Integrert oppdagelse og utvikling av innovativ TB-diagnostikk ((CETR))

Det langsiktige målet med dette prosjektet er å gi informasjon som er kritisk for utvikling og bruk av et rimelig, pleiepunkt, raskt, enkelt og svært nøyaktig diagnostisk verktøy som kan hjelpe klinikere med å stille en mikrobiologisk diagnose hos barn som har med tegn og symptomer som tyder på tuberkulose.

Spesifikt mål 1: Å identifisere hvilke typer pasientprøver som best kan påvise Mtb-DNA hos barn med TB. Vi foreslår å innhente serieprøver av sputum, blod, avføring og mage- og nasofaryngeale sekreter fra barn med symptomatisk TB og å bruke molekylære metoder for å karakterisere fordelingen av Mtb i disse prøvene. Resultatene av denne studien vil tillate oss å identifisere de mest lovende prøvetakingsstrategiene for diagnostisering av TB hos barn, slik at optimalisering av disse lett tilgjengelige prøvene for påvisning av Mtb-nukleinsyrer kan adresseres.

Spesifikt mål 2: Å bestemme om cellefritt Mtb-DNA kan påvises i plasma- og urinprøver fra barn og voksne med TB og å beskrive de vertsrelaterte faktorene som endrer sensitiviteten til denne analysen. Vi foreslår å teste serielle urin- og plasmaprøver for Mtb DNA-fragmenter i to grupper: (1) barn med symptomer på TB og (2) voksne med TB. Her vil vi optimere prøvevolumstørrelser og toppmoderne sekvenseringsverktøy for å forbedre DNA-gjenoppretting og deteksjon. Denne studien vil bidra til å identifisere optimale prøver og strategier for ikke-invasiv diagnose av Mtb ved bruk av urin.

Sekundært mål: Å lage en bank med arkiverte prøver for (1) optimalisering av Mtb DNA-rensing, -ekstraksjon og (2) bruk i fremtidig pediatrisk TB-diagnostisk forskning.