Nanopore-sekventering i oftalmologi
29. september 2025 opdateret af: Medical University of Graz
Nanopore-sekventering i oftalmologi - et paradigmeskifte i patogenbestemmelse?
I denne pilotundersøgelse skal Oxford Nanopore MinION's gennemførlighed til at identificere patogener fra vitrektomiprøver i øjne med endophthalmitis vurderes.
MinION er en billig kommercielt tilgængelig enhed til DNA/RNA-analyse, der i undersøgelser er blevet brugt til patogenbestemmelse i forskellige infektionssygdomme såvel som til genetisk karakterisering af hæmatologiske tumorer.
Studieoversigt
Status
Rekruttering
Betingelser
Detaljeret beskrivelse
Glaslegemeprøver og forkammerhaner fra øjne med endophthalmitis tages under rutinemæssig vitrektomi.
De indsamlede prøver deles i to for at gennemgå rutinekultur til mikrobiel vækst og nanopore-sekventering med MinION Mk1b, en kommercielt tilgængelig enhed til DNA/RNA-sekventering.
Baselæsninger fra Nanopore-sekventering sammenlignes derefter med tilgængelige biblioteker til patogenidentifikation.
Nanopore-sekventeringsresultaterne for patogener sammenlignes med resultaterne af den mikrobiologiske kultur af det samme øje som guldstandarden.
Kliniske træk og visuel funktion før og efter vitrektomi er samlet fra patientskemaer.
Behandlingen ændres ikke på grund af resultaterne af Nanopore-sekventeringen.
Undersøgelsestype
Observationel
Tilmelding (Anslået)
20
Kontakter og lokationer
Dette afsnit indeholder kontaktoplysninger for dem, der udfører undersøgelsen, og oplysninger om, hvor denne undersøgelse udføres.
Studiekontakt
- Navn: Michael Sommer, MD
- Telefonnummer: 004331638531033
- E-mail: michael.sommer@medunigraz.at
Undersøgelse Kontakt Backup
- Navn: Gerald Seidel, MD, PhD
- Telefonnummer: 004331638580714
- E-mail: gerald.seidel@medunigraz.at
Studiesteder
-
-
Styria
-
Graz, Styria, Østrig, 8036
- Rekruttering
- Universitäts Augenklinik Graz
-
Kontakt:
- Michael Sommer, MD
- Telefonnummer: 004331638531033
- E-mail: michael.sommer@medunigraz.at
-
Kontakt:
- Gerald Seidel, MD, PhD
- Telefonnummer: 004331638580714
- E-mail: gerald.seidel@medunigraz.at
-
-
Deltagelseskriterier
Forskere leder efter personer, der passer til en bestemt beskrivelse, kaldet berettigelseskriterier. Nogle eksempler på disse kriterier er en persons generelle helbredstilstand eller tidligere behandlinger.
Berettigelseskriterier
Aldre berettiget til at studere
18 år til 99 år (Voksen, Ældre voksen)
Tager imod sunde frivillige
N/A
Prøveudtagningsmetode
Ikke-sandsynlighedsprøve
Studiebefolkning
Øjne hos voksne patienter med endoftalmitis
Beskrivelse
Inklusionskriterier:
- Øjne hos patienter med endophthalmitis
Ekskluderingskriterier:
- Intet informeret samtykke muligt
- Deltagelse i andre undersøgelser
Studieplan
Dette afsnit indeholder detaljer om studieplanen, herunder hvordan undersøgelsen er designet, og hvad undersøgelsen måler.
Hvordan er undersøgelsen tilrettelagt?
Design detaljer
Hvad måler undersøgelsen?
Primære resultatmål
Resultatmål |
Foranstaltningsbeskrivelse |
Tidsramme |
|---|---|---|
|
Patogen påvisning
Tidsramme: In vitro analyse efter vitrektomi for endophthalmitis. Start af analyse: Inden for den næste arbejdsdag efter prøvetagning. Tid til Nanopore-sekventering: Cirka op til 10 timer. Tid til dyrkning: 24 timer op til 14 dage.
|
Patogener påvist ved Nanopore-sekventering versus mikrobiologisk kultur
|
In vitro analyse efter vitrektomi for endophthalmitis. Start af analyse: Inden for den næste arbejdsdag efter prøvetagning. Tid til Nanopore-sekventering: Cirka op til 10 timer. Tid til dyrkning: 24 timer op til 14 dage.
|
Sekundære resultatmål
Resultatmål |
Foranstaltningsbeskrivelse |
Tidsramme |
|---|---|---|
|
Tid til patogendetektion
Tidsramme: Tid målt fra start af analyse til ankomst af resultater. Tid til Nanopore-sekventering: Cirka op til 10 timer. Tid til dyrkning: 24 timer op til 14 dage.
|
Tid i dage fra indsamling af prøven til ankomst af resultater
|
Tid målt fra start af analyse til ankomst af resultater. Tid til Nanopore-sekventering: Cirka op til 10 timer. Tid til dyrkning: 24 timer op til 14 dage.
|
|
Synsstyrke
Tidsramme: Samlet fra patientskemaer to måneder efter vitrektomi.
|
Synsstyrke målt med Snellen-diagrammer
|
Samlet fra patientskemaer to måneder efter vitrektomi.
|
Samarbejdspartnere og efterforskere
Det er her, du vil finde personer og organisationer, der er involveret i denne undersøgelse.
Sponsor
Datoer for undersøgelser
Disse datoer sporer fremskridtene for indsendelser af undersøgelsesrekord og resumeresultater til ClinicalTrials.gov. Studieregistreringer og rapporterede resultater gennemgås af National Library of Medicine (NLM) for at sikre, at de opfylder specifikke kvalitetskontrolstandarder, før de offentliggøres på den offentlige hjemmeside.
Studer store datoer
Studiestart (Faktiske)
22. april 2022
Primær færdiggørelse (Anslået)
1. december 2026
Studieafslutning (Anslået)
1. december 2027
Datoer for studieregistrering
Først indsendt
22. april 2022
Først indsendt, der opfyldte QC-kriterier
12. maj 2022
Først opslået (Faktiske)
13. maj 2022
Opdateringer af undersøgelsesjournaler
Sidste opdatering sendt (Anslået)
30. september 2025
Sidste opdatering indsendt, der opfyldte kvalitetskontrolkriterier
29. september 2025
Sidst verificeret
1. september 2025
Mere information
Begreber relateret til denne undersøgelse
Yderligere relevante MeSH-vilkår
Andre undersøgelses-id-numre
- NSIO
Plan for individuelle deltagerdata (IPD)
Planlægger du at dele individuelle deltagerdata (IPD)?
INGEN
Lægemiddel- og udstyrsoplysninger, undersøgelsesdokumenter
Studerer et amerikansk FDA-reguleret lægemiddelprodukt
Ingen
Studerer et amerikansk FDA-reguleret enhedsprodukt
Ingen
Disse oplysninger blev hentet direkte fra webstedet clinicaltrials.gov uden ændringer. Hvis du har nogen anmodninger om at ændre, fjerne eller opdatere dine undersøgelsesoplysninger, bedes du kontakte register@clinicaltrials.gov. Så snart en ændring er implementeret på clinicaltrials.gov, vil denne også blive opdateret automatisk på vores hjemmeside .