Sequenciamento de Nanoporos em Oftalmologia

Amostras vítreas e punções da câmara anterior de olhos com endoftalmite são coletadas durante a vitrectomia de rotina. As amostras coletadas são divididas ao meio para serem submetidas a cultura de rotina para crescimento microbiano e sequenciamento de nanoporos com o MinION Mk1b, um dispositivo comercialmente disponível para sequenciamento de DNA/RNA. As leituras de base do sequenciamento Nanopore são então comparadas com as bibliotecas disponíveis para identificação de patógenos. Os resultados do sequenciamento Nanopore para patógenos são comparados com os resultados da cultura microbiológica do mesmo olho como padrão-ouro. As características clínicas e a função visual antes e depois da vitrectomia são coletadas dos prontuários dos pacientes. O tratamento não é alterado devido aos resultados do sequenciamento do Nanopore.