Suoliston mikrobiomien evoluution luonnehdinta munuaissiirron luovutuksen tai vastaanoton jälkeen (COMET-DR)
Tämä on hypoteesia luova pilottitutkimus. Tarkoituksena on mallintaa perioperatiivisten käytäntöjen vaikutusta suoliston mikrobiomiin ja mahdollisesti yhdistää nämä tilat lopulliseen mikrobiomin tilaan (esim. resistenssigeenien määrään ja perioperatiivisiin käytäntöihin liittyvään monimuotoisuuteen ja leikkausta edeltävään mikrobiomiin). Osallistujia on henkilöitä, joille tehdään leikkaus joko munuaisen vastaanottamiseksi tai luovuttamiseksi. Suoliston mikrobiotan monimuotoisuuden muutoksen määrittämiseksi ajan mittaan peräsuolen pyyhkäisynäytteet otetaan ennen leikkausta ja useaan ajankohtaan leikkauksen jälkeen, ja viimeinen vanupuikko otetaan 30 päivää leikkauksen jälkeen.
Tämän pilottitutkimuksen tarkoituksena on saada alustavia tietoja myöhemmän kliinisen tutkimuksen perustelujen ja suunnittelun tukemiseksi. Tämä tutkimus on suunniteltu ymmärtämään suoliston mikrobiotan monimuotoisuutta munuaisensiirtoleikkauksen taustalla sekä antibioottien käytön ja siihen liittyvän resistomin kliinistä merkitystä (kaikkien antibioottiresistenssigeenien ja prekursorien kerääminen näytteessä).
Tutkimuksen yleiskatsaus
Tila
Ehdot
Yksityiskohtainen kuvaus
Monilääkeresistenttien organismien (MDRO) ilmaantuminen on kasvava uhka maailmanlaajuiselle kansanterveydelle, ja se liittyy korkeaan sairastuvuuteen ja kuolleisuuteen sekä yleisessä että kiinteässä elinsiirtopopulaatiossa. Suoliston mikrobiotan monimuotoisuus voi tarjota toiminnallisia ja alueellisia esteitä bakteerien ja sienten MDRO-kolonisaatiolle, ja monimuotoisuuden menetys liittyy lisääntyneeseen MDRO-kolonisaatioon. Dysbioosi on mikrobiotan monimuotoisuuden katoamistila ja yksi antibioottihoito voi aiheuttaa merkittäviä häiriöitä mikrobiston monimuotoisuudessa jopa muuten terveillä yksilöillä. Tämä häiriö voi edistää patogeenisten ja useille lääkkeille vastustuskykyisten bakteerien ja sienten kasvua. Erityisesti elinsiirtopotilailla on lisääntynyt kolonisaation ja MDRO-infektion riski immunomoduloivien hoitojen, terveydenhuollon altistumisen, lisääntyneen antibioottialtistuksen ja limakalvon kirurgisen manipuloinnin vuoksi. Lisäksi kroonisen munuaissairauden ja siirtoon johtavan dialyysihoidon on osoitettu liittyvän muutoksiin sekä suoliston että parodontaalin mikrobiomissa. Suoliston mikrobiomin häiriön evoluution ymmärtäminen sekä munuaisensiirron saajien että terveiden munuaisensiirtoluovuttajien siirtoleikkauksen aikana antaa arvokasta tietoa uusista tutkimusmahdollisuuksista ja mahdollisista interventioista, jotka voivat vähentää MDRO-kolonisaatioriskiä.
Tämä on prospektiivinen, havainnollinen ja ei-interventiopilottitutkimus, jonka tavoitteena on ottaa mukaan 100 aikuista munuaisensiirron saajaa ja 100 aikuista munuaisensiirtoluovuttajaa. Osallistujat tarjoavat ulostenäytteitä ja peräaukon vanupuikkonäytteitä ja täyttävät ruokavaliokyselyt. Osallistujat voivat myös halutessaan osallistua valinnaiseen osatutkimukseen, joka sisältää jäännösjakkarat tulevaa tutkimuskäyttöä varten.
Suoliston mikrobiotan monimuotoisuuden muutos ajan myötä arvioidaan seulontakäynnillä, leikkauksen jälkeisenä päivänä 2; Purkamisen jälkeinen päivä 15 ja purkamisen jälkeinen päivä 30. Osallistujia seurataan potilastiedot 24 viikon ajan leikkauksen jälkeen.
