- ICH GCP
- Registro de ensaios clínicos dos EUA
- Ensaio Clínico NCT06860295
"Imunorregulação na aterosclerose: um estudo de sequenciamento de RNA de célula"
A imunorregulação arquitetônica em doença aterosclerótica: uma abordagem de sequenciamento de RNA de célula única e abordagem de biologia espacial
Visão geral do estudo
Status
Condições
Intervenção / Tratamento
Descrição detalhada
Tipo de estudo
Inscrição (Estimado)
Contactos e Locais
Contato de estudo
- Nome: Carlos Vicente Serrano, PhD
- Número de telefone: +55 (11) 2151-5408
- E-mail: carlos.sjunior@einstein.br
Locais de estudo
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SP
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São Paulo, SP, Brasil, 05652-900
- Hospital israelita Albert Einstein
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Critérios de participação
Critérios de elegibilidade
Idades elegíveis para estudo
- Adulto
- Adulto mais velho
Aceita Voluntários Saudáveis
Método de amostragem
População do estudo
Descrição
Critérios de inclusão:
- Pacientes diagnosticados com cardiomiopatia isquêmica devido à aterosclerose avançada, em transplante cardíaco;
- Pacientes com doença arterial coronariana submetida à cirurgia de enxerto de desvio de artéria coronariana (CRM). "
- Com idades entre 40 e 75 anos;
- Formulário de consentimento informado assinado.
Critérios de exclusão:
- Pacientes com doenças inflamatórias ou autoimunes sistêmicas;
- História do câncer nos últimos 5 anos ou malignidade ativa;
- Uso recente (nos últimos 6 meses) da terapia imunossupressora.
Plano de estudo
Como o estudo é projetado?
Detalhes do projeto
Coortes e Intervenções
Grupo / Coorte |
Intervenção / Tratamento |
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Placas coronárias do coração explantado
As artérias selecionadas serão dissecadas e avaliadas microscopicamente, e as amostras serão fixadas em formalina, incorporadas em parafina e coradas para análise histológica.
O tecido será dissociado enzimaticamente para obter células individuais, que serão filtradas e avaliadas quanto à viabilidade celular.
As células serão submetidas a seqüenciamento de RNA de célula única (SCRNaseq) com o objetivo de analisar cerca de 5.000 a 10.000 células por amostra.
O tamanho da amostra será de 20 a 30 placas, com o objetivo de capturar as principais populações celulares e realizar uma análise robusta.
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Reprocessamento A normalização dos dados, a redução da dimensionalidade e o cluster serão realizados usando o pacote Seurat (com base em R). Os tipos de células serão identificados com base na expressão do gene do marcador canônico. Identificação da subpopulação celular Os clusters serão anotados com base em assinaturas de tipos de células conhecidas (por exemplo, células endoteliais, células do músculo liso, macrófagos, etc.). A análise diferencial da expressão gênica será realizada para identificar genes associados à doença. Enriquecimento de caminho e função A análise de enriquecimento do conjunto de genes (GSEA) e análises de via (por exemplo, KEGG, Reactome) serão realizadas para investigar os processos biológicos e as vias que impulsionam a aterosclerose. Controle de qualidade As leituras de sequenciamento serão avaliadas quanto à qualidade usando o FastQC, e as leituras de baixa qualidade serão filtradas. O software Cell Ranger (10X genômica) será usado para alinhar leituras ao genoma humano e quantificar a expressão gênica no nível de célula única. |
O que o estudo está medindo?
Medidas de resultados primários
Medida de resultado |
Descrição da medida |
Prazo |
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Concentração de clusters de células específicas e subpopulações de macrófagos / linfocitos: Crie um atlas de célula única de alta resolução de placas ateroscleróticas.
Prazo: Através da conclusão do estudo, uma média de 1 ano e meio.
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Determine a concentração de aglomerados celulares com uma determinação específica de subpopulações inflamatórias para criar um atlas de célula única de alta resolução de placas ateroscleróticas, revelando alterações transcricionais específicas para células associadas à doença.
Os resultados podem identificar novos alvos terapêuticos para intervenção na aterosclerose e aumentar a compreensão de sua patogênese molecular.
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Através da conclusão do estudo, uma média de 1 ano e meio.
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Medidas de resultados secundários
Medida de resultado |
Descrição da medida |
Prazo |
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Concentração de interleucinas e subtipos celulares pelo citômetro Fluxo para identificação de assinaturas moleculares na aterosclerose
Prazo: Através da conclusão do estudo, uma média de 1 ano e meio.
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O objetivo secundário é identificar assinaturas moleculares que revelam predisposições individuais a fenótipos específicos, como suscetibilidade à aterosclerose, resposta a terapias e outras características de saúde, estabelecendo as bases para medicina de precisão e estudos de saúde da população no Brasil, determinando concentrações específicas de moléculas pró-inflamatórias e anti-inflamatórias e tipos de células.
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Através da conclusão do estudo, uma média de 1 ano e meio.
