"Immunoregulering i åreforkalkning: en enkeltcelle-RNA-sekventeringsundersøgelse"
9. juni 2025 opdateret af: Carlos Vicente Serrano Junior, Hospital Israelita Albert Einstein
Den arkitektoniske immunoregulering i aterosklerotisk sygdom: En enkeltcelle-RNA-sekventering og rumlig biologi-tilgang
Aterosklerose er den førende årsag til akutte kardiovaskulære begivenheder, såsom myokardieinfarkt og slagtilfælde, og er en betydelig risikofaktor for kardiovaskulær dødelighed.
Den detaljerede forståelse af immunmekanismerne og cellulære transformationer, der er involveret i patogenesen af åreforkalkning, er stadig begrænset, og brugen af enkeltcelle-RNA-sekventering (SCRNASEQ) har afsløret nye cellulære funktioner og underpopulationer forbundet med sygdomsprogression.
Denne undersøgelse sigter mod at identificere cellulære subpopulationer, molekylære veje og ændringer i genekspression relateret til udviklingen af åreforkalkning i humane koronararterier.
Ved hjælp af SCRNASEQ søger undersøgelsen at karakterisere det transkriptomiske landskab af celler, der er til stede i aterosklerotiske plaques og identificere molekylære signaturer, der afslører individuelle disponeringer for specifikke fænotyper, såsom sygdomsfølsomhed og respons på terapier.
Forskningen vil blive udført på Albert Einstein Israeli Hospital i São Paulo og vil involvere prøver fra koronararterier og aterosklerotiske plaques i de eksplicitt hjerter hos patienter, der har gennemgået hjertetransplantationer såvel som fra kasseret materiale af koronar arterie bypass transplantationskirurgi (CABG).
Med en estimeret prøvestørrelse på 20-30 plaques vil de opnåede data muliggøre en detaljeret analyse af de molekylære mekanismer involveret i åreforkalkning, hvilket bidrager til udviklingen af specifikke terapeutiske mål.
Studieoversigt
Status
Ikke rekrutterer endnu
Betingelser
Intervention / Behandling
Detaljeret beskrivelse
Dette er en prospektiv observationsundersøgelse, der vil blive udført med prøver af koronararterier og aterosklerotiske plaques fra de eksplanterede hjerter hos patienter med iskæmisk kardiomyopati, der har gennemgået hjertetransplantationer såvel som fra kasseret materiale af koronar bypass -graftkirurgi.
De aterosklerotiske plakprøver hentes fra koronararterierne under transplantationskirurgien eller CABG -proceduren og transporteres til laboratoriet inden for 2 timer.
De valgte arterier vil blive dissekeret og mikroskopisk evalueret, og prøverne vil blive fikseret i formalin, indlejret i paraffin og farvet til histologisk analyse.
Vævet vil blive enzymatisk dissocieret for at opnå individuelle celler, som derefter filtreres og vurderes for cellelevedygtighed.
Cellerne gennemgår enkeltcelle-RNA-sekventering (SCRNASEQ) med det formål at analysere omkring 5.000-10.000 celler pr. Prøve.
Prøvestørrelsen vil være 20-30 plaques med det mål at fange de vigtigste cellulære populationer og udføre en robust analyse.
Undersøgelsestype
Observationel
Tilmelding (Anslået)
30
Kontakter og lokationer
Dette afsnit indeholder kontaktoplysninger for dem, der udfører undersøgelsen, og oplysninger om, hvor denne undersøgelse udføres.
Studiekontakt
- Navn: Carlos Vicente Serrano, PhD
- Telefonnummer: +55 (11) 2151-5408
- E-mail: carlos.sjunior@einstein.br
Studiesteder
-
-
SP
-
São Paulo, SP, Brasilien, 05652-900
- Hospital israelita Albert Einstein
-
-
Deltagelseskriterier
Forskere leder efter personer, der passer til en bestemt beskrivelse, kaldet berettigelseskriterier. Nogle eksempler på disse kriterier er en persons generelle helbredstilstand eller tidligere behandlinger.
Berettigelseskriterier
Aldre berettiget til at studere
- Voksen
- Ældre voksen
Tager imod sunde frivillige
Ingen
Prøveudtagningsmetode
Sandsynlighedsprøve
Studiebefolkning
Patienter, der er diagnosticeret med iskæmisk kardiomyopati på grund af avanceret åreforkalkning, gennemgår hjertetransplantation.
