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Sequenziamento dei nanopori in oftalmologia

29 settembre 2025 aggiornato da: Medical University of Graz

Sequenziamento dei nanopori in oftalmologia: un cambiamento di paradigma nella determinazione dei patogeni?

In questo studio pilota, sarà valutata la fattibilità dell'Oxford Nanopore MinION per identificare i patogeni dai campioni di vitrectomia negli occhi con endoftalmite. Il MinION è un dispositivo disponibile in commercio a basso costo per l'analisi del DNA/RNA che, negli studi, è stato utilizzato per la determinazione dei patogeni in varie malattie infettive nonché per la caratterizzazione genetica dei tumori ematologici.

Panoramica dello studio

Stato

Reclutamento

Condizioni

Descrizione dettagliata

Durante la vitrectomia di routine vengono prelevati campioni vitreali e prelievi della camera anteriore da occhi con endoftalmite. I campioni raccolti vengono divisi a metà per essere sottoposti a coltura di routine per la crescita microbica e il sequenziamento dei nanopori con MinION Mk1b, un dispositivo disponibile in commercio per il sequenziamento di DNA/RNA. Le letture di base dal sequenziamento di Nanopore vengono quindi confrontate con le librerie disponibili per l'identificazione dei patogeni. I risultati del sequenziamento di Nanopore per i patogeni vengono confrontati con i risultati della coltura microbiologica dello stesso occhio del gold standard. Le caratteristiche cliniche e la funzione visiva prima e dopo la vitrectomia sono raccolte dalle cartelle cliniche dei pazienti. Il trattamento non è alterato dai risultati del sequenziamento di Nanopore.

Tipo di studio

Osservativo

Iscrizione (Stimato)

20

Contatti e Sedi

Questa sezione fornisce i recapiti di coloro che conducono lo studio e informazioni su dove viene condotto lo studio.

Contatto studio

Backup dei contatti dello studio

Luoghi di studio

Criteri di partecipazione

I ricercatori cercano persone che corrispondano a una certa descrizione, chiamata criteri di ammissibilità. Alcuni esempi di questi criteri sono le condizioni generali di salute di una persona o trattamenti precedenti.

Criteri di ammissibilità

Età idonea allo studio

Da 18 anni a 99 anni (Adulto, Adulto più anziano)

Accetta volontari sani

N/A

Metodo di campionamento

Campione non probabilistico

Popolazione di studio

Occhi di pazienti adulti con endoftalmite

Descrizione

Criterio di inclusione:

  • Occhi di pazienti con endoftalmite

Criteri di esclusione:

  • Nessun consenso informato possibile
  • Partecipazione ad altri studi

Piano di studio

Questa sezione fornisce i dettagli del piano di studio, compreso il modo in cui lo studio è progettato e ciò che lo studio sta misurando.

Come è strutturato lo studio?

Dettagli di progettazione

Cosa sta misurando lo studio?

Misure di risultato primarie

Misura del risultato
Misura Descrizione
Lasso di tempo
Rilevazione di agenti patogeni
Lasso di tempo: Analisi in vitro dopo vitrectomia per endoftalmite. Inizio dell'analisi: entro il giorno lavorativo successivo all'acquisizione del campione. Tempo per il sequenziamento dei nanopori: circa fino a 10 ore. Tempo per la cultura: 24 ore fino a 14 giorni.
Patogeni rilevati dal sequenziamento di Nanopore rispetto alla coltura microbiologica
Analisi in vitro dopo vitrectomia per endoftalmite. Inizio dell'analisi: entro il giorno lavorativo successivo all'acquisizione del campione. Tempo per il sequenziamento dei nanopori: circa fino a 10 ore. Tempo per la cultura: 24 ore fino a 14 giorni.

Misure di risultato secondarie

Misura del risultato
Misura Descrizione
Lasso di tempo
Tempo per il rilevamento dell'agente patogeno
Lasso di tempo: Tempo misurato dall'inizio dell'analisi fino all'arrivo dei risultati. Tempo per il sequenziamento dei nanopori: circa fino a 10 ore. Tempo per la cultura: 24 ore fino a 14 giorni.
Tempo in giorni dalla raccolta del campione fino all'arrivo dei risultati
Tempo misurato dall'inizio dell'analisi fino all'arrivo dei risultati. Tempo per il sequenziamento dei nanopori: circa fino a 10 ore. Tempo per la cultura: 24 ore fino a 14 giorni.
Acuità visiva
Lasso di tempo: Raccolti dalle cartelle dei pazienti due mesi dopo la vitrectomia.
Acuità visiva misurata con grafici di Snellen
Raccolti dalle cartelle dei pazienti due mesi dopo la vitrectomia.

Collaboratori e investigatori

Qui è dove troverai le persone e le organizzazioni coinvolte in questo studio.

Sponsor

Medical University of Graz

Studiare le date dei record

Queste date tengono traccia dell'avanzamento della registrazione dello studio e dell'invio dei risultati di sintesi a ClinicalTrials.gov. I record degli studi e i risultati riportati vengono esaminati dalla National Library of Medicine (NLM) per assicurarsi che soddisfino specifici standard di controllo della qualità prima di essere pubblicati sul sito Web pubblico.

Studia le date principali

Inizio studio (Effettivo)

22 aprile 2022

Completamento primario (Stimato)

1 dicembre 2026

Completamento dello studio (Stimato)

1 dicembre 2027

Date di iscrizione allo studio

Primo inviato

22 aprile 2022

Primo inviato che soddisfa i criteri di controllo qualità

12 maggio 2022

Primo Inserito (Effettivo)

13 maggio 2022

Aggiornamenti dei record di studio

Ultimo aggiornamento pubblicato (Stimato)

30 settembre 2025

Ultimo aggiornamento inviato che soddisfa i criteri QC

29 settembre 2025

Ultimo verificato

1 settembre 2025

Maggiori informazioni

Termini relativi a questo studio

Parole chiave

Termini MeSH pertinenti aggiuntivi

Altri numeri di identificazione dello studio

  • NSIO

Piano per i dati dei singoli partecipanti (IPD)

Hai intenzione di condividere i dati dei singoli partecipanti (IPD)?

NO

Informazioni su farmaci e dispositivi, documenti di studio

Studia un prodotto farmaceutico regolamentato dalla FDA degli Stati Uniti

No

Studia un dispositivo regolamentato dalla FDA degli Stati Uniti

No

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