"Immunoregolazione nell'aterosclerosi: uno studio di sequenziamento dell'RNA a cellula"
9 giugno 2025 aggiornato da: Carlos Vicente Serrano Junior, Hospital Israelita Albert Einstein
L'immunoregolazione architettonica nella malattia aterosclerotica: un approccio di sequenziamento dell'RNA a cellula e biologia spaziale
L'aterosclerosi è la principale causa di eventi cardiovascolari acuti, come l'infarto del miocardio e l'ictus, ed è un fattore di rischio significativo per la mortalità cardiovascolare.
La comprensione dettagliata dei meccanismi immunitari e delle trasformazioni cellulari coinvolte nella patogenesi dell'aterosclerosi è ancora limitata e l'uso del sequenziamento dell'RNA a singola cellula (SCRNASEQ) ha rivelato nuove funzioni cellulari e sottopopolazioni associate alla progressione della malattia.
Questo studio mira a identificare le sottopopolazioni cellulari, le vie molecolari e i cambiamenti nell'espressione genica correlati allo sviluppo dell'aterosclerosi nelle arterie coronarie umane.
Usando ScRNaseQ, lo studio cerca di caratterizzare il panorama trascrittomico delle cellule presenti nelle placche aterosclerotiche e identificare le firme molecolari che rivelano predisposizioni individuali a fenotipi specifici, come la suscettibilità alla malattia e la risposta alle terapie.
La ricerca sarà condotta presso l'ospedale di Albert Einstein Israeli di San Paolo e coinvolgerà campioni di arterie coronarie e placche aterosclerotiche dei cuori espiantati dei pazienti che hanno subito trapianti di cuore e di materiale scartato di chirurgia del bypass dell'arteria coronarica (CABG).
Con una dimensione del campione stimata di 20-30 placche, i dati ottenuti consentiranno un'analisi dettagliata dei meccanismi molecolari coinvolti nell'aterosclerosi, contribuendo allo sviluppo di obiettivi terapeutici specifici.
Panoramica dello studio
Stato
Non ancora reclutamento
Condizioni
Intervento / Trattamento
Descrizione dettagliata
Questo è uno studio osservazionale prospettico che sarà condotto con campioni di arterie coronarie e placche aterosclerotiche dai cuori espiantati dei pazienti con cardiomiopatia ischemica che hanno subito trapianti di cuore e da materiale scartato di chirurgia del bypass arteria coronarica.
I campioni di placca aterosclerotici saranno recuperati dalle arterie coronarie durante la chirurgia del trapianto o la procedura CABG e trasportati in laboratorio entro 2 ore.
Le arterie selezionate saranno sezionate e valutate microscopicamente e i campioni saranno fissati in formalina, incorporati nella paraffina e colorati per l'analisi istologica.
Il tessuto verrà dissociato enzimaticamente per ottenere singole cellule, che verranno quindi filtrate e valutate per la vitalità cellulare.
Le cellule subiranno sequenziamento dell'RNA a cella singola (SCRNaseQ) con l'obiettivo di analizzare circa 5.000-10.000 cellule per campione.
La dimensione del campione sarà di 20-30 placche, con l'obiettivo di catturare le principali popolazioni cellulari e eseguire un'analisi robusta.
Tipo di studio
Osservativo
Iscrizione (Stimato)
30
Contatti e Sedi
Questa sezione fornisce i recapiti di coloro che conducono lo studio e informazioni su dove viene condotto lo studio.
Contatto studio
- Nome: Carlos Vicente Serrano, PhD
- Numero di telefono: +55 (11) 2151-5408
- Email: carlos.sjunior@einstein.br
Luoghi di studio
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SP
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São Paulo, SP, Brasile, 05652-900
- Hospital Israelita Albert Einstein
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Criteri di partecipazione
I ricercatori cercano persone che corrispondano a una certa descrizione, chiamata criteri di ammissibilità. Alcuni esempi di questi criteri sono le condizioni generali di salute di una persona o trattamenti precedenti.