Beskrivelse
Inkluderingskriterier:
- Patienter, der er diagnosticeret med iskæmisk kardiomyopati på grund af avanceret åreforkalkning, gennemgår hjertetransplantation;
- Patienter med koronararteriesygdom, der blev indsendt til koronar bypass -transplantatkirurgi (CABG). "
- I alderen 40 og 75 år;
- Underskrevet formular med informeret samtykke.
Ekskluderingskriterier:
- Patienter med systemiske inflammatoriske eller autoimmune sygdomme;
- Historie om kræft inden for de sidste 5 år eller aktiv malignitet;
- Seneste anvendelse (inden for de sidste 6 måneder) af immunsuppressiv terapi.
Studieplan
Dette afsnit indeholder detaljer om studieplanen, herunder hvordan undersøgelsen er designet, og hvad undersøgelsen måler.
Hvordan er undersøgelsen tilrettelagt?
Design detaljer
Kohorter og interventioner
Gruppe / kohorte |
Intervention / Behandling |
|---|---|
|
Koronarplaques fra Explanted Heart
De valgte arterier vil blive dissekeret og mikroskopisk evalueret, og prøverne vil blive fikseret i formalin, indlejret i paraffin og farvet til histologisk analyse.
Vævet vil blive enzymatisk dissocieret for at opnå individuelle celler, som derefter filtreres og vurderes for cellelevedygtighed.
Cellerne gennemgår enkeltcelle-RNA-sekventering (SCRNASEQ) med det formål at analysere omkring 5.000-10.000 celler pr. Prøve.
Prøvestørrelsen vil være 20-30 plaques med det mål at fange de vigtigste cellulære populationer og udføre en robust analyse.
|
Oparbejdning Datalormalisering, dimensionalitetsreduktion og klynge udføres ved hjælp af Seurat -pakken (baseret på R). Celletyper identificeres baseret på kanonisk markørgenekspression. Identifikation af cellesubpopulation Klynger vil blive kommenteret baseret på underskrifter af kendte celletyper (f.eks. Endotelceller, glatte muskelceller, makrofager osv.). Differentialgenekspressionsanalyse vil blive udført for at identificere sygdomsassocierede gener. Vej og funktionsberigelse Gendsæt berigelseanalyse (GSEA) og pathway -analyser (f.eks. KEGG, reaktom) vil blive udført for at undersøge de biologiske processer og veje, der driver åreforkalkning. Kvalitetskontrol Sekventeringslæsninger vurderes for kvalitet ved hjælp af FASTQC, og læsninger af lav kvalitet vil blive filtreret ud. Cell Ranger-softwaren (10x genomik) vil blive brugt til at justere læsning til det humane genom og kvantificere genekspression på enkeltcelleniveau. |
Hvad måler undersøgelsen?
Primære resultatmål
Resultatmål |
Foranstaltningsbeskrivelse |
Tidsramme |
|---|---|---|
|
Koncentration af specifikke celler klynger og makrofag / Linfocite-underpopulationer: Opret en højopløsning med en-celle atlas af aterosklerotiske plaques.
Tidsramme: Gennem undersøgelsesafslutning, i gennemsnit 1 og et halvt år.
|
Bestem koncentrationen af cellulære klynger med specifikke inflammatoriske underpopulationer bestemmelse af at skabe en højopløsning enkeltcelle atlas af aterosklerotiske plaques, hvilket afslører cellespecifikke transkriptionelle ændringer forbundet med sygdommen.
Resultaterne kunne identificere nye terapeutiske mål for intervention i aterosklerose og øge forståelsen af dens molekylære patogenese.
|
Gennem undersøgelsesafslutning, i gennemsnit 1 og et halvt år.
|
Sekundære resultatmål
Resultatmål |
Foranstaltningsbeskrivelse |
Tidsramme |
|---|---|---|
|
Koncentration af interleukiner og cellulære undertyper efter citometerstrøm til identifikation af molekylære underskrifter i aterosklerose
Tidsramme: Gennem undersøgelsesafslutning, i gennemsnit 1 og et halvt år.
|
Det sekundære mål er at identificere molekylære signaturer, der afslører individuelle disponeringer for specifikke fænotyper, såsom modtagelighed for åreforkalkning, respons på terapier og andre sundhedsmæssige egenskaber, der etablerer grundlaget for præcisionsmedicin og befolkningssundhedsstudier i Brasilien ved at bestemme specifikke koncentrationer af PRO og antiinflammatoriske molekul og celletyper.
|
Gennem undersøgelsesafslutning, i gennemsnit 1 og et halvt år.
|
Samarbejdspartnere og efterforskere
Det er her, du vil finde personer og organisationer, der er involveret i denne undersøgelse.
