Streptococcus Pyogenes vognanskaffelses- og transmissionsundersøgelse (SpyCATS)

Studietype og design

Undersøgelsen er et prospektivt, longitudinalt (åbent) kohortestudie inden for husstande i Sukuta, Gambia. Husstande vil blive rekrutteret, og alle tilgængelige husstandsmedlemmer bliver bedt om at deltage. Husstande vil blive fulgt i 12 måneder, med op til månedlige besøg (mindst 3-måneders besøg), og hyppigere for nogle undergrupper af deltagere.

I alt 45 husstande vil blive rekrutteret, inklusive hvert ledigt husstandsmedlem som individuelle deltagere (hvilket resulterer i en kohorte på ca. 450 deltagere med den gennemsnitlige husstandsstørrelse i Sukuta på omkring 10).

Husstande vil blive tilmeldt i 12 måneder, hvor tilmeldingen sigter mod at begynde før regntiden for at sikre, at tilmeldingsperioden vil strække sig over en hel regnsæson med tørre perioder på begge sider. Hver husstand vil gennemgå et tilmeldingsbesøg (MV0), derefter op til månedlige besøg (MV1, MV2, MV3 osv., op til MV12) eller sjældnere, hvis der opstår praktiske begrænsninger.

Ved hvert besøg vil der blive taget en orofaryngeal podning, normal hudpodning, oral væskeprøve og tørret blodpletprøve fra alle individer, data indsamlet om sociodemografi, social blandingsadfærd og kliniske undersøgelsesresultater. De registrerede undersøgelsesresultater vil omfatte tegn på pharyngitis, pyodermi og fnat. Derudover vil der blive taget en blodprøve for serum i begyndelsen og slutningen af ​​undersøgelsen for detaljerede funktionelle immunresponser. Podninger vil også blive taget fra eventuelle pyodermi-læsioner, fra almindelige berøringspunkter i husstanden, såsom dørhåndtag, og bundplader, der bruges i husholdninger.

Podninger vil blive transporteret samme dag til laboratoriet og udpladet til mikrobiologisk dyrkning. Kulturen vil identificere tilstedeværelsen af ​​GAS fra podningen, og hvis den er til stede, vil antibiotikaresistens blive bestemt og isolater opbevaret til senere brug. Derudover, hvis gruppe C og G Streptococcus identificeres, vil isolaterne blive opbevaret, og fra normal hud og pyoderma sårprøver vil alle Staphylococcus aureus isolater blive opbevaret.

Podninger fra deltagere vil blive dyrket for tilstedeværelsen af ​​GAS, og isolater vil gennemgå hele genomsekventering for at vurdere fylogenetisk slægtskab af identificerede stammer. Disse data kombineret med tidsmæssig forekomst af stammeovertagelse, kliniske data og husstandssituation vil blive brugt til at opbygge en matematisk model for GAS-transmission for at identificere centrale transmissionsveje inden for og mellem husstande.

Delstudier:

Intensiveret hændelse GAS-overvågningskohorte

En undergruppe på 12 husstande, de fleste med mindst et asymptomatisk GAS-bærende individ ved baseline, og nogle uden bærere, vil danne en kohorte, der skal gennemgå intensiveret podning. Denne kohorte vil blive brugt til at vurdere forekomsten af ​​GAS-bære og sygdom med større opløsning end hovedkohorten. Alle tilstedeværende husstandsmedlemmer vil gennemgå hyppigere podning med henblik på besøg hver uge i 6 måneder. Ved disse besøg vil der blive indsamlet mere detaljerede social-blandingsadfærdsdata.

Estimering af varigheden af ​​GAS-transport

En yderligere undergruppe vil også blive identificeret for at give mulighed for større opløsning i estimeringen af ​​varigheden af ​​GAS-transport. Efter tilmelding vil enhver deltager, der bliver GAS-bærerpositiv (dvs. var negativ ved baseline eller det forrige besøg og derefter bliver asymptomatisk positiv), få ​​taget ugentlige podninger fra det samme sted, som var positivt, indtil 2 GAS-negative podninger er blevet taget i en række.

Estimering af GAS-infektionshyppighed

For at vurdere forekomsten af ​​klinisk GAS-sygdom i kohorten gennem hele undersøgelsen vil alle deltagere, der rapporterer symptomer, der tyder på mulig klinisk GAS-infektion såsom pharyngitis eller pyodermi (men også invasive infektioner), blive besøgt til et uplanlagt besøg, hvor en klinisk og sundheds- søgningshistorie vil blive registreret, en podepind, spyt og DBS taget, og behandling (eller yderligere behandling) vil blive leveret i overensstemmelse med WHOs retningslinjer eller bedste lokale praksis. Desuden vil enhver person, der er identificeret med symptomer på klinisk GAS-infektion, ved hvert planlagt besøg gennemgå den samme proces med historieoptagelse, podning, behandling og opfølgning.