Studie získávání a přenosu nosičů Streptococcus Pyogenes (SpyCATS)

Typ studie a design

Studie je prospektivní, longitudinální (otevřená) kohortová studie v domácnostech v Sukutě v Gambii. Budou vybrány domácnosti a všichni dostupní členové domácnosti budou požádáni o účast. Domácnosti budou sledovány po dobu 12 měsíců s až měsíčními návštěvami (nejméně 3měsíční návštěvy), u některých podskupin účastníků častěji.

Bude vybráno celkem 45 domácností, včetně každého dostupného člena domácnosti jako individuálního účastníka (výsledkem bude kohorta přibližně 450 účastníků s průměrnou velikostí domácnosti v Sukutě kolem 10).

Domácnosti budou zapsány na 12 měsíců, přičemž zápis bude zahájen před obdobím dešťů, aby bylo zajištěno, že období zápisu bude trvat jedno celé období dešťů s obdobím sucha na obou stranách. Každá domácnost absolvuje registrační návštěvu (MV0), poté až měsíční návštěvy (MV1, MV2, MV3 atd., až MV12) nebo méně často, pokud nastanou praktická omezení.

Při každé návštěvě bude všem jedincům odebrán orofaryngeální výtěr, normální kožní výtěr, vzorek orální tekutiny a vzorek vysušené krevní skvrny, shromážděny údaje o sociodemografii, společenském míšení a nálezech klinického vyšetření. Zaznamenané nálezy vyšetření budou zahrnovat známky faryngitidy, pyodermie a svrabu. Kromě toho bude na začátku a na konci studie odebrán vzorek krve na sérum pro podrobné funkční imunitní odpovědi. Výtěry budou také odebrány z jakýchkoli pyodermických lézí, z běžných dotykových bodů v domácnosti, jako jsou kliky dveří a usazovací talíře používané v domácnostech.

Výtěry budou dopraveny týž den do laboratoře a naneseny na mikrobiologickou kultivaci. Kultivace identifikuje přítomnost GAS z výtěrů, a pokud je přítomen, určí se antibiotická rezistence a izoláty se uloží pro pozdější použití. Kromě toho, pokud jsou identifikovány Streptococcus skupiny C a G, izoláty budou uloženy a z výtěrů normální kůže a pyodermických ran budou uloženy všechny izoláty Staphylococcus aureus.

Výtěry od účastníků budou kultivovány na přítomnost GAS a izoláty budou podrobeny sekvenování celého genomu za účelem posouzení fylogenetické příbuznosti identifikovaných kmenů. Tato data v kombinaci s časovou incidencí akvizice kmene, klinickými daty a situací v domácnosti budou použity k vytvoření matematického modelu přenosu GAS k identifikaci klíčových cest přenosu v rámci domácností a mezi nimi.

Dílčí studie:

Posílená kohorta sledování incidentů GAS

Podskupina 12 domácností, většinou s alespoň jedním asymptomatickým jedincem přenášejícím GAS na začátku studie a některé bez přenašečů, vytvoří kohortu, která podstoupí zesílený výtěr. Tato kohorta bude použita k posouzení výskytu přenosu GAS a onemocnění s větším rozlišením než hlavní kohorta. Všichni přítomní členové domácnosti budou podstupovat častější výtěry s výhledem na návštěvy každý týden po dobu 6 měsíců. Při těchto návštěvách budou shromážděny podrobnější údaje o chování při míšení sociálních sítí.

Odhad doby trvání přepravy PLYNU

Bude také identifikována další podskupina, která umožní větší rozlišení při odhadu doby trvání přepravy GAS. Po zápisu bude každému účastníkovi, který se stane pozitivním přenašečem GAS (tj. byl negativní na začátku nebo při předchozí návštěvě a poté se stane pozitivním asymptomaticky), jednou týdně odebírány výtěry ze stejného místa, které bylo pozitivní, dokud nebudou odebrány 2 výtěry negativní na GAS. řádek.

Odhad výskytu infekce GAS

Za účelem posouzení incidence klinického onemocnění GAS v kohortě v průběhu studie budou všichni účastníci, kteří uvádějí příznaky naznačující možnou klinickou infekci GAS, jako je faryngitida nebo pyodermie (ale také včetně invazivních infekcí), neplánovaně navštíveni, kde budou klinické a zdravotní Zaznamená se anamnéza, odebere se výtěr, sliny a DBS a bude poskytnuta léčba (nebo další léčba) podle pokynů WHO nebo nejlepší místní praxe. Kromě toho při každé plánované návštěvě podstoupí každý jedinec identifikovaný se symptomy klinické infekce GAS stejný proces odebírání anamnézy, výtěru, léčby a sledování.