Tämä tutkimus on suunniteltu ymmärtämään suoliston mikrobiotan monimuotoisuutta munuaisensiirtoleikkauksen taustalla sekä antibioottien käytön ja siihen liittyvän resistomin kliinistä merkitystä (kaikkien antibioottiresistenssigeenien ja prekursorien kerääminen näytteessä). Tästä tutkimuksesta saatuja tietoja käytetään tulevien kliinisten tutkimusten suunnittelussa.
Opintotyyppi
Ilmoittautuminen (Todellinen)
Yhteystiedot ja paikat
Opiskelupaikat
-
-
Georgia
-
Atlanta, Georgia, Yhdysvallat, 30322
- The Emory Clinic
-
Atlanta, Georgia, Yhdysvallat, 30324
- Emory University Hospital
-
-
Osallistumiskriteerit
Kelpoisuusvaatimukset
Opintokelpoiset iät
Hyväksyy terveitä vapaaehtoisia
Näytteenottomenetelmä
Tutkimusväestö
Kuvaus
Sisällyttämiskriteerit:
- Kyky ymmärtää ja halukkuus allekirjoittaa kirjallinen tietoinen suostumusasiakirja.
- Kyky ja halu noudattaa tutkimusprotokollan vaatimuksia.
- Täytetty suullinen seulontalomake
- Suunniteltu munuaisten luovutus tai elävän luovuttajan munuaisensiirto 28 päivän kuluessa kirjallisen tietoisen suostumuksen saamisesta.
Jos suorituskyvyn tila tunnetaan, pisteet jokin seuraavista:
- American Society of Anesthesia (ASA) -luokitus I (normaali terve potilas), II (potilas, jolla on lievä systeeminen sairaus) tai III (potilas, jolla on vaikea systeeminen sairaus)
- Eastern Cooperative Oncology Group (ECOG) Status-asteikko 0 (normaali aktiivisuus), 1 (oireet, mutta avohoidossa) tai 2 (sängyssä < 50 % ajasta)
- Karnofsky Performance Scale (KPS) 50 % (vaatii huomattavaa apua ja toistuvaa lääkärinhoitoa) 100 %:iin (normaali, ei valituksia, ei merkkejä sairaudesta)
- Englantia puhuva.
Poissulkemiskriteerit:
Mikä tahansa ehto, joka tutkijan mielestä saattaa häiritä tutkimuksen tavoitteita tai rajoittaa tutkimusvaatimusten noudattamista, mukaan lukien, mutta ei rajoittuen:
- Tunnettu aktiivinen suonensisäisten huumeiden tai alkoholin väärinkäyttö
- Psykiatrinen sairaus
- Sosiaalinen tilanne
- Suunniteltu tai tosiasiallinen kuolleen luovuttajan munuaisensiirto.
- Aikaisempi munuaisensiirto, joka vaatii edelleen aktiivista immunosuppressiivista hoitoa tai interventiota.
- Suuntautuvan ileostoman tai koolostoman esiintyminen.
Opintosuunnitelma
Miten tutkimus on suunniteltu?
Suunnittelun yksityiskohdat
- Havaintomallit: Muut
- Aikanäkymät: Tulevaisuuden
Kohortit ja interventiot
Ryhmä/Kohortti |
Interventio / Hoito |
|---|---|
|
Munuaisensiirron saaja
Osallistujat, joille on suunniteltu suunniteltu munuaisensiirto munuaisen vastaanottajaksi. Kaikki osallistujat suorittavat seuraavat interventiot:
|
Osallistujat toimittavat ulostenäytteen lähtötilanteessa (ennen leikkausta) ja 30 päivää siirtoleikkauksen jälkeen.
Osallistuja kerää ulostenäytteet itse.
Anaalinäytteet otetaan ennen leikkausta (perustila) ja leikkauksen jälkeisinä päivinä 2, 15 ja 30.
Osallistujille, joiden suunniteltu sairaalahoidon kesto on pidennetty ennen leikkausta koskevaa suunnitelmaa, otetaan ylimääräinen valinnainen peräaukon vanupuikko 2 päivää ennen heidän arvioitua sairaalasta lähtöpäivää.
