Samodzielnie pobrane wymazy z prącia do wykrywania chlamydii, rzeżączki i mykoplazmy narządów płciowych (Me-swab)

Metody badania Badaną populacją będą mężczyźni i transkobiety w wieku 18 lat i starsi zgłaszający się do Leeds Sexual Health, którzy chcą zostać przebadani pod kątem chlamydii, rzeżączki i M. genitalium (jeśli występują objawy zapalenia cewki moczowej). Osoby, które przyjmowały antybiotyki (z wyjątkiem metronidazolu) w ciągu ostatnich 14 dni, zostaną wykluczone. Zostaną zebrane szczegółowe informacje na temat wieku, pochodzenia etnicznego, przebytej infekcji przenoszonej drogą płciową (STI), kontaktu z chorobą przenoszoną drogą płciową oraz objawów sugerujących bakteryjną chorobę przenoszoną drogą płciową (wydzielina z cewki moczowej, bolesne oddawanie moczu, ból jąder i obrzęk). Przed jakimkolwiek badaniem przez lekarza uczestnik zostanie poproszony o wykonanie wymazu z prącia samodzielnie pobranego zgodnie z pisemnymi i schematycznymi instrukcjami dotyczącymi samodzielnego pobierania wymazów z miąższu prącia przy użyciu techniki zalecanej przez Hologic. Osoby z objawami narządów płciowych zostaną zbadane i odnotowane zostaną obecność wydzieliny z cewki moczowej oraz obrzęk i tkliwość jąder. Wymaz z cewki moczowej do mikroskopii i posiewu gonokoków zostanie pobrany przez klinicystę, jeśli pojawią się jakiekolwiek oznaki wydzieliny z cewki moczowej. Osoby, które nie mają objawów ze strony narządów płciowych, nie będą badane i nie będą miały wymazu z cewki moczowej do mikroskopii ani posiewu gonokoków, jak w rutynowej praktyce klinicznej. Następnie wszyscy mężczyźni zostaną poproszeni o wykonanie próbki FCU. Wymaz z prącia i FCU zostaną przetestowane na obecność M. genitalium, jeśli wystąpią objawy zapalenia cewki moczowej. Pierwszych 500 uczestników zostanie poproszonych o wypełnienie krótkiego kwestionariusza składającego się z sześciu pytań dotyczących tego, jak łatwe/trudne i wygodne/niewygodne okazało się pobranie wymazu z prącia w porównaniu z pobraniem FCU i ich ogólnych preferencji próbki.

W związku z tym każdy uczestnik będzie miał pobrane dwie różne próbki:

Wymaz z mięsa: test Aptima Combo 2; Aptima MGen assay (przy objawach zapalenia cewki moczowej)

Próbka moczu z pierwszego połowu: test Aptima Combo 2; Aptima MGen assay (przy objawach zapalenia cewki moczowej)

Pobrane samodzielnie mięśnie prącia i próbki FCU zostaną przebadane na obecność C. trachomatis i N. gonorrhoeae przy użyciu testu Hologic Aptima Combo 2 (AC2), a próbki pochodzące od uczestników z objawami zapalenia cewki moczowej zostaną przebadane na obecność M. genitalium przy użyciu Aptima MGen oznaczać zgodnie z instrukcjami producenta (Hologic, San Diego, CA, USA). Pozytywne testy w kierunku C. trachomatis zostaną ponownie przetestowane przy użyciu testu Aptima CT assay, a pozytywne testy w kierunku N. gonorrhoeae zostaną ponownie przebadane przy użyciu testu Aptima GC, z których oba wykorzystują inny cel niż AC2. Test zostanie sklasyfikowany jako klinicznie pozytywny tylko wtedy, gdy odpowiedni test potwierdzający jest również pozytywny. Pozytywne testy na M. genitalium będą badane pod kątem mutacji oporności na makrolidy i fluorochinolony M. genitalium za pomocą wewnętrznego PCR z wykorzystaniem sekwencjonowania Sangera w celu scharakteryzowania mutantów w genie 23s oporności na makrolidy oraz genach gyrA i parC oporności na fluorochinolony (opracowane przez Jednostka Referencyjna ds. Bakterii Przenoszonych Seksualnie, Public Health England). Test oporności będzie również działał jako test potwierdzający, jeśli amplifikacja zakończy się pomyślnie. Przewiduje się, że amplifikacja nie powiedzie się w przypadku do 20% dodatnich testów Aptima Mgen ze względu na lepszą czułość testu komercyjnego. , San Diego, Kalifornia, do testów potwierdzających. Ze względu na wysoką specyficzność testu Aptima MGen assay oraz w celu uniknięcia dalszej zachorowalności i przenoszenia drogą płciową, uczestnik będzie traktowany tak, jakby był pozytywny na obecność M. genitalium podczas oczekiwania na te wyniki potwierdzające.

