Selvtagne penis kødpodninger til påvisning af klamydia, gonoré og mycoplasma genitalium (Me-swab)

Undersøgelsesmetoder Undersøgelsespopulationen vil være mænd og transkvinder på 18 år og derover, der præsenterer for Leeds Sexual Health, som ønsker at blive testet for klamydia, gonoré og M. genitalium (hvis der er symptomer på urethritis). De, der har taget antibiotika (undtagen metronidazol) inden for de seneste 14 dage, vil blive udelukket. Oplysninger om alder, etnicitet, tidligere seksuelt overført infektion (STI) historie, at være i kontakt med en STI og symptomer, der tyder på en bakteriel STI (urethral udledning, dysuri, testikelsmerter og hævelse) vil blive indsamlet. Forud for enhver undersøgelse foretaget af klinikeren vil deltageren blive bedt om at udføre en selvudtaget penis kødpodning efter de skriftlige og diagrammatiske instruktioner for selvindsamlede penis kødpodninger ved brug af teknikken anbefalet af Hologic. Dem med genitale symptomer vil blive undersøgt, og tilstedeværelsen af ​​urinrørsudflåd og testikelhævelse og ømhed vil blive registreret. En urethral podning til mikroskopi og gonokokdyrkning vil blive taget af klinikeren, hvis der er tegn på urethral udledning. De, der ikke har nogen genitale symptomer, vil ikke blive undersøgt og vil ikke have en urethral podning til mikroskopi eller gonokokkultur taget som i rutinemæssig klinisk praksis. Alle mænd vil derefter blive bedt om at udføre en FCU-prøve. Penis kødpodningen og FCU vil blive testet for M. genitalium, hvis der er symptomer på urethritis. De første 500 deltagere vil blive bedt om at udfylde et kort spørgeskema med seks spørgsmål om, hvor let/svært og behageligt/ubehageligt, de fandt ud af at tage penis kødpodningen blev sammenlignet med at indsamle FCU og deres overordnede prøvepræference.

Derfor vil hver deltager få udtaget to forskellige prøver:

Kødpind: Aptima Combo 2-analyse; Aptima MGen-analyse (hvis symptomer på urethritis)

Første-fangst urinprøve: Aptima Combo 2-analyse; Aptima MGen-analyse (hvis symptomer på urethritis)

De selvudtagne penile meatal- og FCU-prøver vil blive testet for C. trachomatis og N. gonorrhoeae ved hjælp af Hologic Aptima Combo 2-analysen (AC2), og dem fra deltagere med symptomer på urethritis vil blive testet for M. genitalium ved hjælp af Aptima MGen assay ifølge producentens instruktioner (Hologic, San Diego, CA, USA). Positive tests for C. trachomatis vil blive testet igen ved hjælp af Aptima CT-analysen, og positive tests for N. gonorrhoeae vil blive testet igen ved hjælp af Aptima GC-analysen, som begge bruger et andet mål end AC2. En test vil kun blive kategoriseret som klinisk positiv, hvis den relevante bekræftende test også er positiv. Positive tests for M. genitalium vil blive testet for M. genitalium makrolid- og fluoroquinolon-resistensmutationer ved intern PCR ved hjælp af Sanger-sekventering til at karakterisere mutanter i 23s-genet for makrolidresistens og gyrA- og parC-gener for fluoroquinolonresistens (som udviklet af Referenceenhed for seksuelt overførte bakterier, Public Health England). Resistenstesten vil også fungere som bekræftende test, hvis amplifikationen lykkes. Det forventes, at amplifikation ikke vil lykkes i op til 20 % af de positive Aptima Mgen-assays på grund af den kommercielle assays bedre følsomhed, i hvilket tilfælde disse positive prøver for M. genitalium vil blive frosset, batchet og sendt til Hologic , San Diego, CA, til bekræftende test. Deltageren vil blive behandlet som om M. genitalium er positiv, mens han venter på disse bekræftende resultater i lyset af den høje specificitet af Aptima MGen-analysen og for at undgå yderligere morbiditet og seksuel overførsel.

