- ICH GCP
- Register voor klinische proeven in de VS.
- Klinische proef NCT06860295
"Immunoregulatie bij atherosclerose: een RNA-sequencingstudie met één cellen"
De architecturale immunoregulatie bij atherosclerotische ziekte: een RNA-sequencing en ruimtelijke biologie-benadering met één cellen
Studie Overzicht
Toestand
Conditie
Interventie / Behandeling
Gedetailleerde beschrijving
Studietype
Inschrijving (Geschat)
Contacten en locaties
Studiecontact
- Naam: Carlos Vicente Serrano, PhD
- Telefoonnummer: +55 (11) 2151-5408
- E-mail: carlos.sjunior@einstein.br
Studie Locaties
-
-
SP
-
São Paulo, SP, Brazilië, 05652-900
- Hospital israelita Albert Einstein
-
-
Deelname Criteria
Geschiktheidscriteria
Leeftijden die in aanmerking komen voor studie
- Volwassen
- Oudere volwassene
Accepteert gezonde vrijwilligers
Bemonsteringsmethode
Studie Bevolking
Beschrijving
Inclusiecriteria:
- Patiënten met de diagnose ischemische cardiomyopathie als gevolg van gevorderde atherosclerose, ondergaan harttransplantatie;
- Patiënten met kransslagaderziekte onderworpen aan bypass -transplantaatchirurgie van de kransslagader (CABG). "
- Tussen 40 en 75 jaar;
- Ondertekend geïnformeerde toestemmingsformulier.
Uitsluitingscriteria:
- Patiënten met systemische inflammatoire of auto -immuunziekten;
- Geschiedenis van kanker in de afgelopen 5 jaar of actieve maligniteit;
- Recent gebruik (in de afgelopen 6 maanden) van immunosuppressieve therapie.
Studie plan
Hoe is de studie opgezet?
Ontwerpdetails
Cohorten en interventies
Groep / Cohort |
Interventie / Behandeling |
|---|---|
|
Coronaire plaques uit een explanted hart
De geselecteerde slagaders worden ontleed en microscopisch geëvalueerd, en de monsters worden gefixeerd in formaline, ingebed in paraffine en gekleurd voor histologische analyse.
Het weefsel zal enzymatisch worden gedissocieerd om individuele cellen te verkrijgen, die vervolgens worden gefilterd en beoordeeld op de levensvatbaarheid van cellen.
De cellen zullen eencellig RNA-sequencing (Scrnaseq) ondergaan met als doel het analyseren van ongeveer 5.000-10.000 cellen per monster.
De steekproefgrootte is 20-30 plaques, met als doel de belangrijkste cellulaire populaties vast te leggen en een robuuste analyse uit te voeren.
|
Het herwerken Gegevensnormalisatie, dimensionaliteitsvermindering en clustering worden uitgevoerd met behulp van het Seurat -pakket (gebaseerd op R). Celtypen worden geïdentificeerd op basis van canonieke markergenexpressie. Identificatie van celsubpopulatie Clusters zullen worden geannoteerd op basis van handtekeningen van bekende celtypen (bijv. Endotheelcellen, gladde spiercellen, macrofagen, enz.). Differentiële genexpressie-analyse zal worden uitgevoerd om ziektegerelateerde genen te identificeren. Pad en functie verrijking Gene set verrijkingsanalyse (GSEA) en padanalyses (bijv. KEGG, reactome) zullen worden uitgevoerd om de biologische processen en routes te onderzoeken die atherosclerose stimuleren. Kwaliteitscontrole Sequencing-reads worden beoordeeld op kwaliteit met behulp van FASTQC en reads van lage kwaliteit worden uitgefilterd. De Cell Ranger-software (10x genomics) zal worden gebruikt om lezingen uit te lijnen op het menselijke genoom en genexpressie op het niveau van één cel te kwantificeren. |
Wat meet het onderzoek?
Primaire uitkomstmaten
Uitkomstmaat |
Maatregel Beschrijving |
Tijdsspanne |
|---|---|---|
|
Concentratie van specifieke cellenclusters en macrofaag / linfociet-subpopulaties: creëer een hoge-resolutie single-cel atlas van atherosclerotische plaques.
Tijdsspanne: Door de voltooiing van de studie, gemiddeld 1 anderhalf jaar.
|
Bepaal de concentratie van cellulaire clusters met specifieke inflammatoire subpopulaties bepaling om een hoge-resolutie single-cel atlas van atherosclerotische plaques te creëren, waardoor celspecifieke transcriptionele veranderingen worden geassocieerd met de ziekte.