Wszyscy pacjenci, u których zdiagnozowano chlamydię i/lub rzeżączkę, zostaną poddani leczeniu i leczeniu po powiadomieniu partnera i obserwacji zgodnie z protokołami klinicznymi i krajowymi wytycznymi. Wszyscy pacjenci przebadani na obecność M. genitalium zostaną zdiagnozowani jako chorzy na zapalenie cewki moczowej, więc będą początkowo leczeni doksycykliną przez siedem dni. Osoby z pozytywnym wynikiem na obecność M. genitalium zostaną przebadane pod kątem mutacji oporności na makrolidy i fluorochinolony M. genitalium. Wynik tego zostanie wykorzystany do kierowania zalecaną terapią w celu leczenia infekcji zgodnie z wytycznymi Wielkiej Brytanii (UK) i europejskimi. Przewiduje się, że około 50% zakażeń M. genitalium będzie opornych na leczenie pierwszego rzutu rozszerzonego schematu azytromycyny. Ci mężczyźni będą leczeni moksyfloksacyną. Mężczyźni z opornością zarówno na makrolidy, jak i fluorochinolony będą leczeni zalecanym w wytycznych leczeniem trzeciego rzutu. Osoby, u których amplifikacja w celu wykonania testu oporności zakończyła się niepowodzeniem, będą początkowo leczone doksycykliną przez siedem dni. Następnie otrzymają przedłużony kurs azytromycyny. Jeśli nie ma poprawy klinicznej i/lub jeśli w teście wyleczenia nadal jest dodatni wynik testu na obecność M. genitalium, zostaną oni poddani leczeniu moksyfloksacyną. Test wyleczenia zostanie przeprowadzony po pięciu tygodniach od rozpoczęcia leczenia przy użyciu zarówno wymazu z prącia pobranego samodzielnie, jak i próbki FCU. Obecni partnerzy seksualni zostaną przebadani na obecność M. genitalium i otrzymają ten sam schemat antybiotyków, jeśli wynik będzie pozytywny.

Dane z formularzy zgłoszeń przypadków (CRF) zostaną wprowadzone przy użyciu unikalnego numeru badania do bezpiecznej bazy danych systemu komputerowego, która będzie chroniona hasłem. Wprowadzane dane będą sprawdzane krzyżowo pod kątem błędów, a baza danych będzie zawierała alerty w celu określenia, czy wprowadzane dane są nielogiczne, niespójne lub niekompletne. Główna lista unikatowych kodów identyfikacyjnych klinik i numerów badań oraz CRF będzie przechowywana w bezpiecznej, zamkniętej szafce, w zamkniętym biurze, w Leeds Sexual Health.

Określenie statusu zakażenia pacjenta Pacjenci zostaną sklasyfikowani jako zakażeni lub niezakażeni na podstawie jednego pozytywnego (potwierdzonego) testu AC2 na obecność C. trachomatis; jeden pozytywny (potwierdzony) test AC2 w kierunku N. gonorrhoeae lub dodatni posiew w kierunku N. gonorrhoeae; i jeden pozytywny test Aptima Mgen.

Zakład Mikrobiologii będzie wykonywał testy amplifikacji kwasów nukleinowych oraz testy mutacji makrolidowych i oporności na fluorochinolony M. genitalium.

Obliczanie mocy i analiza statystyczna Przewiduje się, że czułość samodzielnie pobranych wymazów z prącia będzie podobna do badania Dize'a niż do badania Chernesky'ego, ponieważ wszyscy uczestnicy najpierw wykonają próbkę prącia. Badacze przewidują czułość 92% dla chlamydii i 99% dla rzeżączki. Oczekuje się, że czułość próbek FCU ​​będzie podobna do badania Chernesky'ego, a nie do badania Dize, ponieważ urządzenie do pobierania moczu nie będzie używane. Badacze przewidują czułość 83% dla chlamydii i 85% dla rzeżączki. Jest tylko jedno opublikowane badanie porównujące wymazy z prącia i FCU do wykrywania M. genitalium. To zgłosiło 100% czułość z wymazami z prącia i 83% z FCU.

W przypadku analizy rzeżączki 85 próbek dodatnich wykryłoby znaczącą różnicę między czułością 85% a 99% z mocą 80% i prawdopodobieństwem 95%. W przypadku analizy chlamydii 260 próbek dodatnich wykryłoby znaczącą różnicę między czułością 83% a 92% z mocą 80% i prawdopodobieństwem 95%. W przypadku analizy M. genitalium 80 próbek dodatnich wykryłoby znaczącą różnicę między czułością 85% a 99% z 80% mocą i 95% prawdopodobieństwem (nieco wyższa czułość FCU i niższa wymaz z prącia wykorzystany jako jedyne opublikowane badanie ).