Publikationer og nyttige links
Den person, der er ansvarlig for at indtaste oplysninger om undersøgelsen, leverer frivilligt disse publikationer. Disse kan handle om alt relateret til undersøgelsen.
Generelle publikationer
- Li Q, Wang M, Zhang S, Jin M, Chen R, Luo Y, Sun X. Single-cell RNA sequencing in atherosclerosis: Mechanism and precision medicine. Front Pharmacol. 2022 Oct 4;13:977490. doi: 10.3389/fphar.2022.977490. eCollection 2022.
- Zhang H, Viveiros A, Nikhanj A, Nguyen Q, Wang K, Wang W, Freed DH, Mullen JC, MacArthur R, Kim DH, Tymchak W, Sergi CM, Kassiri Z, Wang S, Oudit GY. The Human Explanted Heart Program: A translational bridge for cardiovascular medicine. Biochim Biophys Acta Mol Basis Dis. 2021 Jan 1;1867(1):165995. doi: 10.1016/j.bbadis.2020.165995. Epub 2020 Oct 22.
- Rajab TK, Singh SK. Donation After Cardiac Death Heart Transplantation in America Is Clinically Necessary and Ethically Justified. Circ Heart Fail. 2018 Mar;11(3):e004884. doi: 10.1161/CIRCHEARTFAILURE.118.004884. No abstract available.
- Price AL, Patterson N, Yu F, Cox DR, Waliszewska A, McDonald GJ, Tandon A, Schirmer C, Neubauer J, Bedoya G, Duque C, Villegas A, Bortolini MC, Salzano FM, Gallo C, Mazzotti G, Tello-Ruiz M, Riba L, Aguilar-Salinas CA, Canizales-Quinteros S, Menjivar M, Klitz W, Henderson B, Haiman CA, Winkler C, Tusie-Luna T, Ruiz-Linares A, Reich D. A genomewide admixture map for Latino populations. Am J Hum Genet. 2007 Jun;80(6):1024-36. doi: 10.1086/518313. Epub 2007 Apr 13.
- Gouveia MH, Bentley AR, Leal TP, Tarazona-Santos E, Bustamante CD, Adeyemo AA, Rotimi CN, Shriner D. Unappreciated subcontinental admixture in Europeans and European Americans and implications for genetic epidemiology studies. Nat Commun. 2023 Nov 7;14(1):6802. doi: 10.1038/s41467-023-42491-0.
- Hu Z, Liu W, Hua X, Chen X, Chang Y, Hu Y, Xu Z, Song J. Single-Cell Transcriptomic Atlas of Different Human Cardiac Arteries Identifies Cell Types Associated With Vascular Physiology. Arterioscler Thromb Vasc Biol. 2021 Apr;41(4):1408-1427. doi: 10.1161/ATVBAHA.120.315373. Epub 2021 Feb 25.
- Soehnlein O, Libby P. Targeting inflammation in atherosclerosis - from experimental insights to the clinic. Nat Rev Drug Discov. 2021 Aug;20(8):589-610. doi: 10.1038/s41573-021-00198-1. Epub 2021 May 11.
- Fernandez DM, Rahman AH, Fernandez NF, Chudnovskiy A, Amir ED, Amadori L, Khan NS, Wong CK, Shamailova R, Hill CA, Wang Z, Remark R, Li JR, Pina C, Faries C, Awad AJ, Moss N, Bjorkegren JLM, Kim-Schulze S, Gnjatic S, Ma'ayan A, Mocco J, Faries P, Merad M, Giannarelli C. Single-cell immune landscape of human atherosclerotic plaques. Nat Med. 2019 Oct;25(10):1576-1588. doi: 10.1038/s41591-019-0590-4. Epub 2019 Oct 7.
- Wirka RC, Wagh D, Paik DT, Pjanic M, Nguyen T, Miller CL, Kundu R, Nagao M, Coller J, Koyano TK, Fong R, Woo YJ, Liu B, Montgomery SB, Wu JC, Zhu K, Chang R, Alamprese M, Tallquist MD, Kim JB, Quertermous T. Atheroprotective roles of smooth muscle cell phenotypic modulation and the TCF21 disease gene as revealed by single-cell analysis. Nat Med. 2019 Aug;25(8):1280-1289. doi: 10.1038/s41591-019-0512-5. Epub 2019 Jul 29.
- Kim K, Park SE, Park JS, Choi JH. Characteristics of plaque lipid-associated macrophages and their possible roles in the pathogenesis of atherosclerosis. Curr Opin Lipidol. 2022 Oct 1;33(5):283-288. doi: 10.1097/MOL.0000000000000842. Epub 2022 Aug 3.
