Écouvillons de viande pénienne auto-prélevés pour la détection de la chlamydia, de la gonorrhée et du mycoplasme génital (Me-swab)

Méthodes d'étude La population à l'étude sera composée d'hommes et de femmes transgenres âgés de 18 ans et plus se présentant à Leeds Sexual Health et souhaitant subir un test de dépistage de la chlamydia, de la gonorrhée et de M. genitalium (si des symptômes d'urétrite sont présents). Ceux qui ont pris des antibiotiques (sauf le métronidazole) au cours des 14 derniers jours seront exclus. Des détails sur l'âge, l'origine ethnique, les antécédents d'infection sexuellement transmissible (IST), le contact avec une IST et les symptômes évocateurs d'une IST bactérienne (écoulement urétral, dysurie, douleur et gonflement des testicules) seront recueillis. Avant tout examen par le clinicien, le participant sera invité à effectuer un écouvillonnage du méat du pénis auto-prélevé en suivant les instructions écrites et schématiques pour les écouvillonnages du méat du pénis auto-prélevés en utilisant la technique recommandée par Hologic. Ceux qui présentent des symptômes génitaux seront examinés et la présence d'un écoulement urétral ainsi que d'un gonflement et d'une sensibilité des testicules sera enregistrée. Un prélèvement urétral pour la microscopie et la culture gonococcique sera effectué par le clinicien s'il y a des signes d'écoulement urétral. Ceux qui ne présentent aucun symptôme génital ne seront pas examinés et ne subiront pas de prélèvement urétral pour la microscopie ou la culture gonococcique comme dans la pratique clinique de routine. Tous les hommes seront ensuite invités à effectuer un échantillon FCU. L'écouvillon du méat du pénis et le FCU seront testés pour M. genitalium s'il y a des symptômes d'urétrite. Les 500 premiers participants seront invités à remplir un court questionnaire de six questions sur la facilité/difficulté et le confort/inconfort qu'ils ont trouvé en prenant l'écouvillon du méat pénien par rapport à la collecte de l'UCF et leur préférence globale en matière d'échantillon.

Par conséquent, chaque participant se verra prélever deux échantillons différents :

Écouvillon de méat : test Aptima Combo 2 ; Test Aptima MGen (si symptômes d'urétrite)

Échantillon d'urine de premier prélèvement : test Aptima Combo 2 ; Test Aptima MGen (si symptômes d'urétrite)

Le méat pénien auto-prélevé et les échantillons de FCU seront testés pour C. trachomatis et N. gonorrhoeae à l'aide du test Hologic Aptima Combo 2 (AC2), et ceux des participants présentant des symptômes d'urétrite seront testés pour M. genitalium à l'aide d'Aptima MGen test, selon les instructions du fabricant (Hologic, San Diego, CA, USA). Les tests positifs pour C. trachomatis seront retestés à l'aide du test Aptima CT et les tests positifs pour N. gonorrhoeae seront retestés à l'aide du test Aptima GC, qui utilisent tous deux une cible différente de l'AC2. Un test ne sera classé comme cliniquement positif que si le test de confirmation approprié est également positif. Les tests positifs pour M. genitalium seront testés pour les mutations de résistance aux macrolides et aux fluoroquinolones de M. genitalium par PCR en interne en utilisant le séquençage de Sanger pour caractériser les mutants dans le gène 23s pour la résistance aux macrolides et les gènes gyrA et parC pour la résistance aux fluoroquinolones (comme développé par le Unité de référence des bactéries sexuellement transmissibles, Public Health England). Le test de résistance servira également de test de confirmation si l'amplification est réussie. Il est prévu que l'amplification ne réussira pas dans jusqu'à 20 % des tests Aptima Mgen positifs, en raison de la meilleure sensibilité du test commercial, auquel cas ces échantillons positifs pour M. genitalium seront congelés, regroupés et expédiés à Hologic , San Diego, CA, pour les tests de confirmation. Le participant sera géré comme s'il était positif à M. genitalium en attendant ces résultats de confirmation compte tenu de la haute spécificité du test Aptima MGen et pour éviter une morbidité et une transmission sexuelle supplémentaires.

