Streptococcus Pyogenes studie av vognanskaffelse og overføring (SpyCATS)

Type studie og design

Studien er en prospektiv, longitudinell (åpen) kohortstudie innenfor husholdninger i Sukuta, Gambia. Husstander vil bli rekruttert, og alle tilgjengelige husstandsmedlemmer blir bedt om å delta. Husholdninger vil bli fulgt i 12 måneder, med opptil månedlige besøk (minst 3-måneders besøk), og oftere for noen undergrupper av deltakere.

Totalt 45 husstander vil bli rekruttert, inkludert hvert tilgjengelig husstandsmedlem som individuelle deltakere (noe som resulterer i en kohort på ca. 450 deltakere med gjennomsnittlig husholdningsstørrelse i Sukuta på rundt 10).

Husholdninger vil være påmeldt i 12 måneder, med påmelding som mål å starte før regntiden, for å sikre at påmeldingsperioden vil spenne over en hel regnsesong, med tørre perioder på hver side. Hver husstand vil gjennomgå et registreringsbesøk (MV0), deretter opp til månedlige besøk (MV1, MV2, MV3 osv., opptil MV12) eller sjeldnere hvis praktiske begrensninger oppstår.

Ved hvert besøk vil det bli tatt en orofaryngeal vattpinne, normal hudpinne, oral væskeprøve og tørket blodflekkprøve fra alle individer, data samlet om sosiodemografi, sosial blandingsatferd og kliniske undersøkelsesfunn. Undersøkelsesfunn registrert vil inkludere tegn på faryngitt, pyodermi og skabb. I tillegg vil det bli tatt en blodprøve for serum i begynnelsen og slutten av studien for detaljerte funksjonelle immunresponser. Vatter vil også bli tatt fra eventuelle pyodermi-lesjoner, fra vanlige berøringspunkter i husholdningen som dørhåndtak og setningsplater som brukes i husholdninger.

Vatter vil bli fraktet samme dag til laboratoriet og belagt for mikrobiologisk dyrking. Kulturen vil identifisere tilstedeværelsen av GAS fra vattpinne, og hvis tilstede, vil antibiotikaresistens bli bestemt og isolater lagret for senere bruk. I tillegg, hvis gruppe C og G Streptococcus identifiseres, vil isolatene bli lagret, og fra normal hud og pyoderma sårprøver vil alle Staphylococcus aureus isolater lagres.

Vatterpinner fra deltakerne vil bli dyrket for tilstedeværelse av GAS og isolater vil gjennomgå helgenomsekvensering for å vurdere fylogenetisk slektskap til identifiserte stammer. Disse dataene, kombinert med tidsmessig forekomst av belastningservervelse, kliniske data og husholdningssituasjon vil bli brukt til å bygge en matematisk modell av GAS-overføring for å identifisere nøkkelveier for overføring i og mellom husholdninger.

Delstudier:

Forsterket hendelse GAS-overvåkingskohort

En undergruppe på 12 husstander, de fleste med minst ett asymptomatisk GAS-bærende individ ved baseline, og noen uten bærere, vil danne en kohort for å gjennomgå intensivert svapping. Denne kohorten vil bli brukt til å vurdere forekomst av GAS-bæring og sykdom med større oppløsning enn hovedkohorten. Alle tilstedeværende husstandsmedlemmer vil gjennomgå hyppigere svapping, med tanke på besøk hver uke i 6 måneder. Ved disse besøkene vil mer detaljerte data om sosial blandingsadferd samles inn.

Estimerer varigheten av GAS-transport

En ytterligere undergruppe vil også bli identifisert for å gi større oppløsning i estimeringen av varigheten av GAS-transport. Etter påmelding vil enhver deltaker som blir GAS-bærerpositiv (dvs. var negativ ved baseline eller forrige besøk, og deretter blir asymptomatisk positiv) få ukentlige vattpinner tatt fra det samme stedet som var positivt, inntil 2 GAS-negative vattpinner har blitt tatt i en rad.

Estimerer forekomst av GAS-infeksjon

For å vurdere forekomsten av klinisk GAS-sykdom i kohorten gjennom hele studien, vil alle deltakere som rapporterer symptomer som tyder på mulig klinisk GAS-infeksjon som faryngitt eller pyodermi (men også invasive infeksjoner), bli besøkt for et uplanlagt besøk hvor en klinisk og helse- søkerhistorie vil bli registrert, en vattpinne, spytt og DBS tatt, og behandling (eller videre behandling) vil bli gitt i henhold til WHOs retningslinjer eller beste lokale praksis. Videre, ved hvert planlagte besøk, vil enhver person identifisert med symptomer på klinisk GAS-infeksjon gjennomgå den samme prosessen med anamnesetaking, vattering, behandling og oppfølging.