Tutkimusryhmä ottaa peräaukkonäytteitä lukuun ottamatta leikkauksen jälkeistä hoitoa (30 päivää leikkauksen jälkeen) eläville luovuttajille, jotka keräävät omat näytteensä.
Tutkimuksen koordinaattori antaa osallistujille lyhyen ruokavalion arvioinnin (SDA) ennen leikkausta lähtötilanteessa ja leikkauksen jälkeen päivinä 2, 15 ja 30.
Osallistujat, joiden suunniteltu sairaalassaoloaika on pidempi kuin ennen leikkausta, täyttävät kyselylomakkeen 2 päivää ennen arvioitua sairaalasta lähtöpäivää.
Kansallinen terveys- ja ravitsemustutkimuskysely (NHANES) 2009-2010 Dietary Screener -kysely täytetään leikkauksen jälkeisenä päivänä 2. Kyselyssä kysytään kuluneiden 30 päivän aikana kulutetuista elintarvikkeista.
Kyselylomakkeessa on 25 kohtaa ja lisäkysymyksiä voidaan esittää vastauksista riippuen.
Kyselyn vastaa itse tai tutkimusryhmän jäsen vastaa.
|
|
Munuaisensiirron luovuttaja
Osallistujat, joille on suunniteltu suunniteltu munuaisensiirto munuaisen luovuttajaksi. Kaikki osallistujat suorittavat seuraavat interventiot:
|
Osallistujat toimittavat ulostenäytteen lähtötilanteessa (ennen leikkausta) ja 30 päivää siirtoleikkauksen jälkeen.
Osallistuja kerää ulostenäytteet itse.
Anaalinäytteet otetaan ennen leikkausta (perustila) ja leikkauksen jälkeisinä päivinä 2, 15 ja 30.
Osallistujille, joiden suunniteltu sairaalahoidon kesto on pidennetty ennen leikkausta koskevaa suunnitelmaa, otetaan ylimääräinen valinnainen peräaukon vanupuikko 2 päivää ennen heidän arvioitua sairaalasta lähtöpäivää.
Tutkimusryhmä ottaa peräaukkonäytteitä lukuun ottamatta leikkauksen jälkeistä hoitoa (30 päivää leikkauksen jälkeen) eläville luovuttajille, jotka keräävät omat näytteensä.
Tutkimuksen koordinaattori antaa osallistujille lyhyen ruokavalion arvioinnin (SDA) ennen leikkausta lähtötilanteessa ja leikkauksen jälkeen päivinä 2, 15 ja 30.
Osallistujat, joiden suunniteltu sairaalassaoloaika on pidempi kuin ennen leikkausta, täyttävät kyselylomakkeen 2 päivää ennen arvioitua sairaalasta lähtöpäivää.
Kansallinen terveys- ja ravitsemustutkimuskysely (NHANES) 2009-2010 Dietary Screener -kysely täytetään leikkauksen jälkeisenä päivänä 2. Kyselyssä kysytään kuluneiden 30 päivän aikana kulutetuista elintarvikkeista.
Kyselylomakkeessa on 25 kohtaa ja lisäkysymyksiä voidaan esittää vastauksista riippuen.
Kyselyn vastaa itse tai tutkimusryhmän jäsen vastaa.
|
Mitä tutkimuksessa mitataan?
Ensisijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Toimenpiteen kuvaus |
Aikaikkuna |
|---|---|---|
|
Muutos mikrobiston koostumuksessa
Aikaikkuna: Lähtötilanne leikkauksen jälkeiseen päivään 30
|
Jotta voitaisiin ymmärtää kirurgisen ennaltaehkäisyn kokonaisvaikutus suoliston mikrobiotan koostumukseen munuaisensiirtoleikkauksen yhteydessä, kuvataan kunkin kerätyn näytteen bakteeri- ja sienitaksonien jakautuminen ja suhteellinen runsaus.
Kantasuku katsotaan vallitsevaksi, jos se edustaa vähintään 30 % kaikista ulostenäytteessä olevista mikrobiotan suvuista tai kannoista.
|
Lähtötilanne leikkauksen jälkeiseen päivään 30
|
|
Muutos mikrobiston monimuotoisuudessa
Aikaikkuna: Lähtötilanne leikkauksen jälkeiseen päivään 30
|
Jotta voitaisiin ymmärtää kirurgisen ennaltaehkäisyn kokonaisvaikutus suoliston mikrobiotan monimuotoisuuteen munuaisensiirtoleikkauksen yhteydessä, käytetään suoliston mikrobiotan α- ja β-diversiteettimittauksia.
