Charakterystyka ewolucji mikrobiomu jelitowego po oddaniu lub otrzymaniu przeszczepu nerki (COMET-DR)
Jest to badanie pilotażowe generujące hipotezy. Celem jest modelowanie wpływu praktyk okołooperacyjnych na mikrobiom jelitowy i ewentualne powiązanie tych warunków z ostatecznym stanem mikrobiomu (np. liczbą genów oporności i różnorodnością związaną z praktykami okołooperacyjnymi i przedoperacyjnym stanem mikrobiomu). Wśród uczestników znajdą się osoby, które mają operację otrzymania lub oddania nerki. Aby określić zmiany różnorodności mikroflory jelitowej w czasie, wymazy z odbytu zostaną pobrane przed operacją i w kilku punktach czasowych po operacji, przy czym ostatni wymaz zostanie pobrany 30 dni po operacji.
To badanie pilotażowe ma na celu uzyskanie wstępnych danych w celu uzasadnienia i zaprojektowania kolejnego badania klinicznego. Badanie to ma na celu zrozumienie różnorodności mikroflory jelitowej w warunkach operacji przeszczepu nerki oraz klinicznego znaczenia stosowania antybiotyków i związanego z tym oporności (zbiór wszystkich genów oporności na antybiotyki i prekursorów w próbce).
Przegląd badań
Status
Warunki
Szczegółowy opis
Pojawienie się organizmów opornych na wiele leków (MDRO) stanowi rosnące zagrożenie dla zdrowia publicznego na świecie i wiąże się z wysoką zachorowalnością i śmiertelnością zarówno w populacji ogólnej, jak i w populacji przeszczepów narządów miąższowych. Różnorodność mikroflory jelitowej może zapewnić funkcjonalne i przestrzenne bariery dla bakteryjnej i grzybiczej kolonizacji MDRO, a utrata różnorodności wiąże się ze zwiększoną kolonizacją MDRO. Dysbioza to stan utraty różnorodności mikrobiomu, a pojedyncza kuracja antybiotykowa może spowodować znaczne zakłócenia różnorodności mikrobiomu, nawet u zdrowych osób. To zakłócenie może sprzyjać wzrostowi patogennych i wielolekoopornych bakterii i grzybów. W szczególności pacjenci po przeszczepach są narażeni na zwiększone ryzyko kolonizacji i zakażenia MDRO z powodu terapii immunomodulujących, narażenia na opiekę zdrowotną, zwiększonego narażenia na antybiotyki i chirurgicznych manipulacji błoną śluzową. Co więcej, wykazano, że przewlekła choroba nerek i dializa prowadząca do przeszczepu są związane ze zmianami mikrobiomu jelitowego i przyzębia. Zrozumienie ewolucji zakłóceń w mikrobiomie jelitowym zarówno u biorców przeszczepu nerki, jak iu zdrowych dawców przeszczepu nerki w czasie profilaktyki chirurgicznej przeszczepu da cenny wgląd w dalsze kierunki badań i możliwe interwencje, które mogą złagodzić ryzyko kolonizacji MDRO.
Jest to prospektywne, obserwacyjne i nieinterwencyjne badanie pilotażowe, którego celem jest włączenie 100 dorosłych biorców przeszczepu nerki i 100 dorosłych dawców przeszczepu nerki. Uczestnicy dostarczą próbki kału i wymazu z odbytu oraz wypełnią kwestionariusze dietetyczne. Uczestnicy mogą również zdecydować się na wzięcie udziału w opcjonalnym badaniu dodatkowym, które obejmuje odkładanie resztek stolca do wykorzystania w przyszłych badaniach.
Zmiana różnorodności mikroflory jelitowej w czasie zostanie oceniona podczas wizyty przesiewowej, 2. dnia po operacji; Dzień 15 po wypisie i Dzień 30 po wypisie. Uczestnicy będą obserwowani w ramach przeglądu dokumentacji medycznej przez 24 tygodnie po operacji.
