Innovatiivisen tuberkuloosidiagnostiikan integroitu löytäminen ja kehittäminen ((CETR))

Tämän projektin pitkän aikavälin tavoitteena on tarjota kriittistä tietoa edullisen, hoitopisteen, nopean, yksinkertaisen ja erittäin tarkan diagnostisen työkalun kehittämiselle ja käytölle, joka voi auttaa kliinikoita tekemään mikrobiologisen diagnoosin sairastuneilla lapsilla. joilla on tuberkuloosiin viittaavia merkkejä ja oireita.

Erityistavoite 1: Tunnistaa potilasnäytteiden tyypit, joista Mtb-DNA voidaan parhaiten havaita tuberkuloosia sairastavilla lapsilla. Ehdotamme sarjanäytteitä ysköksestä, verestä, ulosteesta sekä maha- ja nenänielun eritteistä lapsilta, joilla on oireinen tuberkuloosi, ja käyttää molekyylimenetelmiä Mtb:n jakautumisen karakterisoimiseksi näissä näytteissä. Tämän tutkimuksen tulokset antavat meille mahdollisuuden tunnistaa lupaavimmat näytteenottostrategiat lasten tuberkuloosin diagnosoimiseksi, jotta voidaan käsitellä näiden helposti saatavilla olevien näytteiden optimointia Mtb-nukleiinihappojen havaitsemiseksi.

Erityinen tavoite 2: Selvittää, voidaanko soluvapaata Mtb-DNA:ta havaita tuberkuloosia sairastavien lasten ja aikuisten plasma- ja virtsanäytteistä ja kuvata isäntään liittyviä tekijöitä, jotka muuttavat tämän määrityksen herkkyyttä. Ehdotamme sarjan virtsa- ja plasmanäytteiden testaamista Mtb-DNA-fragmenttien varalta kahdessa ryhmässä: (1) lapset, joilla on tuberkuloosin oireita, ja (2) aikuiset, joilla on tuberkuloosi. Täällä optimoimme näytetilavuuden koot ja huippuluokan sekvensointityökalut DNA:n talteenoton ja havaitsemisen parantamiseksi. Tämä tutkimus auttaa tunnistamaan optimaaliset näytteet ja strategiat Mtb:n ei-invasiiviseen diagnosointiin virtsan avulla.

Toissijainen tavoite: Luoda arkistoitujen näytteiden pankki (1) Mtb DNA:n puhdistuksen, uuttamisen optimointia ja (2) käyttöä tulevassa lasten tuberkuloosin diagnostisessa tutkimuksessa.