Kaikkien samaan taksoniin kuuluvien tunnistettujen geenien enimmäisprosenttiosuus määritetään kustakin ulostenäytteestä.
|
Lähtötilanne leikkauksen jälkeiseen päivään 30
|
|
Mikrobiootan taksonomian muutos
Aikaikkuna: Lähtötilanne leikkauksen jälkeiseen päivään 30
|
Jotta voitaisiin ymmärtää kirurgisen ennaltaehkäisyn kokonaisvaikutus suoliston mikrobiotan taksonomiaan, munuaisensiirtoleikkauksen yhteydessä kerättyjä näytteitä käytetään bakteerien ja sienten taksonomisen koostumuksen määrittämiseen.
Koko genomin haulikon metagenominen sekvensointi suoritetaan Illumina Miseqillä (tai HiSeqillä).
Lyhytlukukartoitinta käytetään ihmissekvenssien seulomiseen ja hylkäämiseen kustakin ulostenäytteestä, ja sen jälkeen Metaphlania ja KRAKENia käytetään taksonomisen koostumuksen määrittämiseen.
|
Lähtötilanne leikkauksen jälkeiseen päivään 30
|
|
Muutos mikrobiotan resistomissa
Aikaikkuna: Lähtötilanne leikkauksen jälkeiseen päivään 30
|
Jotta voitaisiin ymmärtää kirurgisen ennaltaehkäisyn kokonaisvaikutus suoliston mikrobiotan vastustuskykyyn, munuaisensiirtoleikkauksen yhteydessä kerättyjä tutkimusnäytteitä käytetään antamaan yhteenveto bakteeri- ja sieniresistenssigeenien kokonaismäärästä ja monimuotoisuudesta, mukaan lukien mahdolliset uudet hankinnat.
|
Lähtötilanne leikkauksen jälkeiseen päivään 30
|
Toissijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Toimenpiteen kuvaus |
Aikaikkuna |
|---|---|---|
|
Mikrobiootan koostumus munuaisdialyysipotilailla
Aikaikkuna: Perustaso
|
Suoliston mikrobiotan koostumuksen ymmärtämiseksi munuaisdialyysihoitoa saavilla potilailla kuvataan kunkin kerätyn näytteen bakteeri- ja sienitaksonien jakautuminen ja suhteellinen runsaus.
Kantasuku katsotaan vallitsevaksi, jos se edustaa vähintään 30 % kaikista mikrobiotan suvuista tai kannoista lähtötilanteessa (ennen munuaisensiirtoa) kerätyssä ulostenäytteessä.
|
Perustaso
|
|
Mikrobiootan monimuotoisuus munuaisdialyysipotilailla
Aikaikkuna: Perustaso
|
Suoliston mikrobiotan alfa- ja beeta-monimuotoisuuden ymmärtämiseksi munuaisdialyysipotilailla kaikkien samaan taksoniin kuuluvien tunnistettujen geenien enimmäisprosenttiosuus määritetään lähtötilanteessa (ennen munuaisensiirtoa) kerätyistä tutkimusnäytteistä.
|
Perustaso
|
|
Mikrobiotaresistomi munuaisdialyysipotilailla
Aikaikkuna: Perustaso
|
Suoliston mikrobiotan resistenssin ymmärtämiseksi munuaisdialyysihoitoa saavilla potilailla lähtötilanteessa (ennen munuaisensiirtoa) kerättyjä tutkimusnäytteitä käytetään yhteenvedon saamiseksi bakteeriresistenssigeenien kokonaismäärästä ja monimuotoisuudesta.
|
Perustaso
|
Muut tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Toimenpiteen kuvaus |
Aikaikkuna |
|---|---|---|
|
Vertaa luovuttajien ja vastaanottajien mikrobiota
Aikaikkuna: Perustaso
|
Tämän tutkimuksen tavoitteena on karakterisoida yhtäläisyyksiä ja eroja suoliston mikrobiotassa elävän luovuttajan ja vastaanottajan välillä lähtötilanteessa.
Bakteeri- ja sienitaksonien jakautuminen ja suhteellinen runsaus kussakin lähtötilanteessa (ennen munuaisensiirtoa) kuvataan.
