Ta strona została przetłumaczona automatycznie i dokładność tłumaczenia nie jest gwarantowana. Proszę odnieść się do angielska wersja za tekst źródłowy.

„Immunoregulacja w miażdżycy: badanie sekwencjonowania RNA jednokomórkowych”

9 czerwca 2025 zaktualizowane przez: Carlos Vicente Serrano Junior, Hospital Israelita Albert Einstein

Immunoregulacja architektoniczna w chorobie miażdżycowej: sekwencjonowanie RNA jednokomórkowe i podejście do biologii przestrzennej

Miażdżyca jest główną przyczyną ostrych zdarzeń sercowo -naczyniowych, takich jak zawał mięśnia sercowego i udar, i stanowi znaczący czynnik ryzyka śmiertelności sercowo -naczyniowej. Szczegółowe zrozumienie mechanizmów odpornościowych i transformacji komórkowych zaangażowanych w patogenezę miażdżycy jest nadal ograniczone, a zastosowanie sekwencjonowania RNA jednokomórkowego (SCRNASEQ) ujawniło nowe funkcje komórkowe i subpopulacje związane z postępem choroby. To badanie ma na celu identyfikację subpopulacji komórkowych, szlaków molekularnych i zmian w ekspresji genów związanych z rozwojem miażdżycy w ludzkich tętnicach wieńcowych. Za pomocą SCRNASEQ badanie ma na celu scharakteryzowanie transkryptomicznego krajobrazu komórek obecnych w płytach miażdżycowych i identyfikacji sygnatur molekularnych, które ujawniają indywidualne predyspozycje do określonych fenotypów, takich jak podatność na choroby i odpowiedź na terapie. Badania zostaną przeprowadzone w izraelskim szpitalu Alberta Einsteina w São Paulo i będą obejmować próbki z tętnic wieńcowych i płytki miażdżycowych eksplantowanych serc pacjentów, którzy przeszli przeszczep serca, a także z odrzuconego materiału pomostowania tętnicy wieńcowej (CABG). Przy szacowanej wielkości próby 20-30 płytek, uzyskane dane pozwolą na szczegółową analizę mechanizmów molekularnych zaangażowanych w miażdżycę, przyczyniając się do rozwoju określonych celów terapeutycznych.

Przegląd badań

Status

Jeszcze nie rekrutacja

Warunki

Interwencja / Leczenie

Szczegółowy opis

Jest to prospektywne badanie obserwacyjne, które zostanie przeprowadzone z próbkami tętnic wieńcowych i blaszek miażdżycowych z eksplantowanych serc pacjentów z kardiomiopatią niedokrwienną, którzy przeszli przeszczep serca, a także od odrzuconego materiału z operacji przeszczepu tętnicy wieńcowej. Próbki płytki miażdżycowej zostaną pobrane z tętnic wieńcowych podczas operacji przeszczepu lub procedury CABG i przetransportowane do laboratorium w ciągu 2 godzin. Wybrane tętnice zostaną wycięte i oceniane mikroskopowo, a próbki zostaną ustalone w formalinie, osadzone w parafinie i zabarwione do analizy histologicznej. Tkanka zostanie enzymatycznie zdysocjowana w celu uzyskania poszczególnych komórek, które następnie zostaną przefiltrowane i ocenione pod kątem żywotności komórek. Komórki ulegną sekwencjonowaniu RNA jednokomórkowej (SCRNASEQ) w celu analizy około 5 000-10 000 komórek na próbkę. Wielkość próby wyniesie 20-30 tabliczek, w którym można uchwycić główne populacje komórkowe i przeprowadzić solidną analizę.

Typ studiów

Obserwacyjny

Zapisy (Szacowany)

30

Kontakty i lokalizacje

Ta sekcja zawiera dane kontaktowe osób prowadzących badanie oraz informacje o tym, gdzie badanie jest przeprowadzane.

Kontakt w sprawie studiów

Lokalizacje studiów

  • Brazylia
    • SP
      • São Paulo, SP, Brazylia, 05652-900
        • Hospital israelita Albert Einstein

Kryteria uczestnictwa

Badacze szukają osób, które pasują do określonego opisu, zwanego kryteriami kwalifikacyjnymi. Niektóre przykłady tych kryteriów to ogólny stan zdrowia danej osoby lub wcześniejsze leczenie.