Badanie to ma na celu zrozumienie różnorodności mikroflory jelitowej w warunkach operacji przeszczepu nerki oraz klinicznego znaczenia stosowania antybiotyków i związanego z tym oporności (zbiór wszystkich genów oporności na antybiotyki i prekursorów w próbce). Informacje uzyskane z tego badania zostaną wykorzystane do ukierunkowania projektowania przyszłych badań klinicznych.
Typ studiów
Zapisy (Rzeczywisty)
Kontakty i lokalizacje
Lokalizacje studiów
-
-
Georgia
-
Atlanta, Georgia, Stany Zjednoczone, 30322
- The Emory Clinic
-
Atlanta, Georgia, Stany Zjednoczone, 30324
- Emory University Hospital
-
-
Kryteria uczestnictwa
Kryteria kwalifikacji
Wiek uprawniający do nauki
Akceptuje zdrowych ochotników
Metoda próbkowania
Badana populacja
Opis
Kryteria przyjęcia:
- Zdolność zrozumienia i gotowość do podpisania pisemnego dokumentu świadomej zgody.
- Zdolność i chęć przestrzegania wymagań protokołu badania.
- Wypełniony ustny formularz przesiewowy
- Planowane oddanie nerki lub planowane przyjęcie przeszczepu nerki od żywego dawcy w ciągu 28 dni od daty pisemnej świadomej zgody.
Jeśli znany jest stan sprawności, wynik któregokolwiek z poniższych:
- Klasyfikacja Amerykańskiego Towarzystwa Anestezjologicznego (ASA) I (normalny zdrowy pacjent), II (pacjent z łagodną chorobą ogólnoustrojową) lub III (pacjent z ciężką chorobą ogólnoustrojową)
- Stopień w skali statusu Eastern Cooperative Oncology Group (ECOG) 0 (normalna aktywność), 1 (objawy, ale ambulatoryjne) lub 2 (w łóżku <50% czasu)
- Karnofsky Performance Scale (KPS) od 50% (wymaga znacznej pomocy i częstej opieki medycznej) do 100% (normalny, bez dolegliwości, bez objawów choroby)
- Mówiący po angielsku.
Kryteria wyłączenia:
Każdy stan, który w opinii badacza może kolidować z celami badania lub ograniczać zgodność z wymogami badania, w tym między innymi:
- Znane aktywne dożylne nadużywanie narkotyków lub alkoholu
- Choroba psychiczna
- Sytuacja społeczna
- Planowane lub faktyczne otrzymanie przeszczepu nerki od zmarłego dawcy.
- Wcześniejszy przeszczep nerki, który nadal wymaga aktywnego leczenia immunosupresyjnego lub interwencji.
- Obecność odwracającej ileostomii lub kolostomii.
Plan studiów
Jak projektuje się badanie?
Szczegóły projektu
- Modele obserwacyjne: Inny
- Perspektywy czasowe: Spodziewany
Kohorty i interwencje
Grupa / Kohorta |
Interwencja / Leczenie |
|---|---|
|
Biorca przeszczepu nerki
Uczestnicy, u których zaplanowano planowany przeszczep nerki jako biorcy nerki. Wszyscy uczestnicy wykonają następujące interwencje:
|
Uczestnicy pobiorą próbkę kału na początku badania (przed operacją) i 30 dni po operacji przeszczepu.
Próbki kału zostaną pobrane przez uczestnika we własnym zakresie.
Wymazy z odbytu zostaną pobrane przed operacją (linia wyjściowa) oraz w dniach 2, 15 i 30 po operacji.
Uczestnicy, których planowany czas hospitalizacji zostanie wydłużony z planu przedoperacyjnego, zostaną pobrani dodatkowo, opcjonalnie, wymaz z odbytu na 2 dni przed przewidywaną datą wypisu ze szpitala.
Wymazy z odbytu będą pobierane przez zespół badawczy, z wyjątkiem standardowej wizyty pooperacyjnej (30 dni po operacji) dla żywych dawców, którzy pobiorą własne próbki.
