- ICH GCP
- US Clinical Trials Registry
- Klinisk utprøving NCT06860295
"Immunregulering i åreforkalkning: en enkeltcelle RNA-sekvenseringsstudie"
Den arkitektoniske immunreguleringen ved aterosklerotisk sykdom: en enkeltcelle RNA-sekvensering og romlig biologi tilnærming
Studieoversikt
Status
Forhold
Intervensjon / Behandling
Detaljert beskrivelse
Studietype
Registrering (Antatt)
Kontakter og plasseringer
Studiekontakt
- Navn: Carlos Vicente Serrano, PhD
- Telefonnummer: +55 (11) 2151-5408
- E-post: carlos.sjunior@einstein.br
Studiesteder
-
-
SP
-
São Paulo, SP, Brasil, 05652-900
- Hospital israelita Albert Einstein
-
-
Deltakelseskriterier
Kvalifikasjonskriterier
Alder som er kvalifisert for studier
- Voksen
- Eldre voksen
Tar imot friske frivillige
Prøvetakingsmetode
Studiepopulasjon
Beskrivelse
Inkluderingskriterier:
- Pasienter diagnostisert med iskemisk kardiomyopati på grunn av avansert aterosklerose, gjennomgått hjertetransplantasjon;
- Pasienter med koronar arteriesykdom sendt til koronar arterie bypass graft -kirurgi (CABG). "
- Alder mellom 40 og 75 år;
- Signert informert samtykkeskjema.
Eksklusjonskriterier:
- Pasienter med systemiske inflammatoriske eller autoimmune sykdommer;
- Historie med kreft i løpet av de siste 5 årene eller aktiv malignitet;
- Nyere bruk (i løpet av de siste 6 månedene) av immunsuppressiv terapi.
Studieplan
Hvordan er studiet utformet?
Designdetaljer
Kohorter og intervensjoner
Gruppe / Kohort |
Intervensjon / Behandling |
|---|---|
|
Koronarplakk fra eksplantert hjerte
De valgte arteriene vil bli dissekert og mikroskopisk evaluert, og prøvene vil bli fikset i formalin, innebygd i parafin og farget for histologisk analyse.
Vevet vil bli enzymatisk dissosiert for å oppnå individuelle celler, som deretter vil bli filtrert og vurdert for cellelevedyktighet.
Cellene vil gjennomgå enkeltcelle RNA-sekvensering (SCRNASEQ) med sikte på å analysere rundt 5 000-10 000 celler per prøve.
Prøvestørrelsen vil være 20-30 plakk, med mål om å fange de viktigste cellulære populasjonene og utføre en robust analyse.
|
Bearbeide Data normalisering, dimensjonalitetsreduksjon og klynging vil bli utført ved hjelp av Seurat -pakken (basert på R). Celletyper vil bli identifisert basert på kanonisk markørgenuttrykk. Celleunderpopulasjonsidentifikasjon Klynger vil bli kommentert basert på signaturer av kjente celletyper (f.eks. Endotelceller, glatte muskelceller, makrofager, etc.). Differensiell genuttrykksanalyse vil bli utført for å identifisere sykdomsassosierte gener. Bane og funksjonsberikelse Gensettanrikningsanalyse (GSEA) og baneanalyser (f.eks. KEGG, Reactome) vil bli utført for å undersøke de biologiske prosessene og traséene som driver aterosklerose. Kvalitetskontroll Sekvenseringsavlesninger vil bli vurdert for kvalitet ved bruk av FASTQC, og avlesninger av lav kvalitet vil bli filtrert ut. Cell Ranger-programvaren (10x genomikk) vil bli brukt til å justere leser til det menneskelige genomet og kvantifisere genuttrykk på enkeltcellenivå. |
Hva måler studien?
Primære resultatmål
Resultatmål |
Tiltaksbeskrivelse |
Tidsramme |
|---|---|---|
|
Konsentrasjon av spesifikke celler klynger og makrofag / linfocitt-underpopulasjoner: Lag en høyoppløselig enkeltcelle-atlas av aterosklerotiske plakk.
Tidsramme: Gjennom fullføring av studien, i gjennomsnitt halvannet år.
|
Bestem konsentrasjonen av cellulære klynger med spesifikke inflammatoriske underpopulasjoner bestemmelse for å skape en høyoppløselig enkeltcelle-atlas med aterosklerotiske plakk, og avsløre cellespesifikke transkripsjonelle forandringer assosiert med sykdommen.
