Estudio de transmisión y adquisición de transporte de Streptococcus Pyogenes (SpyCATS)

Tipo de estudio y diseño.

El estudio es un estudio de cohorte prospectivo, longitudinal (abierto) dentro de los hogares en Sukuta, Gambia. Se reclutarán hogares y se pedirá a todos los miembros disponibles del hogar que participen. Los hogares serán seguidos durante 12 meses, con visitas mensuales (al menos 3 visitas mensuales), y con mayor frecuencia para algunos subgrupos de participantes.

Se reclutará un total de 45 hogares, incluidos todos los miembros disponibles del hogar como participantes individuales (lo que dará como resultado una cohorte de aproximadamente 450 participantes con un tamaño promedio de hogar en Sukuta de alrededor de 10).

Los hogares se inscribirán durante 12 meses, con el objetivo de que la inscripción comience antes de la temporada de lluvias, para garantizar que el período de inscripción abarque una temporada de lluvias completa, con períodos secos a ambos lados. Cada hogar se someterá a una visita de inscripción (MV0), luego hasta visitas mensuales (MV1, MV2, MV3, etc., hasta MV12) o con menos frecuencia si surgen restricciones prácticas.

En cada visita, se tomará un hisopo orofaríngeo, un hisopo de piel normal, una muestra de fluido oral y una muestra de gota de sangre seca de todos los individuos, se recopilarán datos sociodemográficos, comportamiento de mezcla social y hallazgos de exámenes clínicos. Los hallazgos del examen registrados incluirán evidencia de faringitis, pioderma y sarna. Además, se tomará una muestra de sangre para suero al principio y al final del estudio para obtener respuestas inmunitarias funcionales detalladas. También se tomarán hisopos de cualquier lesión de pioderma, de puntos de contacto comunes en el hogar, como manijas de puertas, y placas de sedimentación utilizadas dentro de los hogares.

Los hisopos serán transportados el mismo día al laboratorio y sembrados para cultivo microbiológico. El cultivo identificará la presencia de GAS de los hisopos y, si está presente, se determinará la resistencia a los antibióticos y se almacenarán los aislamientos para su uso posterior. Además, si se identifican estreptococos de los grupos C y G, los aislamientos se almacenarán y, a partir de hisopos de heridas de pioderma y piel normal, se almacenarán los aislamientos de Staphylococcus aureus.

Los hisopos de los participantes se cultivarán para detectar la presencia de GAS y los aislamientos se someterán a la secuenciación del genoma completo para evaluar la relación filogenética de las cepas identificadas. Estos datos, combinados con la incidencia temporal de la adquisición de cepas, los datos clínicos y la situación del hogar, se utilizarán para construir un modelo matemático de transmisión de GAS para identificar rutas clave de transmisión dentro y entre los hogares.

Sub-estudios:

Cohorte de vigilancia intensificada de incidentes de GAS

Un subgrupo de 12 hogares, la mayoría con al menos un individuo portador de GAS asintomático al inicio, y algunos sin portadores, formarán una cohorte para someterse a un hisopado intensificado. Esta cohorte se utilizará para evaluar la incidencia de portación y enfermedad de GAS con mayor resolución que la cohorte principal. Todos los miembros del hogar presentes se someterán a hisopados más frecuentes, con miras a ser visitados cada semana durante 6 meses. En estas visitas, se recopilarán datos de comportamiento de mezcla social más detallados.

Estimación de la duración del transporte de GAS

También se identificará un subgrupo adicional para permitir una mayor resolución en la estimación de la duración del transporte de GAS. Después de la inscripción, a cualquier participante que se vuelva portador de GAS positivo (es decir, fue negativo al inicio del estudio o en la visita anterior, y luego se vuelve positivo asintomáticamente) se le tomarán hisopos semanalmente del mismo sitio que fue positivo, hasta que se hayan tomado 2 hisopos negativos para GAS en un fila.

Estimación de la incidencia de infección por GAS

Para evaluar la incidencia de la enfermedad clínica por GAS en la cohorte a lo largo del estudio, todos los participantes que informen síntomas que sugieran una posible infección clínica por GAS, como faringitis o pioderma (pero que también incluyan infecciones invasivas), recibirán una visita no programada en la que se realizará una evaluación clínica y de salud. se registrará el historial de búsqueda, se tomará un hisopo, saliva y DBS, y se administrará el tratamiento (o el manejo posterior) de acuerdo con las pautas de la OMS o las mejores prácticas locales. Además, en cada visita programada, cualquier individuo identificado con síntomas de infección clínica por GAS se someterá al mismo proceso de toma de antecedentes, hisopado, tratamiento y seguimiento.