Częstość występowania rzeżączki cewki moczowej w badanej populacji mężczyzn wynosi co najmniej 3,7%, włączając mężczyzn bezobjawowych. W tym 2400 uczestników z objawami i bezobjawowymi, da ponad 85 pozytywnych osób z 3,7% rozpowszechnieniem. Częstość występowania chlamydii cewki moczowej w badanej populacji mężczyzn wynosi co najmniej 11%. 2400 uczestników da 260 pozytywnych osobników z 11% rozpowszechnieniem. Częstość występowania M. genitalium u osób z objawami zapalenia cewki moczowej w badanej populacji nie jest znana, ponieważ zatwierdzony w Europie komercyjny test diagnostyczny z oznaczeniem Conformité Européene (z oznaczeniem CE) dopiero teraz stał się dostępny. W 2017 r. zaobserwowano 500 przypadków nierzeżączkowego zapalenia cewki moczowej (NGU) u mężczyzn, z których 100 (20%) miałoby być dodatnich pod względem M. genitalium. Wszyscy z objawowym gonokokowym zapaleniem cewki moczowej zostaną również przebadani w kierunku M. genitalium, z których do 10 mężczyzn rocznie może również mieć pozytywny wynik w kierunku M. genitalium. Oznacza to, że wielkość próby 80 byłaby osiągalna w ciągu 15 miesięcy z 50-60% wychwytem u pacjentów z objawami zapalenia cewki moczowej. Oczekuje się, że zainteresowanie będzie wysokie, zwłaszcza u osób z objawami zapalenia cewki moczowej, ponieważ badanie oferuje badania w kierunku M. genitalium, które nie są jeszcze dostępne w rutynowej praktyce klinicznej, ponieważ obecnie nie ma funduszy na tę usługę. Badacze przeprowadzili i opublikowali podobne badania w celu określenia optymalnej próbki do wykrywania chlamydii i rzeżączki u kobiet, gdzie 42 klinicystów zrekrutowało prawie 4000 kobiet w ciągu 10 miesięcy, czyli krócej niż planowany okres rekrutacji.

Cała analiza danych zostanie przeprowadzona przy użyciu numeru badania. Ogólna czułość, swoistość, dodatnia wartość predykcyjna i ujemna wartość predykcyjna zostaną określone dla samodzielnie pobranych wymazów z prącia i próbek moczu pierwszego połowu poprzez porównanie wyników testu ze statusem zakażenia pacjenta. Porównanie między pobranymi przez siebie wymazami z prącia a próbkami FCU zostanie przeprowadzone za pomocą testu McNemara. Analizy pod kątem wykrycia chlamydii i rzeżączki zostaną również obliczone u osób z objawami i bez objawów.

Użyteczność terapii opartej na oporności na środki przeciwdrobnoustrojowe (AMR) Użyteczność terapii opartej na oporności na środki przeciwdrobnoustrojowe będzie mierzona liczbą osób, które otrzymałyby nieodpowiednie antybiotyki, gdyby przestrzegano wytycznych NGU i podawano doksycyklinę, następnie rozszerzoną azytromycynę, a następnie moksyfloksacynę.

Porównanie kosztów Analiza ekonomiczna będzie prostym porównaniem kosztów i będzie koncentrować się na tym, czy stosowanie samodzielnie pobranych wymazów z prącia daje oszczędności w porównaniu z próbkami FCU. Analiza będzie wykorzystywać prawidłowe wykrywanie Chlamydia trachomatis, Neisseria gonorrhoeae i Mycoplasma genitalium jako pierwszorzędowy punkt końcowy i przyjąć perspektywę brytyjskiej Narodowej Służby Zdrowia/Zleconych Usług Specjalistycznych (NHS/PSS) zgodnie z zaleceniami NICE (NICE 2013). Koszty zostaną obliczone na podstawie podpróby 240 uczestników. Wykorzystanie zasobów i koszty NHS będą zbierane prospektywnie i będą obejmować koszty czasu i zasobów kliniki oraz czasu i zasobów laboratoryjnych. Personel kliniki wypełni specjalnie zaprojektowany formularz zbierania danych dla każdego uczestnika badania podczas 5-6 tygodniowego okresu badania. Informacje na temat kosztów jednostkowych lub cen będą pozyskiwane w celu dołączenia do każdej pozycji wykorzystania zasobów, aby umożliwić obliczenie całkowitego kosztu (np. Curtis i Burns 2016). Ostateczne porównanie będzie oparte na koszcie prawidłowego wykrycia Chlamydia trachomatis, Neisseria gonorrhoeae i Mycoplasma genitalium przy użyciu samodzielnie pobranych wymazów z prącia w porównaniu z próbkami FCU.