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Colaboradores e Investigadores
Patrocinador
Publicações e links úteis
Publicações Gerais
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- Zhang H, Viveiros A, Nikhanj A, Nguyen Q, Wang K, Wang W, Freed DH, Mullen JC, MacArthur R, Kim DH, Tymchak W, Sergi CM, Kassiri Z, Wang S, Oudit GY. The Human Explanted Heart Program: A translational bridge for cardiovascular medicine. Biochim Biophys Acta Mol Basis Dis. 2021 Jan 1;1867(1):165995. doi: 10.1016/j.bbadis.2020.165995. Epub 2020 Oct 22.
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- Price AL, Patterson N, Yu F, Cox DR, Waliszewska A, McDonald GJ, Tandon A, Schirmer C, Neubauer J, Bedoya G, Duque C, Villegas A, Bortolini MC, Salzano FM, Gallo C, Mazzotti G, Tello-Ruiz M, Riba L, Aguilar-Salinas CA, Canizales-Quinteros S, Menjivar M, Klitz W, Henderson B, Haiman CA, Winkler C, Tusie-Luna T, Ruiz-Linares A, Reich D. A genomewide admixture map for Latino populations. Am J Hum Genet. 2007 Jun;80(6):1024-36. doi: 10.1086/518313. Epub 2007 Apr 13.
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- Fernandez DM, Rahman AH, Fernandez NF, Chudnovskiy A, Amir ED, Amadori L, Khan NS, Wong CK, Shamailova R, Hill CA, Wang Z, Remark R, Li JR, Pina C, Faries C, Awad AJ, Moss N, Bjorkegren JLM, Kim-Schulze S, Gnjatic S, Ma'ayan A, Mocco J, Faries P, Merad M, Giannarelli C. Single-cell immune landscape of human atherosclerotic plaques. Nat Med. 2019 Oct;25(10):1576-1588. doi: 10.1038/s41591-019-0590-4. Epub 2019 Oct 7.
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- Chattopadhyay A, Guan P, Majumder S, Kaw K, Zhou Z, Zhang C, Prakash SK, Kaw A, Buja LM, Kwartler CS, Milewicz DM. Preventing Cholesterol-Induced Perk (Protein Kinase RNA-Like Endoplasmic Reticulum Kinase) Signaling in Smooth Muscle Cells Blocks Atherosclerotic Plaque Formation. Arterioscler Thromb Vasc Biol. 2022 Aug;42(8):1005-1022. doi: 10.1161/ATVBAHA.121.317451. Epub 2022 Jun 16.
- Su C, Lu Y, Wang Z, Guo J, Hou Y, Wang X, Qin Z, Gao J, Sun Z, Dai Y, Liu Y, Liu G, Xian X, Cui X, Zhang J, Tang J. Atherosclerosis: The Involvement of Immunity, Cytokines and Cells in Pathogenesis, and Potential Novel Therapeutics. Aging Dis. 2023 Aug 1;14(4):1214-1242. doi: 10.14336/AD.2022.1208.
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- Serrano CV Jr, de Mattos FR, Pitta FG, Nomura CH, de Lemos J, Ramires JAF, Kalil-Filho R. Association between Neutrophil-Lymphocyte and Platelet-Lymphocyte Ratios and Coronary Artery Calcification Score among Asymptomatic Patients: Data from a Cross-Sectional Study. Mediators Inflamm. 2019 Mar 26;2019:6513847. doi: 10.1155/2019/6513847. eCollection 2019.
- Makover ME, Shapiro MD, Toth PP. There is urgent need to treat atherosclerotic cardiovascular disease risk earlier, more intensively, and with greater precision: A review of current practice and recommendations for improved effectiveness. Am J Prev Cardiol. 2022 Aug 6;12:100371. doi: 10.1016/j.ajpc.2022.100371. eCollection 2022 Dec.
Datas de registro do estudo
Datas Principais do Estudo
Início do estudo (Estimado)
Conclusão Primária (Estimado)
Conclusão do estudo (Estimado)
Datas de inscrição no estudo
Enviado pela primeira vez
Enviado pela primeira vez que atendeu aos critérios de CQ
Primeira postagem (Real)
Atualizações de registro de estudo
Última Atualização Postada (Real)
Última atualização enviada que atendeu aos critérios de controle de qualidade
Última verificação
Mais Informações
Termos relacionados a este estudo
Palavras-chave
Termos MeSH relevantes adicionais
Outros números de identificação do estudo
- AteroImunoHIAE
Plano para dados de participantes individuais (IPD)
Planeja compartilhar dados de participantes individuais (IPD)?
Descrição do plano IPD
Tipo de informação de suporte de compartilhamento de IPD
- PROTOCOLO DE ESTUDO
- SEIVA
- CSR
Informações sobre medicamentos e dispositivos, documentos de estudo
Estuda um medicamento regulamentado pela FDA dos EUA
Estuda um produto de dispositivo regulamentado pela FDA dos EUA
produto fabricado e exportado dos EUA
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