- ICH GCP
- US-Register für klinische Studien
- Klinische Studie NCT06860295
"Immunegulation bei Atherosklerose: eine Einzelzell-RNA-Sequenzierungsstudie"
Die architektonische Immunegulation bei atherosklerotischer Erkrankung: Ein Einzelzell-RNA-Sequenzierung und räumlicher biologischer Ansatz
Studienübersicht
Status
Bedingungen
Intervention / Behandlung
Detaillierte Beschreibung
Studientyp
Einschreibung (Geschätzt)
Kontakte und Standorte
Studienkontakt
- Name: Carlos Vicente Serrano, PhD
- Telefonnummer: +55 (11) 2151-5408
- E-Mail: carlos.sjunior@einstein.br
Studienorte
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SP
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São Paulo, SP, Brasilien, 05652-900
- Hospital israelita Albert Einstein
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Teilnahmekriterien
Zulassungskriterien
Studienberechtigtes Alter
- Erwachsene
- Älterer Erwachsener
Akzeptiert gesunde Freiwillige
Probenahmeverfahren
Studienpopulation
Beschreibung
Einschlusskriterien:
- Patienten, bei denen eine ischämische Kardiomyopathie diagnostiziert wurde, aufgrund fortgeschrittener Atherosklerose, die sich einer Herztransplantation unterziehen;
- Patienten mit einer Erkrankung der Koronararterien, die einer Bypass -Bypass -Operation der Koronararterien (CABG) unterzogen wurden. "
- Alter zwischen 40 und 75 Jahren;
- Signiertes Einverständnisformular.
Ausschlusskriterien:
- Patienten mit systemischen entzündlichen oder Autoimmunerkrankungen;
- Krebsgeschichte innerhalb der letzten 5 Jahre oder aktive Malignität;
- Jüngste Verwendung (innerhalb der letzten 6 Monate) der immunsuppressiven Therapie.
Studienplan
Wie ist die Studie aufgebaut?
Designdetails
Kohorten und Interventionen
Gruppe / Kohorte |
Intervention / Behandlung |
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Koronarplatten aus explantiertem Herzen
Die ausgewählten Arterien werden seziert und mikroskopisch bewertet, und die Proben werden in Formalin fixiert, in Paraffin eingebettet und für die histologische Analyse gefärbt.
Das Gewebe wird enzymatisch dissoziiert, um einzelne Zellen zu erhalten, die dann filtriert und auf die Lebensfähigkeit der Zellen bewertet werden.
Die Zellen werden einer Einzelzell-RNA-Sequenzierung (scrnaseq) unterzogen, um rund 5.000 bis 10.000 Zellen pro Probe zu analysieren.
Die Stichprobengröße beträgt 20-30 Plaques, mit dem Ziel, die Hauptpopulationen der Mobilfunkpopulationen aufzunehmen und eine robuste Analyse durchzuführen.
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Wiederaufbereitung Datennormalisierung, Dimensionalitätsreduzierung und Clusterbildung werden mit dem Seurat -Paket (basierend auf R) durchgeführt. Zelltypen werden basierend auf der kanonischen Marker -Genexpression identifiziert. Identifizierung der Zell -Subpopulation Cluster werden anhand von Signaturen bekannter Zelltypen (z. B. Endothelzellen, glatte Muskelzellen, Makrophagen usw.) kommentiert. Die differentielle Genexpressionsanalyse wird durchgeführt, um krankheitsassoziierte Gene zu identifizieren. Weg und Funktionsanreicherung Die Gen -Set -Anreicherungsanalyse (GSEA) und die Pfadanalysen (z. B. Kegg, Reaktom) werden durchgeführt, um die biologischen Prozesse und Wege zu untersuchen, die Atherosklerose antreiben. Qualitätskontrolle Die Sequenzierungslesungen werden mit FastQC für Qualität bewertet, und es werden minderwertige Lesevorgänge herausgefiltert. Die Cell Ranger-Software (10x Genomics) wird verwendet, um die Lesungen an das menschliche Genom auszurichten und die Genexpression auf Einzelzellebene zu quantifizieren. |
Was misst die Studie?
Primäre Ergebnismessungen
Ergebnis Maßnahme |
Maßnahmenbeschreibung |
Zeitfenster |
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Konzentration spezifischer Zellencluster und Makrophagen / Linfocit-Subpopulationen: Erstellen Sie einen hochauflösenden Einzelzellatlas von atherosklerotischen Plaques.