- Chattopadhyay A, Guan P, Majumder S, Kaw K, Zhou Z, Zhang C, Prakash SK, Kaw A, Buja LM, Kwartler CS, Milewicz DM. Preventing Cholesterol-Induced Perk (Protein Kinase RNA-Like Endoplasmic Reticulum Kinase) Signaling in Smooth Muscle Cells Blocks Atherosclerotic Plaque Formation. Arterioscler Thromb Vasc Biol. 2022 Aug;42(8):1005-1022. doi: 10.1161/ATVBAHA.121.317451. Epub 2022 Jun 16.
- Su C, Lu Y, Wang Z, Guo J, Hou Y, Wang X, Qin Z, Gao J, Sun Z, Dai Y, Liu Y, Liu G, Xian X, Cui X, Zhang J, Tang J. Atherosclerosis: The Involvement of Immunity, Cytokines and Cells in Pathogenesis, and Potential Novel Therapeutics. Aging Dis. 2023 Aug 1;14(4):1214-1242. doi: 10.14336/AD.2022.1208.
- Serrano CV Jr, Yoshida VM, Venturinelli ML, D'Amico E, Monteiro HP, Ramires JA, da Luz PL. Effect of simvastatin on monocyte adhesion molecule expression in patients with hypercholesterolemia. Atherosclerosis. 2001 Aug;157(2):505-12. doi: 10.1016/s0021-9150(00)00757-7.
- Serrano CV Jr, de Mattos FR, Pitta FG, Nomura CH, de Lemos J, Ramires JAF, Kalil-Filho R. Association between Neutrophil-Lymphocyte and Platelet-Lymphocyte Ratios and Coronary Artery Calcification Score among Asymptomatic Patients: Data from a Cross-Sectional Study. Mediators Inflamm. 2019 Mar 26;2019:6513847. doi: 10.1155/2019/6513847. eCollection 2019.
- Makover ME, Shapiro MD, Toth PP. There is urgent need to treat atherosclerotic cardiovascular disease risk earlier, more intensively, and with greater precision: A review of current practice and recommendations for improved effectiveness. Am J Prev Cardiol. 2022 Aug 6;12:100371. doi: 10.1016/j.ajpc.2022.100371. eCollection 2022 Dec.
Datoer for undersøgelser
Disse datoer sporer fremskridtene for indsendelser af undersøgelsesrekord og resumeresultater til ClinicalTrials.gov. Studieregistreringer og rapporterede resultater gennemgås af National Library of Medicine (NLM) for at sikre, at de opfylder specifikke kvalitetskontrolstandarder, før de offentliggøres på den offentlige hjemmeside.
Studer store datoer
Studiestart (Anslået)
25. juni 2025
Primær færdiggørelse (Anslået)
25. oktober 2026
Studieafslutning (Anslået)
25. april 2027
Datoer for studieregistrering
Først indsendt
24. februar 2025
Først indsendt, der opfyldte QC-kriterier
28. februar 2025
Først opslået (Faktiske)
6. marts 2025
Opdateringer af undersøgelsesjournaler
Sidste opdatering sendt (Faktiske)
10. juni 2025
Sidste opdatering indsendt, der opfyldte kvalitetskontrolkriterier
9. juni 2025
Sidst verificeret
1. juni 2025
Mere information
Begreber relateret til denne undersøgelse
Yderligere relevante MeSH-vilkår
Andre undersøgelses-id-numre
- AteroImunoHIAE
Plan for individuelle deltagerdata (IPD)
Planlægger du at dele individuelle deltagerdata (IPD)?
JA
IPD-planbeskrivelse
SCRNA-seq-dataene og R-scripts, der blev anvendt i analysen af denne undersøgelse, vil være tilgængelige fra den tilsvarende forfatter efter anmodning.
IPD-deling Understøttende informationstype
- STUDY_PROTOCOL
- SAP
- CSR
Lægemiddel- og udstyrsoplysninger, undersøgelsesdokumenter
Studerer et amerikansk FDA-reguleret lægemiddelprodukt
Ingen
Studerer et amerikansk FDA-reguleret enhedsprodukt
Ingen
produkt fremstillet i og eksporteret fra U.S.A.
Ingen
Disse oplysninger blev hentet direkte fra webstedet clinicaltrials.gov uden ændringer. Hvis du har nogen anmodninger om at ændre, fjerne eller opdatere dine undersøgelsesoplysninger, bedes du kontakte register@clinicaltrials.gov. Så snart en ændring er implementeret på clinicaltrials.gov, vil denne også blive opdateret automatisk på vores hjemmeside .