Funnene kan identifisere nye terapeutiske mål for intervensjon i aterosklerose og forbedre forståelsen av dens molekylære patogenese.
|
Gjennom fullføring av studien, i gjennomsnitt halvannet år.
|
Sekundære resultatmål
Resultatmål |
Tiltaksbeskrivelse |
Tidsramme |
|---|---|---|
|
Konsentrasjon av interleukiner og cellulære undertyper ved siteterstrøm til identifisering av molekylære signaturer ved åreforkalkning
Tidsramme: Gjennom fullføring av studien, i gjennomsnitt halvannet år.
|
Det sekundære målet er å identifisere molekylære signaturer som avslører individuelle disposisjoner for spesifikke fenotyper, for eksempel mottakelighet for åreforkalkning, respons på terapier og andre helsemessige egenskaper, og etablerer grunnlaget for presisjonsmedisin og populasjonshelsestudier i Brasil ved å bestemme spesifikke konsentrasjoner av Pro og anti-inflammatoriske molekulater og celletyper.
|
Gjennom fullføring av studien, i gjennomsnitt halvannet år.
|
Samarbeidspartnere og etterforskere
Publikasjoner og nyttige lenker
Generelle publikasjoner
- Li Q, Wang M, Zhang S, Jin M, Chen R, Luo Y, Sun X. Single-cell RNA sequencing in atherosclerosis: Mechanism and precision medicine. Front Pharmacol. 2022 Oct 4;13:977490. doi: 10.3389/fphar.2022.977490. eCollection 2022.
- Zhang H, Viveiros A, Nikhanj A, Nguyen Q, Wang K, Wang W, Freed DH, Mullen JC, MacArthur R, Kim DH, Tymchak W, Sergi CM, Kassiri Z, Wang S, Oudit GY. The Human Explanted Heart Program: A translational bridge for cardiovascular medicine. Biochim Biophys Acta Mol Basis Dis. 2021 Jan 1;1867(1):165995. doi: 10.1016/j.bbadis.2020.165995. Epub 2020 Oct 22.
- Rajab TK, Singh SK. Donation After Cardiac Death Heart Transplantation in America Is Clinically Necessary and Ethically Justified. Circ Heart Fail. 2018 Mar;11(3):e004884. doi: 10.1161/CIRCHEARTFAILURE.118.004884. No abstract available.
- Price AL, Patterson N, Yu F, Cox DR, Waliszewska A, McDonald GJ, Tandon A, Schirmer C, Neubauer J, Bedoya G, Duque C, Villegas A, Bortolini MC, Salzano FM, Gallo C, Mazzotti G, Tello-Ruiz M, Riba L, Aguilar-Salinas CA, Canizales-Quinteros S, Menjivar M, Klitz W, Henderson B, Haiman CA, Winkler C, Tusie-Luna T, Ruiz-Linares A, Reich D. A genomewide admixture map for Latino populations. Am J Hum Genet. 2007 Jun;80(6):1024-36. doi: 10.1086/518313. Epub 2007 Apr 13.
- Gouveia MH, Bentley AR, Leal TP, Tarazona-Santos E, Bustamante CD, Adeyemo AA, Rotimi CN, Shriner D. Unappreciated subcontinental admixture in Europeans and European Americans and implications for genetic epidemiology studies. Nat Commun. 2023 Nov 7;14(1):6802. doi: 10.1038/s41467-023-42491-0.
- Hu Z, Liu W, Hua X, Chen X, Chang Y, Hu Y, Xu Z, Song J. Single-Cell Transcriptomic Atlas of Different Human Cardiac Arteries Identifies Cell Types Associated With Vascular Physiology. Arterioscler Thromb Vasc Biol. 2021 Apr;41(4):1408-1427. doi: 10.1161/ATVBAHA.120.315373. Epub 2021 Feb 25.
- Soehnlein O, Libby P. Targeting inflammation in atherosclerosis - from experimental insights to the clinic. Nat Rev Drug Discov. 2021 Aug;20(8):589-610. doi: 10.1038/s41573-021-00198-1. Epub 2021 May 11.
- Fernandez DM, Rahman AH, Fernandez NF, Chudnovskiy A, Amir ED, Amadori L, Khan NS, Wong CK, Shamailova R, Hill CA, Wang Z, Remark R, Li JR, Pina C, Faries C, Awad AJ, Moss N, Bjorkegren JLM, Kim-Schulze S, Gnjatic S, Ma'ayan A, Mocco J, Faries P, Merad M, Giannarelli C. Single-cell immune landscape of human atherosclerotic plaques. Nat Med. 2019 Oct;25(10):1576-1588. doi: 10.1038/s41591-019-0590-4. Epub 2019 Oct 7.