Zeitfenster: Durch die Fertigstellung der Studie durchschnittlich eineinhalb Jahre.
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Bestimmen Sie die Konzentration von zellulären Clustern mit spezifischen entzündlichen Subpopulationen, um einen hochauflösenden Einzelzell-Atlas von atherosklerotischen Plaques zu erzeugen, wodurch zellspezifische Transkriptionsänderungen im Zusammenhang mit der Krankheit auftreten.
Die Ergebnisse könnten neue therapeutische Ziele für die Intervention bei Atherosklerose identifizieren und das Verständnis der molekularen Pathogenese verbessern.
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Durch die Fertigstellung der Studie durchschnittlich eineinhalb Jahre.
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Sekundäre Ergebnismessungen
Ergebnis Maßnahme |
Maßnahmenbeschreibung |
Zeitfenster |
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Konzentration von Interleukinen und zellulären Subtypen durch Citometerfluss zur Identifizierung molekularer Signaturen bei Atherosklerose
Zeitfenster: Durch die Fertigstellung der Studie durchschnittlich eineinhalb Jahre.
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Das sekundäre Ziel ist es, molekulare Signaturen zu identifizieren, die individuelle Veranlagungen für spezifische Phänotypen wie Anfälligkeit für Atherosklerose, Reaktion auf Therapien und andere gesundheitliche Merkmale aufweisen, die Grundlage für Präzisionsmedizin und Bevölkerungsgesundheit in Brasilien und Zellentypen für die Präzisionsmedizin und Bevölkerung in Brasilien festlegen.
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Durch die Fertigstellung der Studie durchschnittlich eineinhalb Jahre.
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Mitarbeiter und Ermittler
Publikationen und hilfreiche Links
Allgemeine Veröffentlichungen
- Li Q, Wang M, Zhang S, Jin M, Chen R, Luo Y, Sun X. Single-cell RNA sequencing in atherosclerosis: Mechanism and precision medicine. Front Pharmacol. 2022 Oct 4;13:977490. doi: 10.3389/fphar.2022.977490. eCollection 2022.
- Zhang H, Viveiros A, Nikhanj A, Nguyen Q, Wang K, Wang W, Freed DH, Mullen JC, MacArthur R, Kim DH, Tymchak W, Sergi CM, Kassiri Z, Wang S, Oudit GY. The Human Explanted Heart Program: A translational bridge for cardiovascular medicine. Biochim Biophys Acta Mol Basis Dis. 2021 Jan 1;1867(1):165995. doi: 10.1016/j.bbadis.2020.165995. Epub 2020 Oct 22.
- Rajab TK, Singh SK. Donation After Cardiac Death Heart Transplantation in America Is Clinically Necessary and Ethically Justified. Circ Heart Fail. 2018 Mar;11(3):e004884. doi: 10.1161/CIRCHEARTFAILURE.118.004884. No abstract available.
- Price AL, Patterson N, Yu F, Cox DR, Waliszewska A, McDonald GJ, Tandon A, Schirmer C, Neubauer J, Bedoya G, Duque C, Villegas A, Bortolini MC, Salzano FM, Gallo C, Mazzotti G, Tello-Ruiz M, Riba L, Aguilar-Salinas CA, Canizales-Quinteros S, Menjivar M, Klitz W, Henderson B, Haiman CA, Winkler C, Tusie-Luna T, Ruiz-Linares A, Reich D. A genomewide admixture map for Latino populations. Am J Hum Genet. 2007 Jun;80(6):1024-36. doi: 10.1086/518313. Epub 2007 Apr 13.
- Gouveia MH, Bentley AR, Leal TP, Tarazona-Santos E, Bustamante CD, Adeyemo AA, Rotimi CN, Shriner D. Unappreciated subcontinental admixture in Europeans and European Americans and implications for genetic epidemiology studies. Nat Commun. 2023 Nov 7;14(1):6802. doi: 10.1038/s41467-023-42491-0.
- Hu Z, Liu W, Hua X, Chen X, Chang Y, Hu Y, Xu Z, Song J. Single-Cell Transcriptomic Atlas of Different Human Cardiac Arteries Identifies Cell Types Associated With Vascular Physiology. Arterioscler Thromb Vasc Biol. 2021 Apr;41(4):1408-1427. doi: 10.1161/ATVBAHA.120.315373. Epub 2021 Feb 25.
- Soehnlein O, Libby P. Targeting inflammation in atherosclerosis - from experimental insights to the clinic. Nat Rev Drug Discov. 2021 Aug;20(8):589-610. doi: 10.1038/s41573-021-00198-1. Epub 2021 May 11.