Tous les patients diagnostiqués comme ayant la chlamydia et/ou la gonorrhée recevront un traitement et seront pris en charge avec notification au partenaire et suivi conformément aux protocoles de la clinique et aux directives nationales. Tous les patients testés pour M. genitalium auront été diagnostiqués comme ayant une urétrite et auront donc été traités initialement avec de la doxycycline pendant sept jours. Ceux qui sont positifs pour M. genitalium seront testés pour les mutations de résistance aux macrolides et aux fluoroquinolones de M. genitalium. Le résultat de ceci sera utilisé pour guider la thérapie prescrite pour traiter l'infection conformément aux directives du Royaume-Uni (Royaume-Uni) et européennes. On prévoit qu'environ 50 % des infections à M. genitalium seront résistantes au traitement de première intention d'un régime prolongé d'azithromycine. Ces hommes seront traités avec de la moxifloxacine. Les hommes présentant à la fois une résistance aux macrolides et aux fluoroquinolones seront traités avec un traitement de troisième intention recommandé par les lignes directrices. Ceux dont l'amplification pour effectuer des tests de résistance a échoué auront été traités initialement avec de la doxycycline pendant sept jours. Après cela, ils recevront un traitement prolongé d'azithromycine. S'il n'y a pas de résolution clinique, et/ou s'ils sont toujours positifs pour M. genitalium au test de guérison, ils seront traités avec de la moxifloxacine. Un test de guérison sera effectué cinq semaines après le début du traitement en utilisant à la fois un prélèvement de méat pénien auto-prélevé et un échantillon de FCU. Les partenaires sexuels actuels seront testés pour M. genitalium et recevront le même traitement antibiotique s'ils sont positifs.

Les données des formulaires de rapport de cas (CRF) seront saisies à l'aide du numéro d'étude unique dans une base de données de système informatique sécurisée qui sera protégée par un mot de passe. La saisie des données sera contre-vérifiée pour les erreurs et la base de données contiendra des alertes pour identifier si les données saisies sont illogiques, incohérentes ou incomplètes. La liste principale des codes d'identification uniques de la clinique et des numéros d'étude, ainsi que les CRF, seront conservés dans une armoire verrouillée sécurisée, dans un bureau verrouillé, au sein de Leeds Sexual Health.

Détermination du statut d'infection du patient Les patients seront classés comme infectés ou non infectés sur la base d'un test AC2 positif (confirmé) pour C. trachomatis ; un test AC2 positif (confirmé) pour N. gonorrhoeae ou une culture positive pour N. gonorrhoeae ; et un test Aptima Mgen positif.

Le Département de microbiologie effectuera les tests d'amplification des acides nucléiques et les tests de mutation de résistance aux macrolides et aux fluoroquinolones de M. genitalium.

Calcul de puissance et analyse statistique Il est prévu que la sensibilité des écouvillons de méat pénien auto-prélevés sera similaire à l'étude Dize plutôt qu'à l'étude Chernesky, car tous les participants effectueront d'abord l'échantillon de méat pénien. Les investigateurs prédisent une sensibilité de 92 % pour la chlamydia et de 99 % pour la gonorrhée. Il est prévu que la sensibilité des échantillons de FCU sera similaire à l'étude Chernesky plutôt qu'à l'étude Dize, car un dispositif de collecte d'urine ne sera pas utilisé. Les investigateurs prédisent une sensibilité de 83 % pour la chlamydia et de 85 % pour la gonorrhée. Il n'y a qu'une seule étude publiée comparant les écouvillons du méat pénien et la FCU pour la détection de M. genitalium. Cela a rapporté une sensibilité de 100 % avec des écouvillons méatiques péniens et de 83 % avec FCU.

Pour l'analyse de la gonorrhée, 85 échantillons positifs détecteraient une différence significative entre une sensibilité de 85 % et 99 % avec une puissance de 80 % et une probabilité de 95 %. Pour l'analyse de la chlamydia, 260 échantillons positifs détecteraient une différence significative entre une sensibilité de 83 % et 92 % avec une puissance de 80 % et une probabilité de 95 %. Pour l'analyse de M. genitalium, 80 échantillons positifs détecteraient une différence significative entre une sensibilité de 85 % et 99 % avec une puissance de 80 % et une probabilité de 95 % (sensibilité légèrement plus élevée du FCU et plus faible de l'écouvillon méatique du pénis utilisé comme une seule étude publiée ).