Alle patienter diagnosticeret med klamydia og/eller gonoré vil blive behandlet og behandlet med partnermeddelelse og opfølgning i henhold til klinikprotokollerne og nationale retningslinjer. Alle patienter testet for M. genitalium vil være blevet diagnosticeret med urethritis, så de vil oprindeligt være blevet behandlet med doxycyclin i syv dage. De, der er positive for M. genitalium, vil blive testet for M. genitalium makrolid og fluoroquinolon-resistensmutationer. Resultatet af dette vil blive brugt til at vejlede den terapi, der er ordineret til at behandle infektionen i henhold til Det Forenede Kongerige (UK) og europæiske retningslinjer. Det forventes, at omkring 50 % af M. genitalium-infektioner vil være resistente over for førstelinjebehandlingen af ​​et udvidet azithromycinregime. Disse mænd vil blive behandlet med moxifloxacin. Mændene med både makrolid- og fluorquinolonresistens vil blive behandlet med en vejledende anbefalet tredjelinjebehandling. De, hvor amplifikationen til at udføre resistenstestning var mislykket, vil oprindeligt være blevet behandlet med doxycyclin i syv dage. Efter dette vil de få en forlænget azithromycin-kur. Hvis der ikke er nogen klinisk opløsning, og/eller hvis de stadig er M. genitalium positive ved helbredelsestest, vil de blive behandlet med moxifloxacin. En helbredelsestest vil blive udført fem uger efter behandlingens start med både en selvudtaget penis kødpodning og en FCU-prøve. De nuværende seksuelle partnere vil blive testet for M. genitalium og får samme antibiotikakur, hvis de er positive.

Data fra Case Report Forms (CRF'er) vil blive indtastet ved hjælp af det unikke undersøgelsesnummer på en sikker computersystemdatabase, som vil være adgangskodebeskyttet. Dataindtastning vil blive krydstjekket for fejl, og databasen vil indeholde advarsler for at identificere, om data, der indtastes, er ulogiske, inkonsistente eller ufuldstændige. Masterlisten over klinikkens unikke identifikationskoder og undersøgelsesnumre og CRF'erne vil blive opbevaret i et sikkert aflåst skab i et aflåst kontor i Leeds Sexual Health.

Bestemmelse af patientens inficerede status Patienter vil blive klassificeret som inficerede eller ikke-inficerede baseret på én positiv (bekræftet) AC2-test for C. trachomatis; én positiv (bekræftet) AC2-test for N. gonorrhoeae eller en positiv kultur for N. gonorrhoeae; og én positiv Aptima Mgen-test.

Mikrobiologisk Institut vil udføre nukleinsyreamplifikationsassays og M. genitalium makrolid- og fluorquinolon-resistensmutationsassays.

Effektberegning og statistisk analyse Det forventes, at følsomheden af ​​de selvudtagne kødprøver fra penis vil svare til Dize-undersøgelsen snarere end Chernesky-undersøgelsen, da alle deltagere vil udføre kødprøven fra penis først. Efterforskerne forudsiger en følsomhed på 92 % for klamydia og 99 % for gonoré. Det forventes, at FCU-prøvernes følsomhed vil svare til Chernesky-undersøgelsen snarere end Dize-undersøgelsen, da der ikke vil blive brugt en urinopsamlingsanordning. Efterforskerne forudsiger en følsomhed på 83 % for klamydia og 85 % for gonoré. Der er kun én publiceret undersøgelse, der sammenligner kødpodninger fra penis og FCU til påvisning af M. genitalium. Dette rapporterede 100 % følsomhed med penis kødpodninger og 83 % med FCU.

Til gonoréanalysen ville 85 positive prøver detektere en signifikant forskel mellem en følsomhed på 85 % og 99 % med 80 % effekt og 95 % sandsynlighed. Til klamydiaanalysen ville 260 positive prøver detektere en signifikant forskel mellem en følsomhed på 83 % og 92 % med 80 % styrke og 95 % sandsynlighed. Til M. genitalium-analysen ville 80 positive prøver påvise en signifikant forskel mellem en følsomhed på 85 % og 99 % med 80 % effekt og 95 % sandsynlighed (lidt højere følsomhed af FCU og lavere kødpodning fra penis brugt som kun én offentliggjort undersøgelse ).

