odhadovaný)
Dokončení studie (Odhadovaný)
Termíny zápisu do studia
První předloženo
První předloženo, které splnilo kritéria kontroly kvality
První zveřejněno (Odhadovaný)
Aktualizace studijních záznamů
Poslední zveřejněná aktualizace (Aktuální)
Odeslaná poslední aktualizace, která splnila kritéria kontroly kvality
Naposledy ověřeno
Více informací
Termíny související s touto studií
Klíčová slova
Další identifikační čísla studie
- IRB00092450
- 16IPA1609418 (Jiné číslo grantu/financování: Centers for Disease Control and Prevention (CDC))
- 16IPA1609428 (Jiné číslo grantu/financování: Centers for Disease Control and Prevention (CDC))
Plán pro data jednotlivých účastníků (IPD)
Plánujete sdílet data jednotlivých účastníků (IPD)?
Informace o lécích a zařízeních, studijní dokumenty
Studuje lékový produkt regulovaný americkým FDA
Studuje produkt zařízení regulovaný americkým úřadem FDA
produkt vyrobený a vyvážený z USA
Tyto informace byly beze změn načteny přímo z webu clinicaltrials.gov. Máte-li jakékoli požadavky na změnu, odstranění nebo aktualizaci podrobností studie, kontaktujte prosím register@clinicaltrials.gov. Jakmile bude změna implementována na clinicaltrials.gov, bude automaticky aktualizována i na našem webu .
Klinické studie na Transplantace ledvin
-
Abramson Cancer Center of the University of PennsylvaniaStaženoPacienti s rakovinou podstupující transplantaci kmenových buněk (RCT of ACP for Transplant)
-
Fady M Kaldas, M.D., F.A.C.S.NáborHodnotí modulaci imunosuprese na Renal Recovery Post LTSpojené státy
-
Baylor College of MedicinePatient-Centered Outcomes Research Institute; M.D. Anderson Cancer Center; The... a další spolupracovníciDokončenoSrdeční selhání v konečné fázi | Bridge-to-Transplant LVAD Placement (BTT) | Umístění cílové terapie LVAD (DT) | Odmítnutí umístění LVAD (odmítači) | Pečovatelé LVADSpojené státy
-
Northwestern UniversityNational Cancer Institute (NCI)UkončenoRakovina ledvin | Hereditary Clear Cell Renal Cell CarcinomaSpojené státy
-
Forest LaboratoriesDokončenoSyndrom systémové zánětlivé reakce (SIRS) | Augmented Renal Clearance (ARC)Spojené státy, Austrálie
-
Guru SonpavdePfizer; Hoosier Cancer Research NetworkStaženoRakovina ledvin | Clear-cell Renal Cell Carcinoma | RCC | Clear-cell Kidney CarcinomaSpojené státy
-
Mirati Therapeutics Inc.Aktivní, ne náborClear-cell Renal Cell CarcinomaSpojené státy
-
RenJi HospitalShanghai Zhongshan Hospital; Ruijin HospitalNáborClear Cell Renal Cell Carcinoma、Rezistence na imunoterapiiČína
-
National Taiwan University HospitalNeznámý
-
Hospices Civils de LyonDokončenoEnd-stage Renal Disease (ESRD)Francie
Klinické studie na Sbírka vzorků stolice
-
Weill Medical College of Cornell UniversityBecton, Dickinson and CompanyPozastaveno
-
IdentigeneCRI Lifetree Clinical ResearchNeznámý
-
M.D. Anderson Cancer CenterDokončenoRakovina prsuSpojené státy
-
Rutgers, The State University of New JerseyNational Cancer Institute (NCI)NáborPeritoneální karcinomatóza | Novotvar trávicího systému | Karcinom jater a intrahepatálních žlučovodů | Apendix Karcinom podle AJCC V8 Stage | Kolorektální karcinom podle AJCC V8 Stage | Karcinom jícnu podle stadia AJCC V8 | Karcinom žaludku podle stadia AJCC V8Spojené státy
-
Cliniques universitaires Saint-Luc- Université...Université de LiègeNáborCystická fibróza | BiomarkeryBelgie
-
Memorial Sloan Kettering Cancer CenterDokončenoRakovina prostatySpojené státy
-
Indiana UniversityUkončenoDiabetes Mellitus | Bakteriální infekce | Rána | Infikovaný vřed kůžeSpojené státy
-
University of MinnesotaNational Institute on Drug Abuse (NIDA)DokončenoPorucha užívání látkySpojené státy
-
Boston UniversityNational Cancer Institute (NCI); American College of Radiology Imaging NetworkDokončeno