La prévalence de la gonorrhée urétrale dans la population masculine à étudier est d'au moins 3,7 %, y compris les hommes asymptomatiques. En incluant 2400 participants symptomatiques et asymptomatiques, cela donnera plus de 85 individus positifs avec une prévalence de 3,7 %. La prévalence de la chlamydia urétrale dans la population masculine à étudier est d'au moins 11 %. 2400 participants donneront 260 individus positifs avec 11% de prévalence. La prévalence de M. genitalium chez les personnes présentant des symptômes d'urétrite dans la population à étudier n'est pas connue, car un test de diagnostic commercial approuvé par la Conformité européenne (marqué CE) vient tout juste d'être disponible. En 2017, 500 cas d'urétrite masculine non gonococcique (UNG) ont été observés, dont 100 (20 %) devraient être positifs pour M. genitalium. Tous ceux qui ont une urétrite gonococcique symptomatique seront également testés pour M. genitalium, parmi lesquels jusqu'à 10 hommes par an peuvent également être positifs pour M. genitalium. Cela signifie que la taille de l'échantillon de 80 serait réalisable dans les 15 mois avec une absorption de 50 à 60 % chez les patients présentant des symptômes d'urétrite. On s'attend à ce que l'adoption soit élevée, en particulier chez les personnes présentant des symptômes d'urétrite, car l'étude propose des tests pour M. genitalium qui ne sont pas encore disponibles dans la pratique clinique de routine car il n'y a actuellement aucun financement pour ce service. Les enquêteurs ont réalisé et publié des études similaires afin d'identifier l'échantillon optimal pour la détection de la chlamydia et de la gonorrhée chez les femmes où 42 cliniciens ont recruté près de 4000 femmes en 10 mois, ce qui était plus court que la période de recrutement prévue.

Toutes les analyses de données seront effectuées à l'aide du numéro d'étude. La sensibilité globale, la spécificité, la valeur prédictive positive et la valeur prédictive négative seront déterminées pour les écouvillons méatiques péniens auto-prélevés et les échantillons d'urine de première capture en comparant les résultats des tests avec le statut d'infection du patient. La comparaison entre les écouvillons de méat pénien auto-prélevés et les échantillons de FCU se fera par le test de McNemar. Les analyses pour la détection de la chlamydia et de la gonorrhée seront également calculées chez les personnes présentant des symptômes et celles sans symptômes.

Utilité de la thérapie guidée par la résistance aux antimicrobiens (RAM) L'utilité de l'utilisation de la thérapie guidée par la résistance aux antimicrobiens sera mesurée par le nombre de personnes qui auraient reçu des antibiotiques inappropriés si la directive NGU avait été suivie en administrant de la doxycycline, puis de l'azithromycine prolongée, puis de la moxifloxacine.

Comparaison des coûts L'analyse économique sera une simple comparaison des coûts et se concentrera sur la question de savoir si l'utilisation d'écouvillons de méat pénien auto-prélevés permet de réaliser des économies par rapport aux échantillons de FCU. L'analyse utilisera la détection correcte de Chlamydia trachomatis, Neisseria gonorrhoeae et Mycoplasma genitalium comme critère d'évaluation principal et adoptera le point de vue du Service national de santé du Royaume-Uni/Services spécialisés prescrits (NHS/PSS) conformément aux recommandations du NICE (NICE 2013). Les coûts seront calculés à partir d'un sous-échantillon de 240 participants. L'utilisation et les coûts des ressources du NHS seront collectés de manière prospective et incluront les coûts du temps et des ressources de la clinique et du temps et des ressources du laboratoire. Le personnel de la clinique remplira un formulaire de collecte de données spécialement conçu pour chaque participant à l'essai pendant une période de 5 à 6 semaines de l'étude. Les informations sur les coûts unitaires ou les prix seront extraites pour être jointes à chaque élément d'utilisation des ressources, afin de permettre le calcul d'un coût global (par ex. Curtis & Burns 2016). La comparaison finale sera basée sur le coût par détection correcte de Chlamydia trachomatis, Neisseria gonorrhoeae et Mycoplasma genitalium à l'aide d'écouvillons de méat pénien auto-prélevés par rapport à des échantillons de FCU.