Kryteria kwalifikacji

Wiek uprawniający do nauki

  • Dorosły
  • Starszy dorosły

Akceptuje zdrowych ochotników

Nie

Metoda próbkowania

Próbka prawdopodobieństwa

Badana populacja

Pacjenci ze zdiagnozowanym kardiomiopatią niedokrwienną z powodu zaawansowanej miażdżycy tętnic, poddawania się przeszczepowi serca.

Opis

Kryteria włączenia:

  • Pacjenci ze zdiagnozowanym kardiomiopatią niedokrwienną z powodu zaawansowanej miażdżycy tętnic, poddawania się przeszczepowi serca;
  • Pacjenci z chorobą wieńcową poddanych operacji przeszczepu tętnicy wieńcowej (CABG). ”
  • W wieku od 40 do 75 lat;
  • Podpisany formularz świadomej zgody.

Kryteria wykluczenia:

  • Pacjenci z ogólnoustrojowymi chorobami zapalnymi lub autoimmunologicznymi;
  • Historia raka w ciągu ostatnich 5 lat lub aktywna nowotworu;
  • Ostatnie zastosowanie (w ciągu ostatnich 6 miesięcy) terapii immunosupresyjnej.

Plan studiów

Ta sekcja zawiera szczegółowe informacje na temat planu badania, w tym sposób zaprojektowania badania i jego pomiary.

Jak projektuje się badanie?

Szczegóły projektu

Kohorty i interwencje

Grupa / Kohorta
Interwencja / Leczenie
Tabliczki wieńcowe z eksplantowanego serca
Wybrane tętnice zostaną wycięte i oceniane mikroskopowo, a próbki zostaną ustalone w formalinie, osadzone w parafinie i zabarwione do analizy histologicznej. Tkanka zostanie enzymatycznie zdysocjowana w celu uzyskania poszczególnych komórek, które następnie zostaną przefiltrowane i ocenione pod kątem żywotności komórek. Komórki ulegną sekwencjonowaniu RNA jednokomórkowej (SCRNASEQ) w celu analizy około 5 000-10 000 komórek na próbkę. Wielkość próby wyniesie 20-30 tabliczek, w którym można uchwycić główne populacje komórkowe i przeprowadzić solidną analizę.
Test diagnostyczny: Sekwencjonowanie RNA pojedynczej komórki

Ponowne przetwarzanie

Normalizacja danych, redukcja wymiarów i grupowanie zostaną wykonane przy użyciu pakietu SEURAT (na podstawie R).

Typy komórek zostaną zidentyfikowane na podstawie ekspresji genu markera kanonicznego. Identyfikacja subpopulacji komórek

Klastry będą adnotowane na podstawie sygnatur znanych typów komórek (np. Komórki śródbłonka, komórki mięśni gładkich, makrofagi itp.).

Zostanie przeprowadzona analiza ekspresji genów różnicowych w celu zidentyfikowania genów związanych z chorobą.

Wzbogacanie ścieżki i funkcji

Analizy wzbogacania zestawu genów (GSEA) i analizy szlaków (np. Kegg, Reactome) zostaną przeprowadzone w celu zbadania procesów biologicznych i szlaków napędzających miażdżycę.

Kontrola jakości

Odczyty sekwencjonowania zostaną ocenione pod kątem jakości za pomocą FASTQC, a odczyty niskiej jakości zostaną przefiltrowane.

Oprogramowanie Cell Ranger (10x genomika) zostanie wykorzystane do wyrównania odczytów do ludzkiego genomu i kwantyfikacji ekspresji genów na poziomie jednokomórkowym.

Co mierzy badanie?

Podstawowe miary wyniku

Miara wyniku
Opis środka
Ramy czasowe
Stężenie specyficznych klastrów komórek i subpopulacji makrofagów / linfocjtów: Utwórz pojedyncze komórkowe atlas płytek miażdżycowych w wysokiej rozdzielczości.
Ramy czasowe: Poprzez zakończenie badania średnio półtora roku.
Określ stężenie klastrów komórkowych ze specyficznymi subpopulacjami zapalnymi, aby stworzyć pojedyncze komórkowe atlas płytek miażdżycowych, ujawniając zmiany transkrypcyjne specyficzne dla komórek związane z chorobą. Odkrycia mogą zidentyfikować nowe cele terapeutyczne interwencji w miażdżycy i zwiększyć zrozumienie jego patogenezy molekularnej.
Poprzez zakończenie badania średnio półtora roku.