Kantasuku katsotaan vallitsevaksi, jos se edustaa vähintään 30 % kaikista ulostenäytteessä olevista mikrobiotan suvuista tai kannoista.
|
Perustaso
|
|
Vertaa luovuttajien ja vastaanottajien mikrobiotan monimuotoisuutta
Aikaikkuna: Perustaso
|
Tämän tutkimuksen tavoitteena on karakterisoida yhtäläisyyksiä ja eroja suoliston mikrobiotassa elävän luovuttajan ja vastaanottajan välillä lähtötilanteessa.
Kaikkien samaan taksoniin kuuluvien tunnistettujen geenien enimmäisprosenttiosuus määritetään kustakin ennen munuaisensiirtoa kerätystä ulostenäytteestä.
|
Perustaso
|
|
Vertaa luovuttajien ja vastaanottajien mikrobiota taksonomiaa
Aikaikkuna: Perustaso
|
Tämän tutkimuksen tavoitteena on karakterisoida yhtäläisyyksiä ja eroja suoliston mikrobiotassa elävän luovuttajan ja vastaanottajan välillä lähtötilanteessa.
Kerättyjä tutkimusnäytteitä käytetään bakteerien ja sienten taksonomisen koostumuksen määrittämiseen.
Koko genomin haulikon metagenominen sekvensointi suoritetaan Illumina Miseqillä (tai HiSeqillä).
Lyhytlukukartoitinta käytetään ihmissekvenssien seulomiseen ja hylkäämiseen kustakin ulostenäytteestä, ja sen jälkeen Metaphlania ja KRAKENia käytetään taksonomisen koostumuksen määrittämiseen.
|
Perustaso
|
|
Vertaa luovuttajien ja vastaanottajien mikrobiotaresistomia
Aikaikkuna: Perustaso
|
Tämän tutkimuksen tavoitteena on karakterisoida yhtäläisyyksiä ja eroja suoliston mikrobiotassa elävän luovuttajan ja vastaanottajan välillä lähtötilanteessa.
Kerättyjä tutkimusnäytteitä käytetään yhteenvedon tekemiseen bakteeri- ja sieniresistenssigeenien kokonaismäärästä ja monimuotoisuudesta, mukaan lukien mahdolliset uudet hankinnat.
|
Perustaso
|
Yhteistyökumppanit ja tutkijat
Sponsori
Yhteistyökumppanit
Tutkijat
- Päätutkija: Colleen S Kraft, MD, MSc, Emory University
Opintojen ennätyspäivät
Opi tärkeimmät päivämäärät
Opiskelun aloitus (Todellinen)
Ensisijainen valmistuminen (Todellinen)
Opintojen valmistuminen (Todellinen)
Opintoihin ilmoittautumispäivät
Ensimmäinen lähetetty
Ensimmäinen toimitettu, joka täytti QC-kriteerit
Ensimmäinen Lähetetty (Arvioitu)
Tutkimustietojen päivitykset
Viimeisin päivitys julkaistu (Todellinen)
Viimeisin lähetetty päivitys, joka täytti QC-kriteerit
Viimeksi vahvistettu
Lisää tietoa
Tähän tutkimukseen liittyvät termit
Avainsanat
Muut tutkimustunnusnumerot
- IRB00092450
- 16IPA1609418 (Muu apuraha/rahoitusnumero: Centers for Disease Control and Prevention (CDC))
- 16IPA1609428 (Muu apuraha/rahoitusnumero: Centers for Disease Control and Prevention (CDC))
- CDC-IRB00092450 (Muu tunniste: Centers for Disease Control and Prevention (CDC))
Yksittäisten osallistujien tietojen suunnitelma (IPD)
Aiotko jakaa yksittäisten osallistujien tietoja (IPD)?
Lääke- ja laitetiedot, tutkimusasiakirjat
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää lääkevalmistetta
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää laitetuotetta
Yhdysvalloissa valmistettu ja sieltä viety tuote
Nämä tiedot haettiin suoraan verkkosivustolta clinicaltrials.gov ilman muutoksia. Jos sinulla on pyyntöjä muuttaa, poistaa tai päivittää tutkimustietojasi, ota yhteyttä register@clinicaltrials.gov. Heti kun muutos on otettu käyttöön osoitteessa clinicaltrials.gov, se päivitetään automaattisesti myös verkkosivustollemme .