- Wirka RC, Wagh D, Paik DT, Pjanic M, Nguyen T, Miller CL, Kundu R, Nagao M, Coller J, Koyano TK, Fong R, Woo YJ, Liu B, Montgomery SB, Wu JC, Zhu K, Chang R, Alamprese M, Tallquist MD, Kim JB, Quertermous T. Atheroprotective roles of smooth muscle cell phenotypic modulation and the TCF21 disease gene as revealed by single-cell analysis. Nat Med. 2019 Aug;25(8):1280-1289. doi: 10.1038/s41591-019-0512-5. Epub 2019 Jul 29.
- Kim K, Park SE, Park JS, Choi JH. Characteristics of plaque lipid-associated macrophages and their possible roles in the pathogenesis of atherosclerosis. Curr Opin Lipidol. 2022 Oct 1;33(5):283-288. doi: 10.1097/MOL.0000000000000842. Epub 2022 Aug 3.
- Chattopadhyay A, Guan P, Majumder S, Kaw K, Zhou Z, Zhang C, Prakash SK, Kaw A, Buja LM, Kwartler CS, Milewicz DM. Preventing Cholesterol-Induced Perk (Protein Kinase RNA-Like Endoplasmic Reticulum Kinase) Signaling in Smooth Muscle Cells Blocks Atherosclerotic Plaque Formation. Arterioscler Thromb Vasc Biol. 2022 Aug;42(8):1005-1022. doi: 10.1161/ATVBAHA.121.317451. Epub 2022 Jun 16.
- Su C, Lu Y, Wang Z, Guo J, Hou Y, Wang X, Qin Z, Gao J, Sun Z, Dai Y, Liu Y, Liu G, Xian X, Cui X, Zhang J, Tang J. Atherosclerosis: The Involvement of Immunity, Cytokines and Cells in Pathogenesis, and Potential Novel Therapeutics. Aging Dis. 2023 Aug 1;14(4):1214-1242. doi: 10.14336/AD.2022.1208.
- Serrano CV Jr, Yoshida VM, Venturinelli ML, D'Amico E, Monteiro HP, Ramires JA, da Luz PL. Effect of simvastatin on monocyte adhesion molecule expression in patients with hypercholesterolemia. Atherosclerosis. 2001 Aug;157(2):505-12. doi: 10.1016/s0021-9150(00)00757-7.
- Serrano CV Jr, de Mattos FR, Pitta FG, Nomura CH, de Lemos J, Ramires JAF, Kalil-Filho R. Association between Neutrophil-Lymphocyte and Platelet-Lymphocyte Ratios and Coronary Artery Calcification Score among Asymptomatic Patients: Data from a Cross-Sectional Study. Mediators Inflamm. 2019 Mar 26;2019:6513847. doi: 10.1155/2019/6513847. eCollection 2019.
- Makover ME, Shapiro MD, Toth PP. There is urgent need to treat atherosclerotic cardiovascular disease risk earlier, more intensively, and with greater precision: A review of current practice and recommendations for improved effectiveness. Am J Prev Cardiol. 2022 Aug 6;12:100371. doi: 10.1016/j.ajpc.2022.100371. eCollection 2022 Dec.
Studierekorddatoer
Studer hoveddatoer
Studiestart (Antatt)
Primær fullføring (Antatt)
Studiet fullført (Antatt)
Datoer for studieregistrering
Først innsendt
Først innsendt som oppfylte QC-kriteriene
Først lagt ut (Faktiske)
Oppdateringer av studieposter
Sist oppdatering lagt ut (Faktiske)
Siste oppdatering sendt inn som oppfylte QC-kriteriene
Sist bekreftet
Mer informasjon
Begreper knyttet til denne studien
Ytterligere relevante MeSH-vilkår
Andre studie-ID-numre
- AteroImunoHIAE
Plan for individuelle deltakerdata (IPD)
Planlegger du å dele individuelle deltakerdata (IPD)?
IPD-planbeskrivelse
IPD-deling Støtteinformasjonstype
- STUDY_PROTOCOL
- SEVJE
- CSR
Legemiddel- og utstyrsinformasjon, studiedokumenter
Studerer et amerikansk FDA-regulert medikamentprodukt
Studerer et amerikansk FDA-regulert enhetsprodukt
produkt produsert i og eksportert fra USA
Denne informasjonen ble hentet direkte fra nettstedet clinicaltrials.gov uten noen endringer. Hvis du har noen forespørsler om å endre, fjerne eller oppdatere studiedetaljene dine, vennligst kontakt register@clinicaltrials.gov. Så snart en endring er implementert på clinicaltrials.gov, vil denne også bli oppdatert automatisk på nettstedet vårt. .