Miary wyników drugorzędnych

Miara wyniku
Opis środka
Ramy czasowe
Stężenie interleukin i podtypów komórkowych przez przepływ cytometru do identyfikacji sygnatur molekularnych w miażdżycy
Ramy czasowe: Poprzez zakończenie badania średnio półtora roku.
Drugim celem jest zidentyfikowanie sygnatur molekularnych, które ujawniają indywidualne predyspozycje do określonych fenotypów, takie jak podatność na miażdżycę, odpowiedź na terapie i inne cechy zdrowia, ustanawianie podstaw dla medycyny precyzyjnej i badań zdrowia populacji w Brazylii, poprzez określenie specyficznych stężeń cząsteczek pro i antyinflamowych i rodzajów komórek.
Poprzez zakończenie badania średnio półtora roku.

Współpracownicy i badacze

Tutaj znajdziesz osoby i organizacje zaangażowane w to badanie.

Sponsor

Hospital Israelita Albert Einstein

Publikacje i pomocne linki

Osoba odpowiedzialna za wprowadzenie informacji o badaniu dobrowolnie udostępnia te publikacje. Mogą one dotyczyć wszystkiego, co jest związane z badaniem.

Publikacje ogólne

Daty zapisu na studia

Daty te śledzą postęp w przesyłaniu rekordów badań i podsumowań wyników do ClinicalTrials.gov. Zapisy badań i zgłoszone wyniki są przeglądane przez National Library of Medicine (NLM), aby upewnić się, że spełniają określone standardy kontroli jakości, zanim zostaną opublikowane na publicznej stronie internetowej.

Główne daty studiów

Rozpoczęcie studiów (Szacowany)

25 czerwca 2025

Zakończenie podstawowe (Szacowany)

25 października 2026

Ukończenie studiów (Szacowany)

25 kwietnia 2027

Daty rejestracji na studia

Pierwszy przesłany

24 lutego 2025

Pierwszy przesłany, który spełnia kryteria kontroli jakości

28 lutego 2025

Pierwszy wysłany (Rzeczywisty)

6 marca 2025

Aktualizacje rekordów badań

Ostatnia wysłana aktualizacja (Rzeczywisty)

10 czerwca 2025

Ostatnia przesłana aktualizacja, która spełniała kryteria kontroli jakości

9 czerwca 2025

Ostatnia weryfikacja

1 czerwca 2025

Więcej informacji

Terminy związane z tym badaniem

Słowa kluczowe

Dodatkowe istotne warunki MeSH

Inne numery identyfikacyjne badania

  • AteroImunoHIAE

Plan dla danych uczestnika indywidualnego (IPD)

Planujesz udostępniać dane poszczególnych uczestników (IPD)?

TAK

Opis planu IPD

Dane SCRNA-Seq i skrypty R zastosowane w analizie tego badania będą dostępne od odpowiedniego autora na żądanie.

Typ informacji pomocniczych dotyczących udostępniania IPD

  • PROTOKÓŁ BADANIA
  • SOK ROŚLINNY
  • CSR

Informacje o lekach i urządzeniach, dokumenty badawcze

Bada produkt leczniczy regulowany przez amerykańską FDA

Nie

Bada produkt urządzenia regulowany przez amerykańską FDA

Nie

produkt wyprodukowany i wyeksportowany z USA

Nie

Te informacje zostały pobrane bezpośrednio ze strony internetowej clinicaltrials.gov bez żadnych zmian. Jeśli chcesz zmienić, usunąć lub zaktualizować dane swojego badania, skontaktuj się z register@clinicaltrials.gov. Gdy tylko zmiana zostanie wprowadzona na stronie clinicaltrials.gov, zostanie ona automatycznie zaktualizowana również na naszej stronie internetowej .

Subskrybuj