Spatially Resolved IBD: Spatial Transcriptomics of Inflammatory Bowel Disease (IBD)
maanantai 1. heinäkuuta 2024 päivittänyt: Silvio Danese, IRCCS San Raffaele
Tämän retrospektiivisen havainnointitutkimuksen tavoitteena on saada koko suoliston fibroottisen prosessin spatiaalinen resoluutio STOmics Stereoseq -teknologialla.
Tässä tutkimuksessa käytämme kirurgisia näytteitä 8 UC e 8 CD:stä, jotka on kerätty aiemmin jo hyväksyttyä projektia, IBD Biobank, varten ja säilytetty -80 °C:ssa.
Tutkimuksen yleiskatsaus
Tila
Ei vielä rekrytointia
Ehdot
Interventio / Hoito
Yksityiskohtainen kuvaus
Tämä on yksikeskinen havaintotutkimus, jossa käytämme normaaliin kliiniseen käytäntöön tehdystä leikkauksesta saatua biologista materiaalia, joka on jo varastoitu -80°C:ssa.
Tällä projektilla on tarkoitus:
- Selvittää komplikaatioihin johtavia muutoksia suolistossa CD- ja UC-potilailla. Erityisesti pyrimme tunnistamaan solupopulaatiot, niiden tilaorganisaation, vuorovaikutukset ja erityiset transkription muutokset, jotka johtavat etenemiseen terveestä kudoksesta tulehtuneeseen ja tulehtuneesta fibroottiseen kudokseen. Olemme kiinnostuneita tuottamaan profiilin spatiaalista transkriptomiikan kaikista kirurgisen näytteen alueista.
- Vertaa kudoksen tilaorganisaatiota ja differentiaalista geeniekspressiota
Opintotyyppi
Havainnollistava
Ilmoittautuminen (Arvioitu)
16
Yhteystiedot ja paikat
Tässä osiossa on tutkimuksen suorittajien yhteystiedot ja tiedot siitä, missä tämä tutkimus suoritetaan.
Opiskelupaikat
-
-
-
Milan, Italia
- IRCCS Ospedale San Raffaele
-
Milano, Italia, 20132
- IRCCS Ospedale San Raffaele
-
-
Osallistumiskriteerit
Tutkijat etsivät ihmisiä, jotka sopivat tiettyyn kuvaukseen, jota kutsutaan kelpoisuuskriteereiksi. Joitakin esimerkkejä näistä kriteereistä ovat henkilön yleinen terveydentila tai aiemmat hoidot.
Kelpoisuusvaatimukset
Opintokelpoiset iät
- Aikuinen
- Vanhempi Aikuinen
Hyväksyy terveitä vapaaehtoisia
Ei käytössä
Näytteenottomenetelmä
Todennäköisyysnäyte
Tutkimusväestö
Retrospektiivinen havainnointitutkimus, johon osallistui Crohnin tautia (CD) sairastavia potilaita (n=8) ja haavaista paksusuolitulehdusta (UC) (n=8) sairastavia potilaita, joille oli tehty hoitostandardien mukainen leikkaus.
Käytämme normaaliin kliiniseen käytäntöön tehdystä leikkauksesta saatua biologista materiaalia, joka on jo varastoitu -80°C:ssa IBD Biobank -projektiin.
Takautuva viittausaika kestää heinäkuusta 2022 heinäkuuhun 2023.
Kuvaus
Sisällyttämiskriteerit:
- aikuinen potilas (ikä ≥ 18 vuotta), sekä mies- että naispotilaat, joilla on histologisesti varmistettu CD ja UC, joille tehdään suolen resektio hoidon standardin mukaisesti komplisoivan taudin vuoksi, riippumatta heidän nykyisestä tai aiemmasta lääkehoidosta;
- potilaat, jotka ovat allekirjoittaneet IBD-biopankin tietoisen suostumuksen ja suostuneet käyttämään omaa biologista materiaaliaan myöhemmässä tai samaa tutkimusalaa koskevassa tutkimuksessa.
Poissulkemiskriteerit:
- - potilaat, joilla on vahvistamaton sekä UC- että CD-diagnoosi;
- potilaat, joilla on päällekkäinen dysplasia tai syöpädiagnoosi ja resektiot, joiden uusiutumisen jälkeinen endoskooppinen arviointi ei ole mahdollista;
- potilaat, jotka eivät ole allekirjoittaneet IBD Biobankin tietoista suostumusta.
Opintosuunnitelma
Tässä osiossa on tietoja tutkimussuunnitelmasta, mukaan lukien kuinka tutkimus on suunniteltu ja mitä tutkimuksella mitataan.