Koordynator badania przeprowadzi ocenę krótkiej diety (SDA) uczestnikom przed operacją w dniu wyjściowym oraz w dniach 2, 15 i 30 po operacji.
Uczestnicy, których planowany czas pobytu w szpitalu zostanie przedłużony z planu przedoperacyjnego, wypełnią kwestionariusz na 2 dni przed przewidywaną datą wypisu ze szpitala.
National Health and Nutrition Examination Survey (NHANES) 2009-2010 Dietary Screener Questionnaire zostanie wypełniony w 2. dniu po operacji. Kwestionariusz dotyczy żywności spożywanej w ciągu ostatnich 30 dni.
Kwestionariusz składa się z 25 pozycji, aw zależności od udzielonych odpowiedzi mogą zostać zadane dodatkowe pytania.
Kwestionariusz będzie wypełniany samodzielnie lub przez członka zespołu badawczego.
|
|
Dawca przeszczepu nerki
Uczestnicy, którzy mają zaplanowany przeszczep nerki jako dawca nerki. Wszyscy uczestnicy wykonają następujące interwencje:
|
Uczestnicy pobiorą próbkę kału na początku badania (przed operacją) i 30 dni po operacji przeszczepu.
Próbki kału zostaną pobrane przez uczestnika we własnym zakresie.
Wymazy z odbytu zostaną pobrane przed operacją (linia wyjściowa) oraz w dniach 2, 15 i 30 po operacji.
Uczestnicy, których planowany czas hospitalizacji zostanie wydłużony z planu przedoperacyjnego, zostaną pobrani dodatkowo, opcjonalnie, wymaz z odbytu na 2 dni przed przewidywaną datą wypisu ze szpitala.
Wymazy z odbytu będą pobierane przez zespół badawczy, z wyjątkiem standardowej wizyty pooperacyjnej (30 dni po operacji) dla żywych dawców, którzy pobiorą własne próbki.
Koordynator badania przeprowadzi ocenę krótkiej diety (SDA) uczestnikom przed operacją w dniu wyjściowym oraz w dniach 2, 15 i 30 po operacji.
Uczestnicy, których planowany czas pobytu w szpitalu zostanie przedłużony z planu przedoperacyjnego, wypełnią kwestionariusz na 2 dni przed przewidywaną datą wypisu ze szpitala.
National Health and Nutrition Examination Survey (NHANES) 2009-2010 Dietary Screener Questionnaire zostanie wypełniony w 2. dniu po operacji. Kwestionariusz dotyczy żywności spożywanej w ciągu ostatnich 30 dni.
Kwestionariusz składa się z 25 pozycji, aw zależności od udzielonych odpowiedzi mogą zostać zadane dodatkowe pytania.
Kwestionariusz będzie wypełniany samodzielnie lub przez członka zespołu badawczego.
|
Co mierzy badanie?
Podstawowe miary wyniku
Miara wyniku |
Opis środka |
Ramy czasowe |
|---|---|---|
|
Zmiana składu mikrobiomu
Ramy czasowe: Wartość wyjściowa do 30. dnia pooperacyjnego
|
Aby zrozumieć ogólny wpływ profilaktyki chirurgicznej na skład mikroflory jelitowej w warunkach operacji przeszczepu nerki, zostanie opisane rozmieszczenie i względna liczebność taksonów bakterii i grzybów dla każdej pobranej próbki.
Rodzaj szczepu zostanie uznany za dominujący, jeśli stanowi co najmniej 30% wszystkich rodzajów lub szczepów mikroflory w próbce kału.
|
Wartość wyjściowa do 30. dnia pooperacyjnego
|
|
Zmiana różnorodności mikrobiomu
Ramy czasowe: Wartość wyjściowa do 30. dnia pooperacyjnego
|
Aby zrozumieć ogólny wpływ profilaktyki chirurgicznej na różnorodność mikroflory jelitowej w warunkach operacji przeszczepu nerki, zostaną wykorzystane pomiary różnorodności α i β mikroflory jelitowej.
