Streptococcus Pyogenes Carriage Acquisition and Transmission Study (SpyCATS)

Art der Studie und Design

Die Studie ist eine prospektive, längsschnittliche (offene) Kohortenstudie innerhalb von Haushalten in Sukuta, Gambia. Die Haushalte werden rekrutiert und alle verfügbaren Haushaltsmitglieder werden zur Teilnahme aufgefordert. Die Haushalte werden 12 Monate lang mit bis zu monatlichen Besuchen (mindestens 3-monatliche Besuche) und häufiger für einige Untergruppen von Teilnehmern beobachtet.

Insgesamt werden 45 Haushalte rekrutiert, darunter jedes verfügbare Haushaltsmitglied als einzelne Teilnehmer (was zu einer Kohorte von etwa 450 Teilnehmern führt, wobei die durchschnittliche Haushaltsgröße in Sukuta bei etwa 10 liegt).

Haushalte werden für 12 Monate angemeldet, wobei die Anmeldung vor der Regenzeit beginnen soll, um sicherzustellen, dass der Anmeldezeitraum eine volle Regenzeit umfasst, mit Trockenperioden auf beiden Seiten. Jeder Haushalt wird einem Einschulungsbesuch (MV0), dann bis zu monatlichen Besuchen (MV1, MV2, MV3 usw., bis MV12) oder seltener, wenn praktische Einschränkungen auftreten, unterzogen.

Bei jedem Besuch werden von allen Personen ein Oropharynxabstrich, ein normaler Hautabstrich, eine Mundflüssigkeitsprobe und eine getrocknete Blutprobe entnommen, Daten zu Soziodemographie, sozialem Mischverhalten und klinischen Untersuchungsbefunden erhoben. Die aufgezeichneten Untersuchungsbefunde umfassen Hinweise auf Pharyngitis, Pyodermie und Krätze. Darüber hinaus wird zu Beginn und am Ende der Studie eine Blutprobe für Serum entnommen, um detaillierte funktionelle Immunantworten zu erhalten. Abstriche werden auch von Pyodermie-Läsionen, von häufigen Berührungspunkten im Haushalt wie Türgriffen und in Haushalten verwendeten Platten genommen.

Die Abstriche werden noch am selben Tag ins Labor transportiert und für die mikrobiologische Kultur ausplattiert. Die Kultur wird das Vorhandensein von GAS aus den Abstrichen identifizieren, und falls vorhanden, wird die Antibiotikaresistenz bestimmt und die Isolate für eine spätere Verwendung aufbewahrt. Wenn Streptococcus der Gruppen C und G identifiziert werden, werden die Isolate gelagert, und von normalen Haut- und Pyoderma-Wundabstrichen werden alle Isolate von Staphylococcus aureus gelagert.

Abstriche von Teilnehmern werden auf das Vorhandensein von GAS kultiviert und Isolate werden einer Gesamtgenomsequenzierung unterzogen, um die phylogenetische Verwandtschaft der identifizierten Stämme zu beurteilen. Diese Daten, kombiniert mit zeitlicher Inzidenz der Belastungserfassung, klinischen Daten und der Haushaltssituation, werden verwendet, um ein mathematisches Modell der GAS-Übertragung zu erstellen, um die wichtigsten Übertragungswege innerhalb und zwischen Haushalten zu identifizieren.

Teilstudien:

Intensivierte GAS-Überwachungskohorte für Vorfälle

Eine Untergruppe von 12 Haushalten, die meisten mit mindestens einer asymptomatischen GAS-tragenden Person zu Studienbeginn und einige ohne Träger, wird eine Kohorte bilden, um sich einem intensivierten Abstrich zu unterziehen. Diese Kohorte wird verwendet, um die Inzidenz von GAS-Trägern und -Erkrankungen mit größerer Auflösung als die Hauptkohorte zu bewerten. Alle anwesenden Haushaltsmitglieder werden häufigeren Abstrichen unterzogen, um 6 Monate lang jede Woche besucht zu werden. Bei diesen Besuchen werden detailliertere Daten zum Social-Mixing-Verhalten erhoben.

Schätzung der Dauer der GAS-Beförderung

Eine weitere Untergruppe wird ebenfalls identifiziert, um eine größere Auflösung bei der Schätzung der Dauer der GAS-Beförderung zu ermöglichen. Nach der Registrierung werden bei jedem Teilnehmer, der GAS-Träger-positiv wird (d. h. bei Studienbeginn oder beim vorherigen Besuch negativ war und dann asymptomatisch positiv wird), wöchentliche Abstriche von derselben positiven Stelle entnommen, bis 2 GAS-negative Abstriche in a genommen wurden Reihe.

Schätzung der Inzidenz von GAS-Infektionen

Um das Auftreten einer klinischen GAS-Erkrankung in der Kohorte während der gesamten Studie zu beurteilen, werden alle Teilnehmer, die über Symptome berichten, die auf eine mögliche klinische GAS-Infektion hindeuten, wie Pharyngitis oder Pyodermie (aber auch invasive Infektionen), für einen außerplanmäßigen Besuch besucht, bei dem ein klinischer und gesundheitlicher Die Anamnese wird aufgezeichnet, ein Abstrich, Speichel und DBS entnommen und die Behandlung (oder weitere Behandlung) wird gemäß den WHO-Richtlinien oder der besten lokalen Praxis durchgeführt. Darüber hinaus wird bei jedem geplanten Besuch jede Person, bei der Symptome einer klinischen GAS-Infektion festgestellt wurden, dem gleichen Prozess der Anamneseerhebung, des Abstrichs, der Behandlung und der Nachsorge unterzogen.