Miten tutkimus on suunniteltu?
Suunnittelun yksityiskohdat
Kohortit ja interventiot
Ryhmä/Kohortti |
Interventio / Hoito |
|---|---|
|
potilailla, joilla on histologisesti vahvistettu CD
potilailla, joilla on histologisesti vahvistettu CD ja joille tehdään suolen resektio
|
käyttää biologisia näytteitään UC- ja CD-potilaista, jotka on jo säilytetty -80 °C:ssa transkriptomista analyysiä varten STOmics Stereoseqin kautta
|
|
potilailla, joilla on histologisesti vahvistettu UC
potilaat, joilla on histologisesti varmistettu UC ja joille tehdään suolen resektio
|
käyttää biologisia näytteitään UC- ja CD-potilaista, jotka on jo säilytetty -80 °C:ssa transkriptomista analyysiä varten STOmics Stereoseqin kautta
|
Mitä tutkimuksessa mitataan?
Ensisijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Toimenpiteen kuvaus |
Aikaikkuna |
|---|---|---|
|
UC- ja CD-potilaiden kirurgisen näytteen kaikkien alueiden spatiaalisen transkriptomiikan profiili
Aikaikkuna: 1 vuosi
|
suorittaaksesi transkriptomisen analyysin koko kirurgisesta näytteestä upotetaan OCT-lohkoon.
OCT-upotusongelmien ratkaisemiseksi leikkaamme sarjaleikkeitä ja värjäämme ne arvioidaksemme kaikkien kiinnostavien suoliston alueiden läsnäolon ja valitsemme sitten viereisen spatiaalista analyysiä varten.
Lisäksi arvioimme histologisella arvioinnilla, sisältääkö yksittäinen leikkausnäyte ei tulehtunutta, tulehtunutta (UC:n tapauksessa) ja myös fibroottisia alueita (CD)
|
1 vuosi
|
Yhteistyökumppanit ja tutkijat
Täältä löydät tähän tutkimukseen osallistuvat ihmiset ja organisaatiot.
Sponsori
Yhteistyökumppanit
Opintojen ennätyspäivät
Nämä päivämäärät seuraavat ClinicalTrials.gov-sivustolle lähetettyjen tutkimustietueiden ja yhteenvetojen edistymistä. National Library of Medicine (NLM) tarkistaa tutkimustiedot ja raportoidut tulokset varmistaakseen, että ne täyttävät tietyt laadunvalvontastandardit, ennen kuin ne julkaistaan julkisella verkkosivustolla.
Opi tärkeimmät päivämäärät
Opiskelun aloitus (Arvioitu)
Torstai 1. elokuuta 2024
Ensisijainen valmistuminen (Arvioitu)
Lauantai 1. helmikuuta 2025
Opintojen valmistuminen (Arvioitu)
Perjantai 1. elokuuta 2025
Opintoihin ilmoittautumispäivät
Ensimmäinen lähetetty
Keskiviikko 26. kesäkuuta 2024
Ensimmäinen toimitettu, joka täytti QC-kriteerit
Maanantai 1. heinäkuuta 2024
Ensimmäinen Lähetetty (Todellinen)
Keskiviikko 3. heinäkuuta 2024
Tutkimustietojen päivitykset
Viimeisin päivitys julkaistu (Todellinen)
Keskiviikko 3. heinäkuuta 2024
Viimeisin lähetetty päivitys, joka täytti QC-kriteerit
Maanantai 1. heinäkuuta 2024
Viimeksi vahvistettu
Lauantai 1. kesäkuuta 2024
Lisää tietoa
Tähän tutkimukseen liittyvät termit
Muita asiaankuuluvia MeSH-ehtoja
Muut tutkimustunnusnumerot
- STOmics
Yksittäisten osallistujien tietojen suunnitelma (IPD)
Aiotko jakaa yksittäisten osallistujien tietoja (IPD)?
EI
Lääke- ja laitetiedot, tutkimusasiakirjat
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää lääkevalmistetta
Ei
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää laitetuotetta
Ei
Nämä tiedot haettiin suoraan verkkosivustolta clinicaltrials.gov ilman muutoksia. Jos sinulla on pyyntöjä muuttaa, poistaa tai päivittää tutkimustietojasi, ota yhteyttä register@clinicaltrials.gov. Heti kun muutos on otettu käyttöön osoitteessa clinicaltrials.gov, se päivitetään automaattisesti myös verkkosivustollemme .