Nanopore-sekvensering i oftalmologi
4. desember 2023 oppdatert av: Medical University of Graz
Nanopore-sekvensering i oftalmologi - et paradigmeskifte i patogenbestemmelse?
I denne pilotstudien skal Oxford Nanopore MinIONs mulighet for å identifisere patogener fra vitrektomiprøver i øyne med endoftalmitt vurderes.
MinION er en rimelig kommersielt tilgjengelig enhet for DNA/RNA-analyse som i studier har blitt brukt til patogenbestemmelse i ulike infeksjonssykdommer samt for genetisk karakterisering av hematologiske svulster.
Studieoversikt
Status
Rekruttering
Forhold
Detaljert beskrivelse
Glassprøver og fremre kammerkraner fra øyne med endoftalmitt tas under rutinemessig vitrektomi.
De innsamlede prøvene er delt i to for å gjennomgå rutinekultur for mikrobiell vekst og nanopore-sekvensering med MinION Mk1b, en kommersielt tilgjengelig enhet for DNA/RNA-sekvensering.
Baseavlesninger fra Nanopore-sekvensering sammenlignes deretter med tilgjengelige biblioteker for patogenidentifikasjon.
Nanopore-sekvenseringsresultatene for patogener sammenlignes med resultatene fra den mikrobiologiske kulturen med samme øye som gullstandarden.
Kliniske egenskaper og visuell funksjon før og etter vitrektomi er samlet fra pasientskjemaer.
Behandlingen endres ikke på grunn av resultatene av Nanopore-sekvenseringen.
Studietype
Observasjonsmessig
Registrering (Antatt)
20
Kontakter og plasseringer
Denne delen inneholder kontaktinformasjon for de som utfører studien, og informasjon om hvor denne studien blir utført.
Studiekontakt
- Navn: Michael Sommer, MD
- Telefonnummer: 004331638531033
- E-post: michael.sommer@medunigraz.at
Studer Kontakt Backup
- Navn: Gerald Seidel, MD, PhD
- Telefonnummer: 004331638580714
- E-post: gerald.seidel@medunigraz.at
Studiesteder
-
-
Styria
-
Graz, Styria, Østerrike, 8036
- Rekruttering
- Universitäts Augenklinik Graz
-
Ta kontakt med:
- Michael Sommer, MD
- Telefonnummer: 004331638531033
- E-post: michael.sommer@medunigraz.at
-
Ta kontakt med:
- Gerald Seidel, MD, PhD
- Telefonnummer: 004331638580714
- E-post: gerald.seidel@medunigraz.at
-
-
Deltakelseskriterier
Forskere ser etter personer som passer til en bestemt beskrivelse, kalt kvalifikasjonskriterier. Noen eksempler på disse kriteriene er en persons generelle helsetilstand eller tidligere behandlinger.
Kvalifikasjonskriterier
Alder som er kvalifisert for studier
18 år til 99 år (Voksen, Eldre voksen)
Tar imot friske frivillige
N/A
Prøvetakingsmetode
Ikke-sannsynlighetsprøve
Studiepopulasjon
Øyne til voksne pasienter med endoftalmitt
Beskrivelse
Inklusjonskriterier:
- Øyne til pasienter med endoftalmitt
Ekskluderingskriterier:
- Ingen informert samtykke mulig
- Deltakelse i andre studier
Studieplan
Denne delen gir detaljer om studieplanen, inkludert hvordan studien er utformet og hva studien måler.
Hvordan er studiet utformet?
Designdetaljer
Hva måler studien?
Primære resultatmål
Resultatmål |
Tiltaksbeskrivelse |
Tidsramme |
|---|---|---|
|
Patogendeteksjon
Tidsramme: In vitro analyse etter vitrektomi for endoftalmitt. Start av analyse: Innen neste arbeidsdag etter prøveinnhenting. Tid for Nanopore-sekvensering: Omtrent opptil 10 timer. Tid for kultur: 24 timer opptil 14 dager.
|
Patogener oppdaget ved Nanopore-sekvensering versus mikrobiologisk kultur
|
In vitro analyse etter vitrektomi for endoftalmitt. Start av analyse: Innen neste arbeidsdag etter prøveinnhenting. Tid for Nanopore-sekvensering: Omtrent opptil 10 timer. Tid for kultur: 24 timer opptil 14 dager.
|
Sekundære resultatmål
Resultatmål |
Tiltaksbeskrivelse |
Tidsramme |
|---|---|---|
|
Tid til patogendeteksjon
Tidsramme: Tid målt fra start av analyse til ankomst av resultater. Tid for Nanopore-sekvensering: Omtrent opptil 10 timer. Tid for kultur: 24 timer opptil 14 dager.
|
Tid i dager fra innsamling av prøve til ankomst av resultater
|
Tid målt fra start av analyse til ankomst av resultater. Tid for Nanopore-sekvensering: Omtrent opptil 10 timer. Tid for kultur: 24 timer opptil 14 dager.
|
|
Synsskarphet
Tidsramme: Innhentet fra pasientdiagrammer to måneder etter vitrektomi.
|
Synsstyrke målt med Snellen-diagrammer
|
Innhentet fra pasientdiagrammer to måneder etter vitrektomi.
|
Samarbeidspartnere og etterforskere
Det er her du vil finne personer og organisasjoner som er involvert i denne studien.
Sponsor
Studierekorddatoer
Disse datoene sporer fremdriften for innsending av studieposter og sammendragsresultater til ClinicalTrials.gov. Studieposter og rapporterte resultater gjennomgås av National Library of Medicine (NLM) for å sikre at de oppfyller spesifikke kvalitetskontrollstandarder før de legges ut på det offentlige nettstedet.
Studer hoveddatoer
Studiestart (Faktiske)
22. april 2022
Primær fullføring (Antatt)
1. desember 2024
Studiet fullført (Antatt)
1. desember 2024
Datoer for studieregistrering
Først innsendt
22. april 2022
Først innsendt som oppfylte QC-kriteriene
12. mai 2022
Først lagt ut (Faktiske)
13. mai 2022
Oppdateringer av studieposter
Sist oppdatering lagt ut (Antatt)
5. desember 2023
Siste oppdatering sendt inn som oppfylte QC-kriteriene
4. desember 2023
Sist bekreftet
1. desember 2023
Mer informasjon
Begreper knyttet til denne studien
Ytterligere relevante MeSH-vilkår
Andre studie-ID-numre
- NSIO
Plan for individuelle deltakerdata (IPD)
Planlegger du å dele individuelle deltakerdata (IPD)?
NEI
Legemiddel- og utstyrsinformasjon, studiedokumenter
Studerer et amerikansk FDA-regulert medikamentprodukt
Nei
Studerer et amerikansk FDA-regulert enhetsprodukt
Nei
Denne informasjonen ble hentet direkte fra nettstedet clinicaltrials.gov uten noen endringer. Hvis du har noen forespørsler om å endre, fjerne eller oppdatere studiedetaljene dine, vennligst kontakt register@clinicaltrials.gov. Så snart en endring er implementert på clinicaltrials.gov, vil denne også bli oppdatert automatisk på nettstedet vårt. .