Нанопоровое секвенирование в офтальмологии
29 сентября 2025 г. обновлено: Medical University of Graz
Нанопоровое секвенирование в офтальмологии — смена парадигмы в определении патогенов?
В этом пилотном исследовании будет оцениваться возможность использования Oxford Nanopore MinION для идентификации патогенов из образцов витрэктомии в глазах с эндофтальмитом.
MinION — это недорогой коммерчески доступный прибор для анализа ДНК/РНК, который в исследованиях использовался для определения патогенов при различных инфекционных заболеваниях, а также для генетической характеристики гематологических опухолей.
Обзор исследования
Статус
Рекрутинг
Условия
Подробное описание
Образцы стекловидного тела и пункции передней камеры глаза с эндофтальмитом берутся во время обычной витрэктомии.
Собранные образцы делят пополам для проведения обычного культивирования для микробного роста и секвенирования нанопор с помощью MinION Mk1b, имеющегося в продаже устройства для секвенирования ДНК/РНК.
Затем базовые данные секвенирования Nanopore сравниваются с доступными библиотеками для идентификации патогенов.
Результаты секвенирования Nanopore для патогенов сравниваются с результатами микробиологического посева того же глаза в качестве золотого стандарта.
Клинические признаки и зрительные функции до и после витрэктомии собраны из историй болезни.
Лечение не изменено из-за результатов секвенирования Nanopore.
Тип исследования
Наблюдательный
Регистрация (Оцененный)
20
Контакты и местонахождение
В этом разделе приведены контактные данные лиц, проводящих исследование, и информация о том, где проводится это исследование.
Контакты исследования
- Имя: Michael Sommer, MD
- Номер телефона: 004331638531033
- Электронная почта: michael.sommer@medunigraz.at
Учебное резервное копирование контактов
- Имя: Gerald Seidel, MD, PhD
- Номер телефона: 004331638580714
- Электронная почта: gerald.seidel@medunigraz.at
Места учебы
-
-
Styria
-
Graz, Styria, Австрия, 8036
- Рекрутинг
- Universitäts Augenklinik Graz
-
Контакт:
- Michael Sommer, MD
- Номер телефона: 004331638531033
- Электронная почта: michael.sommer@medunigraz.at
-
Контакт:
- Gerald Seidel, MD, PhD
- Номер телефона: 004331638580714
- Электронная почта: gerald.seidel@medunigraz.at
-
-
Критерии участия
Исследователи ищут людей, которые соответствуют определенному описанию, называемому критериям приемлемости. Некоторыми примерами этих критериев являются общее состояние здоровья человека или предшествующее лечение.
Критерии приемлемости
Возраст, подходящий для обучения
От 18 лет до 99 лет (Взрослый, Пожилой взрослый)
Принимает здоровых добровольцев
Н/Д
Метод выборки
Невероятностная выборка
Исследуемая популяция
Глаза взрослых пациентов с эндофтальмитом
Описание
Критерии включения:
- Глаза больных эндофтальмитом
Критерий исключения:
- Информированное согласие невозможно
- Участие в других исследованиях
Учебный план
В этом разделе представлена подробная информация о плане исследования, в том числе о том, как планируется исследование и что оно измеряет.
Как устроено исследование?
Детали дизайна
Что измеряет исследование?
Первичные показатели результатов
Мера результата |
Мера Описание |
Временное ограничение |
|---|---|---|
|
Обнаружение возбудителя
Временное ограничение: Анализ in vitro после витрэктомии на эндофтальмит. Начало анализа: В течение следующего рабочего дня после получения образца. Время секвенирования Nanopore: примерно до 10 часов. Время для культуры: от 24 часов до 14 дней.
|
Патогены, обнаруженные с помощью секвенирования Nanopore, в сравнении с микробиологической культурой
|
Анализ in vitro после витрэктомии на эндофтальмит. Начало анализа: В течение следующего рабочего дня после получения образца. Время секвенирования Nanopore: примерно до 10 часов. Время для культуры: от 24 часов до 14 дней.
|
Вторичные показатели результатов
Мера результата |
Мера Описание |
Временное ограничение |
|---|---|---|
|
Время обнаружения возбудителя
Временное ограничение: Время измеряется от начала анализа до получения результатов. Время секвенирования Nanopore: примерно до 10 часов. Время для культуры: от 24 часов до 14 дней.
|
Время в днях от сбора образца до получения результатов
|
Время измеряется от начала анализа до получения результатов. Время секвенирования Nanopore: примерно до 10 часов. Время для культуры: от 24 часов до 14 дней.
|
|
Острота зрения
Временное ограничение: Собраны из карт пациентов через два месяца после витрэктомии.
|
Острота зрения измеряется по диаграммам Снеллена.
|
Собраны из карт пациентов через два месяца после витрэктомии.
|
Соавторы и исследователи
Здесь вы найдете людей и организации, участвующие в этом исследовании.
Спонсор
Даты записи исследования
Эти даты отслеживают ход отправки отчетов об исследованиях и сводных результатов на сайт ClinicalTrials.gov. Записи исследований и сообщаемые результаты проверяются Национальной медицинской библиотекой (NLM), чтобы убедиться, что они соответствуют определенным стандартам контроля качества, прежде чем публиковать их на общедоступном веб-сайте.
Изучение основных дат
Начало исследования (Действительный)
22 апреля 2022 г.
Первичное завершение (Оцененный)
1 декабря 2026 г.
Завершение исследования (Оцененный)
1 декабря 2027 г.
Даты регистрации исследования
Первый отправленный
22 апреля 2022 г.
Впервые представлено, что соответствует критериям контроля качества
12 мая 2022 г.
Первый опубликованный (Действительный)
13 мая 2022 г.
Обновления учебных записей
Последнее опубликованное обновление (Оцененный)
30 сентября 2025 г.
Последнее отправленное обновление, отвечающее критериям контроля качества
29 сентября 2025 г.
Последняя проверка
1 сентября 2025 г.
Дополнительная информация
Термины, связанные с этим исследованием
Дополнительные соответствующие термины MeSH
Другие идентификационные номера исследования
- NSIO
Планирование данных отдельных участников (IPD)
Планируете делиться данными об отдельных участниках (IPD)?
НЕТ
Информация о лекарствах и устройствах, исследовательские документы
Изучает лекарственный продукт, регулируемый FDA США.
Нет
Изучает продукт устройства, регулируемый Управлением по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов США.
Нет
Эта информация была получена непосредственно с веб-сайта clinicaltrials.gov без каких-либо изменений. Если у вас есть запросы на изменение, удаление или обновление сведений об исследовании, обращайтесь по адресу register@clinicaltrials.gov. Как только изменение будет реализовано на clinicaltrials.gov, оно будет автоматически обновлено и на нашем веб-сайте. .