Integreret opdagelse og udvikling af innovativ TB-diagnostik ((CETR))

Det langsigtede mål med dette projekt er at give information, der er afgørende for udviklingen og brugen af ​​et billigt, point-of-care, hurtigt, enkelt og meget præcist diagnostisk værktøj, der kan hjælpe klinikere med at stille en mikrobiologisk diagnose hos børn, der med tegn og symptomer, der tyder på TB.

Specifikt mål 1: At identificere de typer af patientprøver, hvorfra man bedst kan påvise Mtb-DNA hos børn med TB. Vi foreslår at få serielle prøver af sputum, blod, afføring og mave- og nasopharyngeale sekreter fra børn med symptomatisk TB og at bruge molekylære metoder til at karakterisere fordelingen af ​​Mtb i disse prøver. Resultaterne af denne undersøgelse vil give os mulighed for at identificere de mest lovende prøvetagningsstrategier til diagnosticering af TB hos børn, således at optimering af disse let tilgængelige prøver til påvisning af Mtb-nukleinsyrer kan løses.

Specifikt mål 2: At bestemme, om cellefrit Mtb-DNA kan påvises i plasma- og urinprøver fra børn og voksne med TB og at beskrive de værtsrelaterede faktorer, der ændrer følsomheden af ​​dette assay. Vi foreslår at teste serielle urin- og plasmaprøver for Mtb DNA-fragmenter i to grupper: (1) børn med symptomer på TB og (2) voksne med TB. Her vil vi optimere prøvevolumenstørrelser og state-of-the-art sekventeringsværktøjer for at forbedre DNA-gendannelse og detektion. Denne undersøgelse vil hjælpe med at identificere optimale prøver og strategier til den ikke-invasive diagnose af Mtb ved hjælp af urin.

Sekundært mål: At skabe en bank af arkiverede prøver til (1) optimering af Mtb DNA-oprensning, -ekstraktion og (2) brug i fremtidig pædiatrisk TB-diagnostisk forskning.