Streptococcus Pyogenes Carriage Acquisition and Transmission Study (SpyCATS)

Tipo di studio e progettazione

Lo studio è uno studio di coorte prospettico longitudinale (aperto) all'interno delle famiglie a Sukuta, in Gambia. Le famiglie saranno reclutate e tutti i membri della famiglia disponibili saranno invitati a partecipare. Le famiglie saranno seguite per 12 mesi, con visite fino a mensili (visite almeno trimestrali) e più frequentemente per alcuni sottogruppi di partecipanti.

Verranno reclutate un totale di 45 famiglie, inclusi tutti i membri della famiglia disponibili come singoli partecipanti (risultando in una coorte di circa 450 partecipanti con una dimensione media della famiglia a Sukuta di circa 10).

Le famiglie saranno iscritte per 12 mesi, con l'obiettivo di iniziare l'iscrizione prima della stagione delle piogge, per garantire che il periodo di iscrizione copra un'intera stagione delle piogge, con periodi di siccità su entrambi i lati. Ogni famiglia sarà sottoposta a una visita di iscrizione (MV0), poi fino a visite mensili (MV1, MV2, MV3 ecc., fino a MV12) o meno frequentemente se sorgono vincoli pratici.

Ad ogni visita verranno prelevati da tutti gli individui un tampone orofaringeo, un tampone cutaneo normale, un campione di fluido orale e un campione di macchie di sangue essiccato, dati raccolti su socio-demografici, comportamento di mescolamento sociale e risultati dell'esame clinico. I risultati degli esami registrati includeranno prove di faringite, piodermite e scabbia. Inoltre, all'inizio e alla fine dello studio verrà prelevato un campione di sangue per il siero per risposte immunitarie funzionali dettagliate. I tamponi verranno prelevati anche da eventuali lesioni da piodermite, da punti di contatto comuni in casa come maniglie delle porte e piastre di sedimentazione utilizzate all'interno delle famiglie.

I tamponi saranno trasportati lo stesso giorno al laboratorio e piastrati per la coltura microbiologica. La coltura identificherà la presenza di GAS dai tamponi e, se presente, verrà determinata la resistenza agli antibiotici e gli isolati verranno conservati per un uso successivo. Inoltre, se vengono identificati gli streptococchi di gruppo C e G, gli isolati verranno conservati e, dai normali tamponi di pelle e piodermite, verranno conservati tutti gli isolati di Staphylococcus aureus.

I tamponi dei partecipanti saranno coltivati ​​per la presenza di GAS e gli isolati saranno sottoposti a sequenziamento dell'intero genoma al fine di valutare la parentela filogenetica dei ceppi identificati. Questi dati, combinati con l'incidenza temporale dell'acquisizione del ceppo, i dati clinici e la situazione familiare verranno utilizzati per costruire un modello matematico di trasmissione GAS per identificare le principali vie di trasmissione all'interno e tra le famiglie.

Sotto-studi:

Coorte di sorveglianza GAS degli incidenti intensificata

Un sottogruppo di 12 famiglie, la maggior parte con almeno un individuo portatore di GAS asintomatico al basale e alcune senza portatori, formerà una coorte per sottoporsi a tampone intensificato. Questa coorte verrà utilizzata per valutare l'incidenza del trasporto e della malattia GAS con una risoluzione maggiore rispetto alla coorte principale. Tutti i familiari presenti saranno sottoposti a tamponi più frequenti, nell'ottica di essere visitati ogni settimana per 6 mesi. Durante queste visite verranno raccolti dati più dettagliati sul comportamento di mescolamento sociale.

Stima della durata del trasporto GAS

Sarà inoltre individuato un ulteriore sottogruppo per consentire una maggiore risoluzione nella stima della durata del trasporto GAS. Dopo l'arruolamento, qualsiasi partecipante che diventa portatore GAS positivo (ovvero era negativo al basale o alla visita precedente, e poi diventa positivo asintomaticamente) riceverà tamponi settimanali prelevati dallo stesso sito che era positivo, fino a quando non saranno stati prelevati 2 tamponi GAS negativi in ​​un riga.

Stima dell'incidenza di infezione da GAS

Per valutare l'incidenza della malattia clinica da GAS nella coorte durante lo studio, tutti i partecipanti che riportano sintomi suggestivi di possibile infezione clinica da GAS come faringite o piodermite (ma includendo anche infezioni invasive), saranno visitati per una visita non programmata in cui un clinico e salute- verrà registrata la storia della ricerca, verrà prelevato un tampone, la saliva e la DBS e verrà somministrato il trattamento (o ulteriore gestione) secondo le linee guida dell'OMS o la migliore pratica locale. Inoltre, ad ogni visita programmata, qualsiasi individuo identificato con sintomi di infezione clinica da GAS sarà sottoposto allo stesso processo di anamnesi, tampone, trattamento e follow-up.