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"Inmunorregulación en la aterosclerosis: un estudio de secuenciación de ARN de una sola célula"

9 de junio de 2025 actualizado por: Carlos Vicente Serrano Junior, Hospital Israelita Albert Einstein

La inmunorregulación arquitectónica en la enfermedad aterosclerótica: un enfoque de secuenciación de ARN de células y biología espacial

La aterosclerosis es la principal causa de eventos cardiovasculares agudos, como el infarto de miocardio y el accidente cerebrovascular, y es un factor de riesgo significativo para la mortalidad cardiovascular. La comprensión detallada de los mecanismos inmunes y las transformaciones celulares involucradas en la patogénesis de la aterosclerosis todavía es limitada, y el uso de la secuenciación de ARN de células individuales (SCRNaseQ) ha revelado nuevas funciones celulares y subpoblaciones asociadas con la progresión de la enfermedad. Este estudio tiene como objetivo identificar subpoblaciones celulares, vías moleculares y cambios en la expresión génica relacionadas con el desarrollo de aterosclerosis en arterias coronarias humanas. Utilizando SCRNaseQ, el estudio busca caracterizar el panorama transcriptómico de las células presentes en las placas ateroscleróticas e identificar firmas moleculares que revelan predisposiciones individuales a fenotipos específicos, como la susceptibilidad a la enfermedad y la respuesta a las terapias. La investigación se realizará en el Hospital Albert Einstein Israeli en São Paulo e involucrará muestras de arterias coronarias y placas ateroscleróticas de los corazones explantados de pacientes que se han sometido a trasplantes cardíacos, así como de material desechado de la cirugía de injerto de arteria coronaria (CABG). Con un tamaño de muestra estimado de 20-30 placas, los datos obtenidos permitirán un análisis detallado de los mecanismos moleculares involucrados en la aterosclerosis, contribuyendo al desarrollo de objetivos terapéuticos específicos.

Descripción general del estudio

Descripción detallada

Este es un estudio observacional prospectivo que se realizará con muestras de arterias coronarias y placas ateroscleróticas de los corazones explantados de pacientes con miocardiopatía isquémica que han sufrido trasplantes cardíacos, así como de material desechado de cirugía de injerto de bypas de arteria coronaria. Las muestras de placa aterosclerótica se recuperarán de las arterias coronarias durante la cirugía de trasplante o el procedimiento CABG y se transportan al laboratorio dentro de las 2 horas. Las arterias seleccionadas se diseccionarán y evaluarán microscópicamente, y las muestras se fijarán en formalina, se incrustarán en parafina y se tiñeron para el análisis histológico. El tejido se disociará enzimáticamente para obtener células individuales, que luego se filtrarán y evaluarán para la viabilidad celular. Las células sufrirán secuenciación de ARN de células individuales (SCRNaseQ) con el objetivo de analizar alrededor de 5,000-10,000 células por muestra. El tamaño de la muestra será de 20-30 placas, con el objetivo de capturar las principales poblaciones celulares y realizar un análisis robusto.

Tipo de estudio

De observación

Inscripción (Estimado)

30

Contactos y Ubicaciones

Esta sección proporciona los datos de contacto de quienes realizan el estudio e información sobre dónde se lleva a cabo este estudio.

Estudio Contacto

Ubicaciones de estudio

    • SP
      • São Paulo, SP, Brasil, 05652-900
        • Hospital israelita Albert Einstein

Criterios de participación

Los investigadores buscan personas que se ajusten a una determinada descripción, denominada criterio de elegibilidad. Algunos ejemplos de estos criterios son el estado de salud general de una persona o tratamientos previos.

Criterio de elegibilidad

Edades elegibles para estudiar

  • Adulto
  • Adulto Mayor

Acepta Voluntarios Saludables

No

Método de muestreo

Muestra de probabilidad

Población de estudio

Los pacientes diagnosticados con miocardiopatía isquémica debido a la aterosclerosis avanzada, sometidos a trasplante cardíaco.

Descripción

Criterios de inclusión:

  • Pacientes diagnosticados con miocardiopatía isquémica debido a la aterosclerosis avanzada, sometidos a trasplante cardíaco;
  • Pacientes con enfermedad de la arteria coronaria sometidos a cirugía de injerto de derivación de la arteria coronaria (CABG) ".
  • De entre 40 y 75 años;
  • Formulario de consentimiento informado firmado.

Criterios de exclusión:

  • Pacientes con enfermedades inflamatorias o autoinmunes sistémicas;
  • Historia de cáncer en los últimos 5 años o malignidad activa;
  • Uso reciente (en los últimos 6 meses) de terapia inmunosupresora.

Plan de estudios

Esta sección proporciona detalles del plan de estudio, incluido cómo está diseñado el estudio y qué mide el estudio.

¿Cómo está diseñado el estudio?

Detalles de diseño

Cohortes e Intervenciones

Grupo / Cohorte
Intervención / Tratamiento
Placas coronarias del corazón explantado
Las arterias seleccionadas se diseccionarán y evaluarán microscópicamente, y las muestras se fijarán en formalina, se incrustarán en parafina y se tiñeron para el análisis histológico. El tejido se disociará enzimáticamente para obtener células individuales, que luego se filtrarán y evaluarán para la viabilidad celular. Las células sufrirán secuenciación de ARN de células individuales (SCRNaseQ) con el objetivo de analizar alrededor de 5,000-10,000 células por muestra. El tamaño de la muestra será de 20-30 placas, con el objetivo de capturar las principales poblaciones celulares y realizar un análisis robusto.