Forekomsten af ​​urethral gonoré i den mandlige befolkning, der skal undersøges, er mindst 3,7 % inklusive asymptomatiske mænd. Inklusive 2400 symptomatiske og asymptomatiske deltagere, vil give mere end 85 positive individer med 3,7% prævalens. Forekomsten af ​​urethral klamydia i den mandlige befolkning, der skal undersøges, er mindst 11 %. 2400 deltagere vil give 260 positive individer med 11% prævalens. Forekomsten af ​​M. genitalium hos dem med symptomer på urethritis i den befolkning, der skal undersøges, er ikke kendt som en europæisk godkendt Conformité Européene mærket (CE-mærket) kommerciel diagnostisk test er først lige blevet tilgængelig. I 2017 blev der set 500 tilfælde af mandlig non-gonokok urethritis (NGU), hvoraf 100 (20%) forventes at være M. genitalium positive. Alle med symptomatisk gonokokurethritis vil også blive testet for M. genitalium, hvoraf op til 10 mænd om året også kan være positive for M. genitalium. Dette betyder, at prøvestørrelsen på 80 ville være opnåelig inden for 15 måneder med en optagelse på 50-60 % hos patienter med symptomer på urethritis. Det forventes, at optagelsen vil være høj, især hos dem med symptomer på urethritis, da undersøgelsen tilbyder testning for M. genitalium, som endnu ikke er tilgængelig i rutinemæssig klinisk praksis, da der ikke er midler til denne service i øjeblikket. Efterforskerne har udført og offentliggjort lignende undersøgelser for at identificere den optimale prøve til påvisning af klamydia og gonoré hos kvinder, hvor 42 klinikere rekrutterede næsten 4000 kvinder på 10 måneder, hvilket var kortere end den planlagte rekrutteringsperiode.

Al dataanalyse vil blive udført ved hjælp af undersøgelsesnummeret. Den overordnede sensitivitet, specificitet, positive prædiktive værdi og negative prædiktive værdi vil blive bestemt for selvudtaget penis kødpodninger og første-fangst urinprøver ved at sammenligne testresultater med patientens inficerede status. Sammenligningen mellem selvudtagne kødpodninger fra penis og FCU-prøver vil være ved McNemars test. Analyserne for påvisning af klamydia og gonoré vil også blive beregnet hos dem med symptomer og dem uden symptomer.

Anvendeligheden af ​​antimikrobiel resistens (AMR)-guidet terapi Nytten af ​​at bruge AMR-guidet terapi vil blive målt ved de tal, der ville være blevet givet upassende antibiotika, hvis NGU-retningslinjen var blevet fulgt ved at give doxycyclin, derefter forlænget azithromycin og derefter moxifloxacin.

Omkostningssammenligning Den økonomiske analyse vil være en simpel omkostningssammenligning og vil fokusere på, om det giver en omkostningsbesparelse at bruge selvudtagne kødpinde fra penis sammenlignet med FCU-prøver. Analysen vil bruge den korrekte påvisning af Chlamydia trachomatis, Neisseria gonorrhoeae og Mycoplasma genitalium som det primære endepunkt og tage udgangspunkt i UK National Health Service/Prescribed Specialist Services (NHS/PSS) i overensstemmelse med NICEs anbefalinger (NICE 2013). Omkostningerne vil blive beregnet ud fra en delprøve på 240 deltagere. NHS ressourceforbrug og omkostninger vil blive indsamlet prospektivt og vil omfatte omkostninger til kliniktid og ressourcer og laboratorietid og -ressourcer. Klinikpersonalet vil udfylde en specialdesignet dataindsamlingsformular for hver forsøgsdeltager i løbet af en 5-6 ugers periode af undersøgelsen. Oplysninger om enhedsomkostninger eller -priser vil blive hentet til at knytte til hver ressourceanvendelse, for at gøre det muligt at beregne en samlet omkostning (f.eks. Curtis & Burns 2016). Den endelige sammenligning vil blive baseret på omkostningerne pr. korrekt påvisning af Chlamydia trachomatis, Neisseria gonorrhoeae og Mycoplasma genitalium ved hjælp af selvudtagne penis kødpodninger versus FCU prøver.