Onderzoek naar acquisitie en transmissie van Streptococcus Pyogenes Carriage (SpyCATS)

Type studie en ontwerp

De studie is een prospectieve, longitudinale (open) cohortstudie bij huishoudens in Sukuta, Gambia. Huishoudens worden geworven en alle beschikbare leden van het huishouden worden gevraagd om deel te nemen. Huishoudens zullen gedurende 12 maanden worden gevolgd, met maximaal maandelijkse bezoeken (minstens 3-maandelijkse bezoeken), en vaker voor sommige subgroepen van deelnemers.

Er zullen in totaal 45 huishoudens worden gerekruteerd, inclusief elk beschikbaar lid van het huishouden als individuele deelnemers (resulterend in een cohort van ongeveer 450 deelnemers met een gemiddelde huishoudengrootte in Sukuta van ongeveer 10).

Huishoudens worden ingeschreven voor 12 maanden, met als doel de inschrijving te starten vóór het regenseizoen, om ervoor te zorgen dat de inschrijvingsperiode een volledig regenseizoen beslaat, met droge periodes aan weerszijden. Elk huishouden zal een inschrijvingsbezoek ondergaan (MV0), daarna tot maandelijkse bezoeken (MV1, MV2, MV3 enz., tot MV12) of minder vaak als er zich praktische beperkingen voordoen.

Bij elk bezoek wordt een orofaryngeaal uitstrijkje, een normaal huiduitstrijkje, een monster van de orale vloeistof en een opgedroogd bloedmonster afgenomen bij alle individuen, worden gegevens verzameld over socio-demografische gegevens, sociaal menggedrag en bevindingen van klinisch onderzoek. De geregistreerde onderzoeksbevindingen omvatten bewijs van faryngitis, pyodermie en schurft. Bovendien zal aan het begin en einde van de studie een bloedmonster voor serum worden genomen voor gedetailleerde functionele immuunresponsen. Er zullen ook wattenstaafjes worden afgenomen van alle pyoderma-laesies, van gemeenschappelijke aanraakpunten in het huishouden, zoals deurklinken, en bezinkplaten die in huishoudens worden gebruikt.

Swabs worden dezelfde dag naar het laboratorium vervoerd en uitgeplaat voor microbiologische kweek. De kweek zal de aanwezigheid van GAS uit de uitstrijkjes identificeren en, indien aanwezig, zal de antibioticaresistentie worden bepaald en de isolaten worden bewaard voor later gebruik. Bovendien, als groep C- en G-streptokokken worden geïdentificeerd, worden de isolaten bewaard, en van normale huid- en pyoderma-wonduitstrijkjes worden alle Staphylococcus aureus-isolaten opgeslagen.

Uitstrijkjes van deelnemers zullen worden gekweekt op de aanwezigheid van GAS en isolaten zullen volledige genoomsequencing ondergaan om de fylogenetische verwantschap van geïdentificeerde stammen te beoordelen. Deze gegevens, gecombineerd met temporele incidentie van stamacquisitie, klinische gegevens en gezinssituatie zullen worden gebruikt om een ​​wiskundig model van GAS-transmissie te bouwen om de belangrijkste transmissieroutes binnen en tussen huishoudens te identificeren.

Deelstudies:

Geïntensiveerd GAS-surveillancecohort voor incidenten

Een subgroep van 12 huishoudens, de meeste met ten minste één asymptomatisch GAS-dragend individu bij baseline, en sommige zonder dragers, zullen een cohort vormen om intensievere uitstrijkjes te ondergaan. Dit cohort zal worden gebruikt om de incidentie van GAS-dragerschap en -ziekte met een grotere resolutie te beoordelen dan het hoofdcohort. Alle aanwezige leden van het huishouden zullen vaker een uitstrijkje ondergaan, met het oog op een wekelijks bezoek gedurende 6 maanden. Bij deze bezoeken zullen meer gedetailleerde gegevens over sociaal menggedrag worden verzameld.

Schatting van de duur van het GAS-vervoer

Er zal ook een andere subgroep worden geïdentificeerd om een ​​grotere resolutie mogelijk te maken bij het schatten van de duur van GAS-vervoer. Na inschrijving zal bij elke deelnemer die GAS-dragerpositief wordt (d.w.z. negatief was bij baseline of het vorige bezoek, en vervolgens asymptomatisch positief wordt) wekelijks een uitstrijkje worden genomen van dezelfde plaats die positief was, totdat er 2 GAS-negatieve uitstrijkjes zijn genomen in een rij.

Schatting van de incidentie van GAS-infecties

Om de incidentie van klinische GAS-ziekte in het cohort tijdens het onderzoek te beoordelen, zullen alle deelnemers die symptomen melden die wijzen op een mogelijke klinische GAS-infectie, zoals faryngitis of pyodermie (maar ook inclusief invasieve infecties), worden bezocht voor een ongepland bezoek waarbij een klinische en gezondheids- het zoeken naar de geschiedenis zal worden geregistreerd, een uitstrijkje, speeksel en DBS worden genomen en behandeling (of verdere behandeling) zal worden gegeven volgens de richtlijnen van de WHO of de beste lokale praktijk. Bovendien zal bij elk gepland bezoek elk individu dat wordt geïdentificeerd met symptomen van klinische GAS-infectie hetzelfde proces van anamnese, uitstrijkjes, behandeling en follow-up ondergaan.