Reprocesamiento

La normalización de datos, la reducción de dimensionalidad y la agrupación se realizarán utilizando el paquete Seurat (basado en R).

Los tipos de células se identificarán en base a la expresión del gen del marcador canónico. Identificación de la subpoblación celular

Los grupos se anotarán en función de firmas de tipos de células conocidas (por ejemplo, células endoteliales, células de músculo liso, macrófagos, etc.).

El análisis de expresión génica diferencial se realizará para identificar genes asociados a la enfermedad.

Enriquecimiento de la vía y función

El análisis de enriquecimiento del conjunto de genes (GSEA) y los análisis de vías (por ejemplo, KEGG, Reactome) se llevarán a cabo para investigar los procesos y vías biológicas que impulsan la aterosclerosis.

Control de calidad

Las lecturas de secuenciación se evaluarán para su calidad utilizando FASTQC, y las lecturas de baja calidad se filtrarán.

El software Cell Ranger (10x genómica) se utilizará para alinear las lecturas con el genoma humano y cuantificar la expresión génica a nivel de células individuales.

¿Qué mide el estudio?

Medidas de resultado primarias

Medida de resultado
Medida Descripción
Periodo de tiempo
Concentración de grupos de células específicas y subpoblaciones de macrófagos / linfocitas: cree un atlas de células individuales de alta resolución de placas ateroscleróticas.
Periodo de tiempo: A través de la finalización del estudio, un promedio de 1 año y medio.
Determine la concentración de grupos celulares con la determinación de subpoblaciones inflamatorias específicas para crear un atlas de células individuales de alta resolución de placas ateroscleróticas, revelando cambios transcripcionales específicos de células asociados con la enfermedad. Los hallazgos podrían identificar nuevos objetivos terapéuticos para la intervención en la aterosclerosis y mejorar la comprensión de su patogénesis molecular.
A través de la finalización del estudio, un promedio de 1 año y medio.

Medidas de resultado secundarias

Medida de resultado
Medida Descripción
Periodo de tiempo
Concentración de interleucinas y subtipos celulares por el flujo del citómetro a la identificación de firmas moleculares en la aterosclerosis
Periodo de tiempo: A través de la finalización del estudio, un promedio de 1 año y medio.
El objetivo secundario es identificar firmas moleculares que revelen predisposiciones individuales a fenotipos específicos, como la susceptibilidad a la aterosclerosis, la respuesta a las terapias y otras características de salud, estableciendo las bases para la medicina de precisión y los estudios de salud de la población en Brasil determinando concentraciones específicas de moléculas pro y antiinflamatorias y tipos de células.
A través de la finalización del estudio, un promedio de 1 año y medio.

Colaboradores e Investigadores

Aquí es donde encontrará personas y organizaciones involucradas en este estudio.

Publicaciones y enlaces útiles

La persona responsable de ingresar información sobre el estudio proporciona voluntariamente estas publicaciones. Estos pueden ser sobre cualquier cosa relacionada con el estudio.

Publicaciones Generales

Fechas de registro del estudio

Estas fechas rastrean el progreso del registro del estudio y los envíos de resultados resumidos a ClinicalTrials.gov. Los registros del estudio y los resultados informados son revisados ​​por la Biblioteca Nacional de Medicina (NLM) para asegurarse de que cumplan con los estándares de control de calidad específicos antes de publicarlos en el sitio web público.

Fechas importantes del estudio

Inicio del estudio (Estimado)

25 de junio de 2025

Finalización primaria (Estimado)

25 de octubre de 2026

Finalización del estudio (Estimado)

25 de abril de 2027

Fechas de registro del estudio

Enviado por primera vez

24 de febrero de 2025

Primero enviado que cumplió con los criterios de control de calidad

28 de febrero de 2025

Publicado por primera vez (Actual)

6 de marzo de 2025

Actualizaciones de registros de estudio

Última actualización publicada (Actual)

10 de junio de 2025

Última actualización enviada que cumplió con los criterios de control de calidad

9 de junio de 2025

Última verificación

1 de junio de 2025

Más información

Términos relacionados con este estudio

Plan de datos de participantes individuales (IPD)

¿Planea compartir datos de participantes individuales (IPD)?

SÍ

Descripción del plan IPD

Los datos de SCRNA-seq y los scripts R utilizados en el análisis de este estudio estarán disponibles del autor correspondiente a pedido.

Tipo de información de apoyo para compartir IPD

  • PROTOCOLO DE ESTUDIO
  • SAVIA
  • RSC

Información sobre medicamentos y dispositivos, documentos del estudio

Estudia un producto farmacéutico regulado por la FDA de EE. UU.

No

Estudia un producto de dispositivo regulado por la FDA de EE. UU.

No

producto fabricado y exportado desde los EE. UU.

No

Esta información se obtuvo directamente del sitio web clinicaltrials.gov sin cambios. Si tiene alguna solicitud para cambiar, eliminar o actualizar los detalles de su estudio, comuníquese con register@clinicaltrials.gov. Tan pronto como se implemente un cambio en clinicaltrials.gov, también se actualizará automáticamente en nuestro sitio web. .

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