- Fernandez DM, Rahman AH, Fernandez NF, Chudnovskiy A, Amir ED, Amadori L, Khan NS, Wong CK, Shamailova R, Hill CA, Wang Z, Remark R, Li JR, Pina C, Faries C, Awad AJ, Moss N, Bjorkegren JLM, Kim-Schulze S, Gnjatic S, Ma'ayan A, Mocco J, Faries P, Merad M, Giannarelli C. Single-cell immune landscape of human atherosclerotic plaques. Nat Med. 2019 Oct;25(10):1576-1588. doi: 10.1038/s41591-019-0590-4. Epub 2019 Oct 7.
- Wirka RC, Wagh D, Paik DT, Pjanic M, Nguyen T, Miller CL, Kundu R, Nagao M, Coller J, Koyano TK, Fong R, Woo YJ, Liu B, Montgomery SB, Wu JC, Zhu K, Chang R, Alamprese M, Tallquist MD, Kim JB, Quertermous T. Atheroprotective roles of smooth muscle cell phenotypic modulation and the TCF21 disease gene as revealed by single-cell analysis. Nat Med. 2019 Aug;25(8):1280-1289. doi: 10.1038/s41591-019-0512-5. Epub 2019 Jul 29.
- Kim K, Park SE, Park JS, Choi JH. Characteristics of plaque lipid-associated macrophages and their possible roles in the pathogenesis of atherosclerosis. Curr Opin Lipidol. 2022 Oct 1;33(5):283-288. doi: 10.1097/MOL.0000000000000842. Epub 2022 Aug 3.
- Chattopadhyay A, Guan P, Majumder S, Kaw K, Zhou Z, Zhang C, Prakash SK, Kaw A, Buja LM, Kwartler CS, Milewicz DM. Preventing Cholesterol-Induced Perk (Protein Kinase RNA-Like Endoplasmic Reticulum Kinase) Signaling in Smooth Muscle Cells Blocks Atherosclerotic Plaque Formation. Arterioscler Thromb Vasc Biol. 2022 Aug;42(8):1005-1022. doi: 10.1161/ATVBAHA.121.317451. Epub 2022 Jun 16.
- Su C, Lu Y, Wang Z, Guo J, Hou Y, Wang X, Qin Z, Gao J, Sun Z, Dai Y, Liu Y, Liu G, Xian X, Cui X, Zhang J, Tang J. Atherosclerosis: The Involvement of Immunity, Cytokines and Cells in Pathogenesis, and Potential Novel Therapeutics. Aging Dis. 2023 Aug 1;14(4):1214-1242. doi: 10.14336/AD.2022.1208.
- Serrano CV Jr, Yoshida VM, Venturinelli ML, D'Amico E, Monteiro HP, Ramires JA, da Luz PL. Effect of simvastatin on monocyte adhesion molecule expression in patients with hypercholesterolemia. Atherosclerosis. 2001 Aug;157(2):505-12. doi: 10.1016/s0021-9150(00)00757-7.
- Serrano CV Jr, de Mattos FR, Pitta FG, Nomura CH, de Lemos J, Ramires JAF, Kalil-Filho R. Association between Neutrophil-Lymphocyte and Platelet-Lymphocyte Ratios and Coronary Artery Calcification Score among Asymptomatic Patients: Data from a Cross-Sectional Study. Mediators Inflamm. 2019 Mar 26;2019:6513847. doi: 10.1155/2019/6513847. eCollection 2019.
- Makover ME, Shapiro MD, Toth PP. There is urgent need to treat atherosclerotic cardiovascular disease risk earlier, more intensively, and with greater precision: A review of current practice and recommendations for improved effectiveness. Am J Prev Cardiol. 2022 Aug 6;12:100371. doi: 10.1016/j.ajpc.2022.100371. eCollection 2022 Dec.
Studienaufzeichnungsdaten
Haupttermine studieren
Studienbeginn (Geschätzt)
Primärer Abschluss (Geschätzt)
Studienabschluss (Geschätzt)
Studienanmeldedaten
Zuerst eingereicht
Zuerst eingereicht, das die QC-Kriterien erfüllt hat
Zuerst gepostet (Tatsächlich)
Studienaufzeichnungsaktualisierungen
Letztes Update gepostet (Tatsächlich)
Letztes eingereichtes Update, das die QC-Kriterien erfüllt
Zuletzt verifiziert
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