Maksymalny odsetek wszystkich zidentyfikowanych genów zawartych w tym samym taksonie zostanie określony z każdej próbki kału.
|
Wartość wyjściowa do 30. dnia pooperacyjnego
|
|
Zmiana taksonomii mikrobiomu
Ramy czasowe: Wartość wyjściowa do 30. dnia pooperacyjnego
|
Aby zrozumieć ogólny wpływ profilaktyki chirurgicznej na taksonomię mikroflory jelitowej w warunkach operacji przeszczepu nerki, pobrane próbki zostaną wykorzystane do określenia składu taksonomicznego bakterii i grzybów.
Sekwencjonowanie metagenomiczne całego genomu shotgun zostanie przeprowadzone na Illumina Miseq (lub HiSeq).
Mapper z krótkim odczytem zostanie wykorzystany do wyselekcjonowania i odrzucenia ludzkich sekwencji z każdej próbki kału, a następnie Metaphlan i KRAKEN zostaną użyte do określenia składu taksonomicznego.
|
Wartość wyjściowa do 30. dnia pooperacyjnego
|
|
Zmiana oporności mikrobiomu
Ramy czasowe: Wartość wyjściowa do 30. dnia pooperacyjnego
|
Aby zrozumieć ogólny wpływ profilaktyki chirurgicznej na oporność mikroflory jelitowej w warunkach operacji przeszczepu nerki, zebrane próbki badawcze zostaną wykorzystane do podsumowania ogólnej liczby i różnorodności genów oporności bakterii i grzybów, w tym wszelkich nowych nabytków.
|
Wartość wyjściowa do 30. dnia pooperacyjnego
|
Miary wyników drugorzędnych
Miara wyniku |
Opis środka |
Ramy czasowe |
|---|---|---|
|
Skład mikrobiomu pacjentów dializowanych nerkowo
Ramy czasowe: Linia bazowa
|
Aby zrozumieć skład mikroflory jelitowej u pacjentów poddawanych dializie nerek, zostanie opisane rozmieszczenie i względna liczebność taksonów bakterii i grzybów dla każdej pobranej próbki.
Rodzaj szczepu zostanie uznany za dominujący, jeśli reprezentuje co najmniej 30% wszystkich rodzajów lub szczepów mikroflory w próbce kału pobranej na początku badania (przed przeszczepem nerki).
|
Linia bazowa
|
|
Różnorodność mikrobiomu u pacjentów dializowanych nerkowo
Ramy czasowe: Linia bazowa
|
Aby zrozumieć różnorodność alfa i beta mikroflory jelitowej u pacjentów poddawanych dializie nerek, maksymalny odsetek wszystkich zidentyfikowanych genów należących do tego samego taksonu zostanie określony na podstawie próbek do badań pobranych na początku badania (przed przeszczepem nerki).
|
Linia bazowa
|
|
Rezystom mikrobiomu u pacjentów dializowanych nerkowo
Ramy czasowe: Linia bazowa
|
Aby zrozumieć oporność mikroflory jelitowej u pacjentów poddawanych dializie nerek, próbki badawcze pobrane na początku badania (przed przeszczepem nerki) zostaną wykorzystane do podsumowania ogólnej liczby i różnorodności genów oporności bakterii.
|
Linia bazowa
|
Inne miary wyników
Miara wyniku |
Opis środka |
Ramy czasowe |
|---|---|---|
|
Porównaj skład mikrobiomu dawców i biorców
Ramy czasowe: Linia bazowa
|
Eksploracyjnym celem tego badania jest scharakteryzowanie podobieństw i różnic w mikroflorze jelitowej między żywym dawcą a biorcami w wyjściowym punkcie czasowym.
Opisane zostanie rozmieszczenie i względna liczebność taksonów bakterii i grzybów dla każdej próbki wyjściowej (przed przeszczepem nerki).