De bevindingen kunnen nieuwe therapeutische doelen voor interventie bij atherosclerose identificeren en het begrip van zijn moleculaire pathogenese vergroten.
|
Door de voltooiing van de studie, gemiddeld 1 anderhalf jaar.
|
Secundaire uitkomstmaten
Uitkomstmaat |
Maatregel Beschrijving |
Tijdsspanne |
|---|---|---|
|
Concentratie van interleukines en cellulaire subtypen door citometerstroom tot identificatie van moleculaire handtekeningen bij atherosclerose
Tijdsspanne: Door de voltooiing van de studie, gemiddeld 1 anderhalf jaar.
|
Het secundaire doel is het identificeren van moleculaire handtekeningen die individuele aanleg aan specifieke fenotypes onthullen, zoals gevoeligheid voor atherosclerose, respons op therapieën en andere gezondheidskenmerken, het leggen van de basis voor precisiegeneeskunde en populatie gezondheidsonderzoeken in Brazilië door specifieke concentraties van pro- en anti-inflammatoire molecules en cellen te bepalen.
|
Door de voltooiing van de studie, gemiddeld 1 anderhalf jaar.
|
Medewerkers en onderzoekers
Publicaties en nuttige links
Algemene publicaties
- Li Q, Wang M, Zhang S, Jin M, Chen R, Luo Y, Sun X. Single-cell RNA sequencing in atherosclerosis: Mechanism and precision medicine. Front Pharmacol. 2022 Oct 4;13:977490. doi: 10.3389/fphar.2022.977490. eCollection 2022.
- Zhang H, Viveiros A, Nikhanj A, Nguyen Q, Wang K, Wang W, Freed DH, Mullen JC, MacArthur R, Kim DH, Tymchak W, Sergi CM, Kassiri Z, Wang S, Oudit GY. The Human Explanted Heart Program: A translational bridge for cardiovascular medicine. Biochim Biophys Acta Mol Basis Dis. 2021 Jan 1;1867(1):165995. doi: 10.1016/j.bbadis.2020.165995. Epub 2020 Oct 22.
- Rajab TK, Singh SK. Donation After Cardiac Death Heart Transplantation in America Is Clinically Necessary and Ethically Justified. Circ Heart Fail. 2018 Mar;11(3):e004884. doi: 10.1161/CIRCHEARTFAILURE.118.004884. No abstract available.
- Price AL, Patterson N, Yu F, Cox DR, Waliszewska A, McDonald GJ, Tandon A, Schirmer C, Neubauer J, Bedoya G, Duque C, Villegas A, Bortolini MC, Salzano FM, Gallo C, Mazzotti G, Tello-Ruiz M, Riba L, Aguilar-Salinas CA, Canizales-Quinteros S, Menjivar M, Klitz W, Henderson B, Haiman CA, Winkler C, Tusie-Luna T, Ruiz-Linares A, Reich D. A genomewide admixture map for Latino populations. Am J Hum Genet. 2007 Jun;80(6):1024-36. doi: 10.1086/518313. Epub 2007 Apr 13.
- Gouveia MH, Bentley AR, Leal TP, Tarazona-Santos E, Bustamante CD, Adeyemo AA, Rotimi CN, Shriner D. Unappreciated subcontinental admixture in Europeans and European Americans and implications for genetic epidemiology studies. Nat Commun. 2023 Nov 7;14(1):6802. doi: 10.1038/s41467-023-42491-0.
- Hu Z, Liu W, Hua X, Chen X, Chang Y, Hu Y, Xu Z, Song J. Single-Cell Transcriptomic Atlas of Different Human Cardiac Arteries Identifies Cell Types Associated With Vascular Physiology. Arterioscler Thromb Vasc Biol. 2021 Apr;41(4):1408-1427. doi: 10.1161/ATVBAHA.120.315373. Epub 2021 Feb 25.
- Soehnlein O, Libby P. Targeting inflammation in atherosclerosis - from experimental insights to the clinic. Nat Rev Drug Discov. 2021 Aug;20(8):589-610. doi: 10.1038/s41573-021-00198-1. Epub 2021 May 11.
- Fernandez DM, Rahman AH, Fernandez NF, Chudnovskiy A, Amir ED, Amadori L, Khan NS, Wong CK, Shamailova R, Hill CA, Wang Z, Remark R, Li JR, Pina C, Faries C, Awad AJ, Moss N, Bjorkegren JLM, Kim-Schulze S, Gnjatic S, Ma'ayan A, Mocco J, Faries P, Merad M, Giannarelli C. Single-cell immune landscape of human atherosclerotic plaques. Nat Med. 2019 Oct;25(10):1576-1588. doi: 10.1038/s41591-019-0590-4. Epub 2019 Oct 7.