Criteri di ammissibilità
Età idonea allo studio
- Adulto
- Adulto più anziano
Accetta volontari sani
No
Metodo di campionamento
Campione di probabilità
Popolazione di studio
Pazienti con diagnosi di cardiomiopatia ischemica a causa dell'aterosclerosi avanzata, sottoposti a trapianto di cuore.
Descrizione
Criteri di inclusione:
- Pazienti con diagnosi di cardiomiopatia ischemica a causa dell'aterosclerosi avanzata, sottoposti a trapianto di cuore;
- Pazienti con malattia coronarica sottoposte alla chirurgia dell'innesto di bypass dell'arteria coronarica (CABG). "
- Di età compresa tra 40 e 75 anni;
- Modulo di consenso informato firmato.
Criteri di esclusione:
- Pazienti con malattie infiammatorie sistemiche o autoimmuni;
- Storia del cancro negli ultimi 5 anni o malignità attiva;
- Uso recente (negli ultimi 6 mesi) della terapia immunosoppressiva.
Piano di studio
Questa sezione fornisce i dettagli del piano di studio, compreso il modo in cui lo studio è progettato e ciò che lo studio sta misurando.
Come è strutturato lo studio?
Dettagli di progettazione
Coorti e interventi
Gruppo / Coorte |
Intervento / Trattamento |
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Pocche coronarie dal cuore esplicativo
Le arterie selezionate saranno sezionate e valutate microscopicamente e i campioni saranno fissati in formalina, incorporati nella paraffina e colorati per l'analisi istologica.
Il tessuto verrà dissociato enzimaticamente per ottenere singole cellule, che verranno quindi filtrate e valutate per la vitalità cellulare.
Le cellule subiranno sequenziamento dell'RNA a cella singola (SCRNaseQ) con l'obiettivo di analizzare circa 5.000-10.000 cellule per campione.
La dimensione del campione sarà di 20-30 placche, con l'obiettivo di catturare le principali popolazioni cellulari e eseguire un'analisi robusta.
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Ritrattamento La normalizzazione dei dati, la riduzione della dimensionalità e il clustering verranno eseguiti utilizzando il pacchetto Seurat (basato su R). I tipi di cellule saranno identificati in base all'espressione genica del marcatore canonico. Identificazione della sottopopolazione cellulare I cluster saranno annotati in base a firme di tipi di cellule note (ad es. Cellule endoteliali, cellule muscolari lisce, macrofagi, ecc.). Verrà condotta analisi di espressione genica differenziale per identificare i geni associati alla malattia. Percorso e arricchimento delle funzioni Verranno eseguite analisi di arricchimento del set genico (GSEA) e analisi del percorso (ad es. Kegg, Reactome) per studiare i processi biologici e i percorsi che guidano l'aterosclerosi. Controllo di qualità Le letture di sequenziamento saranno valutate per la qualità utilizzando FastQC e le letture di bassa qualità verranno filtrate. Il software Cell Ranger (10x Genomics) verrà utilizzato per allineare le letture al genoma umano e quantificare l'espressione genica a livello di singola cellula. |
Cosa sta misurando lo studio?
Misure di risultato primarie
Misura del risultato |
Misura Descrizione |
Lasso di tempo |
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Concentrazione di cluster di cellule specifiche e sottopopolazioni di macrofagi / linfocite: creare un atlante a cellule singole ad alta risoluzione di placche aterosclerotiche.
Lasso di tempo: Attraverso il completamento dello studio, una media di 1 anno e mezzo.
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Determinare la concentrazione di cluster cellulari con specifiche sottopopolazioni infiammatorie Determinazione a creare un atlante a cellule singole ad alta risoluzione di placche aterosclerotiche, rivelando cambiamenti trascrizionali specifici delle cellule associati alla malattia.
I risultati potrebbero identificare nuovi obiettivi terapeutici per l'intervento nell'aterosclerosi e migliorare la comprensione della sua patogenesi molecolare.
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Attraverso il completamento dello studio, una media di 1 anno e mezzo.
