Rumligt løst IBD: Spatial Transcriptomics of Inflammatory Bowel Disease (IBD)
1. juli 2024 opdateret af: Silvio Danese, IRCCS San Raffaele
Målet med denne retrospektive observationsundersøgelse er at opnå den rumlige opløsning af hele den intestinale fibrotiske proces gennem teknologien STOmics Stereoseq.
Til denne undersøgelse vil vi bruge kirurgiske prøver fra 8 UC e 8 CD tidligere indsamlet til det allerede godkendte projekt, IBD Biobank, og opbevaret ved -80°C.
Studieoversigt
Status
Ikke rekrutterer endnu
Betingelser
Intervention / Behandling
Detaljeret beskrivelse
Dette er et monocentrisk observationsstudie, hvor vi vil bruge det biologiske materiale fra kirurgi udført til normal klinisk praksis og allerede opbevaret ved -80°C.
Dette projekt har som formål:
- At optrevle de ændringer i tarmen, der fører til komplikationer hos CD- og UC-patienter. Især sigter vi på at identificere cellepopulationerne, deres rumlige organisation, interaktioner og specifikke transkriptionelle skift, hvilket fører til udviklingen fra sundt væv til betændt og fra betændt til fibrotisk væv. Vi vil være interesserede i at producere en profil af Spatial transcriptomics af alle områder af den kirurgiske prøve.
- At sammenligne den rumlige organisation og differentielle genekspression af væv
Undersøgelsestype
Observationel
Tilmelding (Anslået)
16
Kontakter og lokationer
Dette afsnit indeholder kontaktoplysninger for dem, der udfører undersøgelsen, og oplysninger om, hvor denne undersøgelse udføres.
Studiesteder
-
-
-
Milan, Italien
- IRCCS Ospedale San Raffaele
-
Milano, Italien, 20132
- IRCCS Ospedale San Raffaele
-
-
Deltagelseskriterier
Forskere leder efter personer, der passer til en bestemt beskrivelse, kaldet berettigelseskriterier. Nogle eksempler på disse kriterier er en persons generelle helbredstilstand eller tidligere behandlinger.
Berettigelseskriterier
Aldre berettiget til at studere
- Voksen
- Ældre voksen
Tager imod sunde frivillige
N/A
Prøveudtagningsmetode
Sandsynlighedsprøve
Studiebefolkning
Retrospektiv observationsundersøgelse, der involverede patienter med Crohns sygdom (CD) (n=8) og patienter med colitis ulcerosa (UC)(n=8), som var blevet opereret i henhold til standarden for pleje.
Vi vil bruge det biologiske materiale fra operation udført til normal klinisk praksis og allerede opbevaret ved -80°C til IBD Biobank-projekt.
Den retrospektive henvisningsperiode går fra juli 2022 til juli 2023.
Beskrivelse
Inklusionskriterier:
- voksen patient (alder ≥18 år), både mandlige og kvindelige patienter med histologisk bekræftet CD og UC, der gennemgår tarmresektion i henhold til standardbehandling på grund af komplicerende sygdom, uanset deres nuværende eller tidligere medicinske behandling;
- patienter, der har underskrevet IBD Biobank informeret samtykke og givet samtykke til brugen af deres eget biologiske materiale i fremtidige undersøgelser eller vedrørende samme undersøgelsesområde.
Ekskluderingskriterier:
- - patienter med ubekræftede både UC- og CD-diagnoser;
- patienter med overlejret dysplasi eller cancerdiagnose og resektioner, hvor postoperativ endoskopisk vurdering af recidiv ikke er mulig;
- patienter, der ikke har underskrevet IBD Biobank informeret samtykke.
Studieplan
Dette afsnit indeholder detaljer om studieplanen, herunder hvordan undersøgelsen er designet, og hvad undersøgelsen måler.
Hvordan er undersøgelsen tilrettelagt?
Design detaljer
Kohorter og interventioner
Gruppe / kohorte |
Intervention / Behandling |
|---|---|
|
patienter med histologisk bekræftet CD
patienter med histologisk bekræftet CD, der gennemgår tarmresektion
|
at bruge deres biologiske prøver fra UC- og CD-patienter, allerede opbevaret ved -80°C til transkriptomisk analyse gennem STOmics Stereoseq
|
|
patienter med histologisk bekræftet UC
patienter med histologisk bekræftet UC, der gennemgår tarmresektion
|
at bruge deres biologiske prøver fra UC- og CD-patienter, allerede opbevaret ved -80°C til transkriptomisk analyse gennem STOmics Stereoseq
|
Hvad måler undersøgelsen?
Primære resultatmål
Resultatmål |
Foranstaltningsbeskrivelse |
Tidsramme |
|---|---|---|
|
Profil af Spatial transcriptomics af alle områder af den kirurgiske prøve fra UC- og CD-patienter
Tidsramme: 1 år
|
at udføre en transkriptomisk analyse af hele den kirurgiske prøve vil blive indlejret i OCT-blok.
For at overvinde eventuelle fejl i OCT-indlejringen vil vi skære serielle snit og farve dem for at evaluere tilstedeværelsen af alle tarmregioner af interesse, og derefter vælge den tilstødende til den rumlige analyse.
Desuden vil vi vurdere ved histologisk vurdering, om et enkelt stykke kirurgisk prøve vil omfatte ikke-betændte, betændte (i tilfælde af UC) og også fibrotiske områder (i tilfælde af CD)
|
1 år
|
Samarbejdspartnere og efterforskere
Det er her, du vil finde personer og organisationer, der er involveret i denne undersøgelse.
Sponsor
Samarbejdspartnere
Datoer for undersøgelser
Disse datoer sporer fremskridtene for indsendelser af undersøgelsesrekord og resumeresultater til ClinicalTrials.gov. Studieregistreringer og rapporterede resultater gennemgås af National Library of Medicine (NLM) for at sikre, at de opfylder specifikke kvalitetskontrolstandarder, før de offentliggøres på den offentlige hjemmeside.
Studer store datoer
Studiestart (Anslået)
1. august 2024
Primær færdiggørelse (Anslået)
1. februar 2025
Studieafslutning (Anslået)
1. august 2025
Datoer for studieregistrering
Først indsendt
26. juni 2024
Først indsendt, der opfyldte QC-kriterier
1. juli 2024
Først opslået (Faktiske)
3. juli 2024
Opdateringer af undersøgelsesjournaler
Sidste opdatering sendt (Faktiske)
3. juli 2024
Sidste opdatering indsendt, der opfyldte kvalitetskontrolkriterier
1. juli 2024
Sidst verificeret
1. juni 2024
Mere information
Begreber relateret til denne undersøgelse
Yderligere relevante MeSH-vilkår
Andre undersøgelses-id-numre
- STOmics
Plan for individuelle deltagerdata (IPD)
Planlægger du at dele individuelle deltagerdata (IPD)?
INGEN
Lægemiddel- og udstyrsoplysninger, undersøgelsesdokumenter
Studerer et amerikansk FDA-reguleret lægemiddelprodukt
Ingen
Studerer et amerikansk FDA-reguleret enhedsprodukt
Ingen
Disse oplysninger blev hentet direkte fra webstedet clinicaltrials.gov uden ændringer. Hvis du har nogen anmodninger om at ændre, fjerne eller opdatere dine undersøgelsesoplysninger, bedes du kontakte register@clinicaltrials.gov. Så snart en ændring er implementeret på clinicaltrials.gov, vil denne også blive opdateret automatisk på vores hjemmeside .