- Wirka RC, Wagh D, Paik DT, Pjanic M, Nguyen T, Miller CL, Kundu R, Nagao M, Coller J, Koyano TK, Fong R, Woo YJ, Liu B, Montgomery SB, Wu JC, Zhu K, Chang R, Alamprese M, Tallquist MD, Kim JB, Quertermous T. Atheroprotective roles of smooth muscle cell phenotypic modulation and the TCF21 disease gene as revealed by single-cell analysis. Nat Med. 2019 Aug;25(8):1280-1289. doi: 10.1038/s41591-019-0512-5. Epub 2019 Jul 29.
- Kim K, Park SE, Park JS, Choi JH. Characteristics of plaque lipid-associated macrophages and their possible roles in the pathogenesis of atherosclerosis. Curr Opin Lipidol. 2022 Oct 1;33(5):283-288. doi: 10.1097/MOL.0000000000000842. Epub 2022 Aug 3.
- Chattopadhyay A, Guan P, Majumder S, Kaw K, Zhou Z, Zhang C, Prakash SK, Kaw A, Buja LM, Kwartler CS, Milewicz DM. Preventing Cholesterol-Induced Perk (Protein Kinase RNA-Like Endoplasmic Reticulum Kinase) Signaling in Smooth Muscle Cells Blocks Atherosclerotic Plaque Formation. Arterioscler Thromb Vasc Biol. 2022 Aug;42(8):1005-1022. doi: 10.1161/ATVBAHA.121.317451. Epub 2022 Jun 16.
- Su C, Lu Y, Wang Z, Guo J, Hou Y, Wang X, Qin Z, Gao J, Sun Z, Dai Y, Liu Y, Liu G, Xian X, Cui X, Zhang J, Tang J. Atherosclerosis: The Involvement of Immunity, Cytokines and Cells in Pathogenesis, and Potential Novel Therapeutics. Aging Dis. 2023 Aug 1;14(4):1214-1242. doi: 10.14336/AD.2022.1208.
- Serrano CV Jr, Yoshida VM, Venturinelli ML, D'Amico E, Monteiro HP, Ramires JA, da Luz PL. Effect of simvastatin on monocyte adhesion molecule expression in patients with hypercholesterolemia. Atherosclerosis. 2001 Aug;157(2):505-12. doi: 10.1016/s0021-9150(00)00757-7.
- Serrano CV Jr, de Mattos FR, Pitta FG, Nomura CH, de Lemos J, Ramires JAF, Kalil-Filho R. Association between Neutrophil-Lymphocyte and Platelet-Lymphocyte Ratios and Coronary Artery Calcification Score among Asymptomatic Patients: Data from a Cross-Sectional Study. Mediators Inflamm. 2019 Mar 26;2019:6513847. doi: 10.1155/2019/6513847. eCollection 2019.
- Makover ME, Shapiro MD, Toth PP. There is urgent need to treat atherosclerotic cardiovascular disease risk earlier, more intensively, and with greater precision: A review of current practice and recommendations for improved effectiveness. Am J Prev Cardiol. 2022 Aug 6;12:100371. doi: 10.1016/j.ajpc.2022.100371. eCollection 2022 Dec.
Studie record data
Bestudeer belangrijke data
Studie start (Geschat)
Primaire voltooiing (Geschat)
Studie voltooiing (Geschat)
Studieregistratiedata
Eerst ingediend
Eerst ingediend dat voldeed aan de QC-criteria
Eerst geplaatst (Werkelijk)
Updates van studierecords
Laatste update geplaatst (Werkelijk)
Laatste update ingediend die voldeed aan QC-criteria
Laatst geverifieerd
Meer informatie
Termen gerelateerd aan deze studie
Trefwoorden
Aanvullende relevante MeSH-voorwaarden
Andere studie-ID-nummers
- AteroImunoHIAE
Plan Individuele Deelnemersgegevens (IPD)
Bent u van plan om gegevens van individuele deelnemers (IPD) te delen?
Beschrijving IPD-plan
IPD delen Ondersteunend informatietype
- LEERPROTOCOOL
- SAP
- MVO
Informatie over medicijnen en apparaten, studiedocumenten
Bestudeert een door de Amerikaanse FDA gereguleerd geneesmiddel
Bestudeert een door de Amerikaanse FDA gereguleerd apparaatproduct
product vervaardigd in en geëxporteerd uit de V.S.
Deze informatie is zonder wijzigingen rechtstreeks van de website clinicaltrials.gov gehaald. Als u verzoeken heeft om uw onderzoeksgegevens te wijzigen, te verwijderen of bij te werken, neem dan contact op met register@clinicaltrials.gov. Zodra er een wijziging wordt doorgevoerd op clinicaltrials.gov, wordt deze ook automatisch bijgewerkt op onze website .