Scoperta e sviluppo integrati di strumenti diagnostici innovativi per la tubercolosi ((CETR))

L'obiettivo a lungo termine di questo progetto è fornire informazioni fondamentali per lo sviluppo e l'uso di uno strumento diagnostico a basso costo, presso il punto di cura, rapido, semplice ed estremamente accurato che possa aiutare i medici a fare una diagnosi microbiologica nei bambini che presentano con segni e sintomi suggestivi di tubercolosi.

Obiettivo specifico 1: identificare i tipi di campioni di pazienti da cui rilevare al meglio il DNA di Mtb nei bambini affetti da tubercolosi. Proponiamo di ottenere campioni seriali di espettorato, sangue, feci e secrezioni gastriche e nasofaringee da bambini con tubercolosi sintomatica e di utilizzare metodi molecolari per caratterizzare la distribuzione di Mtb in questi campioni. I risultati di questo studio ci consentiranno di identificare le strategie di campionamento più promettenti per la diagnosi di tubercolosi nei bambini in modo da poter affrontare l'ottimizzazione di questi campioni facilmente accessibili per il rilevamento degli acidi nucleici di Mtb.

Obiettivo specifico 2: determinare se il DNA cellulare libero di Mtb può essere rilevato in campioni di plasma e urina di bambini e adulti affetti da tubercolosi e descrivere i fattori correlati all'ospite che alterano la sensibilità di questo test. Proponiamo di testare campioni seriali di urina e plasma per frammenti di DNA di Mtb in due gruppi: (1) bambini con sintomi di tubercolosi e (2) adulti con tubercolosi. Qui ottimizzeremo le dimensioni del volume del campione e gli strumenti di sequenziamento all'avanguardia per migliorare il recupero e il rilevamento del DNA. Questo studio aiuterà a identificare campioni e strategie ottimali per la diagnosi non invasiva di Mtb utilizzando l'urina.

Obiettivo secondario: creare una banca di campioni archiviati per (1) l'ottimizzazione della purificazione, estrazione del DNA di Mtb e (2) l'utilizzo nella futura ricerca diagnostica sulla tubercolosi pediatrica.