Rodzaj szczepu zostanie uznany za dominujący, jeśli stanowi co najmniej 30% wszystkich rodzajów lub szczepów mikroflory w próbce kału.
|
Linia bazowa
|
|
Porównaj różnorodność mikrobiomu dawców i biorców
Ramy czasowe: Linia bazowa
|
Eksploracyjnym celem tego badania jest scharakteryzowanie podobieństw i różnic w mikroflorze jelitowej między żywym dawcą a biorcami w wyjściowym punkcie czasowym.
Maksymalny odsetek wszystkich zidentyfikowanych genów należących do tego samego taksonu zostanie określony z każdej próbki kału pobranej przed przeszczepem nerki.
|
Linia bazowa
|
|
Porównaj taksonomię mikrobiomu dawców i biorców
Ramy czasowe: Linia bazowa
|
Eksploracyjnym celem tego badania jest scharakteryzowanie podobieństw i różnic w mikroflorze jelitowej między żywym dawcą a biorcami w wyjściowym punkcie czasowym.
Pobrane próbki do badań posłużą do określenia składu taksonomicznego bakterii i grzybów.
Sekwencjonowanie metagenomiczne całego genomu shotgun zostanie przeprowadzone na Illumina Miseq (lub HiSeq).
Mapper z krótkim odczytem zostanie wykorzystany do wyselekcjonowania i odrzucenia ludzkich sekwencji z każdej próbki kału, a następnie Metaphlan i KRAKEN zostaną użyte do określenia składu taksonomicznego.
|
Linia bazowa
|
|
Porównanie oporności mikrobiomu dawców i biorców
Ramy czasowe: Linia bazowa
|
Eksploracyjnym celem tego badania jest scharakteryzowanie podobieństw i różnic w mikroflorze jelitowej między żywym dawcą a biorcami w wyjściowym punkcie czasowym.
Zebrane próbki badawcze zostaną wykorzystane do podsumowania ogólnej liczby i różnorodności genów oporności bakterii i grzybów, w tym wszelkich nowych nabytków.
|
Linia bazowa
|
Współpracownicy i badacze
Sponsor
Współpracownicy
Śledczy
- Główny śledczy: Colleen S Kraft, MD, MSc, Emory University
Daty zapisu na studia
Główne daty studiów
Rozpoczęcie studiów (Rzeczywisty)
Zakończenie podstawowe (Rzeczywisty)
Ukończenie studiów (Rzeczywisty)
Daty rejestracji na studia
Pierwszy przesłany
Pierwszy przesłany, który spełnia kryteria kontroli jakości
Pierwszy wysłany (Szacowany)
Aktualizacje rekordów badań
Ostatnia wysłana aktualizacja (Rzeczywisty)
Ostatnia przesłana aktualizacja, która spełniała kryteria kontroli jakości
Ostatnia weryfikacja
Więcej informacji
Terminy związane z tym badaniem
Słowa kluczowe
Inne numery identyfikacyjne badania
- IRB00092450
- 16IPA1609418 (Inny numer grantu/finansowania: Centers for Disease Control and Prevention (CDC))
- 16IPA1609428 (Inny numer grantu/finansowania: Centers for Disease Control and Prevention (CDC))
- CDC-IRB00092450 (Inny identyfikator: Centers for Disease Control and Prevention (CDC))
Plan dla danych uczestnika indywidualnego (IPD)
Planujesz udostępniać dane poszczególnych uczestników (IPD)?
Informacje o lekach i urządzeniach, dokumenty badawcze
Bada produkt leczniczy regulowany przez amerykańską FDA
Bada produkt urządzenia regulowany przez amerykańską FDA
produkt wyprodukowany i wyeksportowany z USA
Te informacje zostały pobrane bezpośrednio ze strony internetowej clinicaltrials.gov bez żadnych zmian. Jeśli chcesz zmienić, usunąć lub zaktualizować dane swojego badania, skontaktuj się z register@clinicaltrials.gov. Gdy tylko zmiana zostanie wprowadzona na stronie clinicaltrials.gov, zostanie ona automatycznie zaktualizowana również na naszej stronie internetowej .