Streptococcus Pyogenes носительство и исследование передачи (SpyCATS)

Тип исследования и дизайн

Исследование представляет собой проспективное продольное (открытое) когортное исследование домохозяйств в Сукуте, Гамбия. Будут набраны домохозяйства, и всех доступных членов домохозяйства попросят принять участие. За домохозяйствами будут наблюдать в течение 12 месяцев с посещениями до одного раза в месяц (по крайней мере, посещения раз в 3 месяца) и чаще для некоторых подгрупп участников.

Всего будет набрано 45 домохозяйств, включая каждого доступного члена домохозяйства в качестве индивидуальных участников (в результате когорта будет состоять примерно из 450 участников, при этом средний размер домохозяйства в Сукуте составляет около 10 человек).

Домохозяйства будут зачислены на 12 месяцев, при этом регистрация должна начаться до сезона дождей, чтобы гарантировать, что период регистрации будет охватывать один полный сезон дождей с засушливыми периодами по обе стороны. Каждое домохозяйство будет проходить визиты для регистрации (MV0), а затем до ежемесячных посещений (MV1, MV2, MV3 и т. д., до MV12) или реже, если возникнут практические ограничения.

При каждом посещении у всех людей будут брать мазок из ротоглотки, мазок с нормальной кожи, образец ротовой жидкости и сухой образец капли крови, собирать данные о социально-демографических характеристиках, социальном поведении и результатах клинического обследования. Зарегистрированные результаты обследования будут включать признаки фарингита, пиодермии и чесотки. Кроме того, в начале и в конце исследования будет взят образец крови на сыворотку для детального определения функционального иммунного ответа. Мазки также будут взяты из любых очагов пиодермии, из общих точек контакта в домашнем хозяйстве, таких как дверные ручки и отстойные пластины, используемые в домашнем хозяйстве.

В тот же день мазки будут доставлены в лабораторию и подвергнуты микробиологическому посеву. Посев выявит наличие ГАС в мазках, и, если он присутствует, будет определена устойчивость к антибиотикам, а изоляты будут сохранены для последующего использования. Кроме того, при обнаружении стрептококка групп C и G изоляты будут храниться, а из мазков с нормальной кожи и ран от пиодермии будут сохранены любые изоляты Staphylococcus aureus.

Мазки от участников будут культивированы на наличие GAS, а изоляты будут подвергнуты полногеномному секвенированию для оценки филогенетического родства выявленных штаммов. Эти данные в сочетании с временной частотой заражения штаммом, клиническими данными и ситуацией в домашнем хозяйстве будут использоваться для построения математической модели передачи ГАГ для определения основных путей передачи внутри и между домохозяйствами.

Дополнительные исследования:

Когорта интенсивного эпиднадзора за GAS

Подгруппа из 12 домохозяйств, в большинстве из которых по крайней мере один человек с бессимптомным GAS-носителем на исходном уровне, а в некоторых нет носителей, сформирует когорту для проведения усиленного взятия мазков. Эта когорта будет использоваться для оценки частоты носительства и заболевания СГА с большей разрешающей способностью, чем основная когорта. Все присутствующие члены домохозяйства будут чаще проходить мазки, чтобы их посещали каждую неделю в течение 6 месяцев. Во время этих посещений будут собираться более подробные данные о социальном поведении.

Оценка продолжительности перевозки ГАЗ

Также будет определена дополнительная подгруппа, чтобы обеспечить большее разрешение при оценке продолжительности перевозки ГАЗ. После регистрации любой участник, который становится положительным носителем GAS (т. е. был отрицательным на исходном уровне или во время предыдущего визита, а затем становится положительным бессимптомно), будет еженедельно брать мазки с того же участка, который был положительным, до тех пор, пока не будут взяты 2 отрицательных мазка GAS за один раз. ряд.

Оценка заболеваемости ГАС-инфекцией

Для оценки частоты клинического заболевания СГА в когорте на протяжении всего исследования все участники, сообщившие о симптомах, указывающих на возможную клиническую инфекцию СГА, таких как фарингит или пиодермия (но также включая инвазивные инфекции), будут посещаться для внепланового визита, где клинические и медицинские будет записан анамнез, взят мазок, слюна и DBS, а лечение (или дальнейшее лечение) будет проводиться в соответствии с рекомендациями ВОЗ или передовой местной практикой. Кроме того, при каждом запланированном посещении любой человек, у которого выявлены симптомы клинической инфекции GAS, будет подвергаться такому же процессу сбора анамнеза, взятия мазка, лечения и последующего наблюдения.