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Misure di risultato secondarie
Misura del risultato |
Misura Descrizione |
Lasso di tempo |
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Concentrazione di interleuchine e sottotipi cellulari mediante flusso di citometro all'identificazione delle firme molecolari nell'aterosclerosi
Lasso di tempo: Attraverso il completamento dello studio, una media di 1 anno e mezzo.
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L'obiettivo secondario è identificare le firme molecolari che rivelano predisposizioni individuali a fenotipi specifici, come la suscettibilità all'aterosclerosi, la risposta alle terapie e altre caratteristiche di salute, stabilendo le basi per la medicina di precisione e gli studi sulla salute della popolazione in Brasile determinando specifiche concentrazioni di molecole pro e antinfiammatorie.
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Attraverso il completamento dello studio, una media di 1 anno e mezzo.
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Collaboratori e investigatori
Qui è dove troverai le persone e le organizzazioni coinvolte in questo studio.
Pubblicazioni e link utili
La persona responsabile dell'inserimento delle informazioni sullo studio fornisce volontariamente queste pubblicazioni. Questi possono riguardare qualsiasi cosa relativa allo studio.
Pubblicazioni generali
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- Price AL, Patterson N, Yu F, Cox DR, Waliszewska A, McDonald GJ, Tandon A, Schirmer C, Neubauer J, Bedoya G, Duque C, Villegas A, Bortolini MC, Salzano FM, Gallo C, Mazzotti G, Tello-Ruiz M, Riba L, Aguilar-Salinas CA, Canizales-Quinteros S, Menjivar M, Klitz W, Henderson B, Haiman CA, Winkler C, Tusie-Luna T, Ruiz-Linares A, Reich D. A genomewide admixture map for Latino populations. Am J Hum Genet. 2007 Jun;80(6):1024-36. doi: 10.1086/518313. Epub 2007 Apr 13.
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- Chattopadhyay A, Guan P, Majumder S, Kaw K, Zhou Z, Zhang C, Prakash SK, Kaw A, Buja LM, Kwartler CS, Milewicz DM. Preventing Cholesterol-Induced Perk (Protein Kinase RNA-Like Endoplasmic Reticulum Kinase) Signaling in Smooth Muscle Cells Blocks Atherosclerotic Plaque Formation. Arterioscler Thromb Vasc Biol. 2022 Aug;42(8):1005-1022. doi: 10.1161/ATVBAHA.121.317451. Epub 2022 Jun 16.
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- Serrano CV Jr, de Mattos FR, Pitta FG, Nomura CH, de Lemos J, Ramires JAF, Kalil-Filho R. Association between Neutrophil-Lymphocyte and Platelet-Lymphocyte Ratios and Coronary Artery Calcification Score among Asymptomatic Patients: Data from a Cross-Sectional Study. Mediators Inflamm. 2019 Mar 26;2019:6513847. doi: 10.1155/2019/6513847. eCollection 2019.
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Studiare le date dei record
Queste date tengono traccia dell'avanzamento della registrazione dello studio e dell'invio dei risultati di sintesi a ClinicalTrials.gov. I record degli studi e i risultati riportati vengono esaminati dalla National Library of Medicine (NLM) per assicurarsi che soddisfino specifici standard di controllo della qualità prima di essere pubblicati sul sito Web pubblico.
Studia le date principali
Inizio studio (Stimato)
25 giugno 2025
Completamento primario (Stimato)
25 ottobre 2026
Completamento dello studio (Stimato)
25 aprile 2027
Date di iscrizione allo studio
Primo inviato
24 febbraio 2025
Primo inviato che soddisfa i criteri di controllo qualità
28 febbraio 2025
Primo Inserito (Effettivo)
6 marzo 2025
Aggiornamenti dei record di studio
Ultimo aggiornamento pubblicato (Effettivo)
10 giugno 2025
Ultimo aggiornamento inviato che soddisfa i criteri QC
9 giugno 2025
Ultimo verificato
1 giugno 2025
Maggiori informazioni
Termini relativi a questo studio
Termini MeSH pertinenti aggiuntivi
Altri numeri di identificazione dello studio
- AteroImunoHIAE
Piano per i dati